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# Ciências da saúde# Medicina genetica e genomica

Methylação do DNA e Dicas para a Saúde das Articulações

Pesquisas mostram como a metilação do DNA afeta o desenvolvimento da cartilagem e o risco de osteoartrite.

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A formação dos membros e articulações humanas começa entre quatro e oito semanas após a concepção. Nessa fase, brotos de membros crescem e grupos de células se juntam para formar a Cartilagem inicial que vai moldar nossos ossos. Esse processo é guiado por uma proteína chave conhecida como SOX9.

À medida que os membros se desenvolvem, as articulações são formadas através de um processo coordenado onde células na cartilagem nas futuras localizações das articulações mudam para criar um grupo único de células chamado de interzone. Essa interzone dá origem a todas as partes de uma articulação madura, incluindo a cartilagem que cobre as extremidades dos ossos, o revestimento que produz o líquido articular, o menisco que funciona como um amortecedor e os ligamentos que mantêm a articulação unida. Para a articulação do joelho especificamente, a formação inicial da cartilagem começa por volta da sétima semana, e aos oito semanas, um espaço claro dentro da articulação, conhecido como cavidade sinovial, começa a se formar.

O desenvolvimento de membros e articulações depende do tempo preciso da atividade genética, que é essencial para construir os vários tecidos nessas estruturas. Os genes são ativados e desativados de uma maneira muito controlada, influenciados por fatores como mudanças na estrutura do DNA, que podem afetar como eles funcionam.

Uma das mudanças importantes no DNA que afeta a atividade gênica é chamada de Metilação do DNA. A metilação ocorre em sítios específicos do DNA e é reconhecida por certas enzimas que adicionam um grupo metila ao DNA. Esse processo geralmente pode diminuir a atividade dos genes próximos, bloqueando as proteínas que normalmente os ativariam. No entanto, a relação entre metilação e atividade gênica pode ser complexa. Às vezes, a presença de metilação dentro de um gene pode estar associada à expressão desse gene.

Osteoartrite e Metilação do DNA

O estudo da metilação do DNA tem sido particularmente relevante para entender a osteoartrite (OA), que é uma das principais causas de incapacidade em adultos mais velhos. A OA é caracterizada pela degradação da cartilagem nas articulações, especialmente nos joelhos e quadris. Pesquisas mostraram que há diferenças notáveis nos padrões de metilação do DNA entre articulações saudáveis e afetadas por OA, fornecendo insights sobre como a doença se desenvolve e progride.

Fatores genéticos desempenham um papel significativo no risco de desenvolver OA, contribuindo com cerca de 30% do risco ao longo da vida. Ao combinar dados de metilação do DNA com estudos genéticos, os pesquisadores identificaram conexões entre marcadores genéticos específicos e mudanças de metilação associadas ao risco de OA. Essa relação ajuda a esclarecer os processos biológicos que contribuem para a saúde e doença das articulações.

Fatores associados à forma das articulações e sua capacidade de suportar peso também influenciam o risco de OA na idade avançada. Além disso, a composição da cartilagem em si desempenha um papel em quão bem ela pode lidar com estresse ao longo do tempo. Estudos recentes indicaram que mesmo no desenvolvimento fetal, mudanças genéticas e epigenéticas relacionadas ao risco de OA podem ser detectadas, sugerindo que esses mecanismos podem ter efeitos que duram a vida toda.

Pesquisa sobre o Desenvolvimento da Cartilagem Fetal

Em um estudo recente, pesquisadores analisaram amostras de cartilagem do joelho em desenvolvimento de fetos humanos com idades entre 7 e 21 semanas. Eles queriam determinar como os padrões de metilação do DNA mudam durante esse tempo e como esses padrões se relacionam com o risco de OA mais tarde na vida. A análise envolveu um total de 72 amostras coletadas da parte distal do fêmur, o osso da coxa.

Eles encontraram mudanças significativas na Expressão Gênica à medida que os fetos se desenvolviam. Certos marcadores que são importantes para a formação da cartilagem mostraram diminuição da expressão, enquanto outros envolvidos na cartilagem madura aumentaram. Por exemplo, genes como GDF5 e SOX9 diminuíram na expressão, enquanto PRG4, associado à cartilagem madura, aumentou.

Os pesquisadores também descobriram que a metilação do DNA variou significativamente ao longo do desenvolvimento. Eles identificaram milhares de regiões específicas no DNA onde os níveis de metilação mudaram, fornecendo uma visão de como a cartilagem se forma e amadurece ao longo do tempo. Essas mudanças foram categorizadas em diferentes grupos com base em se envolveram aumento ou diminuição de metilação.

Além disso, eles observaram que diferentes processos biológicos estavam enriquecidos nessas regiões, mostrando que certos genes envolvidos no desenvolvimento da cartilagem e articulações estavam sendo ativamente regulados durante esse tempo.

O Papel da Cromatina Aberta

Para entender melhor a função dessas regiões metiladas, os pesquisadores examinaram como elas se sobrepunham a áreas de cromatina aberta. As regiões de cromatina aberta são partes do DNA que são mais acessíveis à maquinaria que lê os genes. A presença de metilação diferencial nessas áreas sugere que elas desempenham um papel ativo na regulação da expressão gênica durante o desenvolvimento da cartilagem.

