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# Biologia # Imunologia

Revolucionando a terapia com células T com mini-binders

Novas estratégias usando mini-binders mostram potencial pra atacar células cancerosas de forma eficaz.

Kristoffer Haurum Johansen, Darian Stephan Wolff, Beatrice Scapolo, Monica L. Fernández Quintero, Charlotte Risager Christensen, Johannes R. Loeffler, Esperanza Rivera-de-Torre, Max D. Overath, Kamilla Kjærgaard Munk, Oliver Morell, Marie Christine Viuff, Alberte T. Damm Englund, Mathilde Due, Stefano Forli, Emma Qingjie Andersen, Jordan Sylvester Fernandes, Suthimon Thumtecho, Andrew B. Ward, Maria Ormhøj, Sine Reker Hadrup, Timothy P. Jenkins

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Avanços na Terapia com Avanços na Terapia com Células T muito mais. tratamentos direcionados para câncer e Mini-encadernadores prometem
Índice

As Células T são um tipo de glóbulo branco que tem um papel super importante no sistema imunológico. Elas são especialistas em identificar e atacar células que estão com problemas, como aquelas infectadas por vírus ou alteradas pelo Câncer. O jeito que as células T reconhecem essas células problemáticas envolve uma ferramenta única que elas têm chamada receptor de célula T (TCR). Esse receptor ajuda as células T a saberem se uma célula tá saudável ou não, verificando pedaços específicos de proteínas, conhecidos como peptídeos, que aparecem na superfície dessas células.

Em termos simples, pense nas células T como seguranças super exigentes de uma balada. Elas só deixam entrar quem tem o "documento" certo. Se uma célula não mostrar a ID correta, a célula T vai mandar pra fora.

O Desafio de Encontrar os TCRs Certos

Identificar os TCRs certos para tratar doenças como o câncer pode ser bem complicado. Os cientistas geralmente tentam encontrar TCRs que sejam eficazes contra certas proteínas que aparecem na superfície de células anormais. Isso envolve selecionar e expandir células T de pacientes que têm os TCRs certos. Mas esse processo pode ser demorado e complicado, especialmente porque os TCRs disponíveis no sistema imunológico de um doador nem sempre são os melhores para uma população maior.

Além disso, tem um problema conhecido como reatividade cruzada, onde um TCR pode reconhecer peptídeos parecidos, mas que não são o alvo, causando efeitos indesejados. É como fazer seu segurança conferir documentos, mas às vezes ele deixa entrar pessoas que parecem um pouco com quem deveria, criando confusão dentro da balada.

Novas Abordagens para Terapia com Células T

Para superar esses desafios, os pesquisadores estão explorando novas estratégias para desenvolver moléculas parecidas com TCRs que possam mirar nas proteínas problemáticas de forma mais direta. Essas moléculas podem ser transformadas em receptores quiméricos de antígenos (CARs), que ajudam as células T a reconhecer e eliminar células cancerígenas de forma mais eficaz.

Mas criar essas moléculas parecidas com TCR não é fácil. Métodos tradicionais podem ser lentos e muitas vezes produzem ligantes fracos que não funcionam tão bem quanto se esperava. Alguns métodos envolvem usar células de camundongos para criar os TCRs, o que pode limitar a variedade e a força dos anticorpos produzidos. Outras abordagens modernas usam tecnologia para simular como essas moléculas interagem, mas ainda enfrentam limitações.

O Papel das Ferramentas Computacionais no Desenvolvimento de TCRs

Avanços em ciência da computação e modelagem estrutural abriram novas portas para os pesquisadores. Usando ferramentas computacionais, os cientistas conseguem desenhar novas moléculas parecidas com TCR de forma muito mais rápida. Essas ferramentas podem prever como uma molécula projetada vai interagir com seu alvo, permitindo que os pesquisadores filtrem múltiplos designs e se concentrem nos mais promissores.

Por exemplo, uma ferramenta chamada RFdiffusion pode ser usada para gerar potenciais ligantes parecidos com TCR em pouco tempo. Essa ferramenta utiliza dados do passado para criar novos designs que têm altas chances de serem eficazes.

Projetando Moléculas de Ligação Direcionadas

Um estudo de caso interessante envolveu projetar ligantes para NY-ESO-1, uma proteína que aparece em muitos tipos de tumores, mas que está ausente em tecidos normais, exceto nos testículos. Os pesquisadores focaram na parte da proteína que garantiria que os ligantes gerados mirassem a proteína em si e não apenas a área ao redor.

Usando uma combinação de modelagem computacional e validação experimental, os pesquisadores criaram 44 mini-ligantes diferentes que foram testados quanto à sua capacidade de se ligar à proteína alvo. Nesses testes, um mini-ligante específico, chamado NY1-B04, se destacou por suas características promissoras de ligação.

Testando a Eficácia dos Mini-Ligantes

Para ver se mini-ligantes como o NY1-B04 realmente conseguem fazer o trabalho, os pesquisadores os testaram em laboratório com células T. Eles acoplaram os mini-ligantes às células T e examinaram como essas células T modificadas conseguiam reconhecer e destruir células cancerígenas que apresentavam a proteína NY-ESO-1.

Nos testes de laboratório, as células T modificadas com NY1-B04 conseguiram matar linhagens de células cancerígenas de forma eficaz. Isso significa que o NY1-B04 pode ser um candidato forte para o desenvolvimento de futuras terapias contra o câncer, reduzindo o risco de efeitos indesejados que poderiam prejudicar células saudáveis.

