O impacto do PITAR na progressão do glioblastoma
Pesquisas mostram como o PITAR influencia o glioblastoma ao inibir o p53.
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Índice
Por muito tempo, partes do nosso DNA eram consideradas inúteis, muitas vezes chamadas de "DNA lixo." No entanto, pesquisas mostraram que muitos desses segmentos são, na verdade, importantes e se transformam em RNAs longos não codificantes (LncRNAs). Esses lncRNAs desempenham papéis críticos em vários processos biológicos e estão ligados a doenças, incluindo câncer.
Os lncRNAs têm mais de 500 pares de bases e possuem características específicas que os tornam únicos. Eles podem interagir com DNA, RNA e proteínas de diferentes formas, influenciando o comportamento e as funções das células. Eles ajudam a modificar a estrutura da cromatina, que é o material que compõe os cromossomos, e gerenciam a atividade de certas estruturas celulares que não têm membranas. Além disso, eles afetam a estabilidade e a tradução dos RNAs mensageiros (mRNAs) e podem interromper vias de sinalização dentro das células.
O Papel do P53 na Regulação Celular
Uma proteína chave que é essencial para manter a integridade do nosso material genético é chamada de p53. Essa proteína é frequentemente conhecida como "guardião do genoma" porque ajuda a prevenir que as células se tornem cancerosas. Quando há estresse, como danos ao DNA, o p53 é ativado e começa a trabalhar ativando vários genes que controlam processos importantes, como o ciclo celular, a morte celular programada (apoptose) e o envelhecimento (senescência).
Em muitos cânceres, o p53 é mutado, o que significa que não pode desempenhar suas funções protetivas de forma eficaz. Mesmo em cânceres onde o p53 não é mutado, outros fatores podem inativá-lo. Entender como o p53 funciona e como sua atividade é regulada é importante para desenvolver novos tratamentos para o câncer.
LncRNAs e Sua Interação com o p53
Pesquisas mostraram que certos lncRNAs têm relações significativas com a via do p53. Alguns lncRNAs atuam como ajudantes ou ativadores do p53, enquanto outros podem inibir suas funções. No nosso estudo, descobrimos um lncRNA específico chamado PITAR (p53 Inactivating TRIM28 associated RNA) que inibe o p53 e está ligado ao crescimento tumoral.
O PITAR é fortemente expresso em Glioblastoma, um tipo de câncer no cérebro, e interage com TRIM28, uma proteína que regula negativamente o p53. Normalmente, o TRIM28 promove a degradação do p53 por meio de processos como a ubiquitinação, que marca proteínas para destruição. Ao estabilizar o TRIM28, o PITAR aumenta os níveis dessa proteína, levando a uma degradação maior do p53.
Objetivos e Descobertas do Estudo
O principal objetivo da nossa pesquisa foi entender como o PITAR afeta o glioblastoma e obter insights sobre seu potencial como alvo terapêutico. Através dos nossos estudos, identificamos alguns pontos-chave:
Expressão do PITAR em Glioblastoma: Descobrimos que o PITAR é significativamente regulado positivamente em tecidos de glioblastoma e em células-tronco semelhantes a glioma, que muitas vezes são resistentes a terapias.
Efeitos do Silenciamento do PITAR: Quando reduzimos os níveis de PITAR em células de glioma, notamos uma diminuição na proliferação celular e um aumento na morte celular cancerosa. Isso sugere que o PITAR promove o crescimento tumoral e é essencial para a sobrevivência das células de glioma.
Interação com TRIM28: Descobrimos que o PITAR se liga diretamente ao mRNA do TRIM28, levando a uma maior estabilidade do TRIM28 e a níveis aumentados dessa proteína.
Impacto nos Níveis de p53: Ao regular positivamente o TRIM28, o PITAR também resultou em níveis mais baixos de p53 ativo, mostrando que o PITAR inibe as funções do p53.
Resposta ao Dano no DNA: Curiosamente, os níveis de PITAR aumentaram em resposta ao dano no DNA, mas esse aumento aconteceu de uma forma independente do p53. Isso significa que mesmo quando o DNA está danificado, a ação do PITAR pode impedir que o p53 responda efetivamente, promovendo o crescimento tumoral e levando à resistência a tratamentos como a quimioterapia.
Métodos Experimentais
Realizamos uma série de experimentos para validar nossas descobertas e explicar o papel do PITAR no glioblastoma. Aqui estão alguns métodos-chave que usamos:
Estudos de Linhas Celulares
Utilizamos várias linhas celulares de glioma para investigar a expressão do PITAR e seus efeitos no comportamento celular. Ao silenciar o PITAR, conseguimos avaliar o impacto no crescimento celular, na sobrevivência e na resposta a agentes que danificam o DNA, como drogas de quimioterapia.
Sequenciamento de RNA e Análise Genética
Usando técnicas de sequenciamento de RNA, identificamos genes expressos de forma diferencial em amostras de glioblastoma. Ao comparar perfis de expressão gênica entre tecidos normais e cancerosos e entre células-tronco de glioma e células diferenciadas, conseguimos identificar genes como o PITAR que estão especificamente regulados positivamente no câncer.
Estudos de Interação
Para investigar como o PITAR interage com outras moléculas, realizamos ensaios de pull-down de RNA para confirmar que o PITAR se liga ao mRNA do TRIM28. Também utilizamos ensaios de luciferase para medir os efeitos do PITAR sobre os transcritos do TRIM28.
