O Papel do TNFSF na Progressão do Câncer de Mama
Investigando como os genes TNFSF impactam o tratamento do câncer de mama e os resultados para os pacientes.
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Índice
- Imunoterapia para Câncer de Mama
- Desafios no Tratamento do Câncer de Mama
- Superfamília do Fator de Necrose Tumoral (TNFSF)
- Analisando a Expressão da TNFSF no Câncer de Mama
- Níveis de Expressão de mRNA
- Análise de Expressão Gênica Diferencial
- Padrões de Expressão de Proteínas
- Associação da Expressão da TNFSF com Características dos Pacientes
- Alterações Genéticas nos Membros da TNFSF
- Identificando Fatores de Transcrição e MicroRNA
- Valor Prognóstico da TNFSF no Câncer de Mama
- Correlação com Infiltração de Células Imunes
- Essencialidade Gênica dos Membros da TNFSF
- Conclusão
- Fonte original
- Ligações de referência
O Câncer de mama é o tipo de câncer mais diagnosticado no mundo todo. Em 2020, cerca de 2,3 milhões de novos casos foram registrados. Esse tipo de câncer aparece quando as células da mama começam a crescer de forma descontrolada. Esses crescimentos podem começar em várias partes da mama e podem se tornar malignos, ou seja, podem se espalhar para outras partes do corpo. O câncer de mama é classificado em quatro tipos principais com base em diferentes características, como status de receptores e padrões de Expressão gênica. Os tipos são Luminal A, Luminal B, HER2-positivo, e câncer de mama triplo-negativo (TNBC).
Imunoterapia para Câncer de Mama
A imunoterapia é uma abordagem promissora para tratar o câncer de mama. Vários tratamentos baseados em imunidade foram aprovados pela FDA (Administração de Alimentos e Medicamentos dos EUA). Esses tratamentos geralmente envolvem inibidores de ponto de checagem imunológica, que visam proteínas específicas nas células Imunes que muitas vezes impedem o sistema imunológico de atacar as células cancerosas. Algumas dessas proteínas incluem CTLA-4, PD1 e PD-L1. Esses tratamentos mostraram efeitos benéficos no tratamento de vários tipos de câncer, incluindo alguns tipos de câncer de mama.
Desafios no Tratamento do Câncer de Mama
Apesar dos avanços no tratamento e nas formas de detecção precoce, muitos pacientes ainda enfrentam resultados ruins, principalmente por causa da disseminação do câncer (metástase) e resistência à quimioterapia. Por isso, é crucial encontrar opções de tratamento melhores e marcadores prognósticos para o câncer de mama.
Superfamília do Fator de Necrose Tumoral (TNFSF)
A TNFSF consiste em 19 proteínas que desempenham um papel na gestão das respostas imunes e da inflamação, além de regular o crescimento e morte celular. A inflamação no ambiente do tumor pode afetar significativamente o desenvolvimento e progresso do tumor.
Pesquisas de 1975 mostraram que o fator de necrose tumoral (TNF), um membro dessa família, pode dificultar o crescimento do câncer. Enquanto alguns estudos sugerem que certos membros da TNFSF podem agir como supressores de tumor, outros indicam que eles podem apoiar o crescimento do câncer. Por exemplo, o APRIL (TNFSF13) foi identificado em células de câncer de mama, e experimentos mostraram que reduzir sua presença pode atrapalhar o crescimento do tumor.
Outros membros da TNFSF, como TNFSF10, TNFSF14 e TNFSF15, estão associados ao processo de apoptose, ou morte celular programada. Alguns membros da TNFSF também foram estudados em outros tipos de câncer, como câncer de pulmão e de rim.
Devido à variedade de funções exibidas pela família TNFSF, mais investigações sobre seus papéis no câncer de mama são necessárias.
Analisando a Expressão da TNFSF no Câncer de Mama
Níveis de Expressão de mRNA
Usando um banco de dados, os pesquisadores analisaram os níveis de expressão de mRNA dos membros da TNFSF em pacientes com câncer de mama. Eles descobriram que certos genes da TNFSF apresentaram expressão mais alta em tecidos cancerosos em comparação com tecidos normais. Por exemplo, FASLG, LTA, LTB, TNF, e vários outros estavam em níveis elevados em Tumores primários, enquanto dois genes, EDA e TNFSF12, mostraram expressão significativamente reduzida nas amostras tumorais. Notavelmente, o TNFSF10 teve a maior expressão entre todos.
Análise de Expressão Gênica Diferencial
Uma análise mais aprofundada revelou diferenças significativas na expressão de certos genes da TNFSF ao comparar tecidos tumorais e metastáticos. Para alguns genes, os níveis de expressão eram notavelmente diferentes, indicando papéis variados durante a progressão do câncer. Em contraste, outros genes mostraram nenhuma diferença significativa na expressão.
