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O Papel do hnRNP_K na Saúde e Doença Celular

Pesquisas mostram o impacto do hnRNP_K nas funções celulares e em doenças priônicas.

Adriano Aguzzi, S. Sellitto, D. Caredio, M. Bimbati, G. Mariutti, M. Cerisoli, L. Frick, V. Bouris, C. O. O. Morales, D. L. Vena, S. Neupane, F. Baroni, K. Ging, J.-A. Yin, E. De Cecco, A. Armani

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hnRNP_K é uma proteína que tá presente quase em todas as partes do corpo dos mamíferos. Ela tem um papel importante na gestão do RNA, que é crucial pra passar informações nas células. Embora a gente saiba que ela é importante, os jeitos exatos que ela funciona não são totalmente claros. Essa proteína pode ajudar a crescer tumores ou proteger contra eles, dependendo do tipo de câncer. Também tá ligada às funções do cérebro. Mudanças na função normal dela podem levar a desordens cerebrais sérias, como certos síndromes genéticos e doenças que afetam as células nervosas.

hnRNP_K e Doença Priônica

Recentemente, pesquisas mostraram que hnRNP_K ajuda a prevenir que uma proteína mal dobrada, chamada de proteína priônica celular, se transforme numa versão prejudicial que causa doenças. Esse processo é importante já que as doenças priônicas causam danos ao cérebro. Entender como hnRNP_K funciona pode dar uma luz em mecanismos semelhantes em doenças cerebrais.

A Importância de Estudar hnRNP_K

Estudar hnRNP_K é essencial porque pode ter um impacto bem amplo em como as proteínas são dobradas e mantidas nas células. Saber mais sobre suas funções pode esclarecer questões genéticas e moleculares que aparecem em várias desordens cerebrais. Porém, estudar essa proteína traz desafios, já que tirar ela das células pode resultar em morte celular.

O Estudo CRISPR pra Estudar hnRNP_K

Pra driblar o problema da morte celular quando hnRNP_K é removida, os pesquisadores usaram um método chamado CRISPR, que permite editar genes. O objetivo era encontrar outros genes que pudessem ajudar as células a sobreviver sem hnRNP_K. Eles descobriram que eliminar outro gene chamado TFAP2C ajudava as células a viverem mais quando hnRNP_K estava ausente. Mas, quando aumentaram os níveis de TFAP2C, isso deixou a perda de hnRNP_K ainda mais prejudicial pras células.

Através de experimentos, eles perceberam que remover hnRNP_K afetava como certos genes que controlam energia e Metabolismo de gordura funcionavam, levando a níveis de energia mais baixos nas células. Quando eles também removeram TFAP2C, as células mostraram condições energéticas melhores. Por outro lado, aumentar TFAP2C deixava as células mais fracas quando hnRNP_K era removida.

Entendendo Modelos Celulares

Pra estudar as funções de hnRNP_K, os pesquisadores usaram dois tipos de células de câncer cerebral humano. Eles garantiram que essas células expressassem altos níveis de hnRNP_K. Eles removeram com cuidado hnRNP_K dessas células enquanto avaliavam como elas reagiam. Eles observaram que algumas células ainda sobreviveram mesmo sem hnRNP_K, levando eles a isolar aquelas células pra mais estudos.

Depois, confirmaram que a morte causada pela remoção de hnRNP_K era específica, já que podiam restaurar a proteína e prevenir a morte celular ao reintroduzi-la nas células.

Usando um Estudo CRISPR Abrangente

Em seguida, os pesquisadores aplicaram uma abordagem de triagem CRISPR em larga escala usando uma biblioteca que podia mirar milhares de genes. Eles procuraram genes que, quando eliminados, ajudariam as células privadas de hnRNP_K. A análise revelou centenas de genes cuja atividade foi afetada quando hnRNP_K foi removida. Eles focaram em genes que foram positiva e negativamente afetados durante esse processo.

Nos achados, eles destacaram genes específicos relacionados à produção e ao processamento de RNA, indicando uma forte conexão com o papel de hnRNP_K em regular esses processos.

