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# Biologie # Microbiologie

Résistance aux antibiotiques chez les mammifères marins : une menace cachée

Des bactéries résistantes aux antibiotiques trouvées chez les dauphins et les baleines soulèvent des inquiétudes pour la santé.

Ren Mark D. Villanueva, Jamaica Ann A. Caras, Windell L. Rivera, Maria Auxilia T. Siringan, Lemnuel V. Aragones, Marie Christine M. Obusan

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Mammifères marins et Mammifères marins et résistance aux antibiotiques aux antibiotiques dans la vie marine. des océans aux bactéries résistantes De nouvelles découvertes lient la santé
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La Résistance aux antibiotiques est un gros problème qui touche à la fois les humains et les animaux. On entend souvent parler des dangers des bactéries devenant résistantes aux antibiotiques dans les hôpitaux, mais ce souci déborde aussi dans nos océans. Étonnamment, des Mammifères marins comme les dauphins et les baleines montrent maintenant des signes de bactéries résistantes aux antibiotiques, ce qui pourrait menacer la faune et la santé humaine.

Qu'est-ce que la résistance aux antibiotiques ?

La résistance aux antibiotiques se produit quand les bactéries évoluent et deviennent plus fortes, leur permettant de survivre même sous traitement antibiotique. C'est un vrai souci pour la santé publique car ça complique le traitement des infections. À l'échelle mondiale, on estime que la résistance aux antibiotiques cause environ 700,000 décès par an— un chiffre qui pourrait grimper à 10 millions d'ici 2050 si rien ne change.

Ce problème n'est pas seulement une préoccupation pour les humains ; c'est aussi crucial pour les animaux, en particulier dans l'agriculture où la santé du bétail est en jeu. Cependant, les chercheurs ont constaté que l'attention sur la résistance aux antibiotiques chez les animaux penche fortement vers les animaux domestiques, laissant un vide quand il s'agit de la faune.

Enterobacteriaceae : Les bactéries derrière le problème

Un groupe de bactéries qui suscite particulièrement des inquiétudes est connu sous le nom d'Enterobacteriaceae. Ces bactéries incluent quelques coupables bien connus comme E. coli et Klebsiella. Elles sont responsables d'un grand nombre d'infections chez l'homme et se sont révélées résistantes à différents types d'antibiotiques, comme les pénicillines et les céphalosporines.

L'Organisation mondiale de la santé (OMS) a souligné les Enterobacteriaceae comme une priorité à surveiller en matière de résistance aux antibiotiques. Bien que plus d'études aient été menées sur ces bactéries dans les animaux terrestres, on ignore encore beaucoup de choses sur ce qui se passe chez les mammifères marins.

Mammifères marins et résistance aux antibiotiques

Les mammifères marins ont reçu moins d'attention dans la recherche concernant la résistance aux antibiotiques. Mais il existe des preuves que ces animaux, comme les dauphins et les baleines, sont aussi porteurs de bactéries résistantes aux antibiotiques. Par exemple, quelques études ont montré que les bactéries trouvées chez les mammifères marins portent des gènes de résistance aux antibiotiques, ce qui leur permet de survivre à des traitements qui les élimineraient normalement.

Aux Philippines, des recherches ont commencé à éclairer cette question. Les scientifiques ont commencé à examiner de près les bactéries trouvées chez les cétacés échoués (un terme classe pour les mammifères marins comme les dauphins, les marsouins et les baleines). Ils se sont concentrés sur la compréhension des types de bactéries présentes et de leur résistance aux antibiotiques.

L'étude sur les cétacés échoués

La recherche a impliqué l'examen de 19 cétacés échoués de différentes espèces, y compris des dauphins à gros nez, des cachalots pygmées, et plus encore. L'équipe a travaillé avec des organisations locales pour collecter des échantillons et analyser les bactéries présentes chez ces animaux.

Caractéristiques des cétacés

Les cétacés ont été examinés en fonction de leur espèce, sexe, longueur, âge, condition corporelle, et les circonstances de leur échouement. Comprendre ces facteurs aide les chercheurs à déterminer comment les éléments environnementaux pourraient affecter la santé de ces animaux.

