Variantes CFTR Diversas Encontradas Entre Diferentes Grupos Étnicos
Estudo revela diversidade nas variantes do CFTR que afetam o diagnóstico e tratamento da fibrose cística.
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Índice
- Compreensão Atual das Variantes CFTR
- Desafios no Diagnóstico da FC
- A Importância de Caracterizar as Variantes do CFTR
- Objetivos do Estudo
- População e Métodos do Estudo
- Resultados: Variantes Diversas de CFTR Entre Ancestries
- Relevância Clínica das Variantes Identificadas
- Participantes com Múltiplas Variantes do CFTR
- Resultados de Saúde e Análise Fenotípica
- Estimativa de Idade das Variantes Causadoras de FC
- Implicações para o Diagnóstico e Tratamento da Fibrose Cística
- Conclusão
- Fonte original
- Ligações de referência
A Fibrose Cística (FC) é uma condição genética séria que afeta várias partes do corpo, especialmente os pulmões. É causada por alterações em um gene chamado regulador da condutância transmembrana da fibrose cística (CFTR). Essas mudanças podem resultar em muco grosso e pegajoso nos pulmões e no sistema digestivo, causando uma série de problemas de saúde. Embora existam tratamentos disponíveis que atacam os problemas causados pelas alterações do gene CFTR, eles só são aprovados para algumas formas de mutação desse gene. Mesmo entre aqueles que são elegíveis, as respostas ao tratamento podem variar bastante.
Compreensão Atual das Variantes CFTR
Recentemente, desenvolvimentos em tecnologia genética identificaram muitas alterações genéticas que causam a FC em pessoas de ascendência europeia. No entanto, sabemos muito menos sobre como essas mudanças estão distribuídas entre pessoas de outras origens. Entender os diferentes tipos de variantes do CFTR em várias populações poderia melhorar o Diagnóstico da FC e permitir que mais pessoas tenham acesso a terapias personalizadas.
A pesquisa se concentrou principalmente em pessoas com FC de origens europeias, já que a condição é muito mais comum nesse grupo. As chances de nascer com FC são cerca de 1 em 3.000 para quem é de descendência europeia, mas muito menores em outros grupos étnicos, como 1 em 15.000 para africanos e 1 em 35.000 para asiáticos.
Globalmente, cerca de 100.000 indivíduos são considerados portadores de FC, sendo a mutação mais comum a F508del. No entanto, estudos emergentes sugerem que as variantes do gene CFTR podem diferir significativamente entre as etnias. Algumas variantes, como 3120+1G>A em africanos ou p.G970D em indivíduos chineses, são menos conhecidas, mas potencialmente importantes para entender a FC nesses grupos.
Desafios no Diagnóstico da FC
O diagnóstico da FC geralmente envolve um teste de suor, que mede os níveis de sal no suor, e testes genéticos para variantes do CFTR. Os testes genéticos podem identificar tanto indivíduos sintomáticos quanto aqueles que podem desenvolver sintomas mais tarde. Porém, confiar apenas nos sintomas pode atrasar o diagnóstico, o que pode piorar os resultados de saúde. Diagnosticar cedo permite intervenções no tempo certo, o que é crucial para gerenciar a FC de forma eficaz.
Um problema significativo surge quando indivíduos possuem variantes raras do CFTR que não estão incluídas nos painéis de teste padrão. Isso pode levar a um diagnóstico tardio para essas pessoas e afetar negativamente sua saúde geral.
A Importância de Caracterizar as Variantes do CFTR
Determinar com precisão quais variantes do CFTR são críticas para a saúde pode ser complicado. As variantes podem afetar as pessoas de maneira diferente, mesmo entre aquelas que têm a mesma mudança genética. Esforços para catalogar variantes do CFTR identificaram mais de 2.100 mudanças diferentes. No entanto, mesmo com esse progresso, nem todas as variantes potencialmente prejudiciais são bem compreendidas. Análises abrangentes recentes usando sequenciamento do genoma inteiro revelaram um número muito maior de variantes, destacando a importância de examinar todas as variações potenciais.
Objetivos do Estudo
Neste estudo, os pesquisadores buscaram analisar a variação das variantes do CFTR em diferentes origens étnicas usando dados de um grande banco de dados de saúde da população do Reino Unido. Eles analisaram variantes do CFTR em seis grupos principais: africano, americano, sul-asiático central, leste asiático, europeu e do Oriente Médio, além de um grupo misto.
O estudo também buscou:
- Identificar variantes únicas do CFTR em diferentes ancestrais.
- Estimar a idade das variantes que causam FC.
- Analisar os resultados de saúde de indivíduos portadores de múltiplas variantes do CFTR.
População e Métodos do Estudo
A pesquisa se baseou em dados de mais de 454.000 indivíduos no Biobank do Reino Unido, um banco de dados público que contém informações de saúde e genéticas. O estudo focou em entender a diversidade das variantes do CFTR entre as diferentes origens étnicas e como essas variações afetam a saúde.
A ancestralidade dos participantes foi classificada com base em dois grandes conjuntos de dados de referência. Os pesquisadores documentaram detalhes demográficos, incluindo gênero e idade, além de outras medições de saúde.
Resultados: Variantes Diversas de CFTR Entre Ancestries
O estudo identificou mais de 4.000 variantes do CFTR nos diferentes grupos ancestrais, com mais da metade representando mudanças em regiões não codificantes do gene. A maioria das variantes foi encontrada em europeus, enquanto outros grupos, como a população hispânica/americana mesclada, tinham significativamente menos variantes.
