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# Biologia # Neurociência

Novo Método Ajuda a Visualizar Respostas de Neurônios a Estímulos

Uma nova abordagem organiza os neurônios com base nas respostas deles a diferentes estímulos visuais.

Steven W Zucker, L. Dyballa, G. D. Field, M. P. Stryker

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A neurociência sensorial foca em como grupos de neurônios representam o mundo exterior. Essa tarefa é complicada porque tanto os estímulos artificiais quanto os naturais podem ser complexos, e os neurônios respondem de maneiras intricadas. Os pesquisadores estão tentando visualizar e entender como essas respostas dos neurônios correspondem aos vários estímulos que encontram.

O Desafio dos Dados de Alta Dimensão

Os neurônios respondem a muitos tipos diferentes de estímulos, criando uma quantidade enorme de dados. Tanto os estímulos quanto a atividade dos neurônios podem ser de alta dimensão, o que dificulta a análise. Métodos tradicionais podem não capturar toda a complexidade de como os neurônios representam esses estímulos.

Nova Ferramenta: Manifolds de Codificação

Para enfrentar esses desafios, os cientistas desenvolveram um método chamado manifolds de codificação. Essa ferramenta organiza os neurônios com base em como eles reagem a vários estímulos visuais. Cada ponto no manifold de codificação representa um neurônio, e neurônios que estão próximos nesse espaço respondem de forma semelhante aos estímulos.

Esse método é diferente de outras abordagens comuns na neurociência. Enquanto outros métodos focam em como populações de neurônios respondem a estímulos específicos, os manifolds de codificação se concentram em organizar os neurônios com base em suas respostas funcionais. Isso pode ajudar os pesquisadores a fazer suposições educadas sobre diferentes tipos de neurônios e suas conexões no cérebro.

Comparando Respostas de Neurônios em Diferentes Áreas Visuais

Uma das características úteis dos manifolds de codificação é que eles permitem a comparação da codificação sensorial em várias etapas do processamento. Ao observar as respostas da retina e do córtex visual primário (V1) em camundongos, os pesquisadores encontraram diferenças interessantes. O manifold de codificação feito a partir das respostas retinianas mostrou distintos grupos de neurônios que correspondiam aos tipos conhecidos de células ganglionares retinianas. Em contraste, o manifold derivado do V1 era mais contínuo, indicando que os neurônios nessa área respondem a uma gama mais ampla de estímulos.

Essas descobertas levantam perguntas importantes sobre como a estrutura do manifold de codificação do V1 pode mudar com base em diferentes conjuntos de estímulos ou sobre quão semelhantes os manifolds de codificação são em áreas visuais superiores. Os pesquisadores usaram um grande conjunto de dados do Instituto Allen para explorar essas questões.

Conjuntos de Estímulos no Estudo

O conjunto de dados incluía vários estímulos, como grades estacionárias e em movimento, além de imagens naturais. Usando esse conjunto, os pesquisadores criaram manifolds de codificação para áreas visuais superiores, focando em como os neurônios nessas áreas respondem a grades estáticas e em movimento. Apesar das diferenças nos estímulos, o manifold de codificação resultante do V1 compartilhou semelhanças com descobertas anteriores, indicando uma organização consistente.

A Estrutura do Manifold de Codificação

Os manifolds de codificação demonstram transições suaves nas respostas neuronais entre diferentes estímulos. Ao observar características específicas, como o índice de seletividade de orientação (OSI) e taxas de disparo, os pesquisadores notaram padrões claros. Os neurônios também foram categorizados em tipos putativos excitatórios e inibitórios com base em seus padrões de disparo.

No V1, Neurônios excitatórios mostraram preferência por certas características, enquanto neurônios inibitórios tendiam a ser menos seletivos. Essa organização oferece uma visão sobre como diferentes tipos de células estão distribuídos em várias camadas corticais.

Analisando Respostas a Cenas Naturais

O conjunto de dados também incluiu respostas a cenas naturais, oferecendo uma chance de ver como essas respostas se encaixam no manifold geral. Ao examinar a relação entre as respostas neuronais a cenas naturais e grades estáticas, os pesquisadores notaram padrões semelhantes. Neurônios no manifold poderiam ser agrupados com base em suas taxas de disparo para diferentes tipos de estímulos, revelando estruturas subjacentes.

Surpreendentemente, o manifold de codificação exibiu uma organização clara, sugerindo que neurônios que preferem cenas naturais estavam distribuídos ao longo de um eixo distinto dos que preferem grades. Isso sugere que os neurônios respondem a ambos os tipos de estímulos, embora suas preferências possam ser diferentes.

Descobertas de Áreas Visuais Superiores

Os pesquisadores estenderam sua análise a cinco áreas visuais superiores no cérebro do camundongo. Aqui, descobriram que os manifolds de codificação eram contínuos, semelhantes ao V1. Os padrões suaves exibiam semelhanças na seletividade de orientação e nas taxas de disparo. No entanto, preferências por frequências espaciais não apresentaram uma organização clara.

A relação entre cenas naturais e grades permaneceu evidente nessas áreas. Cada área visual mostrou padrões consistentes onde células que preferiam grades tendiam a ter alta seletividade de orientação, enquanto aquelas que preferiam cenas naturais demonstraram características diferentes.

