Aproveitando a Química da Natureza para Novos Medicamentos
Cientistas estão criando compostos naturais pra desenvolver medicamentos inovadores.
Nika Sokolova, Angelina Osipyan, Lili Zhang, Matthew R. Groves, Sandy Schmidt, Kristina Haslinger
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Índice
- A Fascinante Estrutura 2-Quinolona
- A Jornada de Criação das 2-Quinolonas
- Encontrando Enzimas Promissoras
- Testando as Enzimas
- Mirando no Grande Prêmio: 4-Metoxi-1-Metil-2-Quinolona
- A Arte da Otimização
- Colocando à Prova: Fazendo Funcionar na Vida Real
- Cristalizando Seu Sucesso
- O Grande Quadro: O Que Isso Significa Para a Medicina
- Conclusão: O Tesouro dos Produtos Naturais
- Fonte original
Produtos naturais (PNs) são como tesouros escondidos na natureza, cheios de compostos que podem ser super úteis na fabricação de medicamentos. Esses compostos evoluíram ao longo de milhões de anos e servem de inspiração para novos remédios. Mas, usar essas maravilhas da natureza diretamente pode ser complicado porque muitas vezes não funcionam bem no corpo. Além disso, suas estruturas complexas tornam difícil modificar em um laboratório. Para superar esses desafios, cientistas começaram a usar as estruturas básicas desses compostos naturais como pontos de partida para descobrir novos medicamentos.
A Fascinante Estrutura 2-Quinolona
Uma estrutura interessante que os cientistas focaram se chama 2-quinolona. Essa estrutura é encontrada em certos produtos naturais, principalmente em uma família de plantas conhecida como Rutaceae. É também a espinha dorsal de vários medicamentos que estão no mercado, com usos diversos. Com o passar dos anos, os cientistas criaram muitas versões sintéticas de 2-quinolona que mostram potencial para combater infecções, a doença de Alzheimer, câncer e diabetes.
Curiosamente, a estrutura da 2-quinolona tem propriedades especiais de absorção de luz. Isso a torna útil não só para medicamentos, mas também para criar materiais fluorescentes e sensores para detectar metais. Parece que a 2-quinolona é uma multiuso no mundo da química!
A Jornada de Criação das 2-Quinolonas
Para fazer 2-quinolonas no laboratório, os pesquisadores inventaram vários métodos. Naturalmente, o tipo de 2-quinolona mais comum encontrado é o 4-hidroxi-1-metil-2-quinolona, criado por certas enzimas naturais chamadas sintases poliquetídicas do tipo III (T3PKSs). Essas enzimas funcionam combinando um composto chamado malonil-CoA com outro composto chamado N-metilantranilol-CoA. Esse processo resulta em um composto especial que eventualmente forma a quinolona desejada.
Porém, não muitas dessas enzimas que fazem quinolona foram bem estudadas. Ainda tem muito para aprender sobre como elas funcionam e como podem ser usadas para fazer novos derivados.
Encontrando Enzimas Promissoras
Em um estudo recente, os cientistas examinaram 37 diferentes T3PKSs fúngicas para ver como elas se saíam com vários materiais de partida. Surpreendentemente, metade das enzimas conseguiu transformar um composto chamado N-metilantranilol-CoA na estrutura de quinolona. Desses, os pesquisadores escolheram duas enzimas que se destacaram para estudos posteriores. Quando essas enzimas foram combinadas com uma enzima bacteriana, produziram uma variedade de novos derivados de quinolona.
Eles até descobriram que essas enzimas poderiam aceitar outros ácidos, levando à formação de diferentes tipos de compostos. Essa flexibilidade surpreendente nas enzimas abriu a porta para uma nova maneira de criar uma versão antimicrobiana do composto quinolona. Os resultados podem guiar esforços futuros para produzir esses compostos benéficos de forma mais sustentável.
Testando as Enzimas
Os pesquisadores primeiro queriam saber quão bem as duas T3PKSs selecionadas poderiam trabalhar com diferentes derivados do ácido antranílico. Eles usaram um método inteligente que permitiu combinar tudo em uma única reação. Ao usar ácido N-metilantranílico, descobriram que ambas as enzimas poderiam converter quase totalmente na quinolona.
Em seguida, testaram outros derivados, mas encontraram níveis variados de sucesso. Alguns foram transformados completamente, enquanto outros foram apenas parcialmente convertidos. Esse teste, como um jogo de "Adivinha o que Serve", deu a eles insights sobre como diferentes materiais de partida poderiam ser usados para criar a quinolona desejada.
Mais tarde, desafiaram essas enzimas com outros compostos relacionados para ver se poderiam produzir diferentes tipos de compostos. Embora as formas de coumarinas e tiocoumarinas tenham sido criadas, não foram tão produtivas quanto o esperado.
Mirando no Grande Prêmio: 4-Metoxi-1-Metil-2-Quinolona
Enquanto olhavam os vários derivados, os cientistas notaram um composto específico chamado 4-metoxi-1-metil-2-quinolona. Esse composto tem potencial para tratar várias doenças. Os pesquisadores perceberam que poderia ser fabricado com apenas um passo adicional a partir da quinolona que estavam produzindo. Empolgados, começaram a procurar a enzima certa para completar essa transformação.