Padrões de Expressão de Proteínas
Além da análise de mRNA, os pesquisadores revisaram os padrões de expressão de proteínas para os membros da TNFSF em tecidos normais e cancerosos. Algumas proteínas estavam ausentes em tecidos normais e cancerosos, enquanto outras estavam presentes apenas em tecidos tumorais. Certas proteínas mostraram níveis mais altos no câncer em comparação com tecidos normais, indicando seus potenciais papéis no câncer de mama.
Associação da Expressão da TNFSF com Características dos Pacientes
Investigando a relação entre os níveis de mRNA da TNFSF e características clínicas em pacientes com câncer de mama, foi revelado que alguns genes mostraram uma diminuição na expressão à medida que o câncer progrediu, enquanto outros aumentaram. Por exemplo, pacientes mais jovens apresentaram níveis de expressão da TNFSF diferentes em comparação com pacientes mais velhos, indicando que a idade pode influenciar a expressão gênica.
O estudo também avaliou as ligações entre a expressão da TNFSF e o status hormonal (como status de ER e PR). Certos genes da TNFSF exibiram níveis de expressão variados dependendo do status dos receptores hormonais, revelando seus potenciais papéis em diferentes subtipos de câncer.
Alterações Genéticas nos Membros da TNFSF
Ao avaliar dados de amostras de câncer, os pesquisadores descobriram que vários genes da TNFSF sofreram alterações genéticas. Esses achados destacaram potenciais vias e interações entre membros da família TNFSF e outros genes que podem estar envolvidos no desenvolvimento do câncer de mama.
Identificando Fatores de Transcrição e MicroRNA
Os pesquisadores tiveram como objetivo identificar quais fatores de transcrição e microRNAs regulam os genes da TNFSF. Essa análise revelou importantes elementos reguladores associados aos membros da família TNFSF, que poderiam levar a uma melhor compreensão de como esses genes influenciam o câncer de mama.
Valor Prognóstico da TNFSF no Câncer de Mama
A análise dos dados de sobrevivência dos pacientes indicou que níveis mais altos de mRNA de certos genes da TNFSF estavam associados a uma melhor sobrevida global (OS) e sobrevida livre de recorrência (RFS). Genes como FASLG, TNF e TNFSF10 mostraram correlações positivas com os resultados dos pacientes. Por outro lado, alguns genes como TNFSF4 foram ligados a taxas de sobrevivência ruins.
Correlação com Infiltração de Células Imunes
Informações de outro banco de dados ilustraram que vários genes da TNFSF estavam positivamente correlacionados com a presença de células imunes em tecidos cancerosos. Essa descoberta sugere que esses genes podem influenciar como as células imunes interagem com as células cancerosas, potencialmente afetando a progressão do câncer e os resultados para os pacientes.
Essencialidade Gênica dos Membros da TNFSF
Uma análise abrangente constatou que nenhum dos genes da TNFSF foi considerado essencial para o câncer de mama, sugerindo que eles podem não ser alvos adequados para drogas. No entanto, certos genes mostraram seletividade e eficiência em outros tipos de câncer, indicando que seus papéis podem variar significativamente entre diferentes tipos de câncer.
Conclusão
Os dados coletados a partir das várias análises mostram que os membros da família TNFSF desempenham papéis complexos no câncer de mama. Alguns genes parecem apoiar o crescimento tumoral, enquanto outros podem agir para suprimir. O envolvimento desses genes na resposta imunológica destaca sua importância no câncer. Mais pesquisas são necessárias para confirmar suas funções e explorar seu potencial como alvos terapêuticos ou marcadores prognósticos no câncer de mama. A exploração dos genes da TNFSF abre portas para melhorar estratégias de tratamento e um melhor cuidado para os pacientes na gestão do câncer de mama.
Título: A comprehensive bioinformatics analysis to identify potential prognostic biomarkers among TNFSF superfamily in breast cancer
Resumo: Breast cancer (BC) is one of most important mortality factors among women therefore to find important genes in BC can help early diagnosis, treatment or prevention. TNFSF or tumor necrosis factor Superfamily have an important role in various cancers. In BC, some of studies have found dual roles for these genes. In this research, we conducted a comprehensive and detailed bioinformatics study on this family. UALCAN, TNMplot, UCSC Xena, GEPIA, The Human Protein Atlas, Kaplan-Meier plotter, bc-GenExMiner, cBioPortal, STRING, GeneMANIA, Enrichr, TIMER and shinyDepMap were used for analysis. We found that these genes play their role through the immune system and the high expression of eight FASLG, LTB, TNF, TNFSF8, TNFSF10, TNFSF11, TNFSF12, TNFSF13 genes were positively associated with OS and RFS. Overall, our data showed that these genes can be considered as prognostic biomarkers. Further, our results suggest that this family has anti-tumor activity.
Autores: Abolfazl Moradi, F. Vafadar Esfahani, A. Mohammadian
Última atualização: 2024-06-12 00:00:00
Idioma: English
Fonte URL: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2024.06.11.24308760
Fonte PDF: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2024.06.11.24308760.full.pdf
Licença: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
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