Explorando Diferenças Entre Áreas Visuais

Focando em áreas representativas, os pesquisadores analisaram dados de VISpm e VISal, que se pensa corresponderem aos fluxos visuais ventral e dorsal, respectivamente. No VISpm, os neurônios favoreciam frequências temporais mais baixas, sugerindo que pode desempenhar um papel no reconhecimento de objetos. O manifold de codificação exibia padrões organizados, com distribuições claras de neurônios excitatórios e inibitórios.

O VISal mostrou preferência por frequências temporais mais altas e frequências espaciais mais baixas, indicando uma possível função no processamento espacial. Semelhante ao VISpm, havia um gradiente nas respostas a cenas naturais e grades estáticas, mas as diferenças na seletividade de orientação destacavam papéis funcionais diversos entre as áreas.

Insights a Partir de Preferências de Camada

O estudo encontrou diferenças notáveis nas preferências neuronais com base nas camadas corticais. No V1, os neurônios excitatórios com maior seletividade de orientação estavam amplamente presentes nas camadas 5 e 6. No entanto, em áreas visuais superiores, neurônios excitatórios da camada 2/3 mostraram padrões diferentes.

A organização de neurônios excitatórios e inibitórios também variou entre as camadas, apontando possíveis caminhos envolvidos na processamento sensorial. Foi descoberto que a camada 5 contém populações distintas de neurônios excitatórios com diferentes características de resposta.

Respostas a Cenas Naturais Podem Revelar Padrões Ocultos

Utilizar respostas a cenas naturais adiciona profundidade à análise. Essas respostas não foram incluídas no manifold de codificação inicial, mas poderiam ser organizadas dentro da estrutura já estabelecida. Mesmo que cenas naturais apresentem variabilidade, a forma como os neurônios responderam ao longo do manifold mostrou uma consistência interessante.

Os pesquisadores notaram que células que respondiam bem a frequências espaciais extremas tendiam a ser mais ativas ao responder a cenas naturais, enquanto células que preferiam frequências intermediárias favoreciam grades. Essa dualidade sugere uma tendência organizacional clara em como os neurônios reagem a diferentes tipos de estímulos.

Conclusão: A Utilidade dos Manifolds de Codificação

O método dos manifolds de codificação serve como uma abordagem valiosa para visualizar como grandes populações de neurônios respondem a vários estímulos. Ele fornece uma estrutura para avaliar as relações entre dinâmicas de resposta, tipos de neurônios e suas propriedades funcionais.

Ao aplicar esse método a estímulos visuais diversos, os pesquisadores podem entender melhor como os neurônios processam informações sensoriais. As descobertas destacam os padrões organizacionais contínuos dentro do córtex visual, revelando insights sobre a complexa interação entre diferentes tipos de neurônios e seus papéis no processamento de informações visuais.

Os manifolds de codificação não apenas aprofundam a compreensão da codificação sensorial, mas também sugerem que métodos semelhantes poderiam ser amplamente úteis em outras áreas da biologia, onde entender relações complexas é crucial.

Fonte original

Título: Functional organization and natural scene responses across mouse visual cortical areas revealed with encoding manifolds

Resumo: A challenge in sensory neuroscience is understanding how populations of neurons operate in concert to represent diverse stimuli. To meet this challenge, we have created "encoding manifolds" that reveal the overall responses of brain areas to diverse stimuli with the resolution of individual neurons and their response dynamics. Here we use encoding manifold to compare the population-level encoding of primary visual cortex (VISp) with five higher visual areas (VISam, VISal, VISpm, VISlm, and VISrl). We used data from the Allen Institute Visual Coding-Neuropixels dataset from the mouse. We show that the encoding manifold topology computed only from responses to grating stimuli is continuous, for V1 and for higher visual areas, with smooth coordinates spanning it that include orientation selectivity and firing-rate magnitude. Surprisingly, the manifolds for each visual area revealed novel relationships between how natural scenes are encoded relative to static gratings--a relationship that was conserved across visual areas. Namely, neurons preferring natural scenes preferred either low or high spatial frequency gratings, but not intermediate ones. Analyzing responses by cortical layer reveals a preference for gratings concentrated in layer 6, whereas preferences for natural scenes tended to be higher in layers 2/3 and 4. The results reveal how machine learning approaches can be used to organize and visualize the structure of sensory coding, thereby revealing novel relationships within and across brain areas and sensory stimuli. Significance StatementManifolds have become a commonplace for analyzing and visualizing neural responses. However, prior work has focused on building manifolds that organize diverse stimuli in neural response coordinates. Here, we demonstrate the utility of an alternative approach: building manifolds to represent neurons in stimulus/response coordinates, which we term encoding manifolds. This approach has several advantages, such as being able to directly visualize and compare how different brain areas encode diverse stimulus ensembles. We use the approach to reveal novel relationships between layer-specific responses and the encoding of natural versus artificial stimuli.

Autores: Steven W Zucker, L. Dyballa, G. D. Field, M. P. Stryker

Última atualização: 2024-12-20 00:00:00

Idioma: English

Fonte URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.10.24.620089

Fonte PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.10.24.620089.full.pdf

Licença: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/

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