薬物毒性試験方法の進展
革新的なアプローチが医薬品の安全性評価における動物実験を置き換える。
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目次
新しい薬の開発の過程では、科学者たちはその安全性を評価する必要があるんだ。これには、薬が生物にどのように影響するかを見る毒性テストが使われる。従来は動物を使っていたけど、今はより倫理的な薬のテスト方法を探す要求が高まってるんだ。
動物から細胞ベースのテストへの移行
研究者たちは、動物テストに頼らない方法を模索してる。薬が人間の試験に入る前に安全かどうかを知りたいんだ。期待できる方向性の一つは、細胞を使った実験、いわゆるin vitroテストやコンピュータシミュレーション、in silico法を使うこと。これらの方法は、動物を傷つけることなく薬の挙動を予測するのに役立つんだ。
物質の潜在的な毒性を予測するために使われる方法の一つがQSPR/QSARと呼ばれるもので、化学物質の構造とその特性との関係に焦点を当ててる。これらの関係を分析することで、研究者は化合物が細胞にどのように影響するかを予測できるんだ。
このアプローチは2000年代初頭から大きく成長して、特にEUなどの新しい規制の影響で、企業はコンピュータシミュレーションを使って製品の毒性を評価することが求められてる。
薬による毒性の予測
多くの薬は安全に使えるけど、いくつかは有害な影響を引き起こすかもしれないんだ。研究者たちは、一般的な細胞損傷や筋肉の分解といった悪影響を予測する進展を遂げてる。でも、毒性を予測するのはいつも簡単じゃない。
一つの課題が「アクティビティクリフ」と呼ばれるもので、これは化学構造の小さな変化が毒性に大きな変化をもたらすことを指してる。そのため、新しい薬がどのように振る舞うかを予測するのはかなり難しいんだ。
この課題に対処するために、科学者たちは様々な技術を検討してる。革新的な方法の一つがCell Paintingアッセイ。これは、高性能顕微鏡を使って細胞が異なる物質にどのように反応するかを調べる技術だ。特別な染料を使って、研究者は細胞構造の変化を視覚化し、異なる化合物が細胞の健康にどのように影響するかを理解できるんだ。
Cell Paintingアッセイの役割
Cell Paintingアッセイでは、細胞を物質で処理してから、蛍光染料を使って特定の細胞部分を強調するんだ。治療後の細胞の見た目を調べることで、物質の影響について重要な情報を収集できる。このアッセイは、化合物が有毒かどうかを示し、細胞レベルでの動作を理解する手助けをするよ。
このアッセイは、6つの蛍光マーカーを使って、様々な細胞小器官を染色するんだ。これによって、研究者は異なる化学物質への曝露によってこれらの構造がどのように変化するかを見られる。結果は、動物テストに入る前に有害な物質を特定するのに役立つ。
筋肉毒性に焦点を当てる
多くの臓器やシステムが毒性について研究されているけど、筋肉毒性はしばしば見落とされがち。例えば、筋肉毒性に関する研究は、脳毒性などの他の分野と比べて非常に少ないんだ。この見落としは、筋肉関連の問題がそれほど深刻でないと見られているからかもしれない。
でも、筋肉は人間の体の大部分を占めていて、さまざまな薬にさらされるんだ。もし薬が筋肉にダメージを与えたら、深刻な結果を招くことがある。歴史的なケースでは、筋肉損傷によるコレステロール低下薬の撤回が例として挙げられるように、この分野でのより良いテストの必要性があるんだ。
研究者たちは、筋肉細胞に焦点を当てて毒性をより理解しようとしている。マウスの筋肉細胞から得られたC2C12細胞株は、筋肉生物学を研究するのに貴重なツールなんだ。これらの細胞は成長して筋肉繊維を形成できるから、化学物質が筋肉の健康にどう影響するかを探るのに理想的なモデルなんだ。
C2C12細胞を使った毒性テスト
C2C12細胞株を使うことで、科学者は異なる化学物質が筋肉細胞に与える影響を調査できる。異なる筋肉毒性物質をこれらの細胞に適用することで、研究者はその反応を観察できる。最初の目標は、これらの反応のプロファイルを作成して、潜在的な毒性をよりよく予測することなんだ。
この研究では、筋肉に毒性のあることで知られる30種類の化学物質をC2C12細胞でテストしたよ。Cell Paintingアッセイを使って、研究者は化学物質への曝露に基づいて細胞の外観や数の変化を視覚化することができた。
結果は、細胞の構造にさまざまな変化が見られた。サイズの増加や形の変化などがあり、これらの観察は筋肉組織に対して有害な物質を特定するのに役立つんだ。
毒物に対する細胞反応の分析
Cell Paintingアッセイを実施した後、研究者たちは細胞の画像を集めて各化学物質の影響を分析した。彼らは、自動化されたプロセスを使って、細胞の形状、サイズ、密度など、さまざまな特徴を評価したよ。
分析から、多くの化学物質が細胞の数を大幅に減少させることがわかった。この減少は、それらの化学物質が有害である可能性を示唆してる。中には、健康な細胞がほとんど残らないほど深刻な影響を与える物質もあったんだ。
研究者たちはまた、細胞の健康を示すATPレベルを見て細胞の生存率を測定した。いくつかの化学物質は細胞数を損なったが、ATPレベルへの影響は異なっていた。いくつかのケースでは、細胞数の減少がATPレベルの低下に対応しなかったことから、細胞数と健康の間には複雑な関係があることが示唆されたんだ。
統計モデルを使って毒性を予測
Cell Paintingアッセイで観察された影響を定量化するために、研究者たちは統計モデルを使用した。特に、ランダムフォレストモデルを適用して、収集したデータに基づいて細胞数と生存率を予測したんだ。
これらのモデルは、異なる化学物質がC2C12細胞にどのように影響するかを予測するのに有望だった。多くの試験された化合物に対して予測は正確で、特に高い毒性が知られているものに対する相関が強かったよ。
しかし、研究者たちは、正確な予測が利用可能なデータの量によって制限される可能性があることにも注意していた。一部の化学物質については、モデルの効果が限定的で、特に細胞の健康に大きな変化を示さなかった場合は効果が薄かった。
異なる種類の細胞の比較
この研究では、C2C12細胞の2つのタイプ、すなわち筋芽細胞(未成熟の筋肉細胞)と筋管(成熟した筋肉繊維)の反応を比較した。結果は、両方の細胞タイプが多くの毒物に似た反応を示すことを示していた。ただし、反応パターンの違いは、特定の毒性テストのために適切な細胞モデルを使用する重要性を明らかにしているんだ。
研究者たちはC2C12細胞から得られた洞察を基に、さまざまな細胞タイプでその発見を確認できることを望んでいる。この理解は、最終的には化学物質が人間の筋肉組織に与える影響について、より信頼性の高い予測につながるかもしれないんだ。
データのクラスタリングによる深い洞察
異なる薬の関係をよりよく理解するために、研究者たちは収集したデータをクラスタリングした。このアプローチは、毒物が細胞に与える影響に基づいて多くの毒物がグループ化されることを明らかにしたよ、例えそれらが異なる化学構造を持っていても。
異なる作用機序を持つ薬物の間に予期しない類似性も見られた。特に、特定のコレステロール低下薬が、異なる意図された使用法にもかかわらず、がん治療薬と似たような効果を示したことがある。こういった発見は、これらの関係を探るためのさらなる調査が必要であることを示唆しているんだ。
