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Cooperação Microbiana no Solo: O Papel do Compartilhamento de Nitrogênio

Estudo revela como S. indica e B. subtilis cooperam na troca de nitrogênio.

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Compartilhamento deCompartilhamento deNitrogênio MicrobianoReveladosubtilis em solo rico em nutrientes.S. indica se dá bem com a amônia do B.
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O solo é lar de uma porção de microrganismos, que são formas de vida minúsculas. Esses microrganismos trabalham juntos em algo que chamamos de comunidade microbiana. Essa comunidade é super importante para o funcionamento do solo, principalmente no que diz respeito aos nutrientes, crescimento das plantas e saúde geral das plantas.

Os microrganismos ajudam a processar os nutrientes que as plantas precisam, combatem doenças que podem prejudicá-las e ajudam as plantas a lidar com o estresse. Entender esses microrganismos e como eles interagem é essencial para manter e melhorar a fertilidade do solo e a produção das culturas.

Pesquisas mostram que fatores ambientais influenciam como essas comunidades microbianas se formam e funcionam. Isso significa que coisas como a disponibilidade de nutrientes podem mudar quais microrganismos se destacam no solo. Por exemplo, altas concentrações de nutrientes podem fazer com que poucas espécies competitivas dominem, enquanto níveis baixos de nutrientes incentivam uma variedade maior de espécies.

O Papel dos Microrganismos na Compartilhamento de Nutrientes

As interações entre microrganismos podem ser competitivas ou cooperativas. Alguns microrganismos dependem de outros para fornecer nutrientes essenciais. Um desses métodos de compartilhamento de nutrientes é através de um processo chamado auxotrofia, onde um organismo não consegue produzir um composto necessário e depende de outro para fornecê-lo.

Um exemplo dessa interação acontece entre um tipo de fungo e uma bactéria. O fungo, conhecido como S. indica, não consegue criar uma vitamina vital chamada tiamina. Isso significa que ele precisa da ajuda de outros microrganismos, como a bactéria B. Subtilis, que pode produzir tiamina.

A falta de certas habilidades nesses microrganismos levanta questões importantes. Se um fungo não consegue utilizar uma fonte comum de Nitrogênio como o Nitrato, como ele sobrevive em ambientes ricos em nitrato? Uma possível explicação é que outros microrganismos ajudam a criar fontes alternativas de nitrogênio junto com o nitrato.

O Estudo da Interação entre S. indica e B. subtilis

Este estudo foca na interação entre S. indica e B. subtilis para explorar como esses microrganismos compartilham nitrogênio. Ele confirma que S. indica não consegue crescer usando nitrato como sua única fonte de nitrogênio. No entanto, quando cresce ao lado de B. subtilis, seu crescimento melhora consideravelmente.

A presença de B. subtilis leva à liberação de amônia na área ao redor. Essa amônia serve como uma fonte alternativa de nitrogênio que S. indica pode usar. Um modelo matemático apoia a ideia de que a amônia pode vazar das células e ser absorvida por microrganismos vizinhos. Esse vazamento atua como uma estratégia de compartilhamento de nitrogênio, que pode ajudar a manter a estabilidade na comunidade microbiana do solo.

A Incapacidade de S. indica Usar Nitrato

Bactérias e fungos geralmente seguem caminhos semelhantes para usar nitrogênio. O nitrato, como fonte de nitrogênio, requer várias enzimas para permitir sua absorção e conversão em formas utilizáveis. S. indica não possui os transportadores e enzimas necessários para utilizar nitrato de forma eficaz. Pesquisas recentes mostram que ele tem dificuldades para crescer em ambientes onde o nitrato é a principal fonte de nitrogênio.

Experimentos confirmaram que S. indica exibe crescimento mínimo quando o nitrato é a única forma de nitrogênio presente, apoiando descobertas anteriores que sugerem sua incapacidade de assimilar nitrato.

Crescimento Melhorado na Presença de B. subtilis

O estudo investiga ainda se B. subtilis pode melhorar o crescimento de S. indica em ambientes ricos em nitrato. Quando S. indica cresce em meios contendo nitrato junto com B. subtilis, ele prospera muito melhor. Isso sugere que B. subtilis pode estar ajudando S. indica ao liberar fontes de nitrogênio que ele pode utilizar.

Para explorar essa ideia, os pesquisadores examinaram amostras de líquidos onde S. indica e B. subtilis cultivaram juntos. Eles observaram níveis de crescimento aumentados em S. indica quando ele tinha acesso a subprodutos de B. subtilis. Testes confirmaram que B. subtilis estava consumindo nitrato e liberando amônia, que S. indica poderia usar como fonte de nitrogênio.

Amônia: A Chave para o Crescimento

Através de experimentos adicionais, os pesquisadores identificaram a amônia como o principal responsável pelo crescimento melhorado de S. indica quando em contato com B. subtilis. Eles encontraram níveis significativos de amônia presentes nos sobrenadantes das culturas de B. subtilis, apoiando a teoria de que essa amônia é crucial para o crescimento de S. indica.

Notavelmente, S. indica também produziu um pouco de amônia quando cultivado sozinho, indicando que pode estar usando fontes de nitrogênio armazenadas ou reciclado aminoácidos. Isso sugere que mesmo sem B. subtilis, S. indica consegue gerar algum nitrogênio, mas não o suficiente para prosperar.

