Desafios em Classificar Relatórios de Radiologia Dinamarqueses Usando NLP
Um estudo sobre como melhorar modelos de PNL para textos médicos na saúde dinamarquesa.
Vincent Beliveau, Helene Kaas, Martin Prener, Claes N. Ladefoged, Desmond Elliott, Gitte M. Knudsen, Lars H. Pinborg, Melanie Ganz
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Índice
A imagem médica é uma parte vital da saúde, ajudando os médicos a diagnosticar e tratar os pacientes. Recentemente, técnicas usando deep learning foram desenvolvidas para ajudar a classificar e entender relatórios de radiologia. No entanto, existem desafios, especialmente quando os relatórios estão em uma língua com menos recursos, como o dinamarquês. Este artigo examina esses desafios e discute descobertas de pesquisas relacionadas à classificação de texto radiológico em uma língua que não é inglês.
Contexto
Processamento de linguagem natural (NLP) é uma área de estudo que foca em como os computadores podem entender a linguagem humana. Na medicina, o NLP pode ser útil para extrair informações importantes de relatórios médicos. Mas, quando lidamos com Conjuntos de dados pequenos em idiomas com menos recursos, o desempenho dos modelos de NLP pode cair bastante. Neste momento, não há uma solução clara para resolver essas questões.
Os registros médicos contêm muitos dados, mas grande parte deles é não estruturada. Isso significa que, antes de usá-los para análise, geralmente precisamos passar por eles com cuidado. Isso é especialmente verdade na radiologia, onde os achados nas imagens são frequentemente descritos em detalhes em relatórios escritos. Extrair essas informações pode ajudar a criar conjuntos de dados necessários para treinar modelos que classificam imagens com base nesses relatórios.
Conjunto de Dados e Desafios
Em um estudo, pesquisadores trabalharam com um conjunto de dados contendo 16.899 relatórios de ressonância magnética em dinamarquês, focando especificamente em pacientes com epilepsia. Coletar um conjunto de dados tão grande pode ser demorado e trabalhoso. Além disso, muitas condições médicas são raras, levando a dados desbalanceados que podem dificultar a classificação.
Os pesquisadores identificaram três tipos de anomalias relacionadas à epilepsia: displasia cortical focal (FCD), esclerose temporal mesial (MTS) e anomalias hipocampais (HA). Cada uma dessas condições pode ser descrita de maneiras diferentes nos relatórios, complicando o processo de rotulagem. Os relatórios precisavam ser lidos e rotulados por pessoas treinadas, aumentando o esforço envolvido.
Rotulagem Precisa
A Importância daA rotulagem precisa é crucial para treinar modelos de NLP para classificar textos médicos de forma eficaz. No estudo, os relatórios foram lidos e categorizados manualmente, o que exigiu bastante tempo e expertise. Esse esforço destaca a necessidade de métodos automatizados para simplificar o processo de rotulagem, especialmente para grandes conjuntos de dados.
Os pesquisadores usaram palavras-chave e padrões específicos para identificar informações essenciais e reduzir a complexidade dos relatórios. Eles focaram em frases individuais contendo dados relevantes, tornando o processo mais gerenciável, mas ainda mantendo o contexto importante.
Avaliação de Modelos de NLP
O estudo avaliou vários modelos de NLP, incluindo modelos transformer e técnicas de few-shot learning. Modelos transformer, especialmente estruturas semelhantes ao BERT, são conhecidos por sua eficácia em entender linguagem. Eles foram testados no conjunto de dados dinamarquês com e sem pré-treinamento adicional em textos médicos relevantes para ver se o desempenho melhorava.
Os modelos apresentaram resultados variados. No final, os modelos semelhantes ao BERT mostraram o melhor desempenho, especialmente quando pré-treinados em um conjunto de dados maior de relatórios de radiologia. Isso sugere que ter acesso a dados adicionais relevantes pode ajudar a melhorar como um modelo funciona, especialmente em um domínio específico como a radiologia.
