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Sistemas de Defesa Bacteriana Contra Fagos em Serratia

As bactérias Serratia mostram estratégias únicas pra se defender contra infecções virais.

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As bactérias enfrentam uma ameaça constante de vírus conhecidos como bacteriófagos ou fags. Para se proteger, as bactérias desenvolveram vários sistemas para lutar contra esses vírus. Pesquisas recentes descobriram várias maneiras diferentes de como as bactérias podem se defender dos fags, com alguns desses sistemas mostrando semelhanças com as respostas imunes encontradas em organismos mais complexos, como os humanos. Este artigo explora os sistemas de defesa encontrados em um grupo específico de bactérias chamado Serratia, focando em como elas se protegem de ataques de fags.

Sistemas Anti-Fags

As bactérias evoluíram vários mecanismos de defesa contra seus predadores virais. Esses sistemas são conhecidos como sistemas anti-fags. Descobertas recentes mostraram uma vasta gama desses sistemas com maneiras únicas de impedir que os fags infectem e prejudique as bactérias. Alguns desses sistemas usam proteínas que são semelhantes a componentes encontrados nos sistemas imunes de organismos superiores.

Um exemplo é um componente conhecido como domínio Toll/IL-1 receptor (TIR). Em alguns sistemas de defesa, esse domínio está envolvido na sinalização que ajuda as bactérias a responderem à infecção por fags. Em um sistema chamado Thoeris, o domínio TIR é usado para produzir uma molécula de sinalização que ajuda as bactérias a gerenciar sua resposta à infecção. Outros sistemas usam o domínio TIR para quebrar componentes celulares essenciais, assim prejudicando a capacidade do fag de infectar e se replicar dentro das bactérias.

Outro sistema de defesa, conhecido como sistema Bil, mostra como as respostas imunes bacterianas podem evoluir. Esse sistema marca os fags com uma proteína pequena chamada ubiquitina após eles infectarem uma célula bacteriana. Essa marcação dificulta a propagação do fag e a infecção de mais bactérias.

Ilhas de Defesa Genômica

Pesquisadores descobriram que muitos desses sistemas anti-fags tendem a se agrupar em locais específicos dentro dos genomas bacterianos, frequentemente chamados de "ilhas de defesa". Estudar essas ilhas ajuda os cientistas a descobrir novos tipos de sistemas de defesa. Observou-se que essas ilhas também podem carregar outras características importantes para as bactérias, como resistência a antibióticos e fatores de virulência (que ajudam as bactérias a causar doenças).

As bactérias Serratia, particularmente a Serratia marcescens, têm sido foco para estudar essas ilhas de defesa. Ao examinar os genomas de várias cepas de S. marcescens, os cientistas identificaram várias áreas onde diferentes sistemas anti-fags estão agrupados.

A Importância das Ilhas de Defesa

Em Serratia, os pesquisadores descobriram três principais pontos quentes de defesa. Cada uma dessas áreas contém uma mistura de sistemas anti-fags e outros fatores que podem impactar a capacidade de sobrevivência e crescimento das bactérias. Um dos pontos quentes, chamado LptG-YjiA, mostrou a maior variabilidade nos tipos de sistemas anti-fags presentes. Os pesquisadores encontraram sistemas anti-fags previamente desconhecidos nessa região, que chamaram de Candidatos a Ilhas de Defesa Serratia (SDIC1-4).

Esses sistemas são notáveis porque revelam como as bactérias podem adaptar suas defesas contra fags. Por exemplo, um dos sistemas, SDIC1, inclui um domínio semelhante ao TIR e uma proteína que se assemelha a uma ligase de ubiquitina. Embora o SDIC1 seja eficaz em proteger as bactérias da infecção por fags, também é necessário que os outros componentes funcionem corretamente sem causar danos às células bacterianas.

Investigando Pontos Quentes de Defesa em Serratia

Para estudar os sistemas de defesa em Serratia de maneira mais próxima, os pesquisadores examinaram uma coleção de isolados clínicos de S. marcescens. A análise mostrou que essa bactéria contém uma variedade surpreendente de sistemas anti-fags conhecidos, indicando uma robusta capacidade de defesa contra ameaças virais.

O estudo das ilhas de defesa de Serratia mostrou que elas frequentemente contêm múltiplos sistemas anti-fags, cada um com um propósito específico. No caso dos pontos quentes identificados, os pesquisadores analisaram de perto sua estrutura genômica e as proteínas codificadas dentro delas. Eles observaram que cada ilha carregava combinações únicas de sistemas anti-fags, que variavam até mesmo entre bactérias intimamente relacionadas.

