Melhorando as previsões de incerteza em GNNs para cálculos de energia
Novos métodos melhoram as estimativas de incerteza em GNNs para modelar as energias dos materiais.
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Índice
- O Desafio da Incerteza nas GNNs
- Soluções Propostas para a Quantificação de Incerteza
- A Importância da Descoberta Eficiente de Materiais
- Entendendo Previsões de Energia Relaxada
- Examinando Métodos de Previsão de Incerteza
- Metodologias na Quantificação de Incerteza
- Métodos de Ensemble
- Distâncias no Espaço Latente
- Estimativa de Média e Variância
- Modelos de Regressão de Sequência
- Validação das Previsões de Incerteza
- Teste CI(Var(Z))
- Gráfico de Calibração Baseado em Erro
- Benchmarking de Desempenho dos Métodos de Incerteza
- Exemplos Interpretabis
- Exemplo de Materiais em Bloco
- Exemplo de Sistema de Laje de Alumínio
- Exemplo de Cobertura de Oxigênio em Platina
- Conclusão
- Fonte original
- Ligações de referência
Redes neurais gráficas (GNNs) são um tipo de modelo de aprendizado de máquina que pode ser usado pra prever propriedades de moléculas. Esses modelos têm mostrado um grande potencial em prever a energia relaxada de novos materiais, que é importante pra descobrir catalisadores inovadores que podem armazenar energia de maneira mais eficiente. Mas, tem um desafio e tanto: as GNNs costumam ter dificuldade em fornecer estimativas de incerteza confiáveis ao prever esses valores de energia.
As estimativas de incerteza são cruciais porque ajudam os pesquisadores a entenderem quando podem confiar nas previsões feitas por esses modelos. Se uma GNN prevê um determinado valor de energia, é importante saber quão confiante o modelo está sobre essa Previsão. Se o modelo estiver inseguro, pode ser necessário fazer mais cálculos ou experimentos pra verificar os resultados.
O Desafio da Incerteza nas GNNs
As GNNs avançaram bastante em substituir métodos tradicionais de cálculo de energia em materiais, que podem ser muito caros e demorados. No entanto, a maioria dos métodos atuais não considera adequadamente a incerteza. Isso é especialmente desafiador em cálculos de energia relaxada, onde a distribuição de erros pode não seguir padrões típicos.
Entender a natureza desses erros é vital, pois pode ajudar a melhorar a confiabilidade das previsões. Portanto, é necessário desenvolver melhores métodos de estimativa e quantificação da incerteza nas previsões das GNNs.
Soluções Propostas para a Quantificação de Incerteza
Neste trabalho, sugerimos que métricas tradicionais pra avaliar incerteza podem não ser as mais adequadas pras previsões de energia relaxada. Em vez disso, sugerimos o uso de métodos que não assumem uma distribuição específica de erros. Essa abordagem poderia oferecer uma imagem mais clara de como as estimativas de incerteza se saem.
Nosso foco é desenvolver uma nova tarefa pra avaliar métodos de incerteza especificamente pras GNNs e usar uma variedade de conjuntos de dados pra testes. Nossas descobertas indicam que certos métodos baseados em distâncias podem oferecer as estimativas de incerteza mais precisas e eficientes ao prever energias relaxadas.
A Importância da Descoberta Eficiente de Materiais
À medida que a demanda por energia continua a crescer, encontrar novos materiais pra catalisadores é essencial. Melhorar o armazenamento de energia de fontes renováveis é crucial pra enfrentar as mudanças climáticas. A descoberta computacional de materiais ajuda a acelerar esse processo permitindo que os pesquisadores filtrem muitos materiais potenciais rapidamente e com menos gastos em comparação aos experimentos físicos.
Melhorias recentes nas GNNs e técnicas de aprendizado de máquina podem aprimorar significativamente o processo de descoberta de novos materiais. Esses métodos simplificam os cálculos necessários pra prever energia e forças em diferentes estruturas atômicas, o que é vital pra otimizar o desempenho dos catalisadores.
Entendendo Previsões de Energia Relaxada
Cálculos de energia relaxada envolvem minimizar a energia de uma dada estrutura, encontrando assim sua forma mais estável. Pra uma certa combinação de catalisador e adsorvato, essa energia relaxada mínima se relaciona diretamente com o quão bem o catalisador pode reagir e selecionar caminhos durante uma reação.
