Como as Células Mantêm a Identidade Durante a Divisão
Pesquisadores descobrem o papel da PBK no comportamento das proteínas durante a divisão celular.
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Índice
- A Complexidade da Divisão Celular
- A Proteína Ikaros
- Investigando o Comportamento da Ikaros Durante a Divisão
- Principais Descobertas da Imagem Ao Vivo
- O Papel das Quinases e Fosfatases
- Mudanças na Composição de Proteínas e Estrutura do Cromossomo
- O Impacto da Perda da PBK na Acessibilidade da Cromatina
- CTCF e Seu Papel na Estrutura da Cromatina
- Entendendo a Importância Dessas Descobertas
- Conclusão
- Fonte original
- Ligações de referência
As células do nosso corpo conseguem se dividir e criar novas células. Esse processo é essencial pra crescer, curar e várias outras funções. Mas, quando as células se dividem, elas precisam manter sua identidade. Em outras palavras, uma célula sanguínea tem que continuar sendo uma célula sanguínea depois da divisão. Os pesquisadores estudam como as células mantêm sua identidade durante a divisão e o que rola no nível molecular.
A Complexidade da Divisão Celular
Quando as células se preparam pra se dividir, elas passam por várias fases, e estruturas especiais chamadas Cromossomos ficam visíveis. Esses cromossomos contêm DNA, que guarda as instruções pra célula. Durante a divisão, algumas proteínas que normalmente estão ligadas aos cromossomos podem se soltar. Entender quais proteínas ficam grudadas e quais saem ajuda os cientistas a entender como as células mudam e permanecem iguais.
Porém, estudar essas mudanças pode ser complicado. Às vezes, consertar amostras pra observação pode tirar proteínas dos cromossomos, levando a conclusões enganosas. Além disso, algumas proteínas são conhecidas por serem empurradas pra longe dos cromossomos durante a divisão por causa da fosforilação, que é uma mudança química que altera a função da proteína. Mais pesquisas são necessárias pra saber exatamente quantas proteínas são removidas e quais enzimas são responsáveis por esse processo.
A Proteína Ikaros
Uma das proteínas-chave envolvidas no desenvolvimento das células sanguíneas se chama Ikaros. Ikaros é um fator de transcrição, ou seja, ajuda a controlar a atividade dos genes. É essencial pro desenvolvimento correto das células imunes, incluindo as células B e T. Os cientistas têm investigado como a Ikaros se comporta durante a divisão celular.
Quando descobriram que a Ikaros estava inativa durante a divisão celular, os pesquisadores ficaram surpresos. Isso foi inesperado porque a Ikaros tá envolvida em manter certos gêneros desligados de forma permanente. Outros estudos mostraram que muitas proteínas necessárias pra manter os genes desligados durante o ciclo celular ainda estavam ligadas aos cromossomos. Isso levantou questões sobre a Ikaros e como ela se comporta de forma diferente de outras proteínas.
Investigando o Comportamento da Ikaros Durante a Divisão
Pra confirmar que a Ikaros realmente sai dos cromossomos durante a divisão celular, os cientistas usaram técnicas de imagem ao vivo. Eles criaram células especiais que permitiam observar a Ikaros em tempo real enquanto as células se dividiam. Eles trataram essas células com diferentes inibidores pra ver como esses tratamentos afetavam o comportamento da Ikaros.
Pelas observações, descobriram que uma enzima específica chamada PBK (também conhecida como TOPK) é vital pra empurrar a Ikaros pra fora dos cromossomos durante a divisão. Quando a PBK foi removida geneticamente das células, a Ikaros permaneceu ligada aos cromossomos, confirmando seu papel na deslocação da Ikaros.
Principais Descobertas da Imagem Ao Vivo
Nos experimentos, os pesquisadores notaram algo interessante: quando a Ikaros foi removida dos cromossomos, podia voltar rapidamente quando os cientistas bloquearam a atividade da PBK. Isso mostrou que a remoção da Ikaros não é um processo simples; na verdade, é controlado de forma rigorosa e acontece rápido.
Os pesquisadores também descobriram que outras proteínas similares à Ikaros também foram mantidas nos cromossomos quando a PBK estava ausente. Isso sugere que pode haver um grupo de proteínas que se comportam de maneira semelhante durante a divisão celular.
O Papel das Quinases e Fosfatases
O equilíbrio entre a PBK e as fosfatases, que são enzimas que removem grupos fosfato, desempenha um papel crítico no comportamento da Ikaros e outras proteínas. Quando a PBK está ativa, ela adiciona grupos fosfato a proteínas como a Ikaros, fazendo com que se descole dos cromossomos. Por outro lado, quando as fosfatases estão ativas, elas removem esses grupos fosfato, permitindo que as proteínas se reanexem.
Os cientistas trataram as células com inibidores da PBK e observaram os padrões da Ikaros. Confirmaram que bloquear a PBK mantém a Ikaros grudada nos cromossomos, indicando como a presença ou ausência dessa quinase pode influenciar significativamente quais proteínas permanecem associadas aos cromossomos durante a divisão celular.
Mudanças na Composição de Proteínas e Estrutura do Cromossomo
Os pesquisadores então analisaram o que acontece com os cromossomos quando a PBK está faltando. Eles descobriram que os cromossomos eram maiores e menos compactos nas células sem PBK. Isso sugere que a PBK é crucial pra estrutura correta dos cromossomos. Isso foi confirmado por vários métodos que examinaram as propriedades físicas dos cromossomos em células que não tinham PBK em comparação com células normais.
