El papel de TNFSF en la progresión del cáncer de mama
Investigando cómo los genes TNFSF impactan en el tratamiento del cáncer de mama y los resultados de los pacientes.
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Tabla de contenidos
- Inmunoterapia para el Cáncer de Mamá
- Desafíos en el Tratamiento del Cáncer de Mama
- Superfamilia del Factor de Necrosis Tumoral (TNFSF)
- Analizando la Expresión de la TNFSF en el Cáncer de Mama
- Niveles de Expresión de mRNA
- Análisis de Expresión Génica Diferencial
- Patrones de Expresión Proteica
- Asociación de la Expresión de TNFSF con Características de los Pacientes
- Alteraciones Genéticas en Miembros de TNFSF
- Identificación de Factores de Transcripción y MicroRNA
- Valor Prognóstico de TNFSF en el Cáncer de Mama
- Correlación con la Infiltración de Células Inmunitarias
- Esencialidad Genética de los Miembros de TNFSF
- Conclusión
- Fuente original
- Enlaces de referencia
El Cáncer de mama es el tipo de cáncer más diagnosticado en todo el mundo. En 2020, se reportaron alrededor de 2.3 millones de nuevos casos. Este tipo de cáncer ocurre cuando las células en la mama comienzan a crecer sin control. Estos crecimientos pueden empezar en varias partes de la mama y pueden volverse malignos, lo que significa que pueden extenderse a otras partes del cuerpo. El cáncer de mama se clasifica en cuatro tipos principales según diferentes características, como el estado de los receptores y los patrones de Expresión genética. Estos tipos son Luminal A, Luminal B, HER2-positivo y cáncer de mama triple negativo (TNBC).
Inmunoterapia para el Cáncer de Mamá
La inmunoterapia es un enfoque prometedor para tratar el cáncer de mama. Varios tratamientos basados en el sistema inmunológico han sido aprobados por la FDA de EE. UU. Estos tratamientos a menudo involucran inhibidores de puntos de control inmunológico, que atacan proteínas específicas en las células inmunitarias que a menudo evitan que el sistema inmunológico ataque las células cancerosas. Algunas de estas proteínas incluyen CTLA-4, PD1 y PD-L1. Estos tratamientos han mostrado efectos beneficiosos en el tratamiento de varios tipos de cáncer, incluidos algunos tipos de cáncer de mama.
Desafíos en el Tratamiento del Cáncer de Mama
A pesar de los avances en tratamientos y métodos de detección temprana, muchos pacientes aún enfrentan malos resultados, principalmente debido a la propagación del cáncer (metástasis) y resistencia a la quimioterapia. Por eso, es crucial encontrar mejores opciones de tratamiento y marcadores pronósticos para el cáncer de mama.
Superfamilia del Factor de Necrosis Tumoral (TNFSF)
La TNFSF consiste en 19 proteínas que juegan un papel en la gestión de las respuestas inmunitarias y la inflamación, así como en la regulación del crecimiento y la muerte celular. La inflamación en el ambiente tumoral puede afectar significativamente el desarrollo y progreso del tumor.
Investigaciones de 1975 mostraron que el factor de necrosis tumoral (TNF), un miembro de esta familia, puede obstaculizar el crecimiento del cáncer. Mientras que algunos estudios sugieren que ciertos miembros de la TNFSF podrían actuar como supresores de Tumores, otros indican que pueden apoyar el crecimiento del cáncer. Por ejemplo, APRIL (TNFSF13) ha sido identificado en células de cáncer de mama, y experimentos han mostrado que reducir su presencia puede obstaculizar el crecimiento tumoral.
Otros miembros de la TNFSF, como TNFSF10, TNFSF14 y TNFSF15, están asociados con el proceso de apoptosis, o muerte celular programada. Algunos miembros de la TNFSF también han sido estudiados en otros tipos de cáncer, como el cáncer de pulmón y riñón.
Debido a la variedad de funciones que exhibe la familia TNFSF, es necesario investigar más sobre sus roles en el cáncer de mama.
Analizando la Expresión de la TNFSF en el Cáncer de Mama
Niveles de Expresión de mRNA
Usando una base de datos, los investigadores analizaron los niveles de expresión de mRNA de los miembros de la TNFSF en pacientes con cáncer de mama. Encontraron que ciertos genes de la TNFSF tenían una expresión más alta en tejidos cancerosos en comparación con tejidos normales. Por ejemplo, FASLG, LTA, LTB, TNF, y varios otros se encontraron en niveles elevados en tumores primarios, mientras que dos genes, EDA y TNFSF12, mostraron una expresión significativamente reducida en muestras tumorales. Notablemente, TNFSF10 tuvo la mayor expresión entre todos.
Análisis de Expresión Génica Diferencial
Un análisis adicional reveló diferencias significativas en la expresión de ciertos genes de la TNFSF al comparar tejidos tumorales y metastásicos. Para algunos genes, los niveles de expresión eran notablemente diferentes, indicando roles variados durante la progresión del cáncer. En contraste, otros genes no mostraron diferencias significativas en la expresión.