Usar GNNs pra essas previsões pode acelerar significativamente o processo. Ao empregar técnicas como AdsorbML, os pesquisadores podem derivar previsões de energia de adsorção muito mais rápido do que os métodos tradicionais, mantendo um nível razoável de precisão.
No entanto, apesar desses avanços, as GNNs frequentemente produzem previsões de energia não confiáveis, especialmente quando aplicadas a novas situações fora de seus dados de treinamento. É aqui que as estimativas de incerteza se tornam extremamente importantes, guiando os pesquisadores sobre quando confiar no modelo e quando buscar cálculos adicionais ou validações.
Examinando Métodos de Previsão de Incerteza
Em nosso estudo, focamos em uma arquitetura específica de GNN conhecida como EquiformerV2, que é bastante respeitada por prever propriedades moleculares relacionadas a catalisadores. Comparamos o EquiformerV2 com outro modelo de GNN bem-sucedido chamado Gemnet-OC. Ambos esses modelos são usados em ferramentas existentes pra prever energias mínimas relaxadas sem incorrer nos custos associados aos cálculos de teoria do funcional de densidade (DFT).
Pra avaliar quão bem os métodos de previsão de incerteza se saem, examinamos várias técnicas estabelecidas. Esses métodos visam medir quão bem as previsões de incerteza de um modelo correspondem aos resultados reais. Descobrimos que algumas das métricas comuns podem não funcionar bem nesse contexto, especialmente porque elas assumem uma distribuição normal de erros, que muitas vezes não é o caso.
Propomos melhores técnicas de Calibração baseadas em intervalos de confiança de bootstrapping. Esses novos métodos se concentram em determinar se as previsões de incerteza estão alinhadas com os erros reais, o que é crucial na avaliação da sua confiabilidade.
Metodologias na Quantificação de Incerteza
Investigamos quatro métodos principais pra previsão de incerteza: métodos de ensemble, distâncias no espaço latente, estimativa de média e variância, e modelos de regressão de sequência.
Métodos de Ensemble
Os métodos de ensemble envolvem treinar vários modelos semelhantes em dados semelhantes e usar a variação em suas previsões pra estimar a incerteza. Treinamos diferentes conjuntos de GNNs pra cálculos de energia e focamos em prever a incerteza do modelo EquiformerV2.
Distâncias no Espaço Latente
As distâncias no espaço latente aproveitam as representações derivadas das GNNs durante o treinamento. Ao calcular as distâncias entre essas representações, podemos avaliar quão semelhantes ou diferentes elas são, o que ajuda a estimar a incerteza quando o modelo encontra novos dados.
Estimativa de Média e Variância
A estimativa de média e variância envolve adicionar novos componentes de saída ao modelo existente pra prever a variância das previsões de energia. Esse método é eficaz quando o modelo pode usar as informações de previsões anteriores pra avaliar a incerteza.
Modelos de Regressão de Sequência
Os modelos de regressão de sequência levam em conta a ordem das previsões em uma sequência. Ao treinar um modelo em todo o processo, ele pode reconhecer padrões na maneira como as Incertezas se comportam ao longo do tempo, permitindo uma melhora nas estimativas de incerteza.
Validação das Previsões de Incerteza
Pra validar nossos métodos de estimativa de incerteza, utilizamos várias métricas que avaliam quão bem as previsões alinham-se aos resultados reais. Reconhecemos que a maioria das métricas comuns se baseia na suposição de erros normalmente distribuídos, o que pode não ser apropriado para nosso contexto específico.
Adotamos dois métodos livres de distribuição: o teste CI(Var(Z)) e o gráfico de calibração baseado em erro. Esses métodos nos permitem avaliar quão bem nossas estimativas de incerteza se comportam sem fazer suposições sobre distribuições de erro.
Teste CI(Var(Z))
O teste CI(Var(Z)) ajuda a determinar se um método de incerteza está corretamente calibrado. Se os valores de incerteza derivados do modelo se encaixam na faixa esperada, isso indica que o método estima a incerteza de forma eficaz.
Gráfico de Calibração Baseado em Erro
O gráfico de calibração baseado em erro ajuda a visualizar conexões entre a incerteza prevista e as medidas reais de erro. Agrupando previsões com base em suas estimativas de incerteza e comparando-as aos erros reais correspondentes, podemos identificar se as previsões do modelo são confiáveis.
