Insigts sobre a produção de energia das bactérias Treponema
Pesquisas revelam descobertas importantes sobre as enzimas geradoras de energia das bactérias Treponema.
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Índice
Treponema é um grupo de bactérias com formato espiral. Essas bactérias podem ser encontradas em várias criaturas vivas, de insetos a humanos. Algumas delas podem causar doenças sérias nas pessoas, como sífilis, bejel e frambesia. Essas doenças podem gerar grandes problemas de saúde, e tem rolado um aumento preocupante nos casos de sífilis, especialmente a sífilis congênita, que é quando a mãe passa a doença para o bebê durante o parto. Isso pode causar abortos, morte de bebês e diversos problemas de saúde para os recém-nascidos.
Pra lidar melhor com essas doenças, é importante entender mais sobre como essas bactérias funcionam. Porém, estudar as bactérias Treponema no laboratório não é fácil. Um tipo patogênico humano, o T. pallidum, só foi cultivado de forma contínua em ambientes de laboratório recentemente, precisando de células humanas específicas pra crescer. Por isso, os pesquisadores têm explorado o estilo de vida dessas bactérias de várias maneiras, usando técnicas que analisam sua estrutura, comportamento em soluções e seus processos químicos.
Características Únicas do Treponema
As pesquisas revelaram novos aspectos de como essas bactérias funcionam. Descobertas importantes incluem um tipo especial de transportador que ajuda as bactérias a absorverem nutrientes, um novo tipo de transportador para nucleotídeos e uma proteína que ajuda a controlar os níveis de metais dentro das bactérias.
Um aspecto significativo do metabolismo do T. pallidum envolve um sistema químico que depende principalmente de flavinas, que são um tipo de cofator crucial para várias reações biológicas. Notavelmente, essa bactéria não possui muitas enzimas à base de ferro, que são comuns em outros organismos. Em vez disso, ela tem sistemas que utilizam flavinas e até uma rota pra quebrar D-lactato, que acaba produzindo energia na forma de ATP (adenosina trifosfato) e acetato.
O Papel da Acetato Quinase
Neste relatório, o foco é uma enzima específica envolvida nesse processo de geração de energia chamada acetato quinase. Essa enzima ajuda a converter acetil-fosfato e ADP (adenosina difosfato) em ATP. Os pesquisadores identificaram uma proteína chamada TP0476 no T. pallidum que provavelmente atua como essa acetato quinase. Pra entender melhor, eles produziram e purificaram essa proteína, mas seu comportamento em testes laboratoriais não foi muito consistente. Por isso, eles se voltaram pra uma proteína similar do T. vincentii chamada TV0924, que teve um desempenho melhor nas condições de laboratório.
Comparando TP0476 e TV0924
Tanto a TP0476 quanto a TV0924 podem catalisar a conversão de acetil-fosfato e ADP em ATP. No entanto, a TV0924 é muito mais eficaz que a TP0476 nessa reação. A eficiência da TV0924 é significativamente maior, o que significa que ela produz ATP de forma mais eficaz se comparada à TP0476. A diferença no desempenho parece vir mais da velocidade com que cada enzima funciona do que de como elas se ligam aos seus substratos.
Os pesquisadores também estudaram a estabilidade dessas proteínas em diferentes temperaturas. Eles descobriram que a TP0476 é menos estável que a TV0924 quando aquecida, o que pode explicar algumas das diferenças em seu comportamento.
Entendendo a Estrutura da TV0924
Os pesquisadores conseguiram cristalizar a TV0924, permitindo que investigassem sua estrutura. Descobriram que a estrutura cristalina revelou características semelhantes a outras quinases de acetato conhecidas. A estrutura tem áreas distintas ou domínios, cada um com papéis específicos, incluindo um sítio ativo onde as reações ocorrem.
Curiosamente, a TV0924 tem uma parte mais longa no final de sua estrutura em comparação com outras enzimas relacionadas. Essa seção adicional não está perto do sítio ativo, então não está claro qual é o seu papel.
