A Ameaça Crescente da Resistência Antimicrobiana em S. Gallinarum
Analisando os riscos e a disseminação da resistência antimicrobiana em Salmonella enterica sorovar Gallinarum.
― 8 min ler
Índice
A resistência antimicrobiana (RAM) rola quando germes, tipo bactérias, ficam fortes o suficiente pra aguentar os remédios que foram feitos pra matar eles. Isso é uma preocupação crescente no mundo hoje em dia, com estimativas de que mais de 10 milhões de pessoas podem morrer a cada ano por causa da RAM até 2050. Um fator importante no desenvolvimento da RAM são os Genes de Resistência Antimicrobiana (ARGs), que ajudam as bactérias a sobreviverem a tratamentos que, se não fossem por eles, eliminariam as bactérias.
As bactérias normalmente pegam esses genes de resistência de outras bactérias através de um processo chamado Transferência Horizontal de Genes (HGT). Isso significa que elas podem passar a resistência pra bactérias que estão por perto, piorando ainda mais a situação. Mudanças nesses genes de resistência podem ajudar muito as bactérias a se adaptarem a novos ambientes e ficarem mais fortes. Fatores como atividade humana, mudanças climáticas e influências geográficas também têm um papel em como esses genes de resistência se espalham.
Enquanto tentamos lidar com doenças causadas por bactérias resistentes, é importante entender como esses germes se adaptam e se espalham. Essa informação pode ajudar a gente a desenvolver estratégias melhores de tratamento e prevenção. Porém, ainda falta conhecimento sobre como as bactérias mudam e se adaptam em certas regiões.
No passado, os pesquisadores não tinham as ferramentas pra analisar os genomas bacterianos inteiros, o que dificultava entender a variedade e o impacto desses genes de resistência nas bactérias. Os métodos tradicionais usados pra identificar tipos bacterianos eram muitas vezes imprecisos demais. Uma bactéria que chama atenção é a Salmonella, que pode aparecer de várias formas. Um tipo específico, Salmonella enterica serovar Gallinarum (S. Gallinarum), afeta principalmente aves e pode causar altas taxas de mortalidade em aves de capoeira, especialmente em países de baixa renda. Esse patógeno já foi muito comum, mas ficou mais localizado devido a esforços de erradicação.
Atualmente, os antimicrobianos ainda são usados pra tratar infecções causadas pela S. Gallinarum. Contudo, o uso inadequado desses medicamentos levou a um aumento na RAM entre essas bactérias, especialmente com certos remédios. Pra entender melhor como a S. Gallinarum evolui diante das pressões da RAM e se adapta ao seu ambiente local, os pesquisadores coletaram uma grande quantidade de amostras de S. Gallinarum ao longo de muitos anos.
Espalhamento e Distribuição Global da S. Gallinarum
Pra entender o espalhamento global da S. Gallinarum e suas relações genéticas, foi criada uma base de dados extensa com 580 sequências de genoma completo (WGS) da S. Gallinarum. Os pesquisadores analisaram o genoma central em busca de variações pra classificar a S. Gallinarum em três tipos principais: bvSP, bvSG e bvSD. A maioria das amostras pertencia ao tipo bvSP. Cada tipo de S. Gallinarum apresenta um padrão diferente na distribuição geográfica.
A maioria das amostras de bvSP foi encontrada na Ásia, especialmente na China, enquanto menos foram encontradas na Europa, América do Sul e América do Norte. Outro tipo, bvSG, foi encontrado principalmente na América do Sul. Dentro do bvSP, classificações adicionais revelaram cinco linhagens distintas. Curiosamente, os tipos predominantes variaram entre os continentes, com diferentes regiões mostrando padrões diferentes de isolamento e prevalência de linhagens.
Na China, especificamente, diferentes regiões mostraram variações significativas nos tipos de S. Gallinarum presentes. Por exemplo, no leste da China, uma linhagem era muito mais comum, enquanto outra predominava nas regiões do norte. Essa informação ajuda a entender como as adaptações localizadas podem estar ocorrendo devido a fatores ambientais.
Evolução e Transmissão da S. Gallinarum
Analisando o contexto histórico da S. Gallinarum, os pesquisadores queriam descobrir como ela passou de um patógeno amplamente disseminado para um localizado. Usando métodos avançados, eles analisaram a evolução e as rotas históricas de transmissão das linhagens dominantes de S. Gallinarum. Descobriram que uma linhagem, L2b, apareceu na China antes de outra linhagem, L3c, e se espalhou pra Europa por volta de 1800.
Rastreando os padrões de transmissão, ficou claro que essas linhagens estavam interconectadas através de diversos eventos, incluindo movimentos e comércio internacionais. O retorno da L2b à China por volta de 1980 coincidiu com a melhora nas relações entre China e Europa. Esse estudo histórico ajuda a entender como a S. Gallinarum passou a ter um status endêmico, principalmente na China.
Adaptação Local e Isolamento
Os pesquisadores isolaram novas cepas de S. Gallinarum de frangos doentes em dois locais diferentes na China. Dessas amostras, dois tipos principais foram identificados. Surpreendentemente, essas cepas tinham uma relação genética próxima, indicando um certo grau de adaptação local aos seus ambientes. A composição genética dos isolados de diferentes fazendas mostrava diferenças significativas, e não foram encontradas conexões históricas entre eles.
