Melhorando a Edição Genética com CRISPR usando EoHR
EoHR aumenta a eficiência da edição de genes visando uma proteína chave de reparo do DNA.
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Índice
- Desativação de Genes
- Adição de Genes
- Desafios na Edição de Genes
- Compostos para Melhorar a Eficiência
- O Papel da 53BP1 na Reparação do DNA
- O Novo Composto EoHR
- Como o EoHR Funciona
- Testando o EoHR em Células
- Impacto na Eficiência do CRISPR
- EoHR e Segurança
- Aplicações Além dos Camundongos
- Conclusão
- Fonte original
O CRISPR é uma ferramenta poderosa usada na engenharia genética. Os pesquisadores usam isso para criar modelos animais, que são importantes para estudar doenças e testar novos tratamentos. Tem três maneiras principais de usar o CRISPR: desativar genes, adicionar genes e editar genes. Cada método ajuda os cientistas a entender como os genes funcionam e como podem ser mudados.
Desativação de Genes
A desativação de genes é um método onde genes específicos são desligados. Os cientistas fazem isso usando o CRISPR para criar erros no DNA. Esse processo aproveita um método de reparo natural nas células chamado ligação de extremidades não homólogas (NHEJ). Embora esse método seja rápido e relativamente eficiente, ele não permite mudanças precisas no DNA.
Adição de Genes
Por outro lado, adicionar um gene significa incluir ou mudar pedaços específicos de DNA. Isso pode envolver corrigir mutações que causam doenças. Para esse processo, os cientistas precisam garantir que as mudanças sejam feitas com precisão. Um método para conseguir isso é a Recombinação Homóloga (HR). Ele usa outro pedaço de DNA como molde para fazer as mudanças. No entanto, esse método é mais lento e menos eficiente em comparação com a desativação de genes.
Desafios na Edição de Genes
Quando os cientistas tentam usar a edição de genes, eles enfrentam vários desafios. Primeiro, a eficiência de conseguir as mudanças corretas no DNA geralmente é baixa. Em muitos casos, apenas uma pequena porcentagem dos animais terá as mudanças desejadas. Por exemplo, ao tentar editar um gene em camundongos, apenas cerca de 3% pode ter as mudanças certas. Isso significa que criar um novo modelo genético usando o CRISPR pode levar muito tempo e ser bem caro.
Compostos para Melhorar a Eficiência
Os pesquisadores tentaram diferentes compostos químicos para melhorar o sucesso da edição de genes. Os resultados foram mistos, e não há uma solução clara que funcione em animais vivos. Algumas tentativas de aprimorar o processo mostraram potencial, mas muitas vezes funcionam apenas em tipos celulares específicos ou em certos locais do DNA.
53BP1 na Reparação do DNA
O Papel daUm jogador chave no processo de reparo do DNA é uma proteína chamada 53BP1. Essa proteína ajuda a decidir qual método de reparo a célula vai usar. Ela promove o método propenso a erros (NHEJ) quando os cromossomos-irmãos estão disponíveis, mas o impede em outras fases do ciclo celular. Se a 53BP1 for removida, a célula pode reparar o DNA com mais precisão, o que é benéfico para a edição de genes.
O Novo Composto EoHR
Um novo composto chamado EoHR foi desenvolvido para inibir a 53BP1. Ao bloquear essa proteína, a esperança é incentivar o método de reparo mais preciso (HDR) ao usar o CRISPR. Isso poderia ajudar a melhorar as taxas de sucesso da edição de genes em modelos animais.
Como o EoHR Funciona
O EoHR ataca especificamente a parte da 53BP1 que se liga a proteínas histonas, que ajudam a embalar o DNA. Quando o EoHR está presente, ele impede que a 53BP1 se acumule nos locais de dano no DNA, favorecendo o uso do HDR em vez do NHEJ para reparos. Isso leva a resultados melhores ao tentar editar genes.
