A Evolução das Plantas Terrestres e das Algas Verdes
Um olhar sobre como as plantas terrestres evoluíram a partir das algas verdes e seu impacto.
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Índice
- O Papel das Embriófitas
- A Evolução das Algas Verdes
- Explorando os Charófitos e Sua Importância
- Novos Dados e Descobertas
- Métodos de Pesquisa em Filogenética
- Padrões em Aminoácidos e Códons
- O Papel de Domínios de Proteínas e Famílias de Genes
- Compreendendo Famílias de Genes
- Insight Filogenético a partir da Análise de Conjuntos de Dados
- Conclusão
- Fonte original
Há cerca de 500 milhões de anos, as plantas terrestres começaram a crescer na Terra. Esse foi um momento chave para a vida como conhecemos. Essas plantas, conhecidas como Embriófitas, se tornaram a base de vários ecossistemas. Elas mudaram o planeta de muitas maneiras, incluindo aumentar a quantidade de carbono que fica no solo e aumentar os níveis de oxigênio no ar. Isso também alterou os processos de água e solo e até afetou a química dos oceanos.
O Papel das Embriófitas
As embriófitas são essenciais para nossa alimentação e tiveram um papel importante no desenvolvimento humano. Elas fornecem colheitas e muitos outros produtos que são vitais para o comércio e a medicina. O grupo de plantas que chamamos de embriófitas faz parte de uma família maior de organismos conhecida como algas verdes. Dentro das algas verdes, existem diferentes ramos, um dos quais inclui as embriófitas.
A Evolução das Algas Verdes
As algas verdes, junto com as embriófitas, se encaixam em duas categorias principais. A primeira categoria é a Streptophyta, que inclui as embriófitas e seus parentes, enquanto a segunda categoria é a Chlorophyta. A Chlorophyta consiste principalmente de algas verdes encontradas em oceanos, lagos e até mesmo em terra em alguns casos. Com o tempo, várias algas verdes se adaptaram a viver na terra, levando à evolução de diferentes espécies.
Explorando os Charófitos e Sua Importância
Na busca para entender como as plantas terrestres evoluíram, os cientistas focam nos charófitos, que são um tipo específico de alga verde. Existem três grupos principais de charófitos: Charophyceae, Coleochaetophyceae e Zygnematophyceae. Esses grupos têm características distintas, como serem multicelulares e se reproduzirem sexualmente.
Os cientistas debateram por muito tempo qual grupo de charófitos está mais intimamente relacionado às embriófitas. Estudos recentes usaram técnicas avançadas para analisar as relações entre esses grupos. Embora vários estudos tenham apoiado cada um dos três grupos como parentes das embriófitas, há evidências crescentes de que o Zygnematophyceae é o mais próximo.
Novos Dados e Descobertas
Avanços recentes em tecnologia permitiram que pesquisadores sequenciassem os genomas de várias algas verdes. Isso fornece mais dados para estudar as relações evolutivas entre esses organismos. Ao olhar para grandes conjuntos de dados, os cientistas podem analisar vários genes e como eles se relacionam com diferentes grupos de plantas.
Dados de alta qualidade levaram a análises Filogenéticas melhores, que ajudam a reconstruir como esses organismos estão relacionados. Usando dados de centenas de genes, os pesquisadores podem obter insights mais profundos sobre como os charófitos e embriófitas fizeram a transição para a terra.
Métodos de Pesquisa em Filogenética
Para estudar essas relações, os cientistas primeiro coletam dados de várias espécies de algas verdes. Eles sequenciam o RNA e, em seguida, filtram e organizam os dados para criar um conjunto de dados abrangente. Os pesquisadores identificam genes ortólogos, que são genes que evoluíram de um ancestral comum, e os analisam para entender como estão distribuídos entre diferentes espécies.
Em seguida, eles alinham esses genes e criam uma árvore filogenética que mostra como os diferentes grupos estão relacionados. Ferramentas de software avançadas ajudam na construção das árvores com base nos dados, permitindo que os pesquisadores visualizem as relações de forma clara.
Padrões em Aminoácidos e Códons
Outro aspecto dessa pesquisa é entender os padrões de aminoácidos e uso de códons entre diferentes grupos. Aminoácidos são os blocos de construção das proteínas, e códons são sequências no código genético que correspondem a aminoácidos específicos. Ao analisar esses padrões, os cientistas podem obter insights sobre a história evolutiva desses organismos.