Das regiões metiladas identificadas, uma parte significativa se sobrepôs a áreas de cromatina aberta, destacando sua importância potencial na regulação gênica. As mudanças na metilação do DNA mostraram-se correlacionadas com a expressão dos genes próximos, indicando que essas regiões podem servir como pontos de controle para a atividade gênica.

Dimorfismo Sexual na Metilação

Os pesquisadores também exploraram diferenças na metilação do DNA entre amostras de cartilagem masculina e feminina. Eles identificaram regiões específicas onde os níveis de metilação variaram significativamente com base no sexo, com a maioria das diferenças mostrando níveis mais altos de metilação em fêmeas. Essa descoberta se alinha com outros estudos que destacam a importância do dimorfismo sexual para entender como doenças como a OA podem afetar homens e mulheres de maneira diferente.

Mecanismos Epigenéticos e Riscos de Osteoartrite

Os pesquisadores realizaram uma extensa análise para identificar como os Locais de Quantidade de Traços de Metilação do DNA (mQTLs) associados ao risco de OA estão ativos durante o desenvolvimento da cartilagem. Eles encontraram numerosos mQTLs significativos por todo o genoma, indicando os efeitos generalizados da variação genética nos padrões de metilação do DNA.

Ao examinar como esses mQTLs ocorrem junto com fatores de risco genéticos conhecidos para a OA, os pesquisadores puderam ver possíveis conexões entre os dois. Isso sugere que algumas influências genéticas sobre o risco de OA podem ser estabelecidas muito cedo na vida através de mecanismos epigenéticos.

Conclusão

Esse estudo fornece insights valiosos sobre a natureza dinâmica da metilação do DNA durante o desenvolvimento da cartilagem humana. Destaca a importância da regulação gênica na formação das articulações e os possíveis efeitos a longo prazo que esses processos iniciais podem ter na saúde das articulações à medida que as pessoas envelhecem.

As descobertas enfatizam a complexidade da OA e suas origens desenvolvimentais, sugerindo que fatores da primeira infância podem desempenhar um papel crítico na formação do risco de doenças articulares mais tarde na vida. Pesquisas futuras poderiam explorar mais essas conexões e potencialmente levar a novas estratégias para prevenir ou tratar a OA, entendendo suas raízes no desenvolvimento inicial.

Fonte original

Título: Epigenetic mechanisms of osteoarthritis risk in human skeletal development

Resumo: The epigenome, including the methylation of cytosine bases at CG dinucleotides, is intrinsically linked to transcriptional regulation. The tight regulation of gene expression during skeletal development is essential, with [~]1/500 individuals born with skeletal abnormalities. Furthermore, increasing evidence is emerging to link age-associated complex genetic musculoskeletal diseases, including osteoarthritis (OA), to developmental factors including joint shape. Multiple studies have shown a functional role for DNA methylation in the genetic mechanisms of OA risk using articular cartilage samples taken from aged patients. Despite this, our knowledge of temporal changes to the methylome during human cartilage development has been limited. We quantified DNA methylation at [~]700,000 individual CpGs across the epigenome of developing human articular cartilage in 72 samples ranging from 7-21 post-conception weeks, a time period that includes cavitation of the developing knee joint. We identified significant changes in 8% of all CpGs, and >9400 developmental differentially methylated regions (dDMRs). The largest hypermethylated dDMRs mapped to transcriptional regulators of early skeletal patterning including MEIS1 and IRX1. Conversely, the largest hypomethylated dDMRs mapped to genes encoding extracellular matrix proteins including SPON2 and TNXB and were enriched in chondrocyte enhancers. Significant correlations were identified between the expression of these genes and methylation within the hypomethylated dDMRs. We further identified 811 CpGs at which significant dimorphism was present between the male and female samples, with the majority (68%) being hypermethylated in female samples. Following imputation, we captured the genotype of these samples at >5 million variants and performed epigenome-wide methylation quantitative trait locus (mQTL) analysis. Colocalization analysis identified 26 loci at which genetic variants exhibited shared impacts upon methylation and OA genetic risk. This included loci which have been previously reported to harbour OA-mQTLs (including GDF5 and ALDH1A2), yet the majority (73%) were novel (including those mapping to CHST3, FGF1 and TEAD1). To our knowledge, this is the first extensive study of DNA methylation across human articular cartilage development. We identify considerable methylomic plasticity within the development of knee cartilage and report active epigenomic mediators of OA risk operating in prenatal joint tissues.

Autores: Sarah J Rice, E. McDonnell, S. E. Orr, M. J. Barter, D. Rux, A. Brumwell, N. Wrobel, L. Murphy, L. M. Overmann, A. K. Sorial, D. A. Young, J. Soul

Última atualização: 2024-05-06 00:00:00

Idioma: English

Fonte URL: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2024.05.05.24306832

Fonte PDF: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2024.05.05.24306832.full.pdf

Licença: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

Alterações: Este resumo foi elaborado com a assistência da AI e pode conter imprecisões. Para obter informações exactas, consulte os documentos originais ligados aqui.

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