Marcação de tempo no Fundo do Mar: Shinkaicaris leurokolos
Estudo revela como camarões de profundidade sentem o tempo sem luz solar.
Jin Sun, H. Zhang, T. Yahagi, N. Miyamoto, C. Chen, Q. Jiang, P.-Y. Qian
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Índice
Os seres vivos têm suas maneiras de contar o tempo. Isso ajuda eles a saber quando fazer coisas como comer ou dormir. Muitos animais conseguem perceber o tempo através de comportamentos naturais que seguem o ciclo dia-noite. Esse ciclo geralmente dura cerca de 24 horas. Mas em alguns lugares, como no fundo do oceano, onde não chega luz do sol, não está claro como essas criaturas conseguem acompanhar o tempo.
O fundo do oceano é a maior parte do nosso planeta, mas não é muito estudado. Os pesquisadores estão bem interessados nessa área porque tem um ambiente especial. À medida que você vai mais fundo no oceano, a luz do sol vai ficando mais fraca e desaparece cerca de 1000 metros abaixo. Nessa escuridão, os animais provavelmente têm que depender de outros sinais, como os movimentos da água causados pelas marés, em vez da luz do sol, para guiar seus comportamentos e atividades.
Um tipo de ambiente no fundo do oceano é chamado de fontes hidrotermais. Esses são lugares onde água quente e produtos químicos saem do fundo do oceano. Os animais que vivem perto dessas fontes dependem dos químicos produzidos por organismos minúsculos que usam esses químicos para viver. Esses animais podem ser afetados pelas mudanças em seu ambiente causadas pelas marés. Alguns estudos mostraram que animais que vivem perto dessas fontes podem ter comportamentos que seguem os ciclos das marés, mas ainda não entendemos completamente quão importantes esses relógios internos são para a sobrevivência deles.
Habitat do Shinkaicaris leurokolos
Em uma área específica conhecida como campo de fontes hidrotermais Iheya North, existe uma espécie de camarão chamada Shinkaicaris leurokolos. Esse camarão vive muito perto de lugares onde água quente e água do mar fria se misturam. Essa mistura acontece muito rápido e provoca mudanças no ambiente. A temperatura e outros fatores podem mudar a cada poucos segundos ou minutos, o que torna difícil perceber qualquer efeito das marés em termos de temperatura e química nessa área.
Os pesquisadores acreditam que ter um relógio interno poderia ajudar o Shinkaicaris leurokolos a reagir a mudanças repentinas nas condições, como mudanças inesperadas de temperatura. Por isso, os cientistas decidiram estudar as expressões gênicas desse camarão para ver se ele tem seu próprio sistema de temporização interna que ajuda a se ajustar ao ambiente. Eles mantiveram os camarões em condições controladas por 72 horas para observar como seus genes são expressos ao longo do tempo.
Compreendendo o Ambiente do Fundo do Mar
Animais como o Shinkaicaris leurokolos vivem em condições extremas. A água quente que vem das fontes hidrotermais é rica em vários químicos, mas pode também ser perigosa. Entender como essas criaturas se adaptam a tais ambientes é crucial. Os pesquisadores mediram as mudanças de temperatura ao longo do tempo para entender melhor as condições em que esses camarões vivem.
Em um experimento, eles realizaram medições de temperatura em uma colônia de Shinkaicaris leurokolos que mostraram que eles frequentemente experimentam mudanças de temperatura entre cerca de 7,6 a 17,7°C em menos de três minutos. Isso significa que o ambiente pode mudar muito rápido, dificultando a confiança deles em sinais ambientais estáveis, como o sol.
Análise do Transcriptoma
Os pesquisadores então coletaram camarões e os armazenaram em um ambiente escuro e a uma temperatura fria enquanto estudavam seus genes. Eles encontraram um grande número de sequências gênicas que forneceram insights sobre como esses camarões podem lidar com seu ambiente extremo. De todos os dados coletados, eles focaram nas sequências gênicas mais relevantes que são provavelmente importantes para entender o Shinkaicaris leurokolos.
