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Como a COVID Longa Influencia a Evolução do Vírus

Pesquisas mostram que infecções crônicas impactam o surgimento de novas variantes da COVID-19.

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Durante a pandemia de COVID-19, várias novas Variantes do vírus apareceram, causando ondas de infecções e mortes. Essas variantes têm uma habilidade única de escapar da proteção imune construída a partir de infecções passadas ou vacinações. Às vezes, essas novas versões do vírus conseguem se espalhar mais facilmente graças a mudanças em sua estrutura que ajudam a se ligar melhor às células humanas ou aumentam a quantidade do vírus em pessoas infectadas.

Um aspecto surpreendente dessas variantes é a rapidez com que elas parecem surgir. Por exemplo, variantes como Alpha, Delta e Omicron mostraram muitas mudanças que não foram vistas em versões anteriores. Essa mudança rápida é inesperada, já que a propagação do vírus COVID normalmente limita a velocidade com que ele pode evoluir. Normalmente, durante uma infecção, apenas algumas mudanças ocorrem, e ainda menos dessas mudanças são transmitidas para outros. Portanto, faria sentido o vírus evoluir devagar, adicionando mudanças benéficas gradualmente.

Especialistas propuseram várias ideias para explicar como uma nova variante muito contagiosa poderia surgir de repente com tantas mudanças. Uma sugestão envolve a propagação oculta entre as pessoas, onde o vírus continua a circular sem ser percebido por longos períodos, permitindo que ele evolua mais. No entanto, isso significaria que as variantes precisariam passar despercebidas por um bom tempo. Outra ideia é que o vírus poderia circular em animais e depois voltar para os humanos, levando a variantes com várias mudanças. Além disso, interações entre diferentes Mutações poderiam acelerar o processo, fazendo com que certas combinações de mudanças aparecessem com mais frequência.

Estudos recentes sugeriram que infecções de COVID duradouras em algumas pessoas poderiam levar ao desenvolvimento dessas variantes altamente diferentes. A maioria das infecções de COVID se resolve rapidamente, mas algumas pessoas, especialmente aquelas com sistemas imunológicos enfraquecidos, podem ter o vírus persistindo por meses. Durante essas infecções prolongadas, o vírus tem mais tempo para fazer muitas mudanças, e algumas dessas mudanças podem se tornar comuns dentro daquela pessoa. Estudos também mostraram que certas mutações ligadas à fuga imune foram vistas nesses casos duradouros.

Reconhecendo a importância potencial das infecções de COVID prolongadas, pesquisadores começaram a criar modelos para ver como elas poderiam afetar a propagação do vírus. Alguns modelos incluem indivíduos imunocomprometidos e consideram a evolução do vírus dentro deles. Previsões sugerem que aumentos notáveis em novas variantes devem ocorrer quando muitas pessoas com sistemas imunológicos fracos estão infectadas e quando há interações entre mutações que ajudam o vírus a escapar da resposta imune.

Em um estudo detalhado, especialistas examinaram como Infecções Crônicas influenciam o surgimento de variantes altamente contagiosas. O modelo deles sugeriu que as mutações nessas infecções de longo prazo poderiam se estabilizar com o tempo e que as vantagens das mutações poderiam começar a se acumular, especialmente quando determinados limiares de mudanças são alcançados. Esse padrão poderia ajudar o vírus a se adaptar rapidamente e se tornar mais eficaz em se espalhar para novos hospedeiros.

Essa pesquisa levou ao desenvolvimento de um modelo simples para entender a evolução do vírus. Esse modelo considera tanto como um vírus muda dentro de uma pessoa infectada quanto como ele se espalha para outros. O objetivo principal é ver como infecções de longo prazo podem moldar como um vírus muda ao longo do tempo. Usando dados sobre mutações do vírus COVID, os pesquisadores demonstraram que explosões repentinas de mutações, semelhantes ao que foi visto durante a pandemia, poderiam ocorrer até mesmo em condições mais simples. Eles examinaram como fatores como a taxa de mutação, a duração média da infecção e o número de infecções crônicas afetaram esses padrões de explosões.

Entender como o vírus muda envolve olhar para dois níveis diferentes: mudanças que acontecem dentro de uma pessoa e como essas mudanças afetam a capacidade do vírus de infectar outros. Dentro de uma pessoa infectada, o vírus pode criar uma mistura de diferentes versões de si mesmo. Então, quando o vírus se espalha, algumas dessas mudanças podem ser transmitidas ou perdidas.

