Simple Science

Ciência de ponta explicada de forma simples

# Biologia# Microbiologia

Rizóbios: Parceiros Essenciais na Agricultura

Explore o papel dos rizóbios na fixação de nitrogênio nas plantas e na agricultura sustentável.

― 8 min ler


Rizóbios e Fixaçao deRizóbios e Fixaçao deNitrogênioplantas.sustentável e o crescimento dasBactérias chave para uma agricultura
Índice

Rhizobia são um tipo de bactéria que têm uma relação especial com plantas leguminosas, como feijões e ervilhas. Elas pertencem a dois grupos principais chamados Alphaproteobacteria e Betaproteobacteria. Essas bactérias vivem nas raízes dessas plantas, formando estruturas conhecidas como nódulos radiculares. Dentro desses nódulos, os rhizobia convertem gás nitrogênio do ar em uma forma que as plantas conseguem usar, chamada amônio. Esse processo é conhecido como fixação simbiônica de nitrogênio. Em troca, as plantas fornecem carbono para os rhizobia, que elas produzem através da fotossíntese. Essa parceria permite que as plantas se desenvolvam em ambientes onde o nitrogênio é escasso.

Importância na Agricultura

O nitrogênio é essencial para o crescimento das plantas, e muitos agricultores usam fertilizantes nitrogenados para melhorar suas colheitas. No entanto, esses fertilizantes podem ser caros e contribuem para emissões de gases do efeito estufa. Como os rhizobia conseguem fixar nitrogênio de forma natural, eles são frequentemente usados na agricultura como uma alternativa mais sustentável aos fertilizantes químicos.

Como os Rhizobia Funcionam?

Quando os rhizobia entram nos nódulos radiculares das plantas leguminosas, eles passam por mudanças significativas para desempenharem suas funções de forma eficaz. Esse processo é chamado de diferenciação terminal de bacteroides. Durante essa fase, as bactérias crescem mais, copiam seu DNA e alteram seu comportamento dentro da planta. Essa transformação é essencial para a fixação do nitrogênio e é influenciada por proteínas específicas da planta conhecidas como peptídeos ricos em cisteína específicos de nódulo (NCR). Esses peptídeos ajudam a regular o crescimento e a função das bactérias dentro dos nódulos.

Papel dos Peptídeos NCR

Os peptídeos NCR desempenham um papel crítico na relação entre rhizobia e plantas. Eles são produzidos pelas plantas e acredita-se que interagem com as bactérias de várias maneiras. Primeiro, eles ajudam as bactérias a crescer e se desenvolver corretamente dentro dos nódulos. Em segundo lugar, eles podem proteger as bactérias das defesas das plantas, especialmente suas propriedades antimicrobianas. Fazendo isso, a planta garante que as bactérias consigam fixar nitrogênio de forma eficaz e continuar a relação simbiótica.

O Mecanismo de Transporte

Para os rhizobia funcionarem direito, eles precisam absorver esses peptídeos NCR. Eles fazem isso usando proteínas de transporte específicas conhecidas como BacA e BclA. Essas proteínas atuam como portões, permitindo que os peptídeos entrem nas células bacterianas. Tanto BacA quanto BclA são encontrados em rhizobia que têm uma relação simbiótica com leguminosas, mas não estão sempre na mesma espécie. BacA usa a força proton-motiva para funcionar, enquanto BclA utiliza energia do ATP, um tipo de combustível da célula.

Quando os rhizobia perdem essas proteínas de transporte, eles se tornam muito sensíveis aos peptídeos NCR. Sem a capacidade de transportar esses peptídeos, as bactérias não conseguem sobreviver nos nódulos da planta, resultando em falha na fixação do nitrogênio. No entanto, alguns tipos de rhizobia que não interagem com os peptídeos NCR não precisam de BacA ou BclA para suas relações simbiôticas.

Por que BacA e BclA São Importantes?

As proteínas BacA e BclA são vitais para o sucesso da simbiose entre rhizobia e leguminosas. Elas ajudam a mover os peptídeos NCR para dentro das bactérias, auxiliando seu crescimento e função. Sem essas proteínas, as bactérias não conseguem prosperar nas condições difíceis criadas pelas defesas da planta, afetando sua capacidade de fixar nitrogênio.

