Un Futuro Más Justo en la Investigación Genética
El programa All of Us busca la inclusión en la investigación de salud.
Shivam Sharma, Shashwat Deepali Nagar, Priscilla Pemu, Stephan Zuchner, Leonardo Mariño-Ramírez, Robert Meller, I. King Jordan
― 7 minilectura
Tabla de contenidos
- ¿Qué es el Programa All of Us?
- Objetivos del Estudio
- Participantes y Recolección de Datos
- Recolectando Datos Genéticos
- Entendiendo la Estructura Poblacional
- Inferencia de la Ascendencia Genética
- Patrones Geográficos
- Edad y Diversidad Genética
- La Importancia de la Diversidad en la Investigación
- Desafíos por Delante
- Conclusión
- Fuente original
- Enlaces de referencia
El mundo de la investigación genética está en una misión para ser más justo. Por mucho tiempo, la mayoría de los estudios en este campo se han centrado en personas de ascendencia europea. Este sesgo no solo dificulta el progreso, sino que también complica la aplicación de descubrimientos de salud a grupos diversos. Para abordar esta brecha, se ha iniciado un gran proyecto llamado "All of Us" en los Estados Unidos. Este programa busca reunir datos de salud de una amplia gama de personas, asegurando que todos puedan beneficiarse de lo último en ciencia médica.
¿Qué es el Programa All of Us?
All of Us es un esfuerzo de investigación masivo. Piénsalo como una forma de recopilar historias, pero en lugar de cuentos de aventuras, recolecta información sobre la salud, genética y el entorno de las personas. El objetivo es crear un recurso rico que cubra muchos antecedentes diferentes. Al centrarse en grupos subrepresentados, All of Us espera ayudar a cerrar la brecha en la investigación genómica y garantizar que todos se beneficien de los avances médicos.
Participantes de todo el país se unen, compartiendo sus datos genómicos y de salud. El programa está cuidadosamente planeado, con pautas estrictas para garantizar la seguridad y privacidad de todos los involucrados. Es como un club de salud, pero en lugar de hacer ejercicio, la gente está contribuyendo a la ciencia.
Objetivos del Estudio
El estudio actual busca analizar la composición de la ascendencia genética entre los participantes de All of Us. Se centra en tres objetivos principales:
- Comprobar la Estructura Poblacional: Esto significa averiguar cómo diferentes grupos de personas están relacionados según su genética.
- Caracterizar la Ascendencia Genética: Esto implica ver de dónde vienen los antepasados de los participantes, no solo dónde viven actualmente.
- Rastrear Cambios: Esto examina cómo la ascendencia genética puede variar según dónde se encuentren las personas en EE. UU. y cómo esto cambia con el tiempo.
Así que, si pensabas que tu árbol genealógico era complicado, ¡espera a escuchar sobre la genética!
Participantes y Recolección de Datos
All of Us está interesado en incluir un grupo diverso de participantes. Invitan a adultos de 18 años o más que vivan en EE. UU. a unirse, pero lamentablemente, aquellos menores de 18 o en situaciones vulnerables, como prisioneros, no pueden participar.
Los participantes aceptan compartir sus datos, que incluyen sus registros de salud, encuestas sobre sus vidas e información genética. Esto puede parecer mucho, pero se hace con el máximo respeto por su privacidad y derechos.
Genéticos
Recolectando DatosPara este estudio, los investigadores analizaron la información genética proporcionada por los participantes. Usaron tecnología especial para capturar una amplia gama de marcadores genéticos, como si tomaran una foto de una reunión familiar gigante con un montón de primos que no sabías que existían.
Combinan los datos genéticos de los participantes de All of Us con un conjunto de datos de referencia global para ver cómo se comparan genéticamente con personas de diversos orígenes en todo el mundo. Esto ayuda a pintar un cuadro más claro de quiénes son los participantes a nivel genético.
Entendiendo la Estructura Poblacional
Los investigadores analizaron los datos genéticos para determinar cómo se agrupan los participantes. Descubrieron algo bastante fascinante: las personas a menudo se agrupan según rasgos genéticos compartidos. ¡Es casi como formar un club, pero en lugar de elegir a tus amigos, tu ADN hace la selección!
Usando métodos de análisis sofisticados, los científicos identificaron siete grupos principales. Cada grupo tenía su identidad genética única, que refleja la diversidad que se encuentra entre los participantes de All of Us.
Inferencia de la Ascendencia Genética
A continuación vino la parte emocionante: averiguar de dónde provienen los antepasados de estos participantes. Los investigadores examinaron más de cerca los patrones genéticos para inferir las proporciones de diferentes ascendencias representadas en los participantes.
Por ejemplo, algunos participantes pueden tener una cantidad significativa de ascendencia africana, mientras que otros podrían tener una mezcla que incluya raíces europeas o asiáticas. Los investigadores utilizaron poblaciones de referencia de estudios globales para ayudar a mapear esta ascendencia. Es como armar un rompecabezas con piezas que vienen de todo el mundo.