Mecanismo da Enzima e Atividade
A equipe de pesquisa também analisou o sítio ativo da TV0924 pra entender como funciona. Eles co-cristalizaram a proteína com ADP e magnésio, que são componentes envolvidos em sua função. Descobriram que, embora o ADP se ligasse à proteína, não havia evidências de algumas partes da molécula que eles esperavam ver, indicando que a ligação pode não ser exata ou que algumas partes estavam desordenadas.
Alterando aminoácidos específicos na proteína, os pesquisadores puderam identificar quais eram essenciais para a atividade da enzima. Muitas dessas versões modificadas da proteína mostraram quedas significativas na atividade, afirmando que aquelas partes originais são críticas para como a enzima funciona bem.
O Que Tudo Isso Significa
Por meio desses estudos, os pesquisadores confirmaram que a TV0924 é uma acetato quinase válida. Eles demonstraram que ela pode gerar ATP de forma eficaz a partir de acetil-fosfato e ADP, provando que é uma parte importante da via de geração de energia nas bactérias de onde veio.
Por outro lado, a TP0476, embora tenha uma alta semelhança com a TV0924, mostrou diferenças em seu comportamento e eficácia. Ainda assim, parece desempenhar um papel semelhante como acetato quinase em seu próprio ambiente bacteriano. Ambas as proteínas também apresentam uma extensão C-terminal única em suas estruturas, que não está presente na maioria das outras acetato quinases.
Conclusão
A pesquisa oferece insights importantes sobre como certas bactérias Treponema funcionam, especialmente focando em suas vias de produção de energia. Entender esses processos é crucial, especialmente considerando o aumento da incidência de doenças causadas por essas bactérias. Esse conhecimento pode levar a melhores estratégias para tratar e prevenir os problemas de saúde associados a elas.
Em resumo, este estudo destaca a importância de duas enzimas principais, TV0924 e TP0476, que mostram as capacidades metabólicas distintas das espécies de Treponema. Pesquisas contínuas são necessárias pra compreender totalmente esses organismos e seus impactos na saúde humana.
Título: Biophysical and biochemical evidence for the role of acetate kinases (AckAs) in an acetogenic pathway in pathogenic spirochetes
Resumo: Unraveling the metabolism of Treponema pallidum is a key component to understanding the pathogenesis of the human disease that it causes, syphilis. For decades, it was assumed that glucose was the sole carbon/energy source for this parasitic spirochete. But the lack of citric-acid-cycle enzymes suggested that alternative sources could be utilized, especially in microaerophilic host environments where glycolysis should not be robust. Recent bioinformatic, biophysical, and biochemical evidence supports the existence of an acetogenic energy-conservation pathway in T. pallidum and related treponemal species. In this hypothetical pathway, exogenous D-lactate can be utilized by the bacterium as an alternative energy source. Herein, we examined the final enzyme in this pathway, acetate kinase (named TP0476), which ostensibly catalyzes the generation of ATP from ADP and acetyl-phosphate. We found that TP0476 was able to carry out this reaction, but the protein was not suitable for biophysical and structural characterization. We thus performed additional studies on the homologous enzyme (75% amino-acid sequence identity) from the oral pathogen Treponema vincentii, TV0924. This protein also exhibited acetate kinase activity, and it was amenable to structural and biophysical studies. We established that the enzyme exists as a dimer in solution, and then determined its crystal structure at a resolution of 1.36 [A], showing that the protein has a similar fold to other known acetate kinases. Mutation of residues in the putative active site drastically altered its enzyme activity. A second crystal structure of TV0924 in the presence of AMP (at 1.3 [A] resolution) provided insight into the binding of one of the enzymes substrates. On balance, this evidence strongly supported the roles of TP0476 and TV0924 as acetate kinases, buttressing the existence of the acetogenic pathway in pathogenic treponemes.
Autores: Chad A. Brautigam, R. Deka, S.-C. Tso, W. Liu
Última atualização: 2024-10-13 00:00:00
Idioma: English
Fonte URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.10.12.617992
Fonte PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.10.12.617992.full.pdf
Licença: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
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