Variantes específicas de ancestralidade também foram identificadas, indicando que certas mudanças genéticas são únicas para populações específicas. O maior número de variantes únicas foi encontrado em europeus, enquanto o menor foi no grupo hispânico/americano mesclado. Notavelmente, cerca de 28% das variantes encontradas no grupo de ancestralidade mista eram únicas para essa população.
Relevância Clínica das Variantes Identificadas
O estudo explorou a distribuição de variantes que causam FC, que variam entre as populações. Uma porcentagem significativa das variantes causadoras de FC foi identificada no grupo europeu em comparação com outros. A variante causadora de FC mais prevalente, a F508del, foi encontrada em todas as populações, mas era particularmente comum entre os europeus. Outras variantes também foram associadas a certos grupos étnicos, mostrando a variação na prevalência das mudanças genéticas relacionadas à FC.
Participantes com Múltiplas Variantes do CFTR
A pesquisa destacou indivíduos com duas variantes causadoras de FC ou aqueles com uma variante causadora de FC e outra variante de significado incerto. Um pequeno número de participantes tinha duas variantes causadoras de FC, com várias combinações ligadas a diferentes resultados. Alguns desses indivíduos apresentaram sintomas clássicos de FC, enquanto outros não, indicando variabilidade na manifestação da doença.
Resultados de Saúde e Análise Fenotípica
O estudo examinou os registros de saúde dos participantes para identificar quaisquer associações entre suas variantes do CFTR e condições de saúde. Alguns participantes com duas variantes causadoras de FC mostraram problemas de saúde relacionados à FC clássica. Uma gama de códigos ICD relacionados a sintomas da FC, como infecções pulmonares, estavam significativamente enriquecidos entre aqueles com mais de uma variante causadora de FC.
Aqueles com variantes de significado incerto também mostraram algumas condições de saúde relacionadas, embora os achados fossem menos claros nesse grupo.
Estimativa de Idade das Variantes Causadoras de FC
Os pesquisadores estimaram as idades de certas variantes causadoras de FC, com algumas originando-se há milhares de anos. Esse contexto histórico pode fornecer uma visão sobre as mudanças genéticas que persistiram ao longo do tempo.
Implicações para o Diagnóstico e Tratamento da Fibrose Cística
Uma das principais conclusões do estudo é a necessidade de entender todo o espectro de variantes do CFTR entre todas as ancestries. Os testes genéticos atuais muitas vezes ignoram variantes que são mais comuns em populações não europeias, o que pode levar a subdiagnóstico ou diagnóstico incorreto da FC.
Identificando e caracterizando mais variantes, especialmente aquelas únicas para certos grupos étnicos, os profissionais de saúde podem aprimorar os painéis de triagem para FC. Isso pode levar a estratégias de tratamento melhores e mais personalizadas para pacientes de origens diversas.
Conclusão
Em conclusão, o estudo ressalta a diversidade das variantes do CFTR presentes em diferentes grupos étnicos. Com mais de 4.000 variantes identificadas, destaca que entender essas variantes é essencial para um diagnóstico preciso e tratamento eficaz da FC.
À medida que bancos de dados genéticos continuam a se expandir, pesquisas futuras se beneficiarão de uma gama mais ampla de dados, permitindo melhores insights sobre a importância clínica dessas mudanças genéticas e, potencialmente, melhores resultados para indivíduos afetados pela FC.
Melhorar o acesso a testes genéticos e terapias direcionadas para populações diversas é crucial para avançar nos cuidados de FC e garantir que todos os indivíduos recebam o melhor tratamento disponível com base em sua única composição genética.
Título: Diversity of CFTR variants across ancestries characterized using 454,727 UK biobank whole exome sequences
Resumo: Limited understanding of the diversity of CFTR variants across ancestries hampers efforts to advance molecular diagnosis of cystic fibrosis (CF). The consequences pose a risk of delayed diagnoses and subsequently worsened health outcomes for patients. Characterizing the distribution of CFTR variants across ancestries is, therefore, critical for revolutionizing molecular diagnoses of CF. By interrogating 454,727 UK biobank whole exome Sequences, we detected over 4,000 CFTR variants, including novel ancestry-specific variants, across six ancestries. F508del was the most prevalent CF-causing variant found across the ancestries, except in East Asia, where V520F was the most prevalent. Sixteen participants had two CF-causing variants, with two diagnosed as CF. We found 154 participants with a CF-causing and varying clinical consequences (VCC) variant. Overall, participants with multiple clinically relevant variants reported indications significantly associated with CF and its pulmonary phenotypes [Bonferroni adjusted p
Autores: Aparna Vasanthakumar, J. E. Ideozu, M. Liu, B. M. Riley-Gillis, S. R. Paladugu, F. Rahimov, P. Krishnan, R. Tripathi, P. Dorr, H. Levy, A. Singh, J. F. Waring
Última atualização: 2023-03-13 00:00:00
Idioma: English
Fonte URL: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2023.03.10.23287070
Fonte PDF: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2023.03.10.23287070.full.pdf
Licença: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
Alterações: Este resumo foi elaborado com a assistência da AI e pode conter imprecisões. Para obter informações exactas, consulte os documentos originais ligados aqui.
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