Os estudos mostram que o uso de aminoácidos e códons varia dentro dos grupos de cloroplastos. Por exemplo, alguns charófitos têm padrões de uso de códons semelhantes aos das plantas terrestres, indicando uma relação próxima. Essas análises também destacam que certas características podem ter evoluído em ambientes específicos, influenciando como esses organismos se adaptaram à terra.
O Papel de Domínios de Proteínas e Famílias de Genes
A pesquisa também se concentra em domínios de proteínas específicos e famílias de genes que são importantes para o crescimento e sobrevivência das plantas terrestres. Os domínios de proteínas são regiões funcionais dentro das proteínas que desempenham papéis cruciais em várias vias biológicas. Ao examinar esses domínios entre diferentes grupos de algas, os pesquisadores podem rastrear a história evolutiva de características-chave nas plantas terrestres.
Por exemplo, estudos olharam para genes envolvidos na via de sinalização do etileno, que é importante para o crescimento das plantas e resposta ao estresse. Alguns desses genes parecem ter evoluído nos charófitos antes da transição para a terra, sugerindo que eles ajudaram as plantas primitivas a sobreviver em habitats terrestres.
Compreendendo Famílias de Genes
Além de domínios de proteínas, os cientistas estudaram famílias de genes específicas que têm papéis vitais na função das plantas. Essas famílias de genes estão envolvidas em processos como transporte de íons, que é crítico para a absorção de nutrientes e a saúde geral da planta. A distribuição desses genes entre diferentes grupos de algas verdes oferece mais insights sobre como as plantas se adaptaram a ambientes terrestres ao longo do tempo.
Por exemplo, certas famílias de genes estão presentes em charófitos, mas ausentes em outras algas verdes, indicando adaptações únicas. A presença desses genes nas embriófitas sugere que elas podem tê-los herdado de seus parentes charófitos.
Insight Filogenético a partir da Análise de Conjuntos de Dados
Ao analisar um grande conjunto de dados com mais de 60 espécies de Chloroplastida, os pesquisadores podem reconstruir uma filogenia que apoia a ideia de que o Zygnematophyceae são os parentes mais próximos das plantas terrestres. Essas descobertas reforçam nossa compreensão de como as plantas terrestres evoluíram e se adaptaram à vida na terra.
A pesquisa destaca tanto a diversidade das algas verdes quanto a importância de estudar espécies menos conhecidas. A análise desses organismos lança luz sobre a complexa história da evolução das plantas e as características que lhes permitiram prosperar em vários ambientes.
Conclusão
O surgimento das plantas terrestres marcou um capítulo significativo na história da vida na Terra. Através de estudos detalhados sobre os charófitos e sua relação com as embriófitas, os cientistas estão montando o quebra-cabeça da evolução das plantas. Combinando dados genômicos, análises filogenéticas e estudos de domínios de proteínas e famílias de genes, os pesquisadores estão obtendo insights valiosos sobre como as plantas se adaptaram à terra e como moldaram o mundo como o conhecemos hoje. Entender essas conexões é essencial para apreciar o papel das plantas em nossos ecossistemas e sua importância na sociedade humana.
Título: Investigating the Evolution of Green Algae with a Large Transcriptomic Dataset
Resumo: The colonization of land by plants, thought to have occurred approximately 450-500 million years ago (Ma) is one of the most important events in the history of life on Earth. Land plants, hereafter referred to as "embryophytes," comprise the foundation of every terrestrial biome, making them an essential lineage for the origin and maintenance of biodiversity. The embryophytes form a monophyletic clade within one of the two major phyla of the green algae, the Streptophyta. Estimates from fossil data and molecular clock analyses suggest the charophytes diverged from the other main phylum of green algae, the Chlorophyta, as much as 1500 Ma. Here we present a phylogenetic analysis using transcriptomic and genomic data of 62 green algae and embryophyte operational taxonomic units, 31 of which were assembled de novo for this project. We focus on identifying the charophyte lineage that is sister to embryophytes, and show that the Zygnematophyceae have the strongest support, followed by the Charophyceae. We demonstrate that this phylogenetic tree topology is robust across different phylogenetic models and methods. Furthermore, we examine amino acid and codon usage across the tree and find these data broadly follow the phylogenetic tree. We conclude by searching the dataset for several protein domains and gene families known to be important in embryophytes, including the ethylene signaling pathway and various ion transporters. Many of these domains and genes have homologous sequences in the charophyte lineages, giving insight into the processes that underlay the colonization of the land by plants.
Autores: David A Ferranti, C. F. Delwiche
Última atualização: 2024-02-22 00:00:00
Idioma: English
Fonte URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.02.21.581324
Fonte PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.02.21.581324.full.pdf
Licença: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
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