O Impacto do pH Ambiental

A saúde e o desempenho geral de ambos os microrganismos podem ser afetados por condições ambientais como os níveis de pH. A amônia se comporta de forma diferente com base no pH, impactando quanto nitrogênio pode ser compartilhado entre esses microrganismos.

Níveis mais baixos de pH podem aumentar o vazamento de amônia das células, o que significa que se um microrganismo tem uma capacidade reduzida de absorver amônio, vai vazar mais amônia para o ambiente. Esse vazamento pode beneficiar outros microrganismos, como S. indica, já que eles podem absorver essa amônia vazada.

Para explorar isso, os pesquisadores estudaram como cepas de B. subtilis, particularmente uma versão mutante com capacidade reduzida de absorver amônia, reagiram a diferentes níveis de pH. Os resultados confirmaram que a cepa mutante teve mais dificuldades em níveis de pH mais baixos do que a cepa selvagem, mostrando como fatores ambientais influenciam as interações microbianas.

Conclusão

Os achados deste estudo ilustram uma relação complexa e benéfica entre S. indica e B. subtilis. Em ambientes onde o nitrato é abundante, S. indica não consegue crescer sozinho, mas prospera através de sua relação com B. subtilis, que lhe fornece amônia.

Este trabalho joga luz sobre as interações intrincadas entre microrganismos do solo e enfatiza a importância de entender essas interações para a saúde do solo e a produtividade das culturas. Ao entender como esses microrganismos compartilham recursos, isso pode levar a melhores práticas agrícolas e a uma melhor gestão de nutrientes nos solos.

Resumindo, a relação entre esses dois microrganismos reforça a importância da cooperação em comunidades microbianas e como as condições ambientais podem moldar essas interações. O conhecimento obtido com este estudo pode ajudar a informar trabalhos futuros em microbiologia do solo e práticas agrícolas sustentáveis.

Direções Futuras

Pesquisas futuras podem focar em identificar outros microrganismos que contribuem para o compartilhamento de nitrogênio e como vários fatores ambientais podem afetar ainda mais essas relações. Explorar ecossistemas de solo mais complexos poderia descobrir interações benéficas adicionais que podem ser usadas para melhorar o crescimento das plantas e a saúde do solo.

Compreender os mecanismos genéticos por trás dessas interações também será valioso. Estudando os genes específicos envolvidos na absorção e compartilhamento de nitrogênio, os cientistas poderão desenvolver culturas que sejam mais resilientes e capazes de prosperar em solos pobres em nitrogênio.

Além disso, explorar como diferentes práticas agrícolas influenciam as interações microbianas poderia abrir caminho para métodos inovadores que visam melhorar a fertilidade do solo e garantir sistemas de produção alimentar sustentáveis.

Fonte original

Título: Ammonia leakage can underpin nitrogen-sharing among soil microbes

Resumo: AbstractSoil microbial communities host a large number of microbial species that support important ecological functions such as biogeochemical cycling and plant nutrition. The extent and stability of these functions are affected by inter-species interactions among soil microbes, yet the different mechanisms underpinning microbial interactions in the soil are not fully understood. Here, we study the extent of nutrient-based interactions among two model, plant-supporting soil microbes, the fungi Serendipita indica and the bacteria Bacillus subtilis. We find that S. indica is unable to grow with nitrate - a common nitrogen source in the soil - but this inability can be rescued, and growth restored in the presence of B. subtilis. We demonstrate that this effect is due to B. subtilis utilising nitrate and releasing ammonia, which can be used by S. indica. We refer to this type of mechanism as ammonia mediated nitrogen sharing (N-sharing). Using a mathematical model, we demonstrate that the pH dependent equilibrium between ammonia (NH3) and ammonium (NH4+) results in an inherent cellular leakiness, and that reduced amonnium uptake or assimilation rates can result in higher levels of leaked ammonia. In line with this model, a mutant B. subtilis - devoid of ammonia uptake - shows higher S. indica growth support in nitrate media. These findings highlight that ammonia based N-sharing can be a previously under-appreciated mechanism underpinning interaction among soil microbes and could be influenced by microbial or abiotic alteration of pH in microenvironments. Significance statementSoil microbial communities are an important factor in environmental nutrient cycling and sub-sequently plant health. S. indica is a well-studied plant growth promoting soil fungus but its inability to use nitrate, a major component of both agricultural/natural soils and crop fertilisers, may have important implications for agriculture and microbial ecology. We have demonstrated that S. indica is dependant on external sources of nitrogen in nitrate-only environments and these can be produced by B. subtilis, another common soil microbe. We then demonstrate that this nitrogen sharing interaction is likely mediated by leaked ammonia and that ammonia leakage is influenced by environmental pH. Ammonia leakage and sharing represent currently unexplored and potentially vital components of nutrient interactions between microbes in soil communities, with profound implications for microbiome community structure and subsequent consequences for soil biogeochemical cycling and crop health.

Autores: Orkun S Soyer, L. Richards, P. Schaefer

Última atualização: 2024-04-08 00:00:00

Idioma: English

Fonte URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.04.08.588523

Fonte PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.04.08.588523.full.pdf

Licença: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/

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