O Papel de TFAP2C na Função de hnRNP_K

Entre os achados mais significativos, TFAP2C apareceu como um fator crucial na interação com hnRNP_K. Quando TFAP2C foi removido, as células mostraram maior resiliência à perda de hnRNP_K. Em contrapartida, aumentar os níveis de TFAP2C deixou as células mais sensíveis à remoção de hnRNP_K. Os pesquisadores notaram que ambas as proteínas desempenhavam papéis no controle da produção de RNA específico.

Isso levou à conclusão de que a atividade de TFAP2C poderia proteger ou prejudicar as células dependendo da interação com hnRNP_K. Essa relação sugere uma regulação complexa das respostas celulares ao estresse.

Observações sobre Mecanismos de Morte Celular

A pesquisa continuou observando se a remoção de hnRNP_K levava à morte celular programada, conhecida como Apoptose. Eles encontraram marcadores aumentados de apoptose em células sem hnRNP_K. No entanto, notaram que quando também removeram TFAP2C, esses sinais de apoptose diminuíram significativamente, sugerindo que TFAP2C tem um papel protetor contra a morte celular nesse contexto.

Explorando Outras Formas de Morte Celular

Os pesquisadores também examinaram se a perda de hnRNP_K poderia levar a um tipo diferente de morte celular conhecido como ferroptose. Eles olharam para marcadores relacionados ao estresse oxidativo que induz ferroptose. Curiosamente, encontraram mudanças em uma proteína que ajuda a combater danos oxidativos, sugerindo que, embora esses mecanismos fossem acionados, não eram as principais vias levando à morte celular quando hnRNP_K estava ausente.

Sequenciamento de RNA pra Entender Atividade Genética

Pra entender melhor as mudanças em nível genético, os pesquisadores sequenciaram RNA de células que tinham diferentes combinações de níveis de hnRNP_K e TFAP2C. Eles encontraram mudanças significativas na expressão de genes relacionados ao metabolismo de gordura e energia. Em particular, identificaram que a ausência de hnRNP_K levou a níveis reduzidos de genes envolvidos nesses processos metabólicos.

Reequilibrando Funções Metabólicas

Os resultados indicaram que a remoção de hnRNP_K atrapalhou a função normal relacionada a energia, e quando também removeram TFAP2C, algumas dessas funções foram restauradas. Certos genes que regulam a produção de energia e metabolismo de gordura pareciam ser influenciados bidirecionalmente por ambas as proteínas, apoiando um papel co-regulador.

Investigando Níveis de Energia nas Células

Devido a distúrbios nas vias metabólicas, os níveis de uma molécula-chave de energia chamada ATP foram significativamente afetados quando hnRNP_K foi removida. Os pesquisadores observaram que essa diminuição de energia levou a um aumento na autofagia, um processo onde as células consomem seus componentes pra obter energia.

Em combinação, a remoção de TFAP2C contribuiu pra uma situação energética mais equilibrada, mostrando quão interligadas essas proteínas são na gestão dos recursos de energia nas células.

O Papel de mTOR e AMPK

A pesquisa também destacou a importância de duas proteínas que ajudam a controlar a energia celular e o metabolismo: mTOR e AMPK. A perda de hnRNP_K diminuiu a atividade de mTOR enquanto aumentou a atividade de AMPK, indicando uma mudança para quebrar componentes celulares pra energia. Novamente, quando TFAP2C foi removido, esses níveis se tornaram mais normalizados, reforçando suas funções inter-relacionadas.

TFAP2C e Regulação de Energia

Curiosamente, aumentar os níveis de TFAP2C levou a uma atividade aumentada de mTOR, sugerindo que TFAP2C apoia diretamente processos que acumulam reservas de energia. Essa descoberta ilustrou como essas proteínas estão intimamente conectadas na orquestração do equilíbrio de gestão de energia nas células.

Propagação de Príons e sua Ligação com hnRNP_K

Dado os papéis emergentes de hnRNP_K na dobra de proteínas e na gestão de energia, os cientistas examinaram suas ligações com doenças priônicas, que são caracterizadas por proteínas mal dobradas. Os estudos indicaram que tanto hnRNP_K quanto TFAP2C têm papéis significativos no controle de como os príons se propagam e como as proteínas mal dobradas se agregam.

