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# Ciências da saúde# Medicina genetica e genomica

Vínculos Genéticos Entre COVID-19 e Doenças Pulmonares

Pesquisadores descobrem conexões genéticas que influenciam tratamentos para COVID-19 e doenças pulmonares.

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Os cientistas têm estudado como nossos genes se relacionam com doenças, especialmente aquelas que afetam seriamente os pulmões. Uma das maneiras que eles usam se chama estudos de associação genômica em larga escala (GWAS). Isso significa olhar para os genes de muitas pessoas para encontrar padrões que conectem variações genéticas a doenças. Essas variações costumam aparecer como mudanças em um único bloco de construção do DNA chamado nucleotídeo. Ao identificar essas variações, os pesquisadores podem aprender mais sobre como as doenças se desenvolvem e encontrar tratamentos potenciais.

O Que São SNPS Pleiotrópicos?

Algumas variações genéticas, conhecidas como Polimorfismos de nucleotídeo único (SNPs), podem influenciar mais de uma doença ao mesmo tempo. Isso é chamado de pleiotropia. Entender esses laços genéticos compartilhados pode iluminar os processos biológicos comuns envolvidos em diferentes doenças. Por exemplo, alguns SNPs podem ser importantes tanto para COVID-19 grave quanto para outra doença pulmonar chamada fibrose pulmonar idiopática (FPI).

A Importância das Evidências Genéticas no Desenvolvimento de Medicamentos

Encontrar essas conexões genéticas pode ajudar no desenvolvimento de medicamentos. Quando os pesquisadores conseguem ligar um gene a uma doença, têm mais chances de desenvolver medicamentos eficazes. Na verdade, muitos medicamentos aprovados foram apoiados por evidências genéticas humanas. Isso significa que entender os fatores genéticos pode levar a tratamentos mais bem-sucedidos.

O Caso da COVID-19 e da FPI

Recentemente, os cientistas analisaram de perto os SNPs que estão ligados tanto a COVID-19 grave quanto à FPI. Eles usaram uma ferramenta chamada Análise Interativa de Fenótipos Cruzados do banco de dados GWAS (iCPAGdb) para encontrar sinais genéticos compartilhados entre essas duas doenças. Na pesquisa, eles descobriram uma sobreposição significativa em SNPs que poderiam estar conectados a ambas as doenças.

Um desses SNPs está localizado perto de um gene chamado DPP9. Este gene tem sido associado a ambas as doenças, sugerindo que pode desempenhar um papel em seu desenvolvimento. Curiosamente, a fibrose pulmonar pós-COVID-19 (PCPF), uma condição que alguns sobreviventes de COVID-19 enfrentam, compartilha semelhanças com a FPI.

A Necessidade de Entender a PCPF

A fibrose pulmonar pós-COVID-19 ocorre quando o tecido pulmonar fica cicatrizado e rígido. Isso leva a dificuldades respiratórias, muitas vezes exigindo um transplante de pulmão. Como a doença crítica é um grande fator de risco para a PCPF, encontrar maneiras de estudar essa conexão é crucial. Evidências mostram que um número significativo de sobreviventes de COVID-19 enfrenta problemas pulmonares a longo prazo, enfatizando a necessidade de pesquisas para descobrir os mecanismos subjacentes.

Novas Descobertas sobre Locais Genéticos Compartilhados

Ao analisar os dados mais recentes sobre COVID-19 e FPI, os cientistas identificaram locais genéticos compartilhados. Eles encontraram cinco SNPs que provavelmente são influenciados pelas mesmas variações genéticas. Dois desses SNPs apresentam alelos de risco reversos nas duas doenças. Isso sugere que, embora possa haver um sinal genético compartilhado, seus efeitos podem ser diferentes no contexto de cada doença.

Identificando Genes Causais

Para identificar os genes responsáveis por esses SNPs compartilhados, os cientistas observaram como diferentes SNPs afetaram a expressão gênica. Eles usaram vários conjuntos de dados para ver se os sinais que observaram nos GWAS estavam relacionados à expressão gênica. Através dessa análise, identificaram vários genes candidatos.

Por exemplo, descobriram que para o SNP ligado ao DPP9, a expressão do gene era significativa em tecidos pulmonares específicos afetados pela FPI. Na verdade, as evidências apontaram que o DPP9 desempenha um papel crucial em como o sistema imunológico responde a infecções e lesões nos pulmões.

O Papel dos Fatores Ambientais

Eles também consideraram como fatores ambientais, como fumar, afetam a expressão gênica. Fumar é conhecido por aumentar o risco de doenças pulmonares, tornando importante analisar tecidos pulmonares de pessoas com histórico de tabagismo. Isso ajudou a revelar novas conexões que não teriam sido visíveis de outra forma.

O Impacto do Contexto Celular

Entender os tipos celulares específicos onde esses genes estão ativos ajuda a identificar seus papéis na doença. Para o ATP11A, os cientistas descobriram que sua expressão estava ligada à resposta imunológica e poderia influenciar os processos de reparo pulmonar. Isso sugere que o gene pode estar agindo de maneira diferente no contexto de COVID-19 em comparação com a FPI.

