Simple Science

Ciencia de vanguardia explicada de forma sencilla

# Ciencias de la Salud# Epidemiología

Predicción de la progresión de la enfermedad en la enfermedad de Wilson

Estudio identifica factores clave que influyen en los resultados de la enfermedad de Wilson usando aprendizaje automático.

― 7 minilectura


Se descubrieron losSe descubrieron losfactores de riesgo de laenfermedad de Wilson.enfermedad de Wilson.graves para los pacientes con laNuevos modelos predicen resultados
Tabla de contenidos

La enfermedad de Wilson (WD) es una condición genética rara causada por cambios en un gen que se encarga del transporte de cobre en el cuerpo. Esto provoca la acumulación de demasiado cobre, sobre todo en el hígado, cerebro y ojos. Los altos niveles de cobre en el hígado pueden dañar las células hepáticas. Al principio, esto puede resultar en hígado graso. A medida que avanza la enfermedad, puede llevar a condiciones más serias como inflamación del hígado, cicatrices, mala función hepática e incluso la muerte.

Alrededor de 1 de cada 30,000 nacimientos resulta en WD. La investigación indica que entre el 40% y el 50% de las personas con WD mostrarán signos de enfermedad hepática. Sin embargo, los síntomas pueden variar mucho, desde problemas hepáticos leves hasta fallos hepáticos severos. Dado que no hay una forma sencilla de diagnosticar o curar la WD, es crucial observar cómo se desarrolla la enfermedad con el tiempo. Identificar factores de riesgo y predecir cómo progresará la enfermedad puede ayudar en una mejor planificación del tratamiento.

Aprendizaje automático en la predicción de la progresión de la enfermedad

Las técnicas recientes en aprendizaje automático permiten a los investigadores identificar factores clave que contribuyen a la progresión de la enfermedad utilizando datos de salud del mundo real. Estos métodos incorporan muchas características e interacciones, lo que los hace más efectivos que los modelos tradicionales para encontrar predictores significativos de los resultados de la enfermedad.

Para este estudio, se utilizaron dos modelos específicos de aprendizaje automático: Random Survival Forest (RSF) y XGBoost (XGB). El RSF es conocido por su flexibilidad y facilidad de uso, mientras que el XGB es reconocido por su rapidez y precisión. Ambos modelos ayudan a predecir qué tan rápido podría progresar la WD de una persona hacia resultados críticos como cirrosis, insuficiencia hepática o muerte.

Detalles del estudio

Fuente de datos

Los datos para este estudio provienen de una gran base de datos de registros electrónicos de salud (EHR) en Estados Unidos, que incluye registros de más de 700 hospitales y clínicas. Esta base de datos captura información detallada de pacientes en diversos entornos de atención médica.

Diseño del estudio

Este estudio revisó a pacientes diagnosticados con WD desde el 1 de enero de 2007 hasta el 30 de septiembre de 2020. Solo se incluyó a adultos de 18 años o más que tuvieran un diagnóstico confirmado de WD y que fueran atendidos al menos una vez en un hospital o al menos dos veces en un entorno ambulatorio durante un período específico antes de su diagnóstico. Aquellos con un diagnóstico previo de WD o eventos médicos relevantes durante ese tiempo no fueron incluidos.

Los datos de los pacientes fueron rastreados desde su diagnóstico de WD hasta que experimentaron eventos de salud significativos, se terminó el período del estudio o ya no estuvieron en la base de datos. Se recopilaron varios factores, incluidos demografía, otras condiciones de salud, tratamientos, resultados de laboratorio y uso de atención médica.

Medidas de resultado

El estudio se centró en qué tan rápido los pacientes progresaron desde un diagnóstico de WD a cirrosis, insuficiencia hepática y muerte. Estos resultados se rastrearon usando códigos de diagnóstico específicos y se confirmaron a través de varios registros.

Análisis de datos

Preparación de datos

El estudio comenzó seleccionando alrededor de 180 posibles predictores basados en investigaciones previas y conocimientos clínicos. Estos incluyeron demografía del paciente, otras condiciones de salud, tratamientos, resultados de laboratorio y uso de atención médica.

Selección de características importantes

Los investigadores utilizaron tres modelos diferentes para identificar qué factores eran los más importantes en la predicción de los resultados. Las características seleccionadas incluían edad, uso de alcohol, pruebas de función hepática y otras condiciones de salud. Después de revisar los factores importantes con expertos clínicos, se estableció un conjunto final de predictores para cada resultado.

Predicción de la progresión

Los modelos creados se utilizaron para examinar el riesgo individual de desarrollar cirrosis, insuficiencia hepática y muerte durante períodos de 1, 2, 3 y 5 años desde el diagnóstico de WD.

Rendimiento del modelo

Para evaluar qué tan bien funcionaron los modelos, se utilizó una medida específica conocida como el C-index. Este índice ayuda a ver con qué precisión los modelos pueden predecir qué pacientes progresarán a resultados severos. El estudio encontró que el XGB tuvo un rendimiento ligeramente mejor que el RSF en la predicción de resultados.

Características basales de los pacientes

El estudio analizó diferentes grupos de pacientes en función de si desarrollaron cirrosis, insuficiencia hepática o murieron. En el grupo que desarrolló cirrosis, se identificaron 2,901 pacientes. El estudio descubrió que aquellos que terminaron con cirrosis tendían a ser mayores y tenían más comorbilidades como hepatitis crónica y alcoholismocomparado con los que no desarrollaron cirrosis.

