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Ribossomos: Mais do que apenas indicadores de crescimento

Explorando a relação complicada entre os níveis de ribossomos e o crescimento celular.

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Células crescem e se dividem em ritmos diferentes, e esse Crescimento geralmente tá relacionado ao número de Ribossomos que elas têm. Ribossomos são essenciais pra fabricar proteínas que as células precisam pra crescer e funcionar. A galera geralmente acha que células que crescem mais rápido têm mais ribossomos porque precisam produzir mais proteínas rapidinho. Mas, a relação entre o número de ribossomos e o crescimento é mais complicada do que parece.

Ribossomos e Crescimento Celular

Pesquisas mostram que quando as células crescem mais rápido, elas geralmente têm mais ribossomos. Isso parece meio óbvio, já que ribossomos são super importantes pro crescimento celular. Mas, fazer ribossomos é caro pras células. Eles são feitos de várias partes, e criá-los exige muita energia e recursos. Por causa disso, as células tentam equilibrar seus níveis de ribossomos com base nos nutrientes disponíveis e na velocidade que conseguem crescer.

As células respondem rapidamente às mudanças no ambiente, às vezes ajustando seus níveis de ribossomos em minutos. Essa coordenação foi observada em muitos tipos de células e em várias condições de crescimento. No geral, à medida que a taxa de crescimento de uma população celular aumenta, os níveis médios de ribossomos nessa população também aumentam.

Importância dos Níveis de Ribossomos

A ligação entre taxas de crescimento e níveis de ribossomos levou a descobertas importantes em várias áreas. Saber os níveis de ribossomos pode ajudar a prever como as células vão crescer. Os pesquisadores também aprenderam sobre os sistemas de controle que ajudam as células a ajustar seu crescimento com base nos recursos disponíveis. Além disso, essas descobertas deram pistas sobre como as células podem mudar com o tempo pra usar os ribossomos de forma mais eficaz.

Apesar desse entendimento, muita pesquisa foca nos níveis médios de ribossomos em grupos de células. Tem sido desafiador estudar ribossomos em células individuais por causa do tamanho minúsculo delas. Em vez disso, os cientistas costumam analisar grandes grupos de células, medindo o conteúdo total de ribossomos e observando como isso muda em diferentes condições de crescimento. No entanto, olhar apenas pra média pode esconder diferenças entre células individuais. Algumas células podem ter altos níveis de ribossomos e crescer devagar, enquanto outras podem ter baixos níveis e crescer rápido. Essa variação pode significar que existem diferentes maneiras de as células gerenciarem seus recursos e se adaptarem aos ambientes.

Investigando Níveis de Ribossomos em Células Únicas

Pra estudar as diferenças nos níveis de ribossomos entre células individuais, os pesquisadores recentemente usaram um novo método que permite ver o RNA de células microbianas únicas. Esse método consegue capturar muitas moléculas de RNA de células individuais, tornando possível ver como os níveis de ribossomos variam em nível de célula única.

Nessa pesquisa, os cientistas examinaram milhares de células de levedura e bactérias em diferentes momentos durante o crescimento delas. Eles descobriram que, enquanto os níveis médios de ribossomos combinavam com as taxas de crescimento da população total, células individuais mostraram uma gama muito maior de níveis de ribossomos. Isso significa que, em nível de célula única, a abundância de ribossomos não previa o crescimento tão bem quanto quando se olhava pra população como um todo.

Heterogeneidade entre Células

A variação nos níveis de ribossomos entre células geneticamente idênticas crescidas nas mesmas condições foi inesperada. Quando os cientistas analisaram de perto células conhecidas por crescer rapidamente, descobriram que nem todas tinham altos níveis de ribossomos ou mostravam sinais de crescimento acelerado. Algumas células com muitos ribossomos apresentaram respostas relacionadas ao estresse em vez de sinais de crescimento. Isso sugere que o conteúdo de ribossomos pode não ser o melhor indicador de quão rápido uma célula está crescendo.

Os achados indicam que, enquanto os níveis de ribossomos podem prever taxas de crescimento em nível populacional, eles não fazem isso para células individuais. Isso levanta questões sobre a compreensão atual de como as células gerenciam seus recursos e crescem.

Taxa de Crescimento e Níveis de Ribossomos

Uma teoria pra explicar a variação nos níveis de ribossomos é que pode estar relacionada às diferenças nas taxas de crescimento das células individuais. Porém, os dados mostram que células que crescem rápido podem, na verdade, ter a maior variabilidade no conteúdo de ribossomos. Isso significa que a taxa de crescimento de uma célula pode não influenciar diretamente seus níveis de ribossomos, como se pensava antes.

Ao olhar para as taxas de crescimento das células individuais, ficou claro que as células que crescem mais rápido têm menos variação nas taxas de crescimento. Células que crescem mais devagar, por outro lado, mostraram mais variação, o que é o oposto do que se poderia esperar se os níveis de ribossomos estivessem fortemente ligados às taxas de crescimento.