Enquanto muitas bactérias têm as proteínas BacA e BclA, elas não são todas iguais. Diferentes bactérias podem usar essas proteínas de maneiras um pouco distintas. Alguns estudos mostraram que, embora BacA e BclA tenham funções semelhantes, elas podem não funcionar sempre de forma intercambiável.

Distribuição Entre Bactérias

Pesquisas revelaram que as proteínas BacA e BclA podem ser encontradas em vários tipos de bactérias, incluindo algumas que causam doenças em plantas e animais. Por exemplo, proteínas semelhantes foram encontradas em bactérias como E. coli e Mycobacterium tuberculosis. Nessas bactérias patogênicas, BacA e BclA também ajudam a proporcionar resistência contra as defesas antimicrobianas de seus hospedeiros.

Evolução de BacA e BclA

A presença das proteínas BacA e BclA em diversas espécies bacterianas sugere que elas podem ter evoluído originalmente para ajudar as bactérias a lidarem com peptídeos antimicrobianos. Essas proteínas podem ter sido adaptadas para usos diferentes em relações simbióticas e patogênicas ao longo do tempo. No entanto, nenhum estudo detalhado foi feito para rastrear seus caminhos evolutivos exatos.

Identificação das Proteínas BacA e BclA

Em um estudo recente, cientistas exploraram a distribuição das proteínas BacA e BclA em 1.255 espécies bacterianas. Eles descobriram que as proteínas BacA eram principalmente encontradas no grupo de bactérias conhecidas como Pseudomonadales, enquanto as proteínas BclA apareciam em vários grupos diferentes, incluindo Actinomycetota e Bacillota. Isso sugere que, embora ambas as proteínas possam desempenhar funções semelhantes, elas seguiram caminhos evolutivos diferentes.

Análise Filogenética

Uma análise detalhada dos genomas bacterianos confirmou que as proteínas BacA e BclA formam grupos distintos, indicando que evoluíram separadamente. Ao examinar uma variedade de genomas bacterianos, os pesquisadores criaram uma filogenia de máxima verossimilhança, um tipo de árvore evolutiva que ajuda a visualizar como diferentes proteínas estão relacionadas.

Estudos Funcionais de BacA e BclA

Para entender melhor como as proteínas BacA e BclA funcionam, os cientistas sintetizaram diferentes genes que codificam essas proteínas. Eles testaram essas proteínas em bactérias para ver se podiam restaurar certas qualidades de resistência. Por exemplo, experimentos de substituição de genes mostraram que algumas proteínas BclA recém-identificadas podiam ajudar as bactérias a resistirem à gentamicina, um antibiótico, de forma semelhante às proteínas BclA conhecidas.

Além disso, a capacidade dessas proteínas de transportar peptídeos NCR também foi avaliada. Muitas das proteínas BclA recém-identificadas complementaram com sucesso as cepas mutantes de bactérias que eram sensíveis aos peptídeos NCR, demonstrando suas semelhanças funcionais com as proteínas BclA existentes.

Teste de Simbiose

Os pesquisadores também testaram se alguma das proteínas recém-identificadas poderia ajudar os rhizobia na fixação do nitrogênio. A capacidade dos rhizobia de formar nódulos em plantas leguminosas foi um fator importante nessa análise. A maioria das proteínas recém-sintetizadas não conseguiu restaurar as habilidades de fixação do nitrogênio em cepas mutantes, indicando um papel específico para as conhecidas proteínas BacA e BclA nesse processo.

A Visão Geral

As descobertas sobre as proteínas BacA e BclA enfatizam seus papéis importantes em bactérias benéficas e prejudiciais. Essas proteínas não apenas ajudam os organismos a sobreviver em ambientes hostis, mas também permitem que prosperem em relações simbióticas com plantas. As interações entre rhizobia e seus parceiros leguminosos ilustram as complexas relações que existem na natureza, onde ambos os organismos se beneficiam das funções um do outro.