A Importância dos Dados Específicos do Contexto

Analisar dados de contextos específicos ajuda a esclarecer essas relações complexas. Por exemplo, quando os cientistas olharam para monócitos, um tipo de célula imunológica, descobriram que a expressão de ATP11A estava intimamente relacionada aos sinais genéticos em COVID-19 e FPI. Isso indica que certos genes podem desempenhar papéis essenciais na inflamação e cicatrização de tecidos nos pulmões.

A Complexidade da Regulação Gênica

A regulação dos genes pode ser afetada por vários fatores, incluindo a metilação do DNA. Os pesquisadores descobriram que variações nos padrões de metilação poderiam influenciar a expressão gênica, adicionando mais uma camada de complexidade à forma como a genética e o ambiente interagem no contexto das doenças pulmonares.

Implicações para Tratamento

As descobertas sobre essas associações genéticas não apenas melhoram nossa compreensão das doenças, mas também abrem potenciais caminhos para tratamento. Por exemplo, terapias voltadas para regular os níveis de DPP9 podem ser benéficas para pacientes com FPI ou aqueles se recuperando de COVID-19 grave.

Genes Causais e Suas Funções

A partir da pesquisa, os cientistas identificaram dois genes principais de interesse: ATP11A e DPP9. Esses genes estavam ligados a mecanismos específicos da doença. Embora ambos os genes apresentassem mudanças na expressão em resposta à doença, seus papéis pareciam divergir com base no contexto da doença.

  • ATP11A: Este gene está envolvido em vários processos celulares, incluindo como as células reagem a danos e inflamações. No contexto de COVID-19, pode influenciar como o sistema imunológico reage ao vírus.
  • DPP9: Este gene é crucial para regular a inflamação. Níveis mais baixos de DPP9 podem levar a respostas inflamatórias aumentadas, potencialmente exacerbando os danos pulmonares tanto na COVID-19 quanto na FPI.

Um Chamado para Mais Pesquisa

Apesar dessas percepções, a relação entre genética e doença continua complicada. Ainda há muito a aprender sobre como esses genes interagem e como melhor usar esse conhecimento em tratamentos. Estudos futuros devem continuar a explorar diferentes tipos celulares, contextos de doenças e influências ambientais para descobrir mais sobre essas relações complexas.

O Caminho à Frente

A compreensão das associações genéticas e suas implicações para doenças como COVID-19 e FPI pode reformular pesquisas e estratégias de tratamento futuras. À medida que os cientistas descobrem mais sobre os laços genéticos e os genes causais, essas percepções podem levar a terapias inovadoras que visam esses caminhos específicos, beneficiando pacientes que lidam com essas condições sérias.

Conclusão

Em conclusão, o estudo da genética está revelando conexões importantes com doenças respiratórias, aumentando o potencial para novos tratamentos. Ao ligar variações genéticas a doenças, os pesquisadores podem descobrir caminhos compartilhados que afetam múltiplas condições. Esse conhecimento pode, em última análise, levar a estratégias mais eficazes para gerenciar doenças como COVID-19 e fibrose pulmonar idiopática, melhorando os resultados dos pacientes e a qualidade de vida no processo. Entender essas conexões é vital enquanto continuamos a enfrentar desafios de saúde global e buscamos melhores soluções para doenças pulmonares.

Fonte original

Título: Context-specific eQTLs reveal causal genes underlying shared genetic architecture of critically ill COVID-19 and idiopathic pulmonary fibrosis

Resumo: Most genetic variants identified through genome-wide association studies (GWAS) are suspected to be regulatory in nature, but only a small fraction colocalize with expression quantitative trait loci (eQTLs, variants associated with expression of a gene). Therefore, it is hypothesized but largely untested that integration of disease GWAS with context-specific eQTLs will reveal the underlying genes driving disease associations. We used colocalization and transcriptomic analyses to identify shared genetic variants and likely causal genes associated with critically ill COVID-19 and idiopathic pulmonary fibrosis. We first identified five genome-wide significant variants associated with both diseases. Four of the variants did not demonstrate clear colocalization between GWAS and healthy lung eQTL signals. Instead, two of the four variants colocalized only in cell-type and disease-specific eQTL datasets. These analyses pointed to higher ATP11A expression from the C allele of rs12585036, in monocytes and in lung tissue from primarily smokers, which increased risk of IPF and decreased risk of critically ill COVID-19. We also found lower DPP9 expression (and higher methylation at a specific CpG) from the G allele of rs12610495, acting in fibroblasts and in IPF lungs, and increased risk of IPF and critically ill COVID-19. We further found differential expression of the identified causal genes in diseased lungs when compared to non-diseased lungs, specifically in epithelial and immune cell types. These findings highlight the power of integrating GWAS, context-specific eQTLs, and transcriptomics of diseased tissue to harness human genetic variation to identify causal genes and where they function during multiple diseases.

Autores: Dennis C Ko, T. Dalapati, L. Wang, A. G. Jones, J. Cardwell, I. R. Konigsberg, Y. R. Bosse, D. D. Sin, W. Timens, K. Hao, I. Yang

Última atualização: 2024-07-14 00:00:00

Idioma: English

Fonte URL: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2024.07.13.24310305

Fonte PDF: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2024.07.13.24310305.full.pdf

Licença: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

Alterações: Este resumo foi elaborado com a assistência da AI e pode conter imprecisões. Para obter informações exactas, consulte os documentos originais ligados aqui.

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