Examinando Outros Fatores

Pra entender melhor por que os níveis de ribossomos variam entre células únicas, os pesquisadores analisaram outras moléculas de RNA nas células. Eles descobriram que, mesmo quando as populações de células pareciam estáveis, ainda havia diferenças significativas na Expressão Gênica. Algumas células mostraram sinais de crescimento rápido, enquanto outras expressaram genes relacionados a respostas de estresse.

Essa descoberta sugere que as células podem não estar todas em um verdadeiro estado de crescimento constante, apesar das aparências. Em vez disso, pode haver uma mistura de células se preparando para diferentes condições futuras, refletindo diferentes estratégias evolutivas.

Abundância de Ribossomos e Sinais de Crescimento

Pra investigar mais a relação entre a abundância de ribossomos e sinais de crescimento, os cientistas separaram as células com base em seus níveis de ribossomos. Depois, analisaram a expressão gênica dessas células separadas. A expectativa era que células com altos níveis de ribossomos mostrassem sinais de crescimento consistentes, enquanto aquelas com baixos níveis de ribossomos mostrassem respostas de estresse.

No entanto, os resultados mostraram que células de ambas as categorias tinham padrões variados de expressão gênica, com células que tinham altos e baixos níveis de ribossomos mostrando sinais de estresse e crescimento. Isso sugere que o conteúdo de ribossomos não se correlaciona diretamente com o potencial de crescimento de uma célula.

Implicações dos Resultados

Esses resultados desafiam a visão tradicional de que as células têm níveis otimizados de ribossomos com base nas condições de crescimento. Em vez disso, as descobertas apontam pra uma relação mais complexa entre os níveis de ribossomos e o comportamento celular. As células podem exibir uma gama de estratégias pra lidar com seus ambientes, sugerindo que células individuais podem não estar buscando a mesma estratégia focada no crescimento. Essa diversidade pode servir como um amortecedor contra mudanças ambientais, permitindo que populações se adaptem a condições flutuantes.

Conclusão

Em resumo, enquanto os níveis de ribossomos podem dar pistas sobre o crescimento celular em nível populacional, eles não preveem o crescimento de células individuais de maneira precisa. A variação na abundância de ribossomos entre células geneticamente idênticas sugere que existem múltiplas estratégias em jogo quando se trata de crescimento e gestão de recursos. Essa complexidade destaca a necessidade de mais pesquisas pra reconciliar as leis tradicionais de crescimento com a heterogeneidade observada em células únicas. Entender essas nuances pode levar a novas ideias sobre o comportamento celular e a adaptabilidade.

Fonte original

Título: Single-cell heterogeneity in ribosome content and the consequences for the growth laws

Resumo: Across species and environments, the ribosome content of cell populations correlates with population growth rate. The robustness and universality of this correlation have led to its classification as a "growth law." This law has fueled theories about how evolution selects for microbial organisms that maximize their growth rate based on nutrient availability, and it has informed models about how individual cells regulate their growth rates and ribosomal content. However, due to methodological limitations, this growth law has rarely been studied at the level of individual cells. While populations of fast-growing cells tend to have more ribosomes than populations of slow-growing cells, it is unclear whether individual cells tightly regulate their ribosome content to match their environment. Here, we employ recent groundbreaking single-cell RNA sequencing techniques to study this growth law at the single-cell level in two different microbes, S. cerevisiae (a single-celled yeast and eukaryote) and B. subtilis (a bacterium and prokaryote). In both species, we observe significant variation in the ribosomal content of single cells that is not predictive of growth rate. Fast-growing populations include cells exhibiting transcriptional signatures of slow growth and stress, as do cells with the highest ribosome content we survey. Broadening our focus to non-ribosomal transcripts reveals subpopulations of cells in unique transcriptional states suggestive that they have evolved to do things other than maximize their rate of growth. Overall, these results indicate that single-cell ribosome levels are not finely tuned to match population growth rates or nutrient availability and cannot be predicted by a Gaussian process model that assumes measurements are sampled from a normal distribution centered on the population average. This work encourages the expansion of growth law and other models that predict how growth rates are regulated or how they evolve to consider single-cell heterogeneity. To this end, we provide extensive data and analysis of ribosomal and transcriptomic variation across thousands of single cells from multiple conditions, replicates, and species.

Autores: Leandra M Brettner, K. Geiler-Samerotte

Última atualização: 2024-10-08 00:00:00

Idioma: English

Fonte URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.04.19.590370

Fonte PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.04.19.590370.full.pdf

Licença: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/

Alterações: Este resumo foi elaborado com a assistência da AI e pode conter imprecisões. Para obter informações exactas, consulte os documentos originais ligados aqui.

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