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O Papel das Histonas no Desenvolvimento Inicial

As histonas H3 e H3.3 são peças chave na regulação gênica durante o início do desenvolvimento celular.

Amanda A Amodeo, A. D. Bhatt, M. G. Brown, A. B. Wackford, Y. Shindo

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Índice

As histonas são proteínas que ajudam a embalar e organizar o DNA nas células dos seres vivos. Elas têm um papel crucial em como os genes são expressos e regulados durante o desenvolvimento. Dois tipos de histonas, conhecidos como H3 e H3.3, são especialmente importantes nas fases iniciais do desenvolvimento, principalmente durante um processo chamado ativação do genoma zigótico (ZGA).

O Básico sobre Histonas

Durante a divisão celular, o DNA precisa estar bem enrolado ao redor das histonas para caber dentro do núcleo celular. Existem vários tipos de histonas, que podem ser produzidas em momentos diferentes. A maioria das histonas é feita durante uma fase do ciclo celular chamada fase S. Aqui, um grande número de histonas acopladas à replicação (RC) é produzido rapidamente para garantir que todas as novas células tenham os materiais necessários para organizar seu DNA. Em contraste, as histonas variantes, incluindo H3.3, podem ser feitas a qualquer momento durante o ciclo celular e geralmente são usadas em partes específicas do genoma.

Mudanças Durante o Desenvolvimento Inicial

Em muitos embriões, especialmente antes da ZGA, as células dependem das histonas fornecidas pela mãe. Essas histonas maternas são usadas enquanto as células passam por ciclos de divisão sem realmente crescer. Essa situação leva a um acúmulo de núcleos sem aumento no citoplasma ao redor, o que influencia como as histonas são incorporadas na estrutura do DNA.

Durante a ZGA, mudanças celulares ocorrem que permitem um aumento na expressão gênica. Isso é essencial para um bom desenvolvimento. As variantes de histonas são frequentemente trocadas durante esse período. Por exemplo, histonas ligadoras específicas da matriz materna podem ser substituídas por histonas H1 acopladas à replicação à medida que o desenvolvimento avança. Da mesma forma, H3 é substituído por H3.3, e esse processo é chave, mas não totalmente compreendido.

O Papel de H3.3

H3.3 é vital para o desenvolvimento adequado de muitos organismos, incluindo camundongos, sapos e peixes. Pesquisas mostram que alterações específicas na proteína H3.3 são cruciais para vários eventos de desenvolvimento, como a formação de estruturas essenciais nos embriões. Em moscas da fruta (Drosophila), quando H3.3 está ausente, os organismos conseguem sobreviver até a maturidade, mas são estéreis, complicando os estudos sobre seu papel.

Acompanhando H3 e H3.3 no Desenvolvimento

Para entender como os níveis de H3 e H3.3 mudam com o tempo, os pesquisadores criaram um sistema que permite visualizar os níveis dessas histonas em tempo real. Usando uma proteína fluorescente especial, eles marcaram as proteínas H3 e H3.3 e, em seguida, as observaram durante vários ciclos celulares que levaram à ZGA. Os resultados mostraram que os níveis de H3 diminuíram significativamente enquanto os níveis de H3.3 aumentaram durante o mesmo período, sugerindo que, à medida que uma proteína se torna menos disponível, a outra se destaca.

O Impacto da Relação Nuclear/Citoplasmática

A relação de material dentro do núcleo em relação ao do citoplasma ao redor (relação N/C) parece influenciar como essas histonas são incorporadas no DNA. Em embriões com muitos núcleos, mas pouco citoplasma, a disponibilidade de H3 diminui, levando a um aumento correspondente em H3.3, mostrando que H3.3 se torna mais disponível à medida que os níveis de H3 caem.

Em experimentos com embriões que apresentavam diferentes densidades nucleares, foi descoberto que altas relações N/C levaram a uma redução na incorporação de H3 e um aumento na incorporação de H3.3. Isso significa que o ambiente local da célula influencia como essas histonas são usadas durante o desenvolvimento.

Chaperonas e Seu Papel

As histonas não flutuam por aí; elas são ajudadas por outras proteínas chamadas chaperonas que ajudam a entrar no núcleo e se incorporar ao DNA. A forma como as histonas interagem com essas chaperonas é vital. Aparentemente, as regiões específicas das proteínas histonas que se ligam a essas chaperonas impactam muito como elas são absorvidas pelo núcleo e incorporadas na cromatina.

