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O Papel dos Plasmídeos na Resistência a Antibióticos

Plasmídeos são protagonistas na propagação da resistência a antibióticos entre as bactérias.

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Plasmídeos são pedaços pequenos de DNA que conseguem se copiar e vivem em bactérias. Eles são importantes porque podem carregar genes que ajudam as bactérias a sobreviver em condições difíceis, como quando são expostas a antibióticos. Alguns plasmídeos têm genes que fazem as bactérias resistentes a antibióticos, que é um problema crescente na medicina. Quando as bactérias compartilham esses plasmídeos, elas conseguem espalhar a Resistência a Antibióticos rapidinho, tornando as infecções mais difíceis de tratar.

Muita gente fica preocupada com bactérias que conseguem resistir a antibióticos, especialmente em hospitais. Alguns estudos mostram que cepas específicas de bactérias, como E. coli e Klebsiella pneumoniae, causaram doenças sérias por causa da sua capacidade de resistir ao tratamento. Uma forma dessa resistência se espalhar é através dos plasmídeos que carregam vários genes de resistência.

Como os Plasmídeos Funcionam

Os plasmídeos podem se mover de uma bactéria para outra em um processo conhecido como Transferência Horizontal de Genes. Essa habilidade de transferir genes é uma das razões principais para a resistência a antibióticos se espalhar tão rápido entre as bactérias. Alguns plasmídeos conseguem carregar vários genes de resistência, tornando-os especialmente perigosos. Esses são conhecidos como plasmídeos de resistência a múltiplas drogas (MDR).

Os pesquisadores estão tentando entender como os plasmídeos evoluem e mudam. Eles estão particularmente interessados em como diferentes Elementos Genéticos Móveis (MGEs) interagem com os plasmídeos e afetam a propagação da resistência a antibióticos. MGEs incluem coisas como transposons e sequências de inserção, que podem "pular" dentro do DNA e levar genes com eles.

A Estrutura dos Genes de Resistência

Em muitos casos, os genes de resistência estão agrupados em grupos chamados ilhas de resistência nos plasmídeos. Essas ilhas contêm os genes que permitem às bactérias resistir a diferentes tipos de antibióticos. Ao analisar plasmídeos de várias bactérias, os pesquisadores descobriram que a maioria dos genes de resistência a antibióticos está localizada perto de MGEs dentro dessas ilhas.

A organização dos genes de resistência nos plasmídeos sugere que eles não estão colocados aleatoriamente. Em vez disso, eles tendem a estar juntos, o que aumenta as chances de que as bactérias consigam pegar várias características de resistência ao mesmo tempo. Esse agrupamento é importante para entender como essas bactérias resistentes evoluem e se espalham em diferentes ambientes.

Analisando Genes de Resistência em Bactérias

Em um estudo recente de plasmídeos de três gêneros de bactérias-Klebsiella, Escherichia e Salmonella-os pesquisadores analisaram um número enorme de genes codificadores de proteínas para procurar padrões. Eles focaram em genes de resistência a antibióticos e nos elementos genéticos móveis associados a eles. Ao agrupar genes semelhantes, conseguiram identificar 397 genes de resistência diferentes em uma amostra ampla de plasmídeos.

A maioria dos plasmídeos estudados continha múltiplos genes de resistência a antibióticos, e os pesquisadores procuraram associações significativas entre esses genes. Eles descobriram que muitos pares de genes de resistência costumavam aparecer juntos, sugerindo que eles provavelmente são transferidos ao mesmo tempo.

O Papel dos Elementos Genéticos Móveis

Os elementos genéticos móveis desempenham um papel crucial no movimento dos genes de resistência a antibióticos. Eles podem se inserir nos plasmídeos e ajudar a rearranjar o material genético. Neste estudo, os pesquisadores identificaram vários tipos de elementos genéticos, incluindo transposons, que frequentemente apareciam com os genes de resistência.

Alguns transposons eram particularmente comuns e foram encontrados ao lado de muitos genes de resistência a antibióticos. Por exemplo, certos grupos de transposases, que ajudam a mover os genes, foram notados por sua alta frequência em plasmídeos. Isso sugere que esses transposons ajudam as bactérias a se adaptarem às pressões dos antibióticos, facilitando a transferência e organização dos genes de resistência.

Estudando Clusters de Genes e Seus Efeitos

O estudo revelou que os genes de resistência costumam estar densamente empacotados nos plasmídeos, ou seja, eles estão muito próximos uns dos outros. Esse arranjo próximo sugere que, quando um plasmídeo adquire um gene de resistência, é provável que adquira outros, criando um "super-plasmídeo" que pode resistir a múltiplos antibióticos.

Os pesquisadores também olharam para a distância entre os genes de resistência e descobriram que a distância média era muito curta. Isso significa que, em muitos casos, múltiplos genes de resistência estão diretamente um ao lado do outro, o que pode facilitar para as bactérias compartilhar essas características.

A Evolução dos Genes de Resistência ao Longo do Tempo

Para entender como a resistência a antibióticos se desenvolve ao longo do tempo, os pesquisadores criaram uma rede para rastrear como os genes de resistência e os elementos genéticos móveis ocorriam juntos nos plasmídeos. Eles atribuíram datas aos genes com base em quando as amostras foram coletadas e notaram tendências ao longo dos anos.