Modelos Animais
Testamos os efeitos do silenciamento e da superexpressão do PITAR em modelos murinos de glioblastoma para ver como isso impactava o crescimento tumoral e a sobrevivência. Esses experimentos destacaram a importância do PITAR in vivo.
Resultados
Aumento dos Níveis de PITAR em Glioblastoma
Nossa análise mostrou que o PITAR é significativamente superexpresso em tecidos de glioblastoma e correlaciona positivamente com marcadores tumorais. Isso nos levou a hipotetizar que o PITAR pode ser um jogador crucial na biologia do glioma.
Efeitos do Silenciamento do PITAR
Quando silenciamos o PITAR em linhas celulares de glioma, observamos uma diminuição robusta na proliferação celular, aumento da morte celular e sensibilidade à quimioterapia. Isso indicou que o PITAR é vital para o crescimento e a sobrevivência das células de glioma.
Mecanismo de Ação
Estabelecemos que o PITAR aumenta os níveis de TRIM28 protegendo seu mRNA da degradação. O aumento do TRIM28 levou a uma degradação maior do p53, confirmando o papel do PITAR como um inibidor do p53.
Papel na Resposta ao Dano ao DNA
Os níveis de PITAR aumentaram quando as células foram expostas a agentes que danificam o DNA. No entanto, a presença do PITAR pareceu diminuir a eficácia do p53 em responder a esse estresse, facilitando a sobrevivência tumoral e a resistência a tratamentos.
Discussão
Implicações das Descobertas
A relação entre PITAR, TRIM28 e p53 destaca uma interação complexa na biologia do câncer. Ao inibir o p53, o PITAR permite que as células de glioma evitem as respostas celulares típicas ao estresse, que são cruciais para prevenir o desenvolvimento tumoral.
Potencial Alvo Terapêutico
Dado seu papel em promover o crescimento tumoral e conferir resistência ao tratamento, o PITAR pode ser um alvo promissor para novas terapias visando o glioblastoma. Intervenções projetadas para reduzir os níveis de PITAR poderiam restaurar as funções do p53, aumentando a eficácia dos tratamentos existentes.
Direções Futuras
Mais pesquisas são necessárias para explorar como o PITAR pode ser efetivamente alvo e entender as implicações mais amplas de seu papel em outros tipos de câncer. Desenvolver estratégias que interrompam a interação entre PITAR e TRIM28 pode abrir novas avenidas para o tratamento do glioblastoma.
Conclusão
Nosso estudo revela que o PITAR é um jogador significativo na progressão do glioblastoma ao inibir o p53 por meio de sua associação com o TRIM28. Esse lncRNA oncogênico não apenas apoia o crescimento tumoral, mas também contribui para a resistência contra terapias, enfatizando a necessidade de intervenções direcionadas.
A compreensão de que RNAs não codificantes, anteriormente descartados como "lixo," desempenham papéis substanciais na biologia do câncer ilustra o panorama em evolução da pesquisa sobre câncer. À medida que continuamos a desvendar as complexidades do genoma, direcionar essas moléculas não codificantes pode fornecer soluções inovadoras para o tratamento do câncer e melhorar os resultados dos pacientes.
Título: PITAR, a DNA damage-inducible Cancer/Testis long noncoding RNA, inactivates p53 by binding and stabilizing TRIM28 mRNA
Resumo: In tumors with WT p53, alternate mechanisms of p53 inactivation are reported. Here, we have identified a long noncoding RNA, PITAR (p53 Inactivating TRIM28 associated RNA), as an inhibitor of p53. PITAR is an oncogenic Cancer/testis lncRNA and is highly expressed in glioblastoma (GBM) and glioma stem-like cells (GSC). We establish that TRIM28 mRNA, which encodes a p53-specific E3 ubiquitin ligase, is a direct target of PITAR. PITAR interaction with TRIM28 RNA stabilized TRIM28 mRNA, which resulted in increased TRIM28 protein levels and reduced p53 steady-state levels due to enhanced p53 ubiquitination. DNA damage activated PITAR, in addition to p53, in a p53-independent manner, thus creating an incoherent feedforward loop to inhibit the DNA damage response by p53. While PITAR silencing inhibited the growth of WT p53 containing GSCs in vitro and reduced glioma tumor growth in vivo, its overexpression enhanced the tumor growth in a TRIM28-dependent manner and promoted resistance to Temozolomide. Thus, we establish an alternate way of p53 inactivation by PITAR, which maintains low p53 levels in normal cells and attenuates the DNA damage response by p53. Finally, we propose PITAR as a potential GBM therapeutic target.
Autores: Kumaravel Somasundaram, S. Jana, M. Mondal, S. Mahale, B. Gupta, K. R. Prasasvi, L. Kandasami, N. Jha, A. Chowdhury, V. Santosh, C. Kanduri
Última atualização: 2024-04-01 00:00:00
Idioma: English
Fonte URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.04.11.536370
Fonte PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.04.11.536370.full.pdf
Licença: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
Alterações: Este resumo foi elaborado com a assistência da AI e pode conter imprecisões. Para obter informações exactas, consulte os documentos originais ligados aqui.
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Ligações de referência
- https://www.ncbi.nlm.nih.gov/orffinder/
- https://rna.informatik.uni-freiburg.de/IntaRNA/Input.jsp
- https://tcga-data.nci.nih.gov/tcga/
- https://broadinstitute.github.io/picard/
- https://www.gencodegenes.org/releases/19.html
- https://tools.altiusinstitute.org/tcga/?gene=FAM95B1
- https://www.broad.mit.edu/gsea/
- https://bioinf.wehi.edu.au/software/elda/