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NanoPlex: 細胞を見る新しい方法

NanoPlexは優しい方法で複数の細胞ターゲットのイメージングを向上させるよ。

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NanoPlexが細胞イメNanoPlexが細胞イメージングを強化するに可視化できるようになった。新しい方法で複数の細胞ターゲットを効果的
目次

蛍光顕微鏡は細胞生物学でよく使われるツールだよ。特別な色の光を使って、細胞や組織の特定の部分を見るのを助けてくれるんだ。科学者たちは、異なる色を使うことで一度に複数のターゲットを見ることができるから、複雑な生物学的サンプルを研究するのに便利なんだよ。

蛍光顕微鏡の基本

蛍光顕微鏡では、特定の光の下で光る特別な染料を使うんだ。異なる色を見るためには、青、緑、赤、深赤の四つのチャネルが最も一般的で、サンプル内の複数のターゲットを見るためには間接免疫蛍光法(IF)っていう方法がよく使われるよ。この方法は二つの種類の抗体に依存しているんだ。

  1. 一次抗体(1.Abs): サンプル内の特定のターゲットに結びつくんだ。
  2. 二次抗体(2.Abs): 蛍光染料と結びついていて、一次抗体に結びつく。

たとえば、サンプル内の三つの異なるターゲットを見るためには、三つの異なる種からの三つの一次抗体が必要になるんだ。これで、二次抗体をそれぞれの一次抗体に特異的に結びつけることができるんだ。

マルチプレックスの課題

この方法は役に立つけど、制限があるんだ。時々、科学者たちは一度にもっと多くのターゲットを観察する必要があって、特に単一細胞のタンパク質を調べるような詳細な研究ではそうなんだ。

過去には、いくつかの科学者が化学的方法を使って抗体を取り除きながら六つのターゲットを視覚化しようとしたことがあるんだ。これは、化学変性やフォトブリーチングなどのプロセスを通じて行われ、10以上のターゲットを視覚化できるようになったんだけど、これらの方法は細胞の構造を傷つける可能性があったんだ。

最近のアプローチでは、特別な種類のDNAを使って信号をタグ付けする方法が探求されていて、大きな面積のイメージングが可能になったんだ。これにより大きな研究ができるようになったけど、分子の位置を特定する精度が低下するなどの課題もあったんだ。だから、科学者たちはサンプルの完全性を保ちながら複数のターゲットのイメージングを可能にする新しい方法を必要としているんだ。

スーパー解像顕微鏡の進展

スーパー解像顕微鏡は、より良い細部を提供する新しい技術だよ。従来の方法よりも同時に多くのターゲットを見ることができるんだ。一番よく知られている技術の一つはExchange-PAINTっていうものなんだ。この方法では、抗体や他の結合ツールが一本鎖DNA(ssDNA)に結びつけられる。各ssDNAはユニークなタグとして機能して、科学者たちがターゲットを正確に特定できるようにしているんだ。

最近の開発では、SUM-PAINTっていうより進んだ技術を使ってサンプル内の30個の異なるターゲットを視覚化できるようになったんだ。でも、これらの技術は複雑で、専門的な機器やスキルが必要になることもあるんだ。

新しいアプローチ: NanoPlex

複数のターゲットのイメージングプロセスを簡略化するために、NanoPlexっていう新しい方法が開発されたんだ。この方法は、一次抗体に簡単に結びつくように設計された二次ナノボディ(2.Nbs)を利用しているんだ。この技術は通常の光顕微鏡でも、dSTORMやSTEDのような高度なスーパー解像技術でも使えるよ。

NanoPlexの鍵は、細胞を傷つけるような過酷な処理に依存しないことなんだ。代わりに、蛍光信号を優しく取り除く方法を使うんだ。

フォトラビル分子: OptoPlex

NanoPlex内の最初の方法、OptoPlexは特別な光感受性分子を使うんだ。この分子は特定の波長の光で照射されると、蛍光基を放出するんだ。これにより、科学者たちはサンプルを傷つけることなく、興味のある領域で信号を迅速かつ選択的に消去できるんだ。

これは特に便利で、細胞構造に大きな損傷を与えずに詳細な研究ができるんだ。信号を消した後、科学者たちはさらに抗体を追加して、イメージングプロセスを繰り返すことができるんだ。

酵素切断: EnzyPlex

二つ目の方法はEnzyPlexって呼ばれているよ。このアプローチは、蛍光基と結びついているリンカーを切断する特定のプロテアーゼ酵素を使うんだ。科学者たちは、この酵素を使うことでナノボディから蛍光信号を効果的に取り除けることができ、サンプルにあまりダメージを与えないことを発見したんだ。