Para desenvolver esse modelo, os cientistas começaram com uma única versão do vírus e permitiram que ele evoluísse ao longo do tempo. Eles introduziram mutações e testaram quais mudanças ajudaram o vírus a sobreviver e se espalhar melhor. Nesses modelos, descobriram que quando há apenas casos agudos de COVID, as mutações não se acumulam muito, e uma versão do vírus tende a dominar. Mas quando infecções crônicas estão envolvidas, dois resultados foram possíveis. Alguns mostraram um aumento constante nas mutações, enquanto outros tiveram picos repentinos nas taxas de mutação, semelhantes ao que ocorreu durante a pandemia.

Para entender melhor o que leva a esses picos de mutações, os pesquisadores criaram um diagrama de fase. Esse diagrama mostra com que frequência as explosões acontecem com base em diferentes parâmetros do modelo. Eles descobriram que, à medida que a duração das infecções agudas aumentava, a probabilidade de explosões repentinas de mutações diminuía. Isso acontece porque casos agudos mais longos podem levar a semelhanças na composição genética do vírus, reduzindo as chances de mudanças notáveis.

Curiosamente, os pesquisadores descobriram que o surgimento de explosões foi afetado pela quantidade de infecções crônicas. Inicialmente, um pequeno número de casos crônicos poderia levar a explosões mais frequentes. No entanto, se as infecções crônicas fossem muito comuns, a competição entre as variantes do vírus resultaria em menos explosões repentinas.

Ao estudar como infecções crônicas afetam a taxa geral de mudança no vírus, eles observaram que a taxa de mutações em um indivíduo com infecção crônica era maior do que na população geral. Isso porque as mutações poderiam se acumular sem serem limitadas pela necessidade de se espalhar. Mesmo quando nenhuma explosão foi observada, a presença de infecções crônicas ainda levou a uma taxa de mutação aumentada em comparação com situações com apenas infecções agudas. Isso sugere que infecções crônicas poderiam impactar significativamente a rapidez com que um vírus evolui, mesmo que novas variantes não apareçam de repente.

Essa pesquisa analisou como o vírus evolui em infecções de curto e longo prazo para entender melhor a dinâmica das mutações do COVID-19. Eles descobriram que infecções crônicas podem influenciar significativamente como o vírus muda, levando a explosões repentinas de novas variantes. Isso é especialmente verdadeiro quando a duração das infecções agudas é curta, permitindo que o vírus se adapte rapidamente.

Os pesquisadores também notaram que como as infecções crônicas afetam as taxas de mutação é complexo. Enquanto ter algumas infecções crônicas pode levar a mais explosões, ter muitas pode causar competição que limita o surgimento de novas variantes. O modelo utilizado tem alguns aspectos simplificadores, como assumir que os efeitos das mutações são consistentes entre diferentes hospedeiros. No entanto, pesquisas futuras poderiam explorar mais a fundo os efeitos de diferentes mutações e como elas funcionam dentro de vários indivíduos.

No geral, as descobertas enfatizam que infecções crônicas podem moldar como os vírus evoluem e que o monitoramento contínuo dessas infecções é essencial para antecipar como novas variantes podem surgir. Compreender os padrões de mutação e Transmissão será crucial para desenvolver estratégias eficazes para controlar a propagação do COVID-19 e futuros surtos virais.

Fonte original

Título: Chronic infections can generate SARS-CoV-2-like bursts of viral evolution without epistasis

Resumo: Multiple SARS-CoV-2 variants have arisen during the first years of the pandemic, often bearing many new mutations. Several explanations have been offered for the surprisingly sudden emergence of multiple mutations that enhance viral fitness, including cryptic transmission, spillover from animal reservoirs, epistasis between mutations, and chronic infections. Here, we simulated pathogen evolution combining within-host replication and between-host transmission. We found that, under certain conditions, chronic infections can lead to SARS-CoV-2-like bursts of mutations even without epistasis. Chronic infections can also increase the global evolutionary rate of a pathogen even in the absence of clear mutational bursts. Overall, our study supports chronic infections as a plausible origin for highly mutated SARS-CoV-2 variants. More generally, we also describe how chronic infections can influence pathogen evolution under different scenarios.

Autores: John P Barton, E. Rodriguez-Horta, J. Strahan, A. Dinner

Última atualização: 2024-10-07 00:00:00

Idioma: English

Fonte URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.10.06.616878

Fonte PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.10.06.616878.full.pdf

Licença: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

Alterações: Este resumo foi elaborado com a assistência da AI e pode conter imprecisões. Para obter informações exactas, consulte os documentos originais ligados aqui.

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