Sci Simple

New Science Research Articles Everyday

# Biologia # Microbiologia

Bactérias ao Resgate: Encarando o Cheiro de Skatole

Descubra como certas bactérias quebram o skatole, reduzindo odores desagradáveis no ambiente.

S.J. Galaz, B. Saavedra, A. Zúñiga, F. González-Toro, R. Donoso

― 7 min ler


Bactérias Combatem o Bactérias Combatem o Cheiro de Skatole eficaz. combatendo a poluição do odor de forma As bactérias quebram o skatole,
Índice

Skatole, também conhecido como 3-metilindole, é um composto famoso pelo seu cheiro horrível. Se você já esteve perto de uma fazenda ou de um lugar que processa dejetos de animais, talvez tenha sentido um pouco disso. Esse composto é produzido por micro-organismos durante a decomposição de uma substância chamada triptofano, que faz parte de muitas proteínas. O triptofano tá presente em alimentos como peru, chocolate e bananas. Então, da próxima vez que você morder uma banana, lembre que uma parte disso pode levar à produção de skatole em algum lugar do mundo animal!

De Triptofano a Skatole

A jornada do triptofano até o skatole é bem interessante. Tudo começa quando o triptofano é alterado por várias reações químicas, levando à formação do ácido indol-3-acético (IAA). Essa transformação rola dentro dos intestinos de mamíferos, graças ao trabalho duro dos micro-organismos. Depois disso, uma enzima chamada descarboxilase indoleacetato entra em cena, que separa o IAA, levando eventualmente ao skatole.

Esses micro-organismos produzem skatole não só nos intestinos humanos, mas também nos intestinos de vários animais. Você normalmente encontra altas quantidades de skatole no esterco de porcos, em fazendas de gado e em outros ambientes agrícolas. Na real, pesquisadores já detectaram skatole em águas residuais em concentrações de até 700 μg/L, o que é bem forte!

O Cheiro de Skatole

Agora, vamos falar do cheiro. O odor do skatole é frequentemente comparado ao de fezes. Ninguém quer admitir que gosta desse tipo de aroma! O limite em que os humanos podem começar a sentir o skatole é em torno de 0,327 nanogramas por litro — isso é tipo, super baixo, um pouquinho já invade seu nariz!

Muita gente nem sabe, mas muito skatole no ambiente pode causar problemas de saúde. Animais podem sofrer de condições como edema pulmonar bovino agudo quando expostos a altos níveis de skatole. Até humanos podem ter problemas relacionados à decomposição de alimentos nos intestinos por causa do excesso de skatole.

Tentativas de Remover Skatole

Vários métodos foram tentados para se livrar dos odores de skatole no ambiente. Técnicas como lavagem química, adsorção ou biofiltração foram investigadas. Infelizmente, até agora, nenhuma dessas métodos foi bem-sucedida sem causar mais problemas ambientais. Isso mostra como o skatole pode ser complicado!

O Papel de Rhodococcus ruber R1

Aqui entra um foco em uma cepa específica de bactéria chamada Rhodococcus ruber R1. Essa bactéria é bem interessante porque pode usar skatole como sua única fonte de alimento. Ela se dá bem quebrando skatole, o que pode ajudar a limpar ambientes onde skatole é uma chatice.

Estudos recentes focaram em como R. ruber R1 decompõe skatole, descobrindo um conjunto genético formado por quatorze genes específicos que trabalham juntos nesse processo. Entre esses genes, tem um que ajuda a converter skatole em outro composto chamado anilina. De certa forma, R. ruber R1 é como uma mini usina de reciclagem, transformando o skatole fedido em algo menos fedido.

A Busca por Anilina

A anilina é um produto intermediário formado enquanto R. ruber R1 digere skatole. Em termos simples, pense no skatole como um bloco de Lego fedido que pode ser desmontado e reconstruído em outra coisa. As bactérias convertem skatole em anilina e depois continuam trabalhando nisso, eventualmente transformando em catecol.

Catecol é bem menos fedido que skatole! Os pesquisadores ficaram animados em descobrir que R. ruber R1 também consegue quebrar anilina, melhorando seu potencial para biorremediação — um termo chique para limpar o ambiente usando organismos vivos.

A Descoberta dos Grupos Genéticos

Cientistas descobriram um grupo de genes chamado cluster skt, que tem um papel importante na degradação do skatole. Esse cluster inclui genes que ajudam a produzir enzimas essenciais para o processo de digestão. Alguns desses genes ajudam a converter skatole em anilina, enquanto outros ajudam a transformar anilina em catecol.

Ao analisar a sequência genética de R. ruber R1, os pesquisadores notaram que alguns desses genes estavam bem relacionados aos encontrados em outras bactérias conhecidas por quebrarem compostos similares. Isso sugere que as bactérias podem estar trabalhando juntas no grande mundo microbiano para lidar com desafios ambientais.

Como R. ruber R1 Funciona?

Para entender como R. ruber R1 funciona, os pesquisadores cultivaram essa bactéria em um ambiente de laboratório com skatole como sua única fonte de alimento. Eles monitoraram o processo de transformação, notando como os níveis de skatole caíam à medida que as bactérias prosperavam e produziam subprodutos. Usando uma técnica chamada cromatografia líquida de alta performance (HPLC), os cientistas mediram os produtos da decomposição para confirmar a presença de anilina.