Testando o EoHR em Células
Os pesquisadores realizaram testes com células para ver se o EoHR poderia realmente bloquear a 53BP1. Eles usaram um sistema especial que permite criar quebras de fita dupla no DNA e monitorar quão bem a 53BP1 se acumula nesses locais. Com o EoHR presente, a formação de 53BP1 em locais de dano foi significativamente reduzida, sugerindo que o EoHR é eficaz em inibir essa proteína.
Impacto na Eficiência do CRISPR
A promessa do EoHR foi testada usando o CRISPR para criar camundongos geneticamente modificados. Os pesquisadores injetaram tanto o Cas9-uma ferramenta usada no CRISPR-quanto o EoHR em óvulos fertilizados de camundongos. Fazendo isso, eles queriam ver se o EoHR melhoraria a eficiência da edição de genes.
Os resultados foram positivos. A integração de genes nos camundongos foi mais bem-sucedida quando o EoHR foi incluído. Na verdade, a taxa de inserções de genes bem-sucedidas aumentou mais de duas vezes em comparação com o grupo controle sem EoHR. Isso é importante porque significa que menos tentativas e menos tempo são necessários para criar animais geneticamente modificados.
EoHR e Segurança
A segurança do EoHR foi cuidadosamente avaliada. O composto não mostrou sinais de toxicidade durante os testes, mesmo em doses mais altas. A saúde dos embriões em desenvolvimento e dos camundongos recém-nascidos permaneceu normal quando tratados com EoHR, indicando que é uma opção segura para futuras pesquisas.
Aplicações Além dos Camundongos
Como a parte da proteína 53BP1 que o EoHR ataca é a mesma em muitos animais, as vantagens observadas em camundongos provavelmente podem se estender a outras espécies também. Isso inclui animais agrícolas importantes, como porcos e vacas. O potencial de aumentar a eficiência da edição de genes em várias espécies pode abrir novas oportunidades na biotecnologia e na agricultura.
Conclusão
O EoHR é uma ferramenta promissora que poderia melhorar significativamente o sucesso da edição de genes CRISPR em animais. Ao atacar a 53BP1, ajuda a favorecer métodos de reparo de DNA mais precisos. Isso pode tornar o processo de criação de animais geneticamente modificados mais rápido e eficiente, mantendo a segurança. As implicações dessa pesquisa podem levar a avanços não só na ciência, mas também na agricultura, medicina e muito mais. À medida que os pesquisadores continuam explorando o potencial do EoHR, ele pode desempenhar um papel crítico no futuro da engenharia genética.
Título: Improved gene targeting in vivo using EoHR, a small molecule inhibitor of 53BP1
Resumo: Precise genome editing by programmable nucleases such as Cas9 has revolutionised medical research by enabling the creation of gene-edited or knock-in mouse models of disease. However, a major limitation of the approach is the inefficient process of homology driven recombination (HDR) from an exogenous DNA repair template. This is because error-prone, 53BP1-dependent non-homologous end joining (NHEJ) predominates at Cas9-induced double strand breaks (DSBs). Here we report the validation of a cell-permeable and non-toxic inhibitor of 53BP1 called EoHR. In vitro, EoHR prevents 53BP1 binding to dimethylated lysine 20 on histone H4, a marker of DSBs. In cells, EoHR prevents localisation of 53BP1 at nuclease mediated DSBs and promotes HDR at a Cas9-induced break. When tested in vivo during mouse Cas9-mediated gene editing, inclusion of EoHR at the time of microinjection more than doubled the recovery of correctly edited mice and halved the time to project success. Our work shows that inhibition of 53BP by EoHR is a simple and robust way to increase HDR at Cas9 breaks that can also dramatically increase the success rates of animal model generation.
Autores: Stephen Headey, S. Spencer, F. O'Donoghue, A. Ristovski, A. Glaser, S. Maniam, M. Mohsenipour, A. Soch, A. J. Deans
Última atualização: 2024-06-01 00:00:00
Idioma: English
Fonte URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.05.30.596757
Fonte PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.05.30.596757.full.pdf
Licença: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/
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