Descobertas e Análise de Desempenho
A análise mostrou que, embora grandes modelos de linguagem (LLMs) estejam ganhando popularidade, eles não se saíram tão bem quanto os modelos mais simples de BERT neste caso. Isso foi inesperado, já que os LLMs costumam se dar bem em muitas aplicações. Um motivo para isso pode ser que os modelos enfrentaram dificuldades com as nuances da língua dinamarquesa e os detalhes nos relatórios de radiologia.
Cada modelo foi testado quanto à sua capacidade de identificar corretamente classes específicas de condições nos relatórios. As métricas de desempenho destacaram que, embora nenhum modelo tenha alcançado uma precisão a nível de especialista, alguns classificadores puderam ajudar a restringir os relatórios que precisavam de revisão detalhada. Isso significa que, embora os modelos não estejam prontos para automatizar completamente o processo de rotulagem, eles podem ajudar a reduzir a carga de trabalho.
Considerações para Pesquisas Futuras
O estudo enfatiza a importância de rotular corretamente textos médicos e os desafios que surgem ao fazê-lo, especialmente para línguas menores. Pesquisas futuras precisam abordar como melhorar o desempenho dos modelos em conjuntos de dados não ingleses e explorar melhores técnicas de tradução que possam melhorar a compreensão.
As descobertas sugerem que mais trabalho é necessário para criar ferramentas de NLP eficazes para aplicações médicas em línguas menos comuns. Focando na otimização de modelos para tarefas específicas e entendendo suas limitações, os pesquisadores podem buscar soluções que tornem os dados médicos mais acessíveis e acionáveis.
Conclusão
A interseção entre NLP e imagem médica apresenta tanto oportunidades quanto desafios. Embora tenha havido progresso na classificação de textos radiológicos, especialmente em idiomas com menos recursos, a necessidade de melhorias em desempenho e precisão permanece. Este estudo destaca os esforços contínuos para desenvolver melhores ferramentas que podem ajudar os profissionais de saúde e agilizar processos em ambientes médicos.
À medida que continuamos a investigar e melhorar os métodos de NLP para textos médicos, a esperança é que essas inovações resultem em melhores resultados para os pacientes e sistemas de saúde mais eficientes.
Título: Classification of Radiological Text in Small and Imbalanced Datasets in a Non-English Language
Resumo: Natural language processing (NLP) in the medical domain can underperform in real-world applications involving small datasets in a non-English language with few labeled samples and imbalanced classes. There is yet no consensus on how to approach this problem. We evaluated a set of NLP models including BERT-like transformers, few-shot learning with sentence transformers (SetFit), and prompted large language models (LLM), using three datasets of radiology reports on magnetic resonance images of epilepsy patients in Danish, a low-resource language. Our results indicate that BERT-like models pretrained in the target domain of radiology reports currently offer the optimal performances for this scenario. Notably, the SetFit and LLM models underperformed compared to BERT-like models, with LLM performing the worst. Importantly, none of the models investigated was sufficiently accurate to allow for text classification without any supervision. However, they show potential for data filtering, which could reduce the amount of manual labeling required.
Autores: Vincent Beliveau, Helene Kaas, Martin Prener, Claes N. Ladefoged, Desmond Elliott, Gitte M. Knudsen, Lars H. Pinborg, Melanie Ganz
Última atualização: 2024-09-30 00:00:00
Idioma: English
Fonte URL: https://arxiv.org/abs/2409.20147
Fonte PDF: https://arxiv.org/pdf/2409.20147
Licença: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
Alterações: Este resumo foi elaborado com a assistência da AI e pode conter imprecisões. Para obter informações exactas, consulte os documentos originais ligados aqui.
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Ligações de referência
- https://www.jmlr.org/format/natbib.pdf
- https://doi.org/10.59275/j.melba.2023-AAAA
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- https://scandeval.com/mainland-scandinavian-nlg
- https://github.com/vbeliveau/radiology-text-classification