Curiosamente, os resultados mostraram que muitos dos genes de resistência estavam presentes nas amostras mais antigas, indicando que, uma vez que um gene aparece, ele tem potencial para se espalhar e persistir na população bacteriana. O número de combinações de genes de resistência compartilhados não aumentou rapidamente ao longo do tempo, sugerindo que muitas combinações já estavam estabelecidas no passado.

O Papel Limitado dos Pequenos Plasmídeos

Nem todos os plasmídeos têm a mesma chance de carregar múltiplos genes de resistência a antibióticos. Pequenos plasmídeos, que normalmente têm menos de 19 quilobases de tamanho, carregaram muito poucos genes de resistência. Os pesquisadores mostraram que apenas uma pequena porcentagem desses pequenos plasmídeos continha genes de resistência.

Aqueles que continham frequentemente tinham apenas um gene de resistência, o que indica que pequenos plasmídeos não são veículos eficazes para espalhar múltiplas resistências a antibióticos. Isso é diferente dos plasmídeos maiores, que podem acomodar mais facilmente vários genes de resistência e estão mais frequentemente envolvidos na disseminação da resistência a antibióticos.

A Importância dos Tipos de Plasmídeos

Os pesquisadores classificaram os plasmídeos em grupos com base no conteúdo de genes e na classe de mobilidade. Eles descobriram que tipos específicos de plasmídeos grandes eram muito mais propensos a carregar múltiplos genes de resistência do que outros. Em particular, os plasmídeos conjugativos-aqueles capazes de se transferirem para outras bactérias-frequentemente estavam associados às ilhas de resistência.

No entanto, nem todos os plasmídeos grandes continham ilhas de resistência. Alguns plasmídeos grandes pareciam ser não mobilizáveis e carregavam poucos genes de resistência, enquanto outros foram identificados como tendo uma gama de características de resistência. Essa variação destaca a complexidade da evolução dos plasmídeos e o equilíbrio delicado de fatores que contribuem para a resistência a antibióticos.

Padrões de Compartilhamento de Genes de Resistência

O estudo também explorou os padrões de compartilhamento de genes de resistência e elementos genéticos móveis entre diferentes plasmídeos. Os pesquisadores descobriram que classes específicas de plasmídeos tinham conteúdos gênicos semelhantes e frequentemente compartilhavam ilhas de resistência. Isso sugere que plasmídeos intimamente relacionados podem ter evoluído de ancestrais comuns, carregando conjuntos semelhantes de genes de resistência.

Para ilustrar isso, os pesquisadores examinaram a árvore genética de uma proteína de replicação de plasmídeo específica, a RepB. Eles encontraram grupos distintos de plasmídeos relacionados que compartilhavam tanto o conteúdo gênico quanto as características de resistência.

Conclusão

Em resumo, os plasmídeos são jogadores vitais na propagação da resistência a antibióticos em bactérias. O estudo destaca como esses elementos genéticos podem carregar múltiplos genes de resistência e como interagem com elementos genéticos móveis para facilitar a transferência de genes. Também enfatiza a importância de entender os tipos de plasmídeos envolvidos na resistência a antibióticos, já que nem todos os plasmídeos são iguais na sua capacidade de espalhar essas características.

Analisando os padrões de compartilhamento de genes, os pesquisadores podem entender melhor como a resistência a antibióticos se desenvolve ao longo do tempo e como pode ser controlada. Compreender essa dinâmica é crucial para lidar com a crescente ameaça das infecções resistentes a antibióticos nos cuidados de saúde.

Fonte original

Título: The evolution of antibiotic resistance islands occurs within the framework of plasmid lineages

Resumo: Bacterial pathogens carrying multidrug resistance (MDR) plasmids are a major threat to human health. The acquisition of antibiotic resistance genes (ARGs) in plasmids is often facilitated by mobile genetic elements that copy or translocate ARGs between DNA molecules. The agglomeration of mobile elements in plasmids generates resistance islands comprising multiple ARGs. However, whether the emergence of resistance islands is restricted to specific MDR plasmid lineages remains understudied. Here we show that the agglomeration of ARGs in resistance islands is biased towards specific large plasmid lineages. Analyzing 6,784 plasmids in 2,441 Escherichia, Salmonella, and Klebsiella isolates, we quantify that 84% of the ARGs in MDR plasmids are found in resistance islands. We furthermore observe rapid evolution of ARG combinations in resistance islands. Most regions identified as resistance islands are shared among closely related plasmids but rarely among distantly related plasmids. Our results suggest the presence of barriers for the dissemination of ARGs between plasmid lineages, which are related to plasmid genetic properties, host range and the plasmid evolutionary history. The agglomeration of ARGs in plasmids is attributed to the workings of mobile genetic elements that operate within the framework of existing plasmid lineages.

Autores: Tal Dagan, Y. Wang

Última atualização: 2024-02-21 00:00:00

Idioma: English

Fonte URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.02.20.581145

Fonte PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.02.20.581145.full.pdf

Licença: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/

Alterações: Este resumo foi elaborado com a assistência da AI e pode conter imprecisões. Para obter informações exactas, consulte os documentos originais ligados aqui.

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