Os pesquisadores criaram diferentes versões da histona H3.3 para ver como a alteração de regiões específicas afetava seu comportamento. Descobriram que, ao mudar a região de ligação das chaperonas, o comportamento de H3.3 mudava significativamente, levando a uma diminuição na incorporação na cromatina.

A Importância da Ligação das Chaperonas

Ao observar como H3 e H3.3 interagiam com suas respectivas chaperonas, os pesquisadores perceberam que as diferenças na forma como são incorporadas podem ser ligadas aos locais de ligação dessas chaperonas. Por exemplo, mudar um aminoácido em H3.3 poderia causar um aumento em sua incorporação na cromatina, enquanto outras mudanças levavam a um comportamento muito semelhante ao de H3, mostrando que o local de ligação era o fator chave.

Resistência à Via Hira

Uma chaperona bem conhecida chamada Hira geralmente está envolvida em ajudar a incorporar H3.3 na cromatina. No entanto, os pesquisadores descobriram que, quando criaram uma mutação especial em Hira, H3.3 ainda conseguia ser importada para o núcleo, mas não podia ser incorporada. Isso sugeriu que H3.3 pode não precisar sempre de Hira para entrar no núcleo da mesma maneira que H3.

Nesse caso, H3 ainda entrava no núcleo e se incorporava normalmente na cromatina mesmo quando Hira não estava funcionando corretamente. H3.3, particularmente as versões modificadas, mostraram uma queda de concentração muito menor do que o que foi observado em H3.

Conclusões sobre a Dinâmica das Histonas

A interação entre H3 e H3.3, particularmente no contexto da relação N/C e a presença de chaperonas, mostra um sistema complexo que é fundamental para o desenvolvimento embrionário adequado. Parece que, à medida que os recursos maternos de H3 diminuem, H3.3 assume para ajudar a manter a estrutura da cromatina e apoiar os eventos celulares em curso.

Existem múltiplos fatores influenciando como H3.3 é incorporada na cromatina. Embora a relação N/C local desempenhe um papel significativo, a sequência e a estrutura específicas das histonas em si também são críticas. À medida que H3 se torna menos disponível, H3.3 pode ser usado mais prontamente, indicando que os processos de desenvolvimento são rigorosamente regulados pela disponibilidade dessas proteínas importantes.

Estudos adicionais ajudarão a esclarecer os mecanismos exatos em ação, mas as descobertas atuais destacam o equilíbrio sofisticado e a interação entre vários componentes celulares durante as fases iniciais do desenvolvimento. Entender essas dinâmicas pode fornecer insights valiosos sobre como as células gerenciam a informação genética durante períodos críticos, com potenciais implicações para entender desordens do desenvolvimento e funções celulares.

Fonte original

Título: Local nuclear to cytoplasmic ratio regulates H3.3 incorporation via cell cycle state during zygotic genome activation

Resumo: Early embryos often have unique chromatin states prior to zygotic genome activation (ZGA). In Drosophila, ZGA occurs after 13 reductive nuclear divisions during which the nuclear to cytoplasmic (N/C) ratio grows exponentially. Previous work found that histone H3 chromatin incorporation decreases while its variant H3.3 increases leading up to ZGA. In other cell types, H3.3 is associated with sites of active transcription and heterochromatin, suggesting a link between H3.3 and ZGA. Here, we test what factors regulate H3.3 incorporation at ZGA. We find that H3 nuclear availability falls more rapidly than H3.3 leading up to ZGA. We generate H3/H3.3 chimeric proteins at the endogenous H3.3A locus and observe that chaperone binding, but not gene structure, regulates H3.3 behavior. We identify the N/C ratio as a major determinant of H3.3 incorporation. To isolate how the N/C ratio regulates H3.3 incorporation we test the roles of genomic content, zygotic transcription, and cell cycle state. We determine that cell cycle regulation, but not H3 availability or transcription, controls H3.3 incorporation. Overall, we propose that local N/C ratios control histone variant usage via cell cycle state during ZGA.

Autores: Amanda A Amodeo, A. D. Bhatt, M. G. Brown, A. B. Wackford, Y. Shindo

Última atualização: 2024-12-12 00:00:00

Idioma: English

Fonte URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.07.15.603602

Fonte PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.07.15.603602.full.pdf

Licença: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/

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