Avanzando en la Identificación de Grupos de Pacientes con ACR
Mejorando la identificación de grupos de pacientes a través de sistemas innovadores de recuperación automática de cohortes.
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Tabla de contenidos
- El Desafío de los Datos Médicos a Largo Plazo
- La Necesidad de Sistemas Eficientes y Efectivos
- Enfoques para la Recuperación Automática de Cohortes
- Razonamiento Longitudinal
- Construyendo Sistemas Eficientes
- Evaluación de los Sistemas ACR
- Hallazgos y Resultados
- Importancia de los Sistemas Híbridos
- Avanzando
- Conclusión
- Fuente original
- Enlaces de referencia
Identificar grupos de Pacientes para tareas específicas de salud es súper importante en el campo médico. Esto incluye cosas como reclutar personas para ensayos clínicos y estudiar casos pasados. Tradicionalmente, estos procesos implican buscar en un montón de datos médicos y suelen requerir mucho trabajo manual, lo que puede llevar mucho tiempo y provocar errores.
Los desarrollos recientes en tecnología moderna, especialmente en modelos de lenguaje grande (LLMs) y técnicas de búsqueda de información, nos dan nuevas formas de mejorar estos sistemas. Sin embargo, todavía hay grandes desafíos por superar. Esto incluye lidiar con historias clínicas largas y asegurar que las nuevas soluciones sean asequibles y prácticas para el uso diario.
Este artículo presenta una tarea llamada Recuperación Automática de Cohortes (ACR) que examina cuán bien los LLMs y sistemas especializados pueden identificar grupos de pacientes según sus registros médicos. El objetivo es crear una prueba estándar, un conjunto de preguntas de muestra y un marco para evaluar cuán bien funcionan estos sistemas.
El Desafío de los Datos Médicos a Largo Plazo
Las historias clínicas de los pacientes pueden ser muy complejas. Por ejemplo, un paciente puede tener múltiples condiciones de salud documentadas a lo largo del tiempo, a menudo en registros diferentes escritos por distintos doctores. Los sistemas ACR necesitan entender estos datos a largo plazo de manera efectiva para responder Consultas con precisión.
Para ilustrar la complejidad, considera un paciente cuyo recorrido incluye tres eventos clave documentados en diferentes momentos: un doctor menciona una propagación de cáncer, un cirujano realiza una cirugía y más tarde un ginecólogo documenta un embarazo. Estos eventos deben estar conectados lógicamente para que tenga sentido la condición de salud del paciente.
Si alguien solicita información sobre pacientes con cáncer de mama que luego tuvieron un embarazo, el sistema ACR tendría que considerar la cirugía como una parte crítica de la historia del paciente. Si la cirugía eliminó órganos necesarios para el embarazo, el sistema necesita reflejar eso en su respuesta.
Además, los registros médicos reales son a menudo mucho más complicados, con miles de eventos separados, lo que hace que sea difícil para las computadoras analizar y razonar sobre esta información.
La Necesidad de Sistemas Eficientes y Efectivos
La base de cualquier sistema ACR es su capacidad para recuperar información del paciente de manera eficiente. Los métodos actuales a menudo dependen de consultas de datos estructurados combinadas con supervisión humana, lo que puede ser lento y propenso a errores. Para abordar el creciente número de pacientes y registros médicos, estos sistemas deben proporcionar resultados rápidos y de alta calidad.
Algunos estudios se han centrado en convertir los requisitos de ensayos clínicos en consultas amigables para las máquinas, mientras que otros buscan asegurarse de que los grupos de pacientes identificados sean representativos y justos. Sin embargo, todavía hay mucho espacio para mejorar, especialmente en el uso de datos estructurados y registros médicos no estructurados.
Enfoques para la Recuperación Automática de Cohortes
Para abordar estos desafíos, proponemos una tarea nueva llamada Recuperación Automática de Cohortes (ACR). Esta tarea va más allá de la coincidencia tradicional de pacientes para ensayos clínicos y se adentra más en los datos a largo plazo.