Identificação de Sistemas Anti-Fags Únicos

Ao analisar o conteúdo genético da ilha de defesa LptG-YjiA, os pesquisadores começaram a identificar sistemas anti-fags únicos. Eles encontraram quatro novos sistemas candidatos, SDIC1-4, cada um com componentes distintos que fornecem proteção contra fags.

Dentre eles, o SDIC1 foi particularmente intrigante. Ele consiste em duas partes: uma que provavelmente interrompe a infecção por fags e outra que ajuda a reduzir a toxicidade potencial causada por essa ação protetora. Esse papel duplo mostra como os sistemas de defesa bacterianos não apenas combatem os fags, mas também podem equilibrar a saúde interna das bactérias.

O Papel das Proteínas Semelhantes a VasI

Mais investigações levaram os pesquisadores a uma proteína chamada VasI, que parece desempenhar um papel nos mecanismos de defesa de Serratia. Proteínas semelhantes foram encontradas em muitas espécies bacterianas diferentes, sugerindo que são componentes amplamente compartilhados dos sistemas de defesa bacterianos.

Em particular, os pesquisadores descobriram que as proteínas semelhantes a VasI em Serratia correlacionam-se com os sistemas SDIC4, que também protegem contra infecções por fags. Essa relação destaca como certas proteínas podem ser reaproveitadas em várias espécies para funções de defesa semelhantes.

Plasticidade dos Sistemas de Defesa

Outra descoberta da pesquisa é a natureza plástica dos sistemas de defesa bacterianos. Mesmo que alguns sistemas tenham sido caracterizados, o alto nível de variabilidade no material genético que envolve esses sistemas indica que as bactérias podem misturar e combinar diferentes componentes para criar novos sistemas funcionais. Essa adaptabilidade ajuda as bactérias a se manterem um passo à frente dos fags em evolução.

Através de análises genômicas detalhadas, os cientistas descobriram que alguns genes associados a sistemas de defesa frequentemente apareciam ao lado de outras características, como resistência a antibióticos. Esse agrupamento sugere que os mecanismos que as bactérias usam para lidar com fags também podem envolver suas estratégias gerais de sobrevivência contra outras ameaças, como antibióticos.

Conclusão

O estudo dos sistemas de defesa bacterianos, particularmente em Serratia, revela um panorama complexo e dinâmico de interações entre bactérias e seus inimigos virais. Ao desvendar os detalhes desses sistemas anti-fags, os pesquisadores não só estão iluminando a corrida armamentista entre bactérias e fags, mas também aumentando nossa compreensão das estratégias de sobrevivência bacteriana em um mundo cheio de desafios.

À medida que a ciência continua a explorar essas interações, podemos descobrir ainda mais sobre como as bactérias se adaptam e prosperam. Essa pesquisa tem o potencial de novas descobertas que poderiam impactar a medicina, especialmente na compreensão das infecções causadas por patógenos oportunistas como S. marcescens. Os insights obtidos a partir dos mecanismos de defesa bacterianos podem, eventualmente, levar a novos tratamentos e estratégias para combater infecções bacterianas e resistência.

Fonte original

Título: Multi-conflict islands are a widespread trend within Serratia spp

Resumo: Bacteria carry numerous anti-phage systems in defence islands or hotspots. Recent studies have delineated the content and boundaries of these islands in various species, revealing instances of islands that encode additional factors, including antibiotic resistance, stress genes, Type VI Secretion System (T6SS)-dependent effectors, and virulence factors. Our study identifies three defence islands in the Serratia genus with a mixed cargo of anti-phage systems, virulence factors and different types of anti-bacterial modules, revealing a widespread trend of co-accumulation that extends beyond T6SS-dependent effectors to colicins and contact-dependent inhibition systems. We report the identification of four distinct anti-phage system/subtypes, including a previously unreported Toll/IL-1 receptor (TIR)-domain-containing system with population-wide immunity, and two loci co-opting a predicted T6SS-related protein for phage defence. This study enhances our understanding of the protein domains that can be co-opted for phage defence and of the diverse combinations in which known anti-phage proteins can be assembled, resulting in a highly diversified anti-phage arsenal.

Autores: Giuseppina Mariano, T. Cummins, S. R. Garrett, T. R. Blower

Última atualização: 2024-03-06 00:00:00

Idioma: English

Fonte URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.01.28.577318

Fonte PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.01.28.577318.full.pdf

Licença: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

Alterações: Este resumo foi elaborado com a assistência da AI e pode conter imprecisões. Para obter informações exactas, consulte os documentos originais ligados aqui.

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