A busca por O-metiltransferases (OMTs) levou-os a descobrir alguns candidatos potenciais entre enzimas bacterianas e vegetais. Eles expressaram essas enzimas em E. coli, uma bactéria de laboratório comum, para ver se poderiam metilar a quinolona no composto desejado. Para a alegria deles, três das cinco enzimas que testaram conseguiram produzir o composto-alvo.
A Arte da Otimização
Depois de encontrar uma forma de produzir a 4-metoxi-1-metil-2-quinolona desejada, os pesquisadores sabiam que não podiam parar por aí. Começaram a ajustar cada parte do processo para otimizar o rendimento do produto final. Após várias tentativas e erros, descobriram que mudar as condições, como o pH ou a quantidade de certos químicos, poderia aumentar significativamente a produção.
No laboratório, implementaram uma cascata de um pote só, que é basicamente uma técnica de cozinhar reações químicas. Eles combinaram todas as enzimas e componentes necessários em um só pote para criar o produto final. Após a otimização, o rendimento do composto desejado aumentou dez vezes! Foi como passar de uma sopinha triste para um ensopado robusto.
Colocando à Prova: Fazendo Funcionar na Vida Real
Agora, os pesquisadores enfrentaram um novo desafio: fazer esse processo funcionar dentro de bactérias vivas. Isso era importante porque poderia tornar o processo mais barato e eficiente. Eles decidiram usar E. coli para essa tarefa devido à sua genética bem conhecida e manejo seguro.
Depois de tentar várias combinações diferentes de plasmídeos (que são como manuais de instruções para células), conseguiram criar cepas bacterianas que podiam produzir o composto desejado. Embora o rendimento inicial fosse pequeno, eles gradualmente viram melhorias com algumas mudanças criativas. Ficou como jogar um videogame onde cada nível trazia novos desafios e recompensas, aproximando-os de seu objetivo.
Cristalizando Seu Sucesso
Enquanto os pesquisadores continuavam seu trabalho, não pararam apenas com os processos bioquímicos. Eles queriam entender melhor as enzimas que estavam usando. Através da cristalização, conseguiram determinar como eram as estruturas das enzimas. Essa é uma informação crucial porque entender como as enzimas são moldadas pode ajudar os cientistas a descobrir como fazê-las funcionar ainda melhor.
Ao olhar para a estrutura cristalina de uma das principais enzimas, perceberam que poderiam fazer modificações para aumentar sua eficiência. É como afinar uma guitarra: alguns pequenos ajustes podem fazer uma grande diferença no desempenho.
O Grande Quadro: O Que Isso Significa Para a Medicina
Essa pesquisa não é só um projeto de ciência divertido; tem potencial para desenvolver novos medicamentos. Criando maneiras de engenheirar caminhos para produzir compostos naturais em bactérias, os cientistas poderiam fazer novos remédios de forma mais eficiente e acessível. À medida que avançamos para um futuro incerto com o desenvolvimento de medicamentos, encontrar formas sustentáveis de produzir compostos importantes é essencial.
Conclusão: O Tesouro dos Produtos Naturais
Em resumo, os produtos naturais oferecem uma vasta oportunidade para desenvolver novos medicamentos, apesar dos desafios que vêm com seu uso. Os pesquisadores fizeram avanços significativos na melhoria da criação de compostos valiosos através de abordagens inovadoras. Com o trabalho e a exploração contínuos, o futuro parece brilhante para transformar as maravilhas da natureza em tratamentos eficazes para todo tipo de doença. Quem sabe um dia, poderemos empacotar esses processos e transformá-los em um livro de receitas para criar medicamentos que salvam vidas em qualquer laboratório!
Então, brindemos à ciência – onde até as menores descobertas podem levar a inovações que salvam vidas, um composto de cada vez!
Fonte original
Título: A biocatalytic platform for the production of substituted 2-quinolones and (thio)coumarins
Resumo: 2-quinolones are privileged scaffolds for drug discovery that are relatively rare in nature. Here, we characterise two promiscuous fungal polyketide synthases AthePKS and FerePKS, which we had previously found to produce quinolones in vitro. We challenged the enzymes with several substituted anthranilic acid derivatives, revealing their ability to produce precursors of pharmaceutically relevant quinolones. We also discovered that AthePKS and FerePKS accept other 2-substituted benzoic acids, leading to the formation of coumarin and thiocoumarin scaffolds. We applied AthePKS in an artificial enzymatic cascade towards an antimicrobial 4-methoxy-1-methyl-2-quinolone and demonstrated its in vivo feasibility by successfully expressing the pathway in Escherichia coli. Lastly, we determined the crystal structure of AthePKS, suggesting hotspots for enhancing its catalytic efficiency by enzyme engineering. Our results provide a framework for further engineering of enzymatic routes towards privileged heteroaromatic scaffolds and derivatives thereof.
Autores: Nika Sokolova, Angelina Osipyan, Lili Zhang, Matthew R. Groves, Sandy Schmidt, Kristina Haslinger
Última atualização: 2024-12-23 00:00:00
Idioma: English
Fonte URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.12.20.629698
Fonte PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.12.20.629698.full.pdf
Licença: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
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