O Impacto das Interações Ambiente-por-Ambiente na Resistência a Medicamentos
Analisando como combinações ambientais afetam as respostas genéticas na resistência a medicamentos.
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Índice
- A Importância de Estudar Interações Genéticas
- Ferramentas Para Estudar Interações Genéticas
- Interações Ambiente-por-Ambiente
- A Conexão com Resistência a drogas
- Descobertas Recentes sobre ExE
- O Papel das Interações de Pares de Medicamentos
- Variabilidade entre Mutantes
- Insights sobre Resistência a Drogas
- Agrupando Mutantes por Perfis de ExE
- Modelando Interações ExE
- O Futuro da Pesquisa sobre ExE
- Conclusão
- Fonte original
Interações genéticas se referem a situações onde duas mudanças genéticas juntas têm um efeito diferente de apenas somar seus efeitos individuais. Um termo chave nessa área é "epistasia". Esse conceito é importante para os cientistas porque dificulta prever o que vai acontecer quando mutações ocorrem em organismos, como plantas ou animais.
A Importância de Estudar Interações Genéticas
Os cientistas estão de olho nas interações genéticas há muitos anos. Essas interações desafiam o objetivo da biologia de prever como mutações vão afetar as características de um organismo. Tem uma discussão rolando sobre o quanto essas interações complicam as previsões e quais tipos são mais relevantes. Por exemplo, os pesquisadores observam interações entre genes e entre genes e o ambiente.
Interações genéticas têm atraído interesse além da genética tradicional, chamando atenção de áreas como ecologia e biologia evolutiva. Por exemplo, essas interações podem ajudar a identificar quais genes trabalham juntos em sistemas biológicos, prever como as espécies podem evoluir e revelar limites de como as proteínas evoluem.
Ferramentas Para Estudar Interações Genéticas
Para estudar interações genéticas, os cientistas usam várias estruturas matemáticas e experimentais. Essas estruturas ajudam a quantificar interações entre genes e entre genes e o ambiente. Porém, tem uma área que recebeu pouca atenção: interações ambiente-por-ambiente, ou ExE.
Interações Ambiente-por-Ambiente
Interações ExE acontecem quando o efeito combinado de dois ambientes diferentes nas características de um organismo não é o que você esperaria dos efeitos individuais desses ambientes. Por exemplo, se um microrganismo cresce lentamente em ambientes de alta salinidade e alta temperatura, mas não cresce ainda mais devagar quando exposto a ambos ao mesmo tempo, isso seria um exemplo de ExE.
A falta de ênfase em ExE na genética pode vir do fato de que não envolve fatores genéticos, mas sim foca nos ambientais, o que pode torná-la menos atraente para geneticistas. Mas estudar ExE tem benefícios significativos. Pode dar insights sobre como as respostas dos organismos aos ambientes funcionam e como essas interações podem variar dependendo do fundo genético de uma espécie.
Resistência a drogas
A Conexão comUma razão prática para estudar ExE é sua relação com a resistência a drogas. Quando testam como diferentes medicamentos funcionam juntos, os pesquisadores geralmente examinam interações para encontrar combinações que sejam mais eficazes do que usar os medicamentos sozinhos. Entender ExE pode levar a novas estratégias para combater infecções e doenças, especialmente à medida que a resistência ao tratamento se torna uma preocupação crescente.
Apesar da extensa pesquisa sobre interações de drogas, muita dela não considera o fundo genético que pode influenciar como esses medicamentos interagem. Essa lacuna de pesquisa é crucial porque mutações podem alterar como os medicamentos interagem, levando a resultados diferentes na eficácia do tratamento.
Descobertas Recentes sobre ExE
Estudos recentes começaram a dar insights sobre como a ExE funciona. Usando experimentos que envolvem várias linhagens de levedura resistente a drogas, os cientistas conseguem medir como essas linhagens se comportam sob diversas condições ambientais. Essa pesquisa revelou que o efeito de pares de medicamentos na aptidão dos organismos muitas vezes não corresponde às previsões baseadas apenas no desempenho de medicamentos individuais.
O Papel das Interações de Pares de Medicamentos
Em estudos recentes, os pesquisadores descobriram que as interações ExE variam significativamente entre diferentes pares de medicamentos e entre diferentes linhagens genéticas. Eles examinaram a aptidão de Mutantes de levedura sob várias condições, olhando especificamente para situações com medicamentos únicos e combinações de dois medicamentos.
Os resultados mostraram que a aptidão em uma combinação de medicamentos não pode ser prevista uniformemente com base na aptidão em condições de medicamentos únicos. Por exemplo, enquanto algumas combinações de medicamentos prejudicaram o organismo mais do que o esperado (isso é conhecido como sinergia), outras combinações ajudaram mais do que o previsto (conhecido como antagonismo).