A pesquisa destaca a necessidade de estudos mais aprofundados para entender completamente como bactérias como os rhizobia se adaptam e evoluem em resposta a seus ambientes. Trabalhos futuros podem revelar novas ideias sobre os mecanismos de sobrevivência bacteriana e interações com plantas, contribuindo, em última instância, para práticas agrícolas mais sustentáveis.

Conclusão

Os rhizobia desempenham um papel crucial em permitir que plantas leguminosas acessem o nitrogênio através de suas relações simbióticas especiais. Ao entender os mecanismos envolvidos, incluindo os papéis das proteínas BacA e BclA, os cientistas podem explorar oportunidades para práticas agrícolas mais sustentáveis. Com esse conhecimento, a agricultura pode se tornar menos dependente de fertilizantes químicos, tornando-se mais amiga do meio ambiente, enquanto ainda garante colheitas saudáveis. A história evolutiva e a distribuição dessas proteínas revelam uma história fascinante sobre a interconexão das formas de vida, com benefícios mútuos promovendo o crescimento e a sobrevivência em contextos diversos.

Fonte original

Título: Taxonomic distribution of SbmA/BacA and BacA-like antimicrobial peptide transporters suggests independent recruitment and convergent evolution in host-microbe interactions

Resumo: Small, antimicrobial peptides are often produced by eukaryotes to control bacterial populations in both pathogenic and mutualistic symbioses. These include proline-rich mammalian immune peptides and cysteine-rich peptides produced by legume plants in symbiosis with rhizobia. The fitness of the bacterial partner is dependent upon their ability to persist in the presence of these antimicrobial peptides. In the case of Escherichia coli and Mycobacterium tuberculosis pathogens and nitrogen-fixing legume symbionts (rhizobia), the ability to survive exposure to these peptides depends on peptide transporters called SbmA (also known as BacA) or BclA (for BacA-like). However, how broadly these transporters are distributed amongst bacteria, and their evolutionary history, is poorly understood. Here, we used hidden Markov models, phylogenetic analysis, and sequence similarity networks to examine the distribution of SbmA/BacA and BclA proteins across a representative set of 1,255 species from across the domain Bacteria. We identified a total of 71 and 177 SbmA/BacA and BclA proteins, respectively. Phylogenetic and sequence similarity analyses suggest that these protein families likely did not evolve from a common ancestor and that their functional similarity is instead a result of convergent evolution. In vitro sensitivity assays using the legume peptide NCR247 and several of the newly-identified BclA proteins confirmed that transport of antimicrobial peptides is a common feature of this protein family. Analysis of the taxonomic distribution of these proteins showed that SbmA/BacA orthologs were encoded only by species in the phylum Pseudomonadota and that they were primarily identified in just two orders: Hyphomicrobiales (class Alphaproteobacteria) and Enterobacterales (class Gammaproteobacteria). BclA orthologs were somewhat more broadly distributed and were found in clusters across four phyla. These included several orders of the phyla Pseudomonadota and Cyanobacteriota, as well as the order Mycobacteriales (phylum Actinomycetota) and the class Negativicutes (phylum Bacillota). Notably, many of the clades enriched for species encoding BacA or BclA orthologs also include many species known to interact with eukaryotic hosts in mutualistic or pathogenic interactions. Collectively, these observations suggest that SbmA/BacA and BclA proteins have been repeatedly co-opted to facilitate both mutualistic and pathogenic associations with eukaryotic hosts by allowing bacteria to cope with host-encoded antimicrobial peptides.

Autores: George C diCenzo, N. T. Smith, A. Boukherissa, K. Antaya, G. W. Howe, R. C. Rodriguez de la Vega, J. A. Shykoff, B. Alunni

Última atualização: 2024-02-25 00:00:00

Idioma: English

Fonte URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.02.25.581009

Fonte PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.02.25.581009.full.pdf

Licença: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

Alterações: Este resumo foi elaborado com a assistência da AI e pode conter imprecisões. Para obter informações exactas, consulte os documentos originais ligados aqui.

Obrigado ao biorxiv pela utilização da sua interoperabilidade de acesso aberto.

Artigos semelhantes