Il est à noter que la plupart des cétacés étudiés étaient des femelles, mais il y avait quelques mâles et certains dont le sexe était inconnu. Ils ont été trouvés dans un large éventail de lieux aux Philippines, ce qui suggère que le problème de la résistance aux antibiotiques pourrait être répandu.

Isolement des bactéries

Des échantillons ont été prélevés sur les corps de ces cétacés, principalement depuis leurs évents et leurs rectums pour les animaux vivants, afin d'isoler les bactéries. Les chercheurs ont utilisé des outils stériles pour collecter des échantillons et s'assurer qu'ils restaient non contaminés.

Une fois collectés, les échantillons ont été ramenés au labo pour analyse. Au total, 86 types de bactéries différentes ont été isolées chez ces cétacés échoués, les types les plus courants étant E. coli, Enterobacter, et Klebsiella.

Identification des bactéries

Pour identifier les bactéries isolées, les scientifiques ont utilisé une combinaison de méthodes traditionnelles et de technologies modernes. Ils ont effectué des tests pour déterminer si les bactéries étaient gram-négatives (un type de bactéries caractérisé par leur structure de paroi cellulaire) et utilisé des systèmes automatisés pour confirmer leur identité.

En plus d'identifier les bactéries, les chercheurs voulaient en savoir plus sur leurs schémas de résistance aux antibiotiques. C'est crucial car cela aide à comprendre comment ces bactéries pourraient potentiellement affecter la vie marine et la santé humaine.

Test de la Sensibilité aux antibiotiques

Après avoir identifié les bactéries, l'étape suivante était de voir à quel point elles étaient sensibles à divers antibiotiques. Les chercheurs ont testé chaque isolat contre 18 antibiotiques différents pour voir lesquels fonctionnaient et lesquels ne fonctionnaient pas.

Les résultats ont montré que certains antibiotiques étaient encore efficaces contre ces bactéries, avec les aminoglycosides et les carbapénèmes montrant le plus de promesses. Cependant, beaucoup des bactéries isolées avaient développé une résistance à des antibiotiques couramment utilisés, ce qui alerte sur la santé publique.

Qu'est-ce que ça veut dire pour les humains ?

La présence de bactéries résistantes aux antibiotiques chez les mammifères marins pourrait avoir des implications pour la santé humaine. Ces bactéries peuvent entrer dans la chaîne alimentaire et mener à des infections plus difficiles à traiter. C'est particulièrement préoccupant dans les régions où les gens entrent en contact avec la vie marine, que ce soit par la pêche, la baignade ou la consommation de fruits de mer.

De plus, si ces bactéries résistantes se propagent et s'adaptent, elles pourraient contribuer au problème plus large de la résistance aux antibiotiques dans les populations humaines. Cela met en lumière l'interconnexion entre la santé humaine et animale et l'importance de surveiller la résistance aux antibiotiques dans divers environnements.

L'impact potentiel de la Pollution

Un des contributeurs probables à l'augmentation de la résistance aux antibiotiques chez les mammifères marins est la pollution. Beaucoup de zones côtières sont soumises à des ruissellements provenant de l'agriculture, des stations d'épuration et d'autres sources qui peuvent introduire des antibiotiques et des bactéries résistantes dans l'environnement marin.

Quand les mammifères marins sont exposés à ces eaux contaminées, ils peuvent attraper des bactéries résistantes aux antibiotiques. Cela crée un cycle où les activités humaines entraînent la propagation de la résistance dans la faune, ce qui peut à son tour affecter les humains.

Conclusion

Les résultats des études sur la résistance aux antibiotiques chez les cétacés montrent qu'il y a encore beaucoup à apprendre sur cette question pressante. Alors que la résistance aux antibiotiques continue d'augmenter à l'échelle mondiale, il est crucial de comprendre son impact sur les mammifères marins et la santé humaine.

Les efforts pour surveiller et réduire l'utilisation d'antibiotiques chez les humains et les animaux, ainsi que le contrôle de la pollution, sont vitaux pour s'attaquer à ce problème. En protégeant les écosystèmes marins et en veillant à la santé des mammifères marins, nous pouvons aussi aider à préserver la santé humaine.