Curiosamente, os cientistas também descobriram que, quando introduziam anilina no ambiente, as bactérias pareciam ficar animadas e trabalhavam mais para quebrá-la. Isso mostrou que o skatole funciona como um impulso motivacional para R. ruber R1 atacar seu próximo alvo, que é a anilina.

O Papel dos Genes Skt

Os genes skt responsáveis pela degradação do skatole foram estudados a fundo. Quando R. ruber R1 foi alimentada com skatole, a expressão desses genes disparou. A presença de skatole acionou esses genes, mostrando uma conexão clara entre a disponibilidade de alimento e a atividade gênica na bactéria.

Os pesquisadores investigaram mais e revelaram que dois dos genes skt, SktA e SktB, são particularmente cruciais para quebrar anilina. Eles trabalham juntos como uma máquina bem ajustada, garantindo que o processo de decomposição funcione lisinho.

Uma Competição Amigável

R. ruber R1 não foi a única jogadora no jogo. Outras bactérias, como algumas cepas de Pseudomonas e Acinetobacter, também foram encontradas quebrando skatole e compostos relacionados. Essa competição amigável entre micro-organismos mostra a forma como a natureza lida com bagunças em diferentes ambientes.

Os pesquisadores notaram que, embora R. ruber R1 seja boa em quebrar skatole, ela também participa da degradação de outros compostos como anilina e seus derivados. Isso pode fazer de R. ruber R1 uma aliada valiosa na limpeza de ambientes afetados pelo skatole, seja por causa da agricultura ou de atividades de tratamento de resíduos.

O Que Vem a Seguir na Pesquisa de Rhodococcus?

As descobertas relacionadas a R. ruber R1 e suas capacidades de degradação de skatole trazem esperança para resolver alguns dos problemas de poluição ligados à pecuária e ao gerenciamento de resíduos. O uso de cepas bacterianas em esforços de biorremediação é um campo em crescimento, mostrando que a natureza tem suas próprias maneiras de lidar com bagunças feitas pelo homem.

Ao identificar os genes exatos envolvidos na quebra de skatole e anilina, os cientistas agora conseguem entender melhor como aproveitar essas bactérias efetivamente em estratégias de limpeza ambiental. Seja aumentando o crescimento desses micróbios benéficos em áreas afetadas ou os engenheirando para quebrar poluentes de forma mais eficaz, o futuro parece promissor.

Conclusão

Resumindo, skatole é um composto fedido que representa um desafio ambiental significativo, especialmente em contextos ligados à pecuária. No entanto, a natureza tem uma arma secreta: as bactérias como R. ruber R1 que conseguem quebrar essa chatice fedida. Essas bactérias não só degradam skatole, mas também abrem caminho para a decomposição de compostos intermediários como anilina.

A pesquisa contínua sobre a maquinaria genética por trás desses processos é crucial para desenvolver soluções ecológicas para o gerenciamento de poluição. Ao entender e utilizar esses processos microbianos, podemos conseguir manter nossos ambientes um pouco mais limpos e menos fedidos!

Imagine um mundo onde os cheiros de skatole são coisa do passado! Isso seria uma conquista aromática e tanto, não seria?

Fonte original

Título: Aniline Dioxygenase in Rhodococcus ruber R1: Insights into Skatole Degradation

Resumo: Skatole is an aromatic heterocyclic compound with a strong offensive odor, produced by microorganisms during the anaerobic breakdown of tryptophan. Skatole accumulation is linked to environmental and health issues. Despite its persistence and harmful effects, skatoles biodegradation by microorganisms is poorly understood. We have recently isolated a gram-positive bacterium, Rhodococcus ruber R1, which uses skatole as its sole carbon and energy source. Here we report an operon consisting of 14 genes encoding aromatic oxygenase systems involved in skatole degradation in Rhodococcus ruber R1. Cells growing on skatole accumulate aniline transiently, indicating its role as an intermediate in the degradation pathway. We characterize six genes in this cluster that encode for an aniline dioxygenase, which converts aniline to catechol and is only activated in the presence of skatole. This gene cluster was successfully introduced into a heterologous strain enabling the full degradation of aniline and its derivatives. Phylogenetic analysis of aniline dioxygenase present in R1 strain reveals a widespread distribution of this system among bacteria, in contrast to the full skatole cluster, which is restricted to a few genera. These findings advance our understanding of the skatole degradation pathway and highlight R1s potential for bioremediation of skatole, aniline, and related contaminants.

Autores: S.J. Galaz, B. Saavedra, A. Zúñiga, F. González-Toro, R. Donoso

Última atualização: 2024-12-29 00:00:00

Idioma: English

Fonte URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.12.29.630347

Fonte PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.12.29.630347.full.pdf

Licença: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

Alterações: Este resumo foi elaborado com a assistência da AI e pode conter imprecisões. Para obter informações exactas, consulte os documentos originais ligados aqui.

Obrigado ao biorxiv pela utilização da sua interoperabilidade de acesso aberto.

Artigos semelhantes