En la cohorte de insuficiencia hepática de 3,251 pacientes, rasgos notables incluyeron una mayor ocurrencia de cirrosis previa y alcoholismo. Aquellos que murieron entre 3,559 pacientes eran generalmente mayores y tenían una tasa más alta de problemas de salud graves como cáncer e insuficiencia renal.

Predictores clave de la progresión de la enfermedad

Los principales predictores identificados en varios resultados incluyeron:

  • Edad al diagnóstico
  • Historial de uso de alcohol
  • Niveles de enzimas hepáticas (AST y bilirrubina)
  • Presencia de condiciones neurológicas y hepáticas

Otras características también jugaron un papel, como hepatitis crónica y obesidad.

Rendimiento del modelo y predicciones

El estudio destacó que el modelo XGB demostró una fuerte precisión en la predicción de la progresión de la enfermedad, especialmente para la insuficiencia hepática y la muerte. A lo largo de un período de 5 años, el modelo mantuvo un buen rendimiento, mostrando que puede ser una herramienta útil en entornos clínicos.

La capacidad de predecir resultados permite a los proveedores de atención médica planificar mejor el tratamiento y manejo de pacientes con WD. Además, entender estos predictores puede guiar ensayos clínicos y ayudar en el desarrollo de intervenciones más efectivas para individuos en alto riesgo de progresión.

Limitaciones del estudio

Aunque el estudio proporcionó información valiosa, había limitaciones a considerar. Como es un estudio retrospectivo, dependió de los registros de salud existentes. Esto significa que algunos pacientes pueden haber tenido WD no diagnosticado o eventos relacionados fuera del período registrado. Además, inexactitudes en la codificación de diagnósticos podrían afectar los hallazgos. La falta de datos de laboratorio, particularmente para indicadores cruciales como los niveles de cobre, también impactó el análisis general.

Conclusión

En resumen, este estudio arrojó luz sobre las características clínicas importantes que pueden ayudar a predecir la progresión de la enfermedad de Wilson. Al usar técnicas avanzadas de aprendizaje automático, los investigadores identificaron factores de riesgo clave asociados con resultados severos. Este trabajo puede, en última instancia, ayudar a personalizar la atención para los pacientes y mejorar el diseño de ensayos clínicos, allanando el camino para un mejor manejo de la enfermedad de Wilson en el futuro. Se recomienda más investigación con conjuntos de datos más grandes para validar estos hallazgos y refinar los modelos predictivos.

Fuente original

Título: Predicting Wilsons Disease Progression using Machine Learning with Real-World Electronic Health Records

Resumen: BACKGROUND & AIMSWilsons disease (WD) is a rare genetic disorder causing excessive copper accumulation. Research on the natural history of WD is limited. Our objective was to identify predictors for WD progression to cirrhosis, liver failure, and death and to predict individual risk of progression to these endpoints at 1, 2, 3, and 5 years after WD diagnosis. METHODSA retrospective natural history cohort study of adult patients with first-recorded WD diagnosis was conducted using the US Optum EHR data between 1/1/2007 and 6/30/2020. LASSO Cox regression, Random Survival Forest (RSF), and XGBoost (XGB) models were used to identify important predictors for progression to cirrhosis, liver failure, and death. The strong predictors for each outcome identified through weighted average rankings across models and reviewed by clinical experts were used for patient-level prediction using RSF and XGB models. The resulting models were validated with an independent sample cohort. C-index and dynamic AUCs were used to evaluate model performance. RESULTSOver the study period, 310 out of 2,901 WD patients developed cirrhosis, 255 out of 3,251 developed liver failure, and 604 out of 3,559 died. Age at WD diagnosis, alcoholism, AST and bilirubin levels within 3 months of WD diagnosis, and neurologic and hepatic conditions were the most common predictors for progression to the study endpoints. XGB had a slight superior predictive performance compared with RSF and was then used to predict individual risks for progression to the study endpoints with the top ensemble predictors. The dynamic AUC was 0.78 at Year 1, 0.74 at Year 2, 0.72 at Year 3 and 0.72 at Year 5 for cirrhosis; 0.82 at Year 1, 0.78 at Year 2, and 0.77 at both Year 3 and Year 5 for liver failure; 0.81 at Year 1, 0.83 at Year 2, and 0.82 at both Year 3 and Year 5 for death. CONCLUSIONSThis study identified the most influential clinical predictors and assessed patient-level risk of WD progression using machine learning. Results from machine learning prognostic models will increase understanding of disease natural history and may help improve clinical trial design and guide individualized clinical care.

Autores: Caihua Liang, S. Kelly, R. Shen, L. Li, K. Lobello, S. Arkin, K. Huang, X. Zhou

Última actualización: 2023-08-04 00:00:00

Idioma: English

Fuente URL: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2023.07.28.23293309

Fuente PDF: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2023.07.28.23293309.full.pdf

Licencia: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

Cambios: Este resumen se ha elaborado con la ayuda de AI y puede contener imprecisiones. Para obtener información precisa, consulte los documentos originales enlazados aquí.

Gracias a medrxiv por el uso de su interoperabilidad de acceso abierto.

Más de autores

Artículos similares