Benchmarking de Desempenho dos Métodos de Incerteza
Após nosso processo de validação, fazemos um benchmarking dos vários métodos de previsão de incerteza entre si. O método de distância latente parece ter o melhor desempenho, indicando que captura efetivamente as incertezas que surgem durante os cálculos de energia relaxada.
Embora todos os métodos apresentem algum grau de incerteza em suas previsões, o método de distância latente se destaca por sua capacidade de se manter bem calibrado em comparação com outras técnicas.
Exemplos Interpretabis
Pra demonstrar ainda mais a eficácia dos nossos métodos de previsão de incerteza, examinamos vários estudos de caso específicos envolvendo diferentes sistemas de materiais. Esses exemplos servem pra ilustrar como as incertezas previstas se alinham ao comportamento real, reforçando a confiabilidade dos nossos métodos.
Exemplo de Materiais em Bloco
No nosso primeiro exemplo, analisamos o comportamento de materiais em bloco de cobre e óxido de titânio. Como nenhum desses sistemas estava presente em nossos dados de treinamento, previmos altas estimativas de incerteza. Como esperado, as flutuações nas medições de energia devido a mudanças no espaçamento entre átomos ofuscaram a previsão esperada do modelo, confirmando nossa previsão.
Exemplo de Sistema de Laje de Alumínio
Em seguida, testamos um sistema de laje de alumínio, que tem alguma semelhança com estruturas vistas nos dados de treinamento, embora não seja uma correspondência exata. Aqui, a incerteza prevista variou, alinhando-se bem com as flutuações observadas na energia em diferentes distâncias interatômicas, confirmando que o modelo avaliou com precisão sua incerteza.
Exemplo de Cobertura de Oxigênio em Platina
Nós também examinamos vários níveis de cobertura de oxigênio em uma superfície de platina. À medida que a cobertura aumentava, as previsões de incerteza aumentavam suavemente, correspondendo à nossa expectativa, já que mais situações fora do domínio foram introduzidas. Esse comportamento destaca quão bem calibradas estão nossas estimativas de incerteza em diferentes cenários.
Conclusão
Métodos eficazes de previsão de incerteza para cálculos de energia relaxada de GNNs desempenham um papel vital em aprimorar processos de descoberta de materiais. Ao utilizar métricas livres de distribuição pra validação da incerteza, podemos melhorar a confiabilidade das previsões das GNNs.
Nossas descobertas revelam que métodos de distância latente superam outras medidas de incerteza nessa tarefa, enfatizando a importância de selecionar representações latentes apropriadas para calibração precisa da incerteza.
Enquanto continuamos a refinar essas abordagens, incentivamos a exploração adicional da estimativa de incerteza nas GNNs, abrindo caminho pra métodos e técnicas aprimorados que podem impulsionar o campo da descoberta computacional de materiais pra frente.
Título: Improved Uncertainty Estimation of Graph Neural Network Potentials Using Engineered Latent Space Distances
Resumo: Graph neural networks (GNNs) have been shown to be astonishingly capable models for molecular property prediction, particularly as surrogates for expensive density functional theory calculations of relaxed energy for novel material discovery. However, one limitation of GNNs in this context is the lack of useful uncertainty prediction methods, as this is critical to the material discovery pipeline. In this work, we show that uncertainty quantification for relaxed energy calculations is more complex than uncertainty quantification for other kinds of molecular property prediction, due to the effect that structure optimizations have on the error distribution. We propose that distribution-free techniques are more useful tools for assessing calibration, recalibrating, and developing uncertainty prediction methods for GNNs performing relaxed energy calculations. We also develop a relaxed energy task for evaluating uncertainty methods for equivariant GNNs, based on distribution-free recalibration and using the Open Catalyst Project dataset. We benchmark a set of popular uncertainty prediction methods on this task, and show that latent distance methods, with our novel improvements, are the most well-calibrated and economical approach for relaxed energy calculations. Finally, we demonstrate that our latent space distance method produces results which align with our expectations on a clustering example, and on specific equation of state and adsorbate coverage examples from outside the training dataset.
Autores: Joseph Musielewicz, Janice Lan, Matt Uyttendaele, John R. Kitchin
Última atualização: 2024-08-26 00:00:00
Idioma: English
Fonte URL: https://arxiv.org/abs/2407.10844
Fonte PDF: https://arxiv.org/pdf/2407.10844
Licença: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
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