Au final, nous partageons tous cette planète, et garder la santé de celle-ci signifie veiller sur nos amis vivant dans l'océan. Qui sait, la prochaine fois que tu iras à la plage, tu pourrais bien apercevoir un dauphin nageant tout en pensant au rôle important qu'ils jouent dans l'écosystème—pas seulement comme des créatures mignonnes, mais aussi comme gardiens de notre santé marine.

Source originale

Titre: Resistance profiles and genes of Enterobacteriaceae from cetaceans stranded in Philippine waters from 2018-2019 provide clues on the extent of antimicrobial resistance in the marine environment

Résumé: With the premise that cetaceans are sentinels for understanding the extent of antimicrobial resistance in the marine environment, we determined the phenotypic and genotypic antibiotic resistance profiles of the Enterobacteriaceae isolated from cetaceans (representing twelve cetacean species) that stranded in Philippine waters from 2018-2019. The phenotypic identifications and antibiotic susceptibility profiles of the isolates were determined through VITEK 2 system while their genotypic identifications were confirmed through 16S rRNA gene sequencing. Targeted antibiotics for profiling phenotypic resistance include penicillins, cephalosporins, carbapenems, quinolones, polymyxins and folate pathway inhibitors while detected antibiotic resistance genes (ARGs) for evaluating genotypic resistance include: (1) ampicillins (blaAmpC); (2) cephalosporins (blaAmpC blaTEM, blaSHV, and blaCTX-M); (4) carbapenem (blaKPC); (4) polymyxins (mcr-1) and (5) sulphonamides (sul1, and sul2). Percent resistances (% R), percent susceptibilities (% S) and multiple antibiotic resistance (MAR) index values were computed. Eighty-six Enterobacteriaceae were isolated from the exhaled breath condensate and swab samples of 19 stranded cetaceans. These isolates were confirmed to belong to the following genera: Escherichia (39.53%), Enterobacter (26.74%), Klebsiella (24.41%), Citrobacter (5.81%), Morganella (1.16%), Pantoea (1.16%) and Providencia (1.16%). Overall, 35/86 (40.70%) of the isolates exhibited acquired resistances against cephalosporins (i.e., cefuroxime, 26/86 or 30.23%), polymyxins (i.e., colistin, 6/86 or 6.97%), folate-pathway inhibitors (i.e., trimethoprim-sulfamethoxazole,5/86 or 5.82%), ampicillin (3/86 or 3.49%), and cefoxitin (2/86 or 2.32%), while the lowest resistance (1.16% of isolates) were resistant against amoxicillin-clavulanic acid, piperacillin and imipenem. Moreover, 40.70% of the isolates were characterized as multidrug-resistant (2.33%) and extensively drug-resistant (38.37%) while 5/86 (5.81%) of the isolates had MAR indices greater than 0.2. Six out of seven (85.71%) of the targeted ARGs responsible for the resistance types for ampicillins, cephalosporins, polymyxins and sulphonamides (i.e., blaAmpC, blaSHV blaTEM, mcr-1, sul1 and sul2, respectively) were detected in 48.57% of isolates. Antibiotic susceptibility testing revealed that a considerable portion of the isolates exhibited acquired resistance to selected antibiotics and were categorized as multidrug-resistant (MDR) or extremely drug-resistant (XDR). As for genotypic resistance, six out of seven target antibiotic resistance genes (ARGs) responsible for resistance to ampicillins, cephalosporins, polymyxins, and sulfonamides were detected in nearly half of the isolates with acquired resistance. Considering the habitat ranges of the source animals, this indicates the extent of reach of antibiotics and/or ARGs in the marine environment, and pelagic migratory cetaceans may play an important role in their dissemination.

Auteurs: Ren Mark D. Villanueva, Jamaica Ann A. Caras, Windell L. Rivera, Maria Auxilia T. Siringan, Lemnuel V. Aragones, Marie Christine M. Obusan

Dernière mise à jour: 2024-12-15 00:00:00

Langue: English

Source URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.12.14.628494

Source PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.12.14.628494.full.pdf

Licence: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

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