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# Biología# Neurociencia

Investigando los cambios en el cerebro en el trastorno del espectro autista

La investigación revela diferencias clave en los axones en el autismo usando técnicas de aprendizaje automático.

Basilis Zikopoulos, A. Yazdanbakhsh, K. Dang, K. Kuang, T. Lian, X. Liu, S. Xie

― 7 minilectura


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Tabla de contenidos

El Trastorno del Espectro Autista (TEA) afecta cómo funcionan las conexiones neuronales y las comunicaciones en el cerebro. Los estudios han encontrado que hay cambios en áreas específicas del cerebro relacionadas con esta condición. Estos cambios incluyen diferencias en las estructuras llamadas axones, que son como cables que llevan señales por todo el cerebro.

Hallazgos Clave sobre Cambios en Axones

La investigación muestra que en personas con TEA, a menudo hay un aumento en el número de axones delgados, mientras que los axones más gruesos tienden a ser menos densos. Esto puede llevar a problemas con cómo se transmiten las señales en el cerebro. Otros cambios reportados incluyen un ramificación excesiva de los axones debido a proteínas específicas, el adelgazamiento de la capa protectora alrededor de los axones llamada mielina y variaciones en los caminos de los axones.

Estas diferencias pueden afectar qué tan rápido viajan las señales y cuán fuertes son las conexiones, impactando las funciones y comunicaciones generales del cerebro. La ubicación y el tamaño de estos axones también pueden proporcionar pistas sobre cómo se conectan a otras áreas del cerebro.

El Papel de la Materia Blanca

La materia blanca en el cerebro es clave para las conexiones. La materia blanca superficial (MBS) contiene principalmente conexiones de corto alcance, mientras que la materia blanca profunda (MBP) contiene conexiones de largo alcance. Los axones en la MBP tienden a ser más gruesos que los que se encuentran en la MBS.

Estudiar la materia blanca es esencial, ya que puede ayudarnos a entender los caminos cerebrales y cómo pueden verse interrumpidos en el autismo. Los métodos tradicionales para analizar estos axones son muy lentos y requieren conocimiento experto, lo que los hace difíciles para estudios más grandes que buscan identificar problemas en el TEA.

Aprendizaje automático como Solución

El aprendizaje automático podría ofrecer una nueva forma de analizar imágenes detalladas de axones mielinizados en la materia blanca. Las redes neuronales profundas (RNP) son una herramienta de aprendizaje automático que ha sido efectiva en la clasificación de imágenes. Pueden ayudar a distinguir entre imágenes de individuos neurotípicos y aquellos con TEA.

Para este estudio, se utilizó una RNP conocida llamada GoogLeNet. Ofreció un marco para personalizar un modelo que pudiera diferenciar imágenes de alta resolución de axones en los cerebros de individuos con y sin TEA.

Enfocándose en la Corteza Cingulada Anterior

El enfoque estuvo en la materia blanca debajo de la corteza cingulada anterior (CCA), una parte del cerebro implicada en la atención, emociones e interacciones sociales, áreas que a menudo se ven afectadas en el autismo. La CCA muestra diferencias notables de actividad en personas con TEA, lo que llevó a los investigadores a pensar que examinar su materia blanca podría revelar información importante sobre el trastorno.

Recopilando y Analizando Datos

Para crear el modelo, los investigadores utilizaron grandes conjuntos de datos de imágenes de muestras cerebrales. Prepararon dos tipos de imágenes: una usando Microscopía Electrónica, que proporciona imágenes estructurales detalladas, y otra usando microscopía óptica. Las muestras de tejido provenían de cerebros post-mortem tanto de individuos neurotípicos como de aquellos con autismo.

Las muestras fueron procesadas y fotografiadas de una manera específica para asegurar una captura precisa de las características. El objetivo era crear un conjunto de datos que pudiera ser utilizado para entrenar el modelo de aprendizaje automático de manera eficiente.

Preparando las Imágenes para el Aprendizaje Automático

Para optimizar el conjunto de datos, se aplicaron dos métodos. El primero consistió en cortar las imágenes originales en secciones más pequeñas. De esta manera, el modelo podría aprender de varias partes de cada imagen. El segundo método utilizó una ventana deslizante para crear secciones superpuestas, aumentando el número de imágenes disponibles para el entrenamiento.

Antes de ser ingresadas en el modelo, las imágenes pasaron por un procesamiento adicional para mejorar la calidad y asegurar consistencia. Esto incluyó ajustar contrastes y normalizar valores, lo que facilitó que el modelo aprendiera de manera efectiva.

Entrenando la Red Neuronal Profunda

Para asegurar resultados confiables, los investigadores dividieron las imágenes en diferentes conjuntos para entrenamiento, validación y prueba. También utilizaron técnicas para equilibrar el número de imágenes de cada clase y mejorar la capacidad del modelo para aprender.

Se empleó aprendizaje por transferencia, utilizando un modelo preentrenado para ayudar con el nuevo conjunto de datos, mejorando la eficiencia y precisión. Se probaron diferentes modelos preentrenados, y los más efectivos fueron ajustados para la tarea específica de clasificar las imágenes de axones.