Patrones de Expresión Proteica
Además del análisis de mRNA, los investigadores revisaron los patrones de expresión proteica de los miembros de la TNFSF en tejidos normales y cancerosos. Algunas proteínas estaban ausentes en tejidos normales y cancerosos, mientras que otras estaban presentes solo en tejidos cancerosos. Ciertas proteínas mostraron niveles más altos en el cáncer en comparación con los tejidos normales, indicando sus roles potenciales en el cáncer de mama.
Asociación de la Expresión de TNFSF con Características de los Pacientes
Investigar el vínculo entre los niveles de mRNA de TNFSF y las características clínicas en pacientes con cáncer de mama reveló que algunos genes mostraron una disminución en la expresión a medida que el cáncer progresaba, mientras que otros aumentaron. Por ejemplo, los pacientes más jóvenes presentaron diferentes niveles de expresión de TNFSF en comparación con los pacientes mayores, lo que indica que la edad puede influir en la expresión génica.
El estudio también evaluó vínculos entre la expresión de TNFSF y el estado hormonal (como el estado de ER y PR). Ciertos genes de la TNFSF exhibieron diferentes niveles de expresión dependiendo del estado de los receptores hormonales, revelando sus roles potenciales en diferentes subtipos de cáncer.
Alteraciones Genéticas en Miembros de TNFSF
Al evaluar datos de muestras de cáncer, los investigadores encontraron que varios genes de la TNFSF experimentaron alteraciones genéticas. Estos hallazgos resaltaron posibles vías e interacciones entre los miembros de la familia TNFSF y otros genes que podrían estar involucrados en el desarrollo del cáncer de mama.
Identificación de Factores de Transcripción y MicroRNA
Los investigadores intentaron identificar qué factores de transcripción y microARN regulan los genes de la TNFSF. Este análisis reveló elementos reguladores importantes asociados con los miembros de la familia TNFSF, lo que podría llevar a una mejor comprensión de cómo estos genes influyen en el cáncer de mama.
Valor Prognóstico de TNFSF en el Cáncer de Mama
El análisis de los datos de supervivencia de los pacientes indicó que niveles más altos de mRNA de ciertos genes de la TNFSF estaban asociados con una mejor supervivencia general (OS) y supervivencia libre de recurrencia (RFS). Genes como FASLG, TNF y TNFSF10 mostraron correlaciones positivas con los resultados de los pacientes. Por el contrario, algunos genes como TNFSF4 estaban vinculados a tasas de supervivencia pobres.
Correlación con la Infiltración de Células Inmunitarias
Perspectivas de otra base de datos ilustraron que varios genes de la TNFSF estaban correlacionados positivamente con la presencia de células inmunitarias en tejidos cancerosos. Este hallazgo sugiere que estos genes podrían influir en cómo las células inmunitarias interactúan con las células cancerosas, afectando potencialmente la progresión del cáncer y los resultados en los pacientes.
Esencialidad Genética de los Miembros de TNFSF
Un análisis exhaustivo encontró que ninguno de los genes de la TNFSF fue considerado esencial para el cáncer de mama, sugiriendo que pueden no ser adecuados como objetivos de fármacos. Sin embargo, ciertos genes mostraron selectividad y eficiencia en otros tipos de cáncer, indicando que sus roles pueden variar significativamente entre diferentes tipos de cáncer.
Conclusión
Los datos recopilados de varios análisis muestran que los miembros de la familia TNFSF juegan roles complejos en el cáncer de mama. Algunos genes parecen apoyar el crecimiento tumoral, mientras que otros pueden actuar para suprimirlo. La participación de estos genes en la respuesta Inmune destaca su importancia en el cáncer. Se necesita más investigación para confirmar sus funciones y explorar su potencial como objetivos terapéuticos o marcadores pronósticos en el cáncer de mama. La exploración de los genes de la TNFSF abre la puerta para mejorar las estrategias de tratamiento y una mejor atención a los pacientes en el manejo del cáncer de mama.
Título: A comprehensive bioinformatics analysis to identify potential prognostic biomarkers among TNFSF superfamily in breast cancer
Resumen: Breast cancer (BC) is one of most important mortality factors among women therefore to find important genes in BC can help early diagnosis, treatment or prevention. TNFSF or tumor necrosis factor Superfamily have an important role in various cancers. In BC, some of studies have found dual roles for these genes. In this research, we conducted a comprehensive and detailed bioinformatics study on this family. UALCAN, TNMplot, UCSC Xena, GEPIA, The Human Protein Atlas, Kaplan-Meier plotter, bc-GenExMiner, cBioPortal, STRING, GeneMANIA, Enrichr, TIMER and shinyDepMap were used for analysis. We found that these genes play their role through the immune system and the high expression of eight FASLG, LTB, TNF, TNFSF8, TNFSF10, TNFSF11, TNFSF12, TNFSF13 genes were positively associated with OS and RFS. Overall, our data showed that these genes can be considered as prognostic biomarkers. Further, our results suggest that this family has anti-tumor activity.
Autores: Abolfazl Moradi, F. Vafadar Esfahani, A. Mohammadian
Última actualización: 2024-06-12 00:00:00
Idioma: English
Fuente URL: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2024.06.11.24308760
Fuente PDF: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2024.06.11.24308760.full.pdf
Licencia: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
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