Variabilidade entre Mutantes
Curiosamente, os pesquisadores descobriram que as variações em ExE podem ocorrer não apenas entre diferentes pares de medicamentos, mas também entre diferentes mutantes expostos aos mesmos medicamentos. Mesmo mutantes com mudanças genéticas semelhantes mostraram respostas diferentes ao mesmo par de medicamentos. Isso sugere uma relação complexa entre o fundo genético e as respostas ambientais.
Insights sobre Resistência a Drogas
Através desse trabalho, os cientistas identificaram genes específicos que levam a padrões semelhantes em ExE entre diferentes mutantes. Certas mutações em genes podem resultar em comportamentos semelhantes em termos de interações de medicamentos, enquanto outras não. Por exemplo, dois genes diferentes podem produzir linhagens que reagem de maneira bastante diferente às mesmas combinações de medicamentos, exibindo sinergia ou antagonismo.
Agrupando Mutantes por Perfis de ExE
Os pesquisadores descobriram que os mutantes podem ser agrupados com base em seus perfis de ExE, o que pode fornecer poder preditivo sobre como novos mutantes se comportarão em condições semelhantes. Quando mutantes com interações ExE semelhantes são agrupados, isso sugere que mecanismos subjacentes similares podem estar em ação.
Modelando Interações ExE
Para entender melhor a ExE, os cientistas propõem modelá-la da mesma forma que as interações genéticas são abordadas. Fazer isso envolve aplicar informações de condições sem medicamentos para criar previsões sobre o efeito combinado de medicamentos na aptidão dos mutantes. Esse novo método pode aumentar a capacidade de prever como combinações de medicamentos funcionarão, especialmente na luta contra infecções resistentes a medicamentos.
O Futuro da Pesquisa sobre ExE
As descobertas desses estudos ressaltam a importância da ExE tanto na genética quanto no tratamento de drogas. Há muitas oportunidades para explorar interações ExE em mais detalhes, o que pode ajudar a melhorar nosso conhecimento sobre como genes e ambientes interagem. Esse entendimento pode, em última análise, auxiliar na criação de melhores estratégias para gerenciar doenças causadas por organismos resistentes a medicamentos.
Estudar ExE e sua variabilidade através de fundos genéticos abre novas avenidas para pesquisas que podem avançar nosso entendimento de sistemas biológicos. Os cientistas são incentivados a aceitar esse desafio em campos que vão da genética à ecologia, o que pode levar a tratamentos mais eficazes e melhores insights biológicos.
Conclusão
Em conclusão, interações ExE representam um aspecto crucial e muitas vezes negligenciado da pesquisa genética. Ao estudar como diferentes ambientes interagem sem a influência da genética, os cientistas podem descobrir insights que aprimoram a compreensão dos processos biológicos. Essas interações são essenciais para desenvolver novos métodos e estratégias para enfrentar a resistência a medicamentos e outros desafios na biologia. Conforme a pesquisa avança, o objetivo é integrar essas descobertas em modelos mais amplos que considerem tanto fatores genéticos quanto ambientais.
Título: Environment by environment interactions (ExE) differ across genetic backgrounds (ExExG)
Resumo: While the terms "gene-by-gene interaction" (GxG) and "gene-by-environment interaction" (GxE) are widely recognized in the fields of quantitative and evolutionary genetics, "environment-byenvironment interaction" (ExE) is a term used less often. In this study, we find that environmentby-environment interactions are a meaningful driver of phenotypes, and moreover, that they differ across different genotypes (suggestive of ExExG). To support this conclusion, we analyzed a large dataset of roughly 1,000 mutant yeast strains with varying degrees of resistance to different antifungal drugs. Our findings reveal that the effectiveness of a drug combination, relative to single drugs, often differs across drug resistant mutants. Remarkably, even mutants that differ by only a single nucleotide change can have dramatically different drug x drug (ExE) interactions. We also introduce a new framework that more accurately predicts the direction and magnitude of ExE interactions for some mutants. Understanding how ExE interactions change across genotypes (ExExG) is crucial not only for modeling the evolution of pathogenic microbes, but also for enhancing our knowledge of the underlying cell biology and the sources of phenotypic variance within populations. While the significance of ExExG interactions has been overlooked in evolutionary and population genetics, these fields and others stand to benefit from understanding how these interactions shape the complex behavior of living systems.
Autores: Kara Schmidlin, C. B. Ogbunugafor, A. Sastokas, K. Geiler-Samerotte
Última atualização: 2024-10-10 00:00:00
Idioma: English
Fonte URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.05.08.593194
Fonte PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.05.08.593194.full.pdf
Licença: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/
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