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O Papel do VRN2 na Regulação do Crescimento das Plantas

VRN2 é essencial pro crescimento das plantas, influenciando a expressão genética em resposta à luz.

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Mudanças na estrutura da cromatina são essenciais pra como os genes são ativados ou desativados em eucariotos, que incluem plantas e animais. Um fator maior nesse controle é a modificação das histonas, as proteínas ao redor das quais o DNA é enrolado. Essas modificações podem ser coisas como adicionar ou remover pequenos grupos químicos das caudas das histonas. Essas mudanças podem afetar quão apertado o DNA tá empacotado, quão acessível ele é pra outras proteínas e, no fim das contas, como os genes são expressos.

Uma modificação de histona notável é chamada de H3K27me3, que pode silenciar genes; essa modificação é feita por um complexo conhecido como o Complexo Repressivo Polycomb 2 (PRC2). Esse complexo é encontrado na maioria dos animais e plantas terrestres e ajuda a manter certos genes em um estado reprimido com o tempo. Nas plantas, enzimas específicas podem remover essa marca repressora, enquanto outras proteínas podem adicionar uma marca que promove a Expressão Gênica. Isso estabelece um sistema dinâmico onde o estado local da cromatina pode se ajustar, influenciando a expressão gênica em resposta a diferentes sinais.

O Papel do PRC2

O PRC2 foi descoberto pela primeira vez na mosca da fruta Drosophila e é conservado em muitos organismos. Ele desempenha um papel crucial em determinar a identidade celular, orientando o desenvolvimento e ajudando organismos a lembrar das condições ambientais que já experimentaram. O PRC2 é composto por várias subunidades de proteínas, e sua função é frequentemente aumentada por proteínas associadas e RNAs não codificantes. Nas plantas, algumas subunidades do PRC2 variam em número em comparação com os animais, indicando que os complexos PRC2 em plantas podem ser muito mais flexíveis.

Por exemplo, na planta modelo comum Arabidopsis thaliana, os PRC2s podem ser agrupados com base em qual versão de uma subunidade particular eles recrutam. Essas categorias incluem aquelas que são específicas para certas fases do desenvolvimento da planta, como a fase embrionária ou a fase de floração, e outras que estão envolvidas na formação de gametas. Algumas dessas subunidades também desempenham papéis únicos em diferentes estágios de desenvolvimento.

Funções do PRC2 em Arabidopsis

Diferentes complexos PRC2 em Arabidopsis mostraram ter funções distintas. Embora alguns componentes do PRC2 sejam vitais para o desenvolvimento normal, mutações que os afetam muitas vezes levam a problemas graves de Crescimento. No entanto, uma subunidade específica, conhecida como VRN2, parece ter papéis mais especializados ou limitados dentro do PRC2. Ela está ligada a vários processos relacionados a mudanças ambientais e ao desenvolvimento da planta, como quando as plantas florescem ou desenvolvem sementes.

O VRN2 é particularmente importante para como as plantas respondem a mudanças de temperatura e regula o tempo da floração. Ele também desempenha um papel em impedir que certas células voltem a um estado menos especializado. Além de regular o processo de floração, ele também influencia outros aspectos do desenvolvimento, como o crescimento das sementes e o desenvolvimento das raízes. Ele interage com várias proteínas auxiliares que modulam sua atividade e determinam quais genes ele influencia.

VRN2 e Seu Papel na Regulação do Crescimento

O VRN2 é proeminente em regiões específicas da planta, como o meristema apical do broto (SAM) e folhas emergentes. Estudos mostraram que ele pode controlar quão rápido as raízes crescem e impedir crescimento excessivo em certas áreas. Quando há uma mutação no gene VRN2, as plantas resultantes geralmente mostram tamanhos maiores devido ao aumento do tamanho celular. Isso indica que o VRN2 normalmente limita o crescimento agindo em vários genes-chave que promovem o crescimento, especialmente em condições de luz.

Ao olhar para a expressão gênica em plantas que não têm VRN2, muitos genes que promovem o crescimento foram encontrados mais ativos. Isso sugere que o VRN2 ajuda a manter esses genes sob controle. O VRN2 regula negativamente a expressão de um conjunto inteiro de genes ativados por outra proteína conhecida como PIF4. Esses genes estão relacionados a hormônios de crescimento importantes como a auxina, que promove a expansão celular, e genes que controlam o processo de crescimento nas plantas.

Análise da Expressão Gênica

Pra identificar os genes específicos que o VRN2 influencia, os pesquisadores examinaram os perfis de expressão gênica de plantas com e sem o gene VRN2 sob várias condições. Eles encontraram um número significativo de genes ligados ao crescimento e à resposta à luz que estavam ativados com mais frequência nas plantas deficientes em VRN2 em comparação com as plantas normais. Especificamente, certos genes que controlam a expansão celular e o crescimento estavam mais ativos.

Analisando essas diferentes expressões, os pesquisadores identificaram um conjunto central de genes que pareciam particularmente influenciados pelo VRN2, incluindo aqueles que respondem a hormônios de crescimento. Esse padrão sugere que o VRN2 desempenha um papel vital no controle de como as plantas crescem ao regular esse conjunto de genes em resposta à luz.

VRN2 e Resposta à Luz

Curiosamente, o efeito do VRN2 na expressão de certos genes foi encontrado dependente da luz. Quando as plantas foram cultivadas no escuro, o VRN2 não influenciou significativamente a expressão dos genes de crescimento. No entanto, em condições de luz, a presença do VRN2 foi crucial pra manter níveis adequados de muitos desses genes. Isso sugere que o VRN2 atua como um sensor, ajustando a expressão gênica com base na disponibilidade de luz, o que é crucial para o crescimento das plantas.