Além disso, observaram mudanças nos tipos e quantidades de proteínas associadas aos cromossomos quando a PBK estava ausente. Houve um aumento em certos fatores de transcrição ligados aos cromossomos, indicando que na falta da PBK, outras proteínas podem não ser expelidas da mesma forma.
O Impacto da Perda da PBK na Acessibilidade da Cromatina
A cromatina é o material que compõe os cromossomos. Entender como as proteínas interagem com a cromatina é vital pra saber como os genes são expressos. Usando uma tecnologia chamada ATAC-seq, os cientistas examinaram a acessibilidade da cromatina em células sem PBK. Descobriram que mais regiões do DNA estavam acessíveis quando a PBK estava ausente. Essa acessibilidade é importante porque permite a regulação da expressão gênica, o que pode ter implicações mais amplas para a função e identidade celular.
CTCF e Seu Papel na Estrutura da Cromatina
CTCF é outra proteína importante que desempenha um papel em como o DNA está organizado dentro do núcleo. CTCF está envolvida em manter a estrutura da cromatina e pode influenciar a expressão gênica formando laços entre diferentes regiões do DNA.
Em células sem PBK, a CTCF permaneceu mais associada aos cromossomos durante a divisão. Isso sugere que quando a PBK não está presente, a CTCF pode ficar ligada ao DNA por mais tempo do que normalmente ficaria. A maior presença da CTCF pode levar a mudanças na forma como os genes são expressos nas células filhas, potencialmente afetando a identidade dessas células enquanto começam a operar normalmente após a divisão.
Entendendo a Importância Dessas Descobertas
Todas essas descobertas destacam a importância da PBK em regular não apenas o comportamento de proteínas específicas como a Ikaros, mas também todo o panorama da cromatina durante a divisão celular. A capacidade da PBK de remover certas proteínas dos cromossomos garante que eles possam se compactar de forma correta e manter sua integridade estrutural ao longo do processo.
A natureza dinâmica das interações entre proteínas durante a divisão, influenciada por fatores como PBK e fosfatases, reflete a complexidade da regulação celular. Essa compreensão é crucial para os pesquisadores que tentam descobrir o que acontece quando esses sistemas dão errado, como em casos de câncer.
Conclusão
A pesquisa sobre como as células mantêm sua identidade durante a divisão é incrivelmente complexa. O equilíbrio das proteínas e suas interações com o DNA são rigorosamente regulados e podem ter implicações significativas para o comportamento celular. Jogadores chave como a PBK ajudam a controlar esse processo gerenciando a presença de proteínas nos cromossomos durante a divisão.
À medida que os cientistas continuam a explorar esses caminhos, eles buscam descobrir mais sobre como as células mantêm suas identidades e o que acontece quando essas identidades são interrompidas. Cada descoberta adiciona mais uma peça ao quebra-cabeça da biologia celular, ajudando a iluminar as complexidades da vida no nível molecular.
Título: PBK/TOPK mediates Ikaros, Aiolos and CTCF displacement from mitotic chromosomes and alters chromatin accessibility at selected C2H2-zinc finger protein binding sites
Resumo: PBK/TOPK is a mitotic kinase implicated in haematological and non-haematological cancers. Here we show that the key haemopoietic regulators Ikaros and Aiolos require PBK-mediated phosphorylation to dissociate from chromosomes in mitosis. Eviction of Ikaros is rapidly reversed by addition of the PBK-inhibitor OTS514, revealing dynamic regulation by kinase and phosphatase activities. To identify more PBK targets, we analysed loss of mitotic phosphorylation events in Pbk-/-preB cells and performed proteomic comparisons on isolated mitotic chromosomes. Among a large pool of C2H2-zinc finger targets, PBK is essential for evicting the CCCTC-binding protein CTCF and zinc finger proteins encoded by Ikzf1, Ikzf3, Znf131 and Zbtb11. PBK-deficient cells were able to divide but showed altered chromatin accessibility and nucleosome positioning consistent with CTCF retention. Our studies reveal that PBK controls the dissociation of selected factors from condensing mitotic chromosomes and contributes to their compaction.
Autores: Amanda G. Fisher, A. Dimond, D. H. Gim, E. Ing-Simmons, C. Whilding, H. Kramer, D. Djeghloul, A. Montoya, B. Patel, S. Cheriyamkunnel, K. Brown, P. Shliaha, J. M. Vaquerizas, M. Merkenschlager
Última atualização: 2024-04-23 00:00:00
Idioma: English
Fonte URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.04.23.590758
Fonte PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.04.23.590758.full.pdf
Licença: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
Alterações: Este resumo foi elaborado com a assistência da AI e pode conter imprecisões. Para obter informações exactas, consulte os documentos originais ligados aqui.
Obrigado ao biorxiv pela utilização da sua interoperabilidade de acesso aberto.
Ligações de referência
- https://genome.ucsc.edu/
- https://www.primer3plus.com/
- https://nebuilder.neb.com
- https://www.informatics.jax.org/function.shtml
- https://www.pantherdb.org/
- https://www.uniprot.org/
- https://bioconductor.org/packages/motifmatchr
- https://hgdownload.soe.ucsc.edu/gbdb/mm10/crisprAll/crispr.bb
- https://jaspar.elixir.no/downloads/
- https://annotations.perseus-framework.org