Los Modelos de Lenguaje Grande (LLMs) han mostrado promesa en el campo médico, pero su efectividad necesita más evaluación, especialmente en grandes bases de datos de pacientes. Investigamos múltiples métodos, incluyendo usar LLMs solos y combinarlos con técnicas de razonamiento tradicionales.
Un enfoque es usar un LLM para analizar y agrupar documentos de pacientes en formatos buscables. Cuando se recibe una consulta, el sistema recupera documentos relevantes y construye un grupo de pacientes a partir de los datos. Este método, llamado 'solo recuperador', se puede mejorar agregando un 'lector' que refine aún más los resultados. Este enfoque combinado se llama 'recuperar-then-leer'.
Razonamiento Longitudinal
Uno de los conceptos clave en ACR es el razonamiento longitudinal, que implica entender cómo diferentes eventos de la vida de un paciente se conectan a lo largo del tiempo. Este tipo de razonamiento ayuda a los sistemas a identificar si los pacientes cumplen con criterios específicos durante un período prolongado.
Por ejemplo, si consideramos un paciente con un diagnóstico de cáncer de mama, que luego se somete a una cirugía y después documenta un embarazo, un razonamiento longitudinal efectivo debe unir estos documentos separados y extraer información relevante que refleje con precisión el viaje de salud del paciente a lo largo del tiempo.
Los sistemas ACR efectivos deben ser capaces de descubrir y resolver conflictos en los datos, como identificar cuándo un paciente no puede ser considerado embarazada después de ciertas cirugías.
Construyendo Sistemas Eficientes
El objetivo principal de ACR es desarrollar sistemas que puedan recuperar datos de pacientes con alta precisión y eficiencia. El sistema ideal debería ser capaz de manejar millones de registros de pacientes y responder a consultas rápidamente.
Basado en nuestros hallazgos, los métodos utilizados en los sistemas actuales de recuperación de cohortes revelan brechas significativas. Por ejemplo, los sistemas existentes a menudo luchan por mantener resultados de alta calidad al manejar datos médicos complejos o ruidosos.
Para mejorar los diseños pasados, el artículo propone utilizar una variedad de técnicas en recuperación de datos y razonamiento que podrían llevar a sistemas ACR más efectivos y rápidos.
Evaluación de los Sistemas ACR
Para asegurar una forma sistemática de evaluar la efectividad de los sistemas ACR, hemos desarrollado un marco de evaluación. El rendimiento puede ser medido contra un conjunto de datos de consultas diseñadas por expertos médicos para cubrir varios escenarios del mundo real.
La evaluación se centra en la calidad de recuperación, consistencia y la tendencia del sistema a producir falsos positivos: pacientes incorrectamente incluidos en una cohorte. Esto es crucial para asegurarse de que los sistemas ACR produzcan resultados fiables sin malgastar recursos en datos incorrectos.
En este esfuerzo, categorizamos las consultas según su complejidad y el tamaño de las cohortes de pacientes involucradas. Esta forma de evaluar sistemas ayuda a identificar brechas de rendimiento y puede guiar futuros desarrollos en la tecnología ACR.
Hallazgos y Resultados
Las pruebas iniciales de los sistemas ACR propuestos revelaron diferencias clave en el rendimiento. Los enfoques solo LLM mostraron potencial para automatizar la recuperación de cohortes de pacientes, pero a menudo lucharon con la consistencia y precisión.
En contraste, nuestro enfoque neuro-simbólico, que combina razonamiento tradicional con modelos de lenguaje modernos, demostró un rendimiento superior. Este enfoque aprovechó efectivamente el conocimiento médico para mejorar la recuperación de datos de pacientes, dando como resultado resultados más precisos.