Patrones Geográficos
Un hallazgo interesante fue cómo la ascendencia genética varía según la geografía. Los investigadores evaluaron cómo se distribuyen las diferentes ascendencias en los Estados Unidos.
Por ejemplo, la ascendencia africana tiende a estar más concentrada en el sureste, mientras que la ascendencia americana a menudo se encuentra en el suroeste. La ascendencia europea, por otro lado, está esparcida casi en todas partes, con cantidades más significativas en los estados del norte.
Para ponerlo simple, si dibujas un mapa de EE. UU. basado en la ascendencia genética, podría parecer un colorido patchwork, con cada bloque representando diferentes antecedentes.
Edad y Diversidad Genética
Otro aspecto fascinante de este estudio es cómo la edad se relaciona con la ascendencia genética. Los investigadores notaron una tendencia: los participantes más jóvenes tienden a tener ascendencia más diversa en comparación con los participantes mayores.
Esto significa que, con el tiempo, nuestros árboles familiares se vuelven más enredados y mezclados. Así que si piensas que tu herencia familiar es complicada, ¡espera hasta la próxima generación!
La Importancia de la Diversidad en la Investigación
El programa All of Us ejemplifica la necesidad de diversidad en la investigación de salud. Con datos únicos de muchos antecedentes, la esperanza es mejorar los resultados de salud y reducir las diferencias en el acceso y tratamiento de atención médica que enfrentan ciertos grupos.
Es como cocinar un guiso: cuantas más variedades de ingredientes tengas, más rica será la sopa. Este enfoque busca crear un futuro sano donde todos se beneficien de los avances en medicina.
Desafíos por Delante
A pesar de las emocionantes perspectivas, hay desafíos que abordar. Los métodos actuales para analizar la ascendencia genética pueden ser lentos, especialmente con la gran cantidad de datos recolectados a través de All of Us.
Para hacer frente a esto, los investigadores han desarrollado herramientas más rápidas como el algoritmo Rye, que acelera el proceso de inferencia de ascendencia. Esto es esencial para asegurarse de que los hallazgos se puedan utilizar de manera eficiente.
Conclusión
El programa All of Us está allanando el camino para un enfoque más inclusivo y representativo en la investigación de salud. A través del análisis de datos genéticos y la comprensión de la ascendencia, los investigadores están descubriendo la riqueza del grupo de participantes, que es única como nunca antes se había visto.
A medida que recopilamos más historias de antecedentes diversos, nos acercamos a un futuro donde la medicina de precisión es accesible para todos, sin importar su origen. Este trabajo no solo se trata de una mejor atención médica; se trata de asegurar que todos tengan un lugar en la mesa, y seamos honestos, ¿quién no querría compartir una pizza mientras habla de genética?
Con cada paso que se da, el programa All of Us está desafiando prejuicios arraigados en la investigación. Nos recuerda que la genética no solo se trata de entendernos a nosotros mismos, sino también de allanar el camino para las generaciones futuras. Al abrazar la diversidad, finalmente podemos trabajar hacia un sistema de salud que realmente sirva a todos.
Título: Genetic ancestry and population structure in the All of Us Research Program cohort
Resumen: The NIH All of Us Research Program (All of Us) aims to build one of the worlds most diverse population biomedical datasets in support of equitable precision medicine. For this study, we analyzed participant genomic variant data to assess the extent of population structure and to characterize patterns of genetic ancestry for the All of Us cohort (n=297,549). Unsupervised clustering of genomic principal component analysis (PCA) data revealed a non-uniform distribution of genetic diversity and substantial population structure in the All of Us cohort, with dense clusters of closely related participants interspersed among less dense regions of genomic PC space. Supervised genetic ancestry inference was performed using genetic similarity between All of Us participants and global reference population samples. Participants show diverse genetic ancestry, with major contributions from European (66.4%), African (19.5%), Asian (7.6%), and American (6.3%) continental ancestry components. Participant genetic similarity clusters show group-specific genetic ancestry patterns, with distinct patterns of continental and subcontinental ancestry among groups. We also explored how genetic ancestry changes over space and time in the United States (US). African and American ancestry are enriched in the southeast and southwest regions of the country, respectively, whereas European ancestry is more evenly distributed across the US. The diversity of All of Us participants genetic ancestry is negatively correlated with age; younger participants show higher levels of genetic admixture compared to older participants. Our results underscore the ancestral genetic diversity of the All of Us cohort, a crucial prerequisite for genomic health equity.
Autores: Shivam Sharma, Shashwat Deepali Nagar, Priscilla Pemu, Stephan Zuchner, Leonardo Mariño-Ramírez, Robert Meller, I. King Jordan
Última actualización: Dec 22, 2024
Idioma: English
Fuente URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.12.21.629909
Fuente PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.12.21.629909.full.pdf
Licencia: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/
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