Inicialmente, eles identificaram mais de 300.000 fragmentos de genes, que avaliaram quanto à completude. Eles acabaram focando em mais de 20.000 transcritos gênicos específicos que mostraram uma taxa de expressão significativa, indicando que esses genes estavam ativos em resposta ao ambiente.
Usando vários métodos estatísticos, os pesquisadores analisaram essas expressões gênicas para detectar ciclos ou ritmos. Os resultados mostraram que os camarões tinham um padrão forte de expressões gênicas que pareciam aumentar e diminuir em relação às mudanças das marés ao redor deles.
Ritmos Biológicos
Através de uma análise mais detalhada, os cientistas descobriram que muitos dos genes estavam ligando e desligando em padrões que se alinhavam com os ciclos das marés. Cerca de 33% dos genes examinados mostraram padrões específicos ligados às marés, ao invés dos ciclos diários usuais seguidos pela maioria dos organismos. Isso sugere que o Shinkaicaris leurokolos se adaptou para seguir um ritmo diferente que se ajusta ao seu ambiente.
Os pesquisadores notaram que havia dois grupos principais de expressões gênicas. Um grupo parecia mostrar padrões consistentes, enquanto o outro grupo mostrava atividade rítmica reduzida ou atenuada. Isso indica que esses camarões podem ter desenvolvido estratégias diferentes para lidar com as flutuações de seu ambiente.
Ritmos de Maré
Os cientistas investigaram mais a fundo os tipos de ritmos de maré nas expressões gênicas do Shinkaicaris leurokolos. Eles descobriram que quase metade dos genes das marés tinha expressões estáveis, enquanto uma porção significativa dos genes tinha expressões flutuantes. Padrões de maré mostraram grandes diferenças, com muitos genes mostrando picos em pontos específicos que correspondiam a movimentos das marés em seu ambiente.
Essa organização das expressões gênicas provavelmente ajuda os camarões a gerenciar o estresse de seu habitat extremo. Os pesquisadores identificaram centenas desses genes que desempenham papéis na reparação do DNA e na regulação de várias funções do corpo, indicando que esses camarões estão continuamente se adaptando ao ambiente.
Respostas ao Estresse Ambiental
Os resultados destacaram que muitos dos genes relacionados à Resposta ao Estresse eram influenciados pelos ciclos das marés. O Shinkaicaris leurokolos apresentou expressões rítmicas em genes relacionados a processos de desintoxicação e reações a níveis elevados de calor ou baixo oxigênio, que são desafios comuns perto das fontes hidrotermais. Isso sugere que esses camarões desenvolveram estratégias para lidar com potenciais estresses de seu habitat enquanto mantêm funções corporais essenciais.
À medida que os pesquisadores analisavam cuidadosamente as expressões dos genes relacionados ao estresse, notaram como seus padrões rítmicos poderiam ser benéficos para a sobrevivência do camarão. Por exemplo, certos genes que gerenciam a desintoxicação eram expressos de forma rítmica, o que pode ajudar a lidar com substâncias tóxicas que encontram em seu ambiente.
O Papel dos Relógios Internos
O estudo mostrou que o Shinkaicaris leurokolos provavelmente possui sistemas de temporização internos que são independentes dos ciclos usuais dia-noite. Em vez disso, eles parecem ter um relógio biológico que se alinha de perto com os padrões de maré de seu ambiente. Os pesquisadores sugeriram que esses relógios internos podem permitir que o camarão reaja efetivamente a mudanças ambientais.
Uma das descobertas importantes foi a presença de genes tipicamente envolvidos nas funções rítmicas dos organismos, demonstrando que os camarões têm alguns componentes essenciais necessários para seus relógios biológicos. No entanto, ao contrário de outros organismos que seguem ritmos circadianos, o Shinkaicaris leurokolos exibe ritmos de maré, mostrando como se adaptou à sua vida no fundo do mar.