Além disso, o timing dessa regulação também era necessário. Os níveis e a atividade do VRN2 precisavam ser temporizados corretamente durante o ciclo dia-noite pra garantir um crescimento ideal. Isso significa que a regulação do crescimento em plantas não é apenas sobre quais genes são ativados, mas também quando esses genes são ativados.

A Interação Entre VRN2 e Outras Proteínas

O VRN2 não age sozinho; ele trabalha junto com outras proteínas pra controlar a expressão gênica. Uma interação significativa é com o PIF4, uma proteína que promove o crescimento e é influenciada pelas condições de luz. Quando tanto o PIF4 quanto o VRN2 foram analisados juntos, foi descoberto que, se o PIF4 fosse mutado, o crescimento excessivo observado nas plantas deficientes em VRN2 não estava mais presente. Isso indica uma relação direta entre essas duas proteínas, onde o VRN2 consegue manter os efeitos do PIF4 sob controle em condições de luz.

Essa interação sugere um loop de retroalimentação complexo na regulação do crescimento das plantas, onde a luz não só ativa o PIF4 pra promover o crescimento, mas também requer um controle adequado por meio de proteínas como o VRN2 pra evitar o crescimento excessivo.

VRN2 e Mecanismos de Crescimento

Ao olhar mais a fundo em como o VRN2 regula esses processos, os pesquisadores descobriram que o VRN2 se liga a regiões específicas do DNA onde pode exercer seus efeitos. Essa ligação é essencial pra adicionar marcas repressoras em genes, que mantém sua expressão baixa quando não devem estar ativos. Notavelmente, a ação do VRN2 não é uniforme em todo o genoma; ele seleciona genes específicos que são cruciais para regular o crescimento da planta.

Estudos envolvendo análise de cromatina – examinando como o DNA é empacotado nas células – revelaram que o VRN2 desempenha um papel significativo em estabelecer um estado de cromatina balanceado essencial pra regular a expressão gênica. Isso indica que a estrutura da cromatina, influenciada pelo VRN2, é fundamental pra determinar quais genes são ativados ou desativados durante diferentes estágios do desenvolvimento da planta e em resposta a mudanças ambientais.

Conclusões

Em resumo, a proteína VRN2 é vital pra garantir que as plantas cresçam no ritmo certo e em resposta ao ambiente. Ela gerencia a expressão de diversos genes que desempenham um papel no crescimento e desenvolvimento, especialmente aqueles ativados em condições de luz. Ao colaborar com outras proteínas como o PIF4, o VRN2 ajuda as plantas a responderem efetivamente ao seu entorno, equilibrando crescimento e adaptabilidade ambiental.

Esse sistema intricado destaca as maneiras sofisticadas com que as plantas regulam seu crescimento e desenvolvimento, sublinhando a importância de fatores genéticos e ambientais na formação da vida vegetal. Mais pesquisas sobre essas interações ainda estão por vir, prometendo novas percepções sobre a biologia das plantas e como esses mecanismos podem ser aplicados na agricultura e horticultura.

Fonte original

Título: VRN2-PRC2 facilitates light-triggered repression of PIF signalling to coordinate growth in Arabidopsis

Resumo: The polycomb protein VERNALIZATION2 (VRN2) is a plant-specific subunit of the polycomb repressive complex 2 (PRC2), a conserved eukaryotic holoenzyme that represses gene expression by depositing the histone H3K27me3 mark in chromatin. Previous work established VRN2 as an oxygen-regulated target of the N-degron pathway that may function as a sensor subunit connecting PRC2 activity to the perception of positional and environmental cues. Here we show that VRN2 is enriched in hypoxic meristematic regions and emerging leaves of Arabidopsis under non-stressed conditions, and that vrn2 mutants are larger than wild type, indicating that VRN2-PRC2 negatively regulates growth and development. This growth phenotype is caused by ectopic expression of genes that promote cell expansion, including many SAUR genes and other direct PIF transcription factor targets. Analysis of SAUR19 promoter activity and expression dynamics revealed that VRN2 is required to specifically repress these genes in the light. Moreover, we show that VRN2 is epistatic to PIF4, and directly binds and methylates histones of key loci in the PIF4 transcriptional network to provide robust light-responsive control of gene expression and growth. We propose that hypoxia-stabilised VRN2-PRC2 sets a conditionally repressed chromatin state at PIF-regulated hub genes early in leaf ontogeny coinciding with the cell division phase, and that this is required for enhancing their subsequent repression via a light-responsive signalling cascade as cells enter the expansion phase. Thus, we have identified VRN2-PRC2 as core component of a spatially regulated and developmentally encoded epigenetic mechanism that co-ordinates environment-responsive growth by facilitating light-triggered suppression of PIF signalling.

Autores: Daniel J Gibbs, R. Osborne, A.-M. Labandera, A. J. Ryder, A. Kanali, O. Akintewe, M. A. Schwarze, C. D. Morgan, T. Xu, S. Hartman, E. Kaiserli

Última atualização: 2024-04-22 00:00:00

Idioma: English

Fonte URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.04.22.590552

Fonte PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.04.22.590552.full.pdf

Licença: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/

Alterações: Este resumo foi elaborado com a assistência da AI e pode conter imprecisões. Para obter informações exactas, consulte os documentos originais ligados aqui.

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