テストでは、EnzyPlexは高い信号除去効率を達成し、細胞を短時間で複数回イメージングできるようにしたんだ。この方法は、酵素が多くの異なる条件下で働けるから実施しやすいんだ。

レドックス化学: ChemiPlex

最後に、ChemiPlexっていう方法があって、これは三つの方法の中で最もシンプルなんだ。ナノボディと蛍光タグの間の結合を切るために化学反応を使うんだ。還元剤を加えることで、複数のターゲット全体で迅速かつ均一に信号を取り除くことができるんだ。

ChemiPlexは、信号除去能力が効率的で均一なことが示されていて、複数回サイクルを行った後でも高品質のイメージングが可能なんだ。

NanoPlexで多様なイメージングを達成

NanoPlexの三つのアプローチにより、科学者たちは過酷な処理なしで単一のサンプル内の多くのターゲットをイメージングできるんだ。これにより、基本的な生物学から高度な医学研究まで、さまざまな分野で適用可能な多様な方法になっているんだ。

ニューロンの実験

NanoPlexの能力を示すために、科学者たちは一次海馬ニューロンに対して実験を行ったんだ。彼らはChemiPlex法を使って、21種類の異なるタンパク質を視覚化することに成功したんだ。これには、シナプスやフィラメント構造、他の細胞部分に関与するタンパク質を見ることが含まれていたんだ。

これらのニューロンを研究することで、研究者たちはシナプスタンパク質の挙動やその相互作用を分析できたんだ。特定の治療がこれらのタンパク質の局在や相互作用にどのように影響を与えるかを調べることもできたんだ。

タンパク質相互作用の相関

別の実験では、科学者たちは九つのシナプスタンパク質の関係を理解しようとしたんだ。興奮性と抑制性シナプスにおけるコロカリゼーションを調べることで、彼らはこれらのタンパク質がどのように互いに相互作用しているかを評価できたんだ。

彼らは、アルファ-シヌクレインやシナプシン-1のような特定のタンパク質に強い相関があることを発見して、これらのタンパク質がシナプス機能においてどのような役割を果たしているかを示したんだ。特定の相互作用を破壊すると知られている1,6-ヘキサンジオールを使った後、彼らはこれらのタンパク質の相関に変化があったことを観察したんだ。これにより、シナプスタンパク質が細胞内でどのように機能し、相互作用しているかについての理解が深まったんだ。

結論

要するに、NanoPlexは細胞内で複数のターゲットを視覚化しようとしている科学者たちに貴重なソリューションを提供しているんだ。その優しい信号除去方法は、最小限のダメージでイメージングの質を向上させるんだ。高度なイメージング技術の需要が高まる中で、NanoPlexのような方法は細胞生物学における画期的な発見への道を切り開く可能性があるんだ。

マルチプレックスイメージングを多くの研究所で利用可能にすることで、この新しい戦略は複雑な生物システムについての理解を広げる可能性があるんだ。多数のターゲットを同時に視覚化できる能力は、研究から臨床診断までさまざまな分野で重要な役割を果たすだろうね。

オリジナルソース

タイトル: NanoPlex: a universal strategy for fluorescence microscopy multiplexing using nanobodies with erasable signals

概要: Fluorescence microscopy has long been a transformative technique in biological sciences. Nevertheless, most implementations are limited to a few targets, revealed using primary antibodies (1.Abs) and fluorescently conjugated secondary antibodies. Super-resolution techniques such as Exchange-PAINT and, more recently, SUM-PAINT have increased multiplexing capabilities, but they require specialized equipment, software, and knowledge. To enable multiplexing for any imaging technique in any laboratory, we developed NanoPlex, a streamlined method based on conventional 1.Abs revealed by engineered secondary nanobodies (2.Nbs) that allow to selectively erase the fluorescence signals. We developed three complementary signal removal strategies: OptoPlex (light-induced), EnzyPlex (enzymatic), and ChemiPlex (chemical). We showcase NanoPlex reaching 21 targets for 3D confocal analyses and 5-8 targets for dSTORM and STED super-resolution imaging. NanoPlex has the potential to revolutionize multi-target fluorescent imaging methods, potentially redefining the multiplexing capabilities of antibody-based assays.

著者: Felipe Opazo, N. Mougios, E. R. Cotroneo, N. Imse, J. Setzke, S. Rizzoli, N. A. Simeth, R. Tsukanov

最終更新: 2024-03-20 00:00:00

言語: English

ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.03.18.585511

ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.03.18.585511.full.pdf

ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/

変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。

オープンアクセスの相互運用性を利用させていただいた biorxiv に感謝します。

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