Novo Método Melhora Análise de Cryo-ET
Cientistas melhoram a tomografia eletrônica criogênica com orientação em tempo real usando fluorescência.
Anthony V. Sica, Magda Zaoralová, Cali Antolini, Daan B. Boltje, Judit J. Penzes, Lilyana M. Malmqvist, Grant Jensen, Jason T. Kaelber, Peter Dahlberg
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Tomografia Eletrônica Criogênica, ou Cryo-ET pra encurtar, é uma técnica daora usada pra olhar estruturas minúsculas dentro das células mantendo elas congeladas. Esse método ajuda os cientistas a entender como as células funcionam sem bagunçar tudo. Mas tem um porém: só rola com amostras super finas. Pense como tentar ver uma foto através de um vidro grosso; não é lá essas coisas, né?
Pra resolver essa parada de amostras finas, os cientistas inventaram um método chamado fresagem com Feixe de íons focados criogênicos (Cryo-FIB). Basicamente, eles detonam parte da célula usando um feixe de íons concentrado, criando fatias ultra-finas, ou lamelas, com cerca de 200 nanômetros de espessura. Isso é tipo a espessura de alguns fios de cabelo! Mas ainda tem um problema.
O Dilema do Alvo
Usando esse método, alinhar o que você tá olhando no microscópio com o feixe de íons pode ser complicado. Imagine tentar arremessar uma bola de basquete enquanto tá vendado, sacou? Os cientistas geralmente usam Marcadores Fluorescentes, tipo bolinhas brilhantes, pra destacar as estruturas que querem observar. Mas às vezes, esses marcadores podem bloquear a visão das próprias estruturas que tão tentando ver.
Além disso, o processo pode ficar bagunçado. Se os marcadores não estiverem perfeitamente alinhados, os cientistas podem acabar cometendo erros. E se a amostra se mover enquanto eles tão tentando cortá-la, isso complica ainda mais. Isso significa que encontrar estruturas pequenas ou raras é como procurar uma agulha em um palheiro-o palheiro sendo a bagunça complexa de uma célula.
Uma Abordagem Mais Inteligente
E se tivesse um jeito melhor? Aí entram os sistemas tri-coincidentes. Esses esquemas legais permitem que os cientistas alinhem os microscópios ópticos, eletrônicos e de íons pra ver o que tão fazendo em tempo real enquanto cortam. É como assistir a um filme enquanto você também se vira pra fazer a pipoca.
Ao observar a fluorescência diminuindo conforme se aproximam do alvo, os cientistas conseguem parar a fresagem no momento certo. Mas calma, isso ainda tem suas limitações! Não ajuda quando as estruturas são quase do mesmo tamanho que a espessura da lamela.
Enviando o Sinal Interferométrico
Aí que a coisa fica interessante. E se os cientistas pudessem usar um sinal extra pra guiar a fresagem? Eles decidiram testar um sistema usando algumas bolinhas fluorescentes misturadas com gotinhas de água. Eles congelaram essas gotinhas e colocaram em uma grade especial. Quando usaram o feixe de íons pra fresar as gotinhas congeladas, notaram umas mudanças doidas no brilho das fluorescentes.
Conforme o processo de fresagem continuava, o brilho subia e descia como uma montanha-russa. Isso era por conta da luz refletindo na superfície da amostra. Observando cuidadosamente essas mudanças de brilho, os cientistas descobriram quão longe as estruturas-alvo estavam escondidas.
Ajustes em Tempo Real
Pra deixar a fresagem ainda mais inteligente, eles ajustaram um modelo às mudanças de brilho pra ajudar a identificar locais precisos. Isso significa que não tem mais chutes às escuras; eles podiam determinar exatamente onde focar o feixe de íons. Sabendo o brilho e a reflexão esperados com base nos materiais envolvidos, eles ficaram ainda mais habilidosos em mirar na fresagem.
A força da reflexão pode variar dependendo da amostra, como um espelho que pode parecer diferente dependendo do ângulo que você tá. Pra acertar, os cientistas primeiro fresaram uma amostra teste pra encontrar as configurações perfeitas antes de atacar os alvos reais.
Colocando à Prova
Pra ver como o novo método funcionava, a equipe decidiu mirar em um vírus chamado vírus adenoassociado (AAV). Esse vírus é super pequeno e pode ser usado em terapia gênica humana-tipo um serviço de entrega de genes em miniatura. Quando o AAV entra nas células humanas, ele tem que passar por uma porrada de coisas, tornando ele um cliente complicado de rastrear.
Usando seu esquema, os cientistas analisaram algumas amostras marcadas com fluorescentes pra ver como as oscilações mudavam conforme se aproximavam do vírus. Depois de anotar essas mudanças, eles ajustaram sua fresagem pra cortar ao redor dos aglomerados de vírus dentro da célula. No final, conseguiram capturar algumas imagens tomográficas iradas que mostravam os vírus nadando em vesículas membranosas como peixes em um mar de gosma celular.
Surfando na Onda da Fluorescência
Graças ao trabalho duro deles, os cientistas agora podiam guiar a fresagem usando observações em tempo real dos marcadores fluorescentes. Nada de jogos de adivinhação! Eles podiam identificar exatamente onde cortar sem perder de vista o alvo. Esse método abre caminho pra observar pequenas estruturas que antes eram difíceis de detectar. É como ter um GPS high-tech pra navegar pelo mundo microscópico.
O Futuro é Brilhante
Com essa nova técnica, as possibilidades são infinitas. Isso significa que os cientistas agora podem estudar estruturas minúsculas e raras dentro das células sem a complicação de usar marcadores extras ou adivinhar onde é o melhor ponto de corte. Essa abordagem abre portas pra um mundo totalmente novo de observação em sistemas biológicos.
E quem sabe? Talvez um dia a gente consiga assistir como vírus como o AAV funcionam em tempo real, nos dando insights que podem levar a terapias gênicas melhores. Então, da próxima vez que você pensar em ciência, lembre-se que tem pessoas inteligentes por aí sempre buscando novas formas de ver o invisível. Quem diria que o mundo das moléculas poderia ser tão divertido?
Título: Optical Interference for the Guidance of Cryogenic Focused Ion Beam Milling Beyond the Axial Diffraction Limit
Resumo: Using a tri-coincident cryogenic FIB-SEM-LM system, we identify an interferometric optical response that can be used for targeting lamella production to fluorescently labelled structures with accuracy beyond the diffraction limit. We demonstrate the approach using synthetic samples of fluorescent beads embedded in micron-scale droplets of water. We then apply the approach to capture virions inside host cells. Successful targeting is confirmed by cryogenic electron tomography revealing clusters of virions in intracellular vesicles.
Autores: Anthony V. Sica, Magda Zaoralová, Cali Antolini, Daan B. Boltje, Judit J. Penzes, Lilyana M. Malmqvist, Grant Jensen, Jason T. Kaelber, Peter Dahlberg
Última atualização: 2024-11-03 00:00:00
Idioma: English
Fonte URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.11.01.621231
Fonte PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.11.01.621231.full.pdf
Licença: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/
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