Estabelecendo uma Linha Celular Humana pra Estudo

Reconhecendo os riscos associados aos príons humanos, os pesquisadores criaram uma linha celular especialmente modificada que não expressa proteínas priônicas. Isso permitiu que eles estudassem com segurança os efeitos de hnRNP_K e TFAP2C na propagação de príons sem os perigos dos príons infecciosos humanos.

Efeitos de TFAP2C nos Níveis de Príon

Quando testaram como os níveis de TFAP2C afetavam os príons, viram uma diminuição notável nos níveis de proteínas priônicas prejudiciais, sugerindo que TFAP2C tem um papel na regulação não apenas dos processos metabólicos, mas também na prevenção do acúmulo de proteínas prejudiciais.

Investigando o Papel de mTOR na Propagação de Príons

Os pesquisadores exploraram a ideia de que a atividade de mTOR influenciava a propagação de príons. Eles trataram suas células modificadas com drogas que inibem mTOR e descobriram que isso levou a níveis aumentados de príons, refletindo os efeitos da deleção de hnRNP_K. Isso reforçou a noção de que essas proteínas e suas funções no metabolismo e na gestão de energia são cruciais no controle do comportamento dos príons.

Resumo e Conclusão

Em resumo, essa pesquisa destaca a importância de hnRNP_K e TFAP2C nas funções celulares, particularmente na gestão de energia, metabolismo e seus papéis na propagação de doenças priônicas. As interconexões entre essas proteínas sugerem que elas trabalham juntas de forma estreita pra manter a saúde e a estabilidade celular.

Os achados mostraram que triagens CRISPR de sobrevivência sintética poderiam rastrear novas funções de proteínas importantes, mesmo quando a ausência delas é prejudicial pras células. Ao revelar as complexas relações entre hnRNP_K e TFAP2C, esse trabalho abre caminhos pra um entendimento mais profundo de como essas proteínas podem influenciar doenças neurológicas e oferecer potenciais alvos terapêuticos pra explorar.

Fonte original

Título: TFAP2C and HNRNPK control mTOR cell metabolism and prion propagation

Resumo: Heterogeneous Nuclear Ribonucleoprotein K (HNRNPK) is a limiting factor for prion propagation. However, little is known about its function except that it is essential to cell survival. Here, we performed a synthetic-viability CRISPR ablation screen to identify epistatic interactors of HNRNPK. We found that deletion of Transcription Factor AP-2{gamma} (TFAP2C) mitigated the survival of hnRNP_K-depleted LN-229 and U-251 MG cells, whereas its overexpression hypersensitized cells to the loss of hnRNP_K. HNRNPK ablation induced downregulation of genes related to lipid and glucose metabolism, decreased cellular ATP, and enhanced catabolism through inhibition of the mTOR pathway and activation of AMPK. Conversely, TFAP2C deletion countered the energy crisis resulting from HNRNPK ablation, while its overexpression promoted mTOR anabolic activity. TFAP2C overexpression reduced prion propagation in wild-type cells and neutralized the enhanced prion replication of HNRNPK-suppressed cells. Importantly, mTOR inhibition mimicked the effects of HNRNPK silencing, increasing prion propagation. We conclude that TFAP2C and HNRNPK are genetic interactors controlling cell metabolism and bioenergy and influencing prion propagation potentially through modulation of the mTOR pathway.

Autores: Adriano Aguzzi, S. Sellitto, D. Caredio, M. Bimbati, G. Mariutti, M. Cerisoli, L. Frick, V. Bouris, C. O. O. Morales, D. L. Vena, S. Neupane, F. Baroni, K. Ging, J.-A. Yin, E. De Cecco, A. Armani

Última atualização: 2024-10-21 00:00:00

Idioma: English

Fonte URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.10.21.619371

Fonte PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.10.21.619371.full.pdf

Licença: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/

Alterações: Este resumo foi elaborado com a assistência da AI e pode conter imprecisões. Para obter informações exactas, consulte os documentos originais ligados aqui.

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