O Futuro Empolgante da Imunoterapia do Câncer

O trabalho com esses mini-ligantes abre caminho para rápidos avanços na imunoterapia do câncer. Uma das maiores vantagens dessa abordagem é a velocidade com que novas terapias podem ser desenvolvidas. Ao contrário dos métodos tradicionais, que podem levar anos para produzir um tratamento viável, essa abordagem permite que os cientistas passem do design de um ligante para tê-lo pronto para testes em apenas algumas semanas.

Além disso, os métodos usados para criar esses mini-ligantes podem ser adaptados para outras doenças também. Desde o combate a infecções virais até possivelmente tratar doenças autoimunes, a ideia de usar essas moléculas engenheiradas pode se expandir bastante.

Neoantígenos: Uma Nova Fronteira

Os pesquisadores também estão investigando os neoantígenos, que são proteínas únicas que surgem de mutações em células tumorais. Esses neoantígenos podem ser alvos ideais para terapias com células T, já que não estão presentes em tecidos normais. Usando as mesmas estratégias de design, os pesquisadores começaram a explorar como mini-ligantes podem ser criados para esses neoantígenos.

Por exemplo, os cientistas miraram um neoantígeno específico relacionado ao melanoma, derivado de uma mutação em uma proteína chamada AKAP9. Aproveitando ferramentas computacionais, eles conseguiram projetar mini-ligantes que miravam esse neoantígeno. Isso pode abrir portas para tratamentos mais personalizados contra o câncer, com base em tumores individuais.

As Implicações Mais Amplas dos Mini-Ligantes

Além de apenas mirar no câncer, a versatilidade dos mini-ligantes abre possibilidades para outras aplicações também. Eles poderiam ser usados para combater infecções virais, visando antígenos apresentados por células infectadas. Isso poderia ser um divisor de águas para doenças que mutam com frequência, como HIV ou hepatite C.

Além disso, os mini-ligantes poderiam ser usados em outros contextos terapêuticos. Por exemplo, eles poderiam ser utilizados para bloquear respostas imunes indesejadas em doenças autoimunes ou para levar agentes terapêuticos diretamente para células que precisam de tratamento.

Conclusão

À medida que a tecnologia em torno dos mini-ligantes continua a evoluir, o futuro parece promissor para terapias direcionadas no câncer e além disso. Com processos de design mais rápidos e melhores ferramentas preditivas, os pesquisadores estão prontos para fazer avanços significativos em como abordamos o tratamento de doenças complexas.

Então, enquanto o mundo espera pela próxima grande descoberta, os cientistas estão se arregaçando, sendo criativos e trabalhando duro para garantir que, quando se trata de identificar células problemáticas, haja uma célula T bem armada pronta para a ação com um mini-ligante de confiança ao seu lado. Afinal, lutar contra doenças é um negócio sério, mas um pouco de humor e pensamento inovador podem fazer uma grande diferença!

Fonte original

Título: De novo designed pMHC binders facilitate T cell induced killing of cancer cells

Resumo: The recognition of intracellular antigens by CD8+ T cells through T-cell receptors (TCRs) is central to adaptive immunity, enabling responses against infections and cancer. The recent approval of TCR-gene-edited T cells for cancer therapy demonstrates the therapeutic advantage of using pMHC recognition to eliminate cancer. However, identification and selection of TCRs from patient material is complex and influenced by the TCR repertoire of the donors used. To overcome these limitations, we here present a rapid and robust de novo binder design platform leveraging state-of-the-art generative models, including RFdiffusion, ProteinMPNN, and AlphaFold2, to engineer minibinders (miBds) targeting the cancer-associated pMHC complex, NY-ESO-1(157-165)/HLA-A*02:01. By incorporating in silico cross-panning and molecular dynamics simulations, we enhanced specificity screening to minimise off-target interactions. We identified a miBd that exhibited high specificity for the NY-ESO-1-derived peptide SLLMWITQC in complex with HLA-A*02:01 and minimal cross-reactivity in mammalian display assays. We further demonstrate the therapeutic potential of this miBd by integrating it into a chimeric antigen receptor, as de novo Binders for Immune-mediated Killing Engagers (BIKEs). BIKE-transduced T cells selectively and effectively killed NY-ESO-1+ melanoma cells compared to non-transduced controls, demonstrating the promise of this approach in precision cancer immunotherapy. Our findings underscore the transformative potential of generative protein design for accelerating the discovery of high-specificity pMHC-targeting therapeutics. Beyond CAR-T applications, our workflow establishes a foundation for developing miBds as versatile tools, heralding a new era of precision immunotherapy.

Autores: Kristoffer Haurum Johansen, Darian Stephan Wolff, Beatrice Scapolo, Monica L. Fernández Quintero, Charlotte Risager Christensen, Johannes R. Loeffler, Esperanza Rivera-de-Torre, Max D. Overath, Kamilla Kjærgaard Munk, Oliver Morell, Marie Christine Viuff, Alberte T. Damm Englund, Mathilde Due, Stefano Forli, Emma Qingjie Andersen, Jordan Sylvester Fernandes, Suthimon Thumtecho, Andrew B. Ward, Maria Ormhøj, Sine Reker Hadrup, Timothy P. Jenkins

Última atualização: 2024-12-03 00:00:00

Idioma: English

Fonte URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.11.27.624796

Fonte PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.11.27.624796.full.pdf

Licença: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/

Alterações: Este resumo foi elaborado com a assistência da AI e pode conter imprecisões. Para obter informações exactas, consulte os documentos originais ligados aqui.

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