Evaluando el Rendimiento del Modelo

Se utilizaron múltiples métodos para evaluar qué tan bien funcionó el modelo. Las técnicas de validación cruzada aseguraron que el modelo aprendiera de manera efectiva de diferentes grupos de imágenes. Las matrices de confusión ayudaron a visualizar cuán bien clasificó el modelo diferentes clases e identificar áreas para mejorar.

El estudio también calculó métricas de precisión y recuerdo, proporcionando una visión más profunda sobre el rendimiento del modelo. El área bajo la curva característica operativa (AUC) fue otra medida importante para evaluar la efectividad general.

Usando Mapas de Sensibilidad para Obtener Información

Para analizar más los resultados, se generaron mapas de sensibilidad para resaltar qué partes de las imágenes influyeron en las decisiones del modelo. Estos mapas ayudaron a identificar características específicas que contribuyeron a clasificaciones correctas e incorrectas, ofreciendo pistas sobre las diferencias estructurales en el cerebro entre individuos neurotípicos y aquellos con TEA.

Imágenes DeepDream para Visualizar Características

Se crearon imágenes DeepDream para ilustrar las características aprendidas por el modelo. Estas imágenes ayudan a visualizar patrones y características que son importantes para las tareas de clasificación. Al resaltar detalles específicos de las imágenes, los investigadores pudieron ver características distintas que ayudaron a diferenciar entre diferentes clases.

Hallazgos e Insights

Los resultados mostraron que el modelo podía clasificar imágenes de grupos de TEA y neurotípicos con alta precisión. Sin embargo, distinguir entre diferentes profundidades de materia blanca fue más desafiante. El análisis destacó la dificultad para clasificar correctamente la materia blanca superficial en individuos con TEA, lo que indica una variabilidad significativa en estas regiones.

Los hallazgos apuntaron a una mezcla de áreas de materia blanca en los cerebros de personas con TEA. Esto sugiere que las diferencias estructurales en los axones pueden ser más pronunciadas debajo de la CCA, mostrando cambios generalizados que impactan cómo se comunica el cerebro.

Desafíos y Direcciones Futuras

Aunque el modelo funcionó bien, quedan varios desafíos. El tamaño limitado del conjunto de datos y la variabilidad en las imágenes pueden afectar la capacidad del modelo para generalizar a nuevos datos. Los estudios futuros deberían centrarse en ampliar los conjuntos de datos y explorar otras regiones del cerebro para identificar más patrones e insights relacionados con el TEA.

El enfoque tomado en este estudio tiene potencial para entender la conectividad cerebral en individuos neurotípicos y aquellos con trastornos mentales. Al analizar sistemáticamente imágenes de estructuras cerebrales y utilizar aprendizaje automático, los investigadores pueden descubrir información vital que podría guiar futuros diagnósticos e intervenciones para el autismo.

Conclusión

El uso de aprendizaje automático para analizar imágenes cerebrales proporciona nuevas perspectivas sobre las diferencias estructurales en el TEA. Este estudio demuestra la efectividad de combinar imágenes de alta resolución con métodos analíticos avanzados. Los hallazgos destacan características axonales específicas que podrían ser objeto de más investigación, lo que podría llevar a una mejor comprensión y opciones de tratamiento para las personas con autismo.

Fuente original

Título: Artificial intelligence networks combining histopathology and machine learning can extract axon pathology in autism spectrum disorder

Resumen: Axon features that underlie the structural and functional organization of cortical pathways have distinct patterns in the brains of neurotypical controls (CTR) compared to individuals with Autism Spectrum Disorder (ASD). However, detailed axon study demands labor-intensive surveys and time-consuming analysis of microscopic sections from post-mortem human brain tissue, making it challenging to systematically examine large regions of the brain. To address these challenges, we developed an approach that uses machine learning to automatically classify microscopic sections from ASD and CTR brains, while also considering different white matter regions: superficial white matter (SWM), which contains a majority of axons that connect nearby cortical areas, and deep white matter (DWM), which is comprised exclusively by axons that participate in long-range pathways. The result was a deep neural network that can successfully classify the white matter below the anterior cingulate cortex (ACC) of ASD and CTR groups with 98% accuracy, while also distinguishing between DWM and SWM pathway composition with high average accuracy, up to 80%. Multidimensional scaling analysis and sensitivity maps further underscored the reliability of ASD vs CTR classification, based on the consistency of axon pathology, while highlighting the important role of white matter location that constrains pathway dysfunction, based on several shared anatomical markers. Large datasets that can be used to expand training, validation, and testing of this network have the potential to automate high-resolution microscopic analysis of post-mortem brain tissue, so that it can be used to systematically study white matter across brain regions in health and disease. One Sentence StatementHistopathology-trained AI can identify ASD network disruptions and guide development of diagnostics and targeted therapeutics.

Autores: Basilis Zikopoulos, A. Yazdanbakhsh, K. Dang, K. Kuang, T. Lian, X. Liu, S. Xie

Última actualización: 2024-10-26 00:00:00

Idioma: English

Fuente URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.10.25.620308

Fuente PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.10.25.620308.full.pdf

Licencia: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

Cambios: Este resumen se ha elaborado con la ayuda de AI y puede contener imprecisiones. Para obtener información precisa, consulte los documentos originales enlazados aquí.

Gracias a biorxiv por el uso de su interoperabilidad de acceso abierto.

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