Além disso, os pesquisadores examinaram várias características genéticas e padrões de resistência nessas cepas recém-isoladas. Os resultados mostraram que uma cepa era particularmente boa em invadir animais hospedeiros, sugerindo que pode ser mais eficaz em causar doenças. A presença de certos genes de resistência e elementos genéticos era maior em alguns isolados, indicando diferenças em como essas cepas podem sobreviver em seu ambiente.
Elementos Genéticos Móveis
O Papel dosOs elementos genéticos móveis (EGMs), como plasmídeos, transposons e integrons, desempenham um papel crucial na disseminação de genes de resistência entre as bactérias. Entender as interações entre esses elementos e o resistoma (um conjunto de genes de resistência) é vital pra compreender como a resistência se espalha.
Na S. Gallinarum, muitos tipos de ARGs foram identificados, com alguns sendo mais prevalentes que outros. O estudo encontrou padrões específicos de como esses genes e elementos móveis estavam distribuídos entre diferentes cepas. Essa informação pode ajudar a destacar riscos potenciais para situações de resistência a múltiplos medicamentos.
Por exemplo, em certas cepas, genes de resistência específicos estavam associados a determinados elementos móveis, sugerindo que esses elementos facilitam a troca e a disseminação de características de resistência. As diferenças observadas nos elementos genéticos móveis e genes de resistência entre regiões indicam que fatores localizados podem influenciar muito os padrões de resistência.
Transferência Horizontal de Genes e Suas Implicações
A transferência horizontal de genes é um método significativo através do qual as bactérias ganham novas características, especialmente as de resistência. Esse processo permite que as bactérias compartilhem genes de resistência dentro e entre diferentes espécies, tornando difícil controlar infecções. Este estudo descobriu que uma porcentagem considerável dos genes de resistência identificados havia sido transferida horizontalmente, indicando uma troca ativa de características de resistência entre as bactérias.
No entanto, a frequência dessa transferência gênica varia por região. Geralmente, as regiões do sul da China mostraram a maior taxa de transferência de genes, enquanto as regiões leste e norte tiveram taxas menores. Isso sugere que a dinâmica de transferência de genes pode ser influenciada por práticas e condições locais.
Os achados demonstram que, embora a S. Gallinarum seja principalmente localizada, o compartilhamento de genes de resistência entre regiões representa um risco. Isso significa que até mesmo patógenos localizados podem ter implicações para a saúde pública devido à sua capacidade de compartilhar características de resistência.
Conclusão
O surgimento da RAM é um problema urgente globalmente, afetando a saúde pública e a agricultura. O estudo sobre a S. Gallinarum fornece informações valiosas sobre como a resistência surge, se espalha e se adapta em ambientes localizados. Ele ilustra as relações complexas entre bactérias, suas características genéticas e seus ambientes, destacando a necessidade de estratégias efetivas de monitoramento e gestão.
Conforme a RAM continua a evoluir, entender os fatores que influenciam seu desenvolvimento dentro de contextos geográficos e ambientais específicos será crucial. Esse conhecimento pode ajudar a guiar as respostas de saúde pública e informar esforços pra combater infecções causadas por bactérias resistentes. Pesquisas contínuas sobre o comportamento genético de patógenos como a S. Gallinarum apoiarão o desenvolvimento de melhores abordagens de tratamento e medidas preventivas.
Título: Avian-specific Salmonella enterica Serovar Gallinarum transition to endemicity is accompanied by localized resistome and mobilome interaction
Resumo: Bacterial regional demonstration after global dissemination is an essential pathway for selecting distinct finesses. However, the evolution of the resistome during the transition to endemicity remains unaddressed. Using the most comprehensive whole-genome sequencing dataset of Salmonella enterica serovar Gallinarum (S. Gallinarum) collected from 15 countries, including 45 newly recovered samples from two related local regions, we established the relationship among avian-specific pathogen genetic profiles and localization patterns. Initially, we revealed the international transmission and evolutionary history of S. Gallinarum to recent endemicity through phylogenetic analysis conducted using a spatiotemporal Bayesian framework. Our findings indicate that the independent acquisition of the resistome via the mobilome, primarily through plasmids, transposons, and prophages, shapes a unique antimicrobial resistance profile among different lineages. Notably, the mobilome-resistome combination among distinct lineages exhibits a geographical-specific manner, further supporting a localized endemic mobilome-driven process. Collectively, this study elucidates resistome adaptation in the endemic transition of an avian-specific pathogen, likely driven by the localized farming style, and provides valuable insights for targeted interventions.
Autores: Min Yue, C. Jia, C. Huang, H. Zhou, X. Zhou, Z. Wang, A. Siddique, X. Kang, Q. Cao, Y. Huang, F. He, Y. Li
Última atualização: 2024-10-27 00:00:00
Idioma: English
Fonte URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.07.26.605275
Fonte PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.07.26.605275.full.pdf
Licença: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
Alterações: Este resumo foi elaborado com a assistência da AI e pode conter imprecisões. Para obter informações exactas, consulte os documentos originais ligados aqui.
Obrigado ao biorxiv pela utilização da sua interoperabilidade de acesso aberto.