A través de nuestras pruebas exhaustivas con diferentes consultas de pacientes, observamos que, aunque los LLM pueden procesar y analizar datos de pacientes rápidamente, a menudo fallan en mantener un razonamiento consistente, especialmente bajo consultas complejas relacionadas con condiciones de salud a largo plazo.
Importancia de los Sistemas Híbridos
Combinar LLM con técnicas tradicionales puede proporcionar un enfoque más equilibrado para ACR. Los profesionales de la salud a menudo buscan un sistema que no solo sea eficiente, sino también fiable, por lo que la integración de conocimiento experto y aprendizaje automático podría llevar a mejores resultados.
Dada la complejidad de los registros médicos y la naturaleza a largo plazo de las historias de salud de los pacientes, los sistemas híbridos que pueden aprovechar las fortalezas de ambos enfoques son probablemente los que darán los mejores resultados.
Avanzando
A medida que miramos hacia el futuro de ACR, está claro que el refinamiento continuo de estos sistemas es crucial. Incorporar comentarios de profesionales médicos, mejorar la interpretabilidad del modelo y mejorar herramientas para limitar inconsistencias y errores serán factores clave en el desarrollo de sistemas de recuperación más fiables.
Al abordar estos desafíos, podemos apoyar mejor la toma de decisiones clínicas y mejorar la atención al paciente, lo que en última instancia conduce a tratamientos e intervenciones más efectivos.
Conclusión
En resumen, la Recuperación Automática de Cohortes representa un avance significativo en cómo se pueden utilizar los datos médicos para la identificación de pacientes y la investigación clínica. Con el potencial de mejorar drásticamente la velocidad y precisión de la identificación de cohortes de pacientes, los sistemas ACR están en camino de transformar la forma en que los proveedores de salud abordan la investigación y la atención al paciente.
La integración continua de tecnologías modernas de IA en las prácticas de salud sugiere un futuro donde la recuperación precisa de pacientes se vuelva común, apoyando una variedad de aplicaciones clínicas.
A través de pruebas rigurosas y evaluación, nos estamos acercando a realizar el potencial completo de estos sistemas, lo que resultará en mejores resultados en salud y contribuirá al avance general de la investigación médica.
Título: ACR: A Benchmark for Automatic Cohort Retrieval
Resumen: Identifying patient cohorts is fundamental to numerous healthcare tasks, including clinical trial recruitment and retrospective studies. Current cohort retrieval methods in healthcare organizations rely on automated queries of structured data combined with manual curation, which are time-consuming, labor-intensive, and often yield low-quality results. Recent advancements in large language models (LLMs) and information retrieval (IR) offer promising avenues to revolutionize these systems. Major challenges include managing extensive eligibility criteria and handling the longitudinal nature of unstructured Electronic Medical Records (EMRs) while ensuring that the solution remains cost-effective for real-world application. This paper introduces a new task, Automatic Cohort Retrieval (ACR), and evaluates the performance of LLMs and commercial, domain-specific neuro-symbolic approaches. We provide a benchmark task, a query dataset, an EMR dataset, and an evaluation framework. Our findings underscore the necessity for efficient, high-quality ACR systems capable of longitudinal reasoning across extensive patient databases.
Autores: Dung Ngoc Thai, Victor Ardulov, Jose Ulises Mena, Simran Tiwari, Gleb Erofeev, Ramy Eskander, Karim Tarabishy, Ravi B Parikh, Wael Salloum
Última actualización: 2024-07-01 00:00:00
Idioma: English
Fuente URL: https://arxiv.org/abs/2406.14780
Fuente PDF: https://arxiv.org/pdf/2406.14780
Licencia: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/
Cambios: Este resumen se ha elaborado con la ayuda de AI y puede contener imprecisiones. Para obtener información precisa, consulte los documentos originales enlazados aquí.
Gracias a arxiv por el uso de su interoperabilidad de acceso abierto.
Enlaces de referencia
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