Possíveis Zeitgebers
Enquanto a luz é um sinal primário usado por muitos organismos para sincronizar seus relógios internos, a falta de luz no fundo do oceano torna necessário procurar outras pistas. Para o Shinkaicaris leurokolos, as variações de temperatura vistas em seu ambiente devido à mistura de água quente e fria não são estáveis o suficiente para servir como uma pista confiável.
Os pesquisadores especulam que a disponibilidade de comida, mudanças de pressão ou até mesmo sons da superfície podem atuar como medidores de tempo para esses camarões do fundo do mar. Esses sinais diferentes poderiam ajudá-los a sincronizar suas atividades mesmo quando a luz do sol direto está ausente.
Comparação com Outras Espécies
O estudo também comparou os comportamentos rítmicos do Shinkaicaris leurokolos com os de outras espécies de fundo marinho, como a mexilhão de fonte hidrotermal Bathymodiolus azoricus. Ambas as espécies mostram ritmos de maré, mas podem diferir em como se adaptam aos seus habitats específicos. Essa comparação pode oferecer insights sobre como vários organismos evoluem e se ajustam a seus ambientes únicos.
As duas espécies se adaptaram de formas diferentes aos seus respectivos habitats. O Bathymodiolus azoricus vive em um ambiente mais estável, longe dos fluxos ativos de água quente, enquanto o Shinkaicaris leurokolos prospera em um ambiente mais turbulento e dinâmico. Suas condições de vida diferentes podem resultar em variações na força e no tipo de ritmo.
Conclusão
Essa pesquisa ilumina os mecanismos de temporização internos do Shinkaicaris leurokolos. Mostra que criaturas que vivem em ambientes extremos, como fontes hidrotermais no fundo do mar, podem se adaptar de maneiras únicas a seus arredores. Em vez de depender dos ciclos do sol, esses camarões confiam em ritmos de maré, indicando que os relógios biológicos dos organismos de fundo do mar podem ser bem diferentes dos dos seres que vivem na superfície.
A profundidade do oceano apresenta desafios e circunstâncias únicas que forçam a vida a se adaptar de maneiras que ainda estamos descobrindo. Entender como organismos como o Shinkaicaris leurokolos conseguem prosperar nos ecossistemas sombrios do fundo do mar pode oferecer insights sobre a evolução da vida e a adaptabilidade dos sistemas biológicos. Essa pesquisa destaca a importância de estudar habitats diversos para entender completamente a complexidade da vida na Terra.
Fonte original
Título: Circatidal control of gene expression in the deep-sea hot vent shrimp Rimicaris leurokolos
Resumo: Biological clocks are a ubiquitous feature of all life, enabling the use of natural environmental cycles to track time. Although studies on circadian rhythms have contributed greatly to the knowledge of chronobiology, biological rhythms in dark biospheres such as the deep sea remain poorly understood. Here, based on a laboratory free-running experiment, we reveal potentially endogenous rhythms in gene expression of the deep-sea hydrothermal vent shrimp Rimicaris leurokolos. Oscillations with [~]12-hour periods, likely reflecting tidal influence, greatly prevail over others in the temporal transcriptome, indicating R. leurokolos likely depends on a circatidal clock consisting of at least some components independent of the circadian clocks. The tidal transcripts exhibit an antiphased expression pattern divided into two internally synchronized clusters, correlated with wide-ranging biological processes that occur in the nucleus and cytoplasm, respectively. In addition, comparing the tidal transcripts with the [~]12-hour ultradian rhythms genes in fruit flies and mice shows large similarity, indicating the likely scenario of broad impact of the tide on the [~]12-hour oscillations across the metazoan. These findings not only provide new insights into the temporal adaptations in deep-sea organisms but also highlight deep-sea hydrothermal vent organisms as intriguing models for chronobiological, particularly 12-hour ultradian rhythms, studies.
Autores: Jin Sun, H. Zhang, T. Yahagi, N. Miyamoto, C. Chen, Q. Jiang, P.-Y. Qian
Última atualização: 2024-12-11 00:00:00
Idioma: English
Fonte URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.01.12.575359
Fonte PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.01.12.575359.full.pdf
Licença: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
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