制限と今後の研究
この研究は、毒性テストに高コンテンツ顕微鏡を使った重要な進展を示したけど、いくつかの制限も指摘された。テストされた化合物の数が少なかったため、結論は普遍的には適用できなかった。筋肉毒性についての理解を深めるためには、より多様な薬剤や濃度での広範なテストが必要だよ。
さらに、Cell Paintingアッセイ中にキャプチャされた画像の品質にも問題が生じた。いくつかの問題は、異なる蛍光マーカーの間での光干渉に関わっていて、結果の明確さに影響を与えたかもしれない。
今後、研究者たちは細胞の健康を評価するために使う技術を洗練させることを目指してる。彼らは、毒性を示す特定の特徴を特定し、それらの特徴を広範な生物学的効果と相関させる計画を立てているんだ。
結論
この研究は、筋肉毒性を予測する上でのCell Paintingアッセイの力を示していて、薬が筋肉の健康に与える影響を探る必要性を強調しているよ。倫理的なテスト方法に焦点を当てることで、研究者たちは動物実験への依存を減らしつつ、将来の薬が人間にとって安全であることを確保したいと考えている。この研究から得られた理解は、将来の薬の開発を導き、製薬業界での安全性評価の改善に役立つかもしれないんだ。
タイトル: Drug-induced cytotoxicity prediction in muscle cells, an application of the Cell Painting assay
概要: In silico toxicity prediction offers the chance of reducing or replacing most animal testing through the integration of large experimental assay datasets with the appropriate computational approaches. The use of Cell Painting to detect various phenotypic changes induced by chemicals is emerging as a powerful technique in toxicity prediction. However, most Cell Painting approaches use cancer cells that are less relevant for many toxicological endpoints, which may limit the usefulness of this data. In this study, a myoblast cell line is used to characterize cellular responses to a panel of 30 known myotoxicants. In place of traditional structural descriptors, here each perturbation is described by a fingerprint of calculated properties, deducted from the intensity, shape, or texture of individual cells. We show that these kinds of descriptors convey information to allow the prediction of the cellular viability and fate of cells in myoblasts and differentiated myotubes of the C2C12 cell line, and the clustering of drugs by their cytotoxicity responses. Author SummaryStudying the toxicity of chemical compounds and drugs is crucial to avoid potentially lethal adverse effects of commercialized products, but also to detect the unsuspected toxicity of existing drugs. While these assays traditionally rely on animal models raising important ethical concerns, a need for in vitro and in silico models is present and increasing in recent years. We here propose a predictive model capable of predicting the values of a cell viability assay using cell morphology profiles captured with a microscopy experiment. This model predicts the healthiness of muscle cells treated with 30 compounds suspected to induce muscular damage or even myopathies in humans. We also use these profiles to find an interesting morphological similarity between two different classes of drugs: statins (used for cholesterol treatments) and tyrosine kinase inhibitors (anti-cancer drugs). This analysis opens a new perspective for understanding the mechanisms responsible for drug-induced muscular toxicity, an area of toxicology that is currently under-researched.
著者: Roman Lambert, E. Serrano Candelas, P. Aparicio, A. Murphy, R. Gozalbes, H. O. Fearnhead
最終更新: 2024-02-11 00:00:00
言語: English
ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.02.08.579439
ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.02.08.579439.full.pdf
ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。
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