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# 生物学# 微生物学

相互つながる健康:マイクロバイオームの役割

この研究は、マイクロバイオームが生態系の健康にどんな影響を与えるかを調べてるよ。

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マイクロバイオームとエコシマイクロバイオームとエコシステムの健康への影響群に悪影響を与えることが明らかに。研究でストレス要因が相互に関係する微生物
目次

ワンヘルスのアイデアは、人間、動物植物、環境がどれもつながっていて、それぞれの健康が影響しあってるってことに焦点を当ててるんだ。つまり、このシステムのどれかが調子悪いと、他にも影響が出ちゃうってこと。これらの要素の中で重要なのは、微生物って呼ばれる小さな生き物たちで、これらはすべてのパーツの上や中に住んでる。これらの微生物は全体のシステムを健康に保つ大事な役割を果たしているよ。

マイクロバイオームの役割

私たちのシステムのすべての部分―人間から植物、動物まで―には、マイクロバイオームって呼ばれる微生物のコミュニティが存在してる。このマイクロバイオームは食べ物の分解、病気の撃退、栄養のリサイクルなど、いろんな機能を助けてるんだ。でも、これらのマイクロバイオームが乱れたりバランスが崩れたりすると、システム全体が健康問題を抱えることになるんだ。

例えば、私たちの腸のマイクロバイオームが健康じゃないと、消化に問題が出たりするし、土壌のマイクロバイオームが影響されると、植物の成長に悪影響を及ぼすことがある。それが、これらのマイクロバイオームがどんなチャレンジに反応するかを理解することが超重要な理由なんだ。

マイクロバイオームに影響を与えるストレス因子

いろんなストレス因子がこれらのマイクロバイオームの健康に悪影響を与えちゃうことがある。ストレス因子には重金属、農薬、特定の植物代謝物質などの化学物質が含まれる。これらの物質は環境やその中の生き物の健康に直接影響を与えることがあるんだ。生き物の成長速度や食べ物の処理方法、さらにはマイクロバイオームのバランスを崩すこともある。

研究は通常、これらのストレス因子が人間、動物、植物それぞれにどう影響するかに焦点を当ててるけど、ストレス因子がシステムの異なる要素にあるマイクロバイオームにどう影響するかを調べた研究は少ないんだ。これを理解することで、共通の課題に直面したときに個々のマイクロバイオームがどれだけ強靭かを見極められるんじゃないかな。

包括的な研究の必要性

このギャップを埋めるためには、水、土壌、植物、動物などのシステムの異なる要素のマイクロバイオームを、同じストレス因子に曝露する体系的な研究を行う必要があるんだ。これによって、マイクロバイオーム同士のつながりやストレスに対する反応についてのいくつかの重要な質問に答えられるようになる。

探求すべき主な質問は次の通り:

  1. 異なる要素のマイクロバイオームは、同じストレスによって悪影響を受けることがあるのか?
  2. もしそうなら、それぞれの要素の中で、また異なる要素間でストレスへの感受性はどう比較されるのか?
  3. これらのマイクロバイオームがストレスに反応する際に共通の反応や違いはあるのか?

研究の設定

これらの質問を調べるために、研究者たちは水、沈泥、土壌、植物、動物(マウスなど)からなる理想的な食物連鎖モデルを設計したんだ。そして、3つのストレス因子を選んだ:ヒ素(有毒金属)、ベンゾキサジノイド(植物由来の自然化学物質)、テルトブチラジン(一般的な除草剤)。

研究の構成要素

  1. 水と沈泥: これらは生態系の水生部分を表していて、多様な微生物がいっぱい住んでる。
  2. 土壌: 栄養循環に重要な役割を果たす豊かな多様性の微生物が含まれている。
  3. 植物: 成長と健康のためにマイクロバイオームに依存する一次生産者を表してる。
  4. 動物: 動物ではマウスを使って、マイクロバイオームから健康な腸を必要とする最終消費者を表現した。

研究者たちは、その後、選ばれた化学物質にこれらのマイクロバイオームを体系的に曝露し、濃度を一定に保ちながら、経時的にモニタリングした。

研究方法

研究者たちはストレス因子を含む溶液を準備して、毎日各要素に適用して、安定した曝露を確保した。1週間後、各要素からサンプルを取り出して分析に回した。サンプルからDNAを抽出して、マイクロバイオームを研究し、存在する微生物のユニークな遺伝子サインに注目した。

マイクロバイオームの分析

彼らはいろんな技術を使ってマイクロバイオームの全体的な健康と多様性を評価した。重要な指標には以下が含まれる:

  • アルファ多様性: マイクロバイオームにどれだけの異なるタイプの微生物が存在し、相対的に分布しているかを測る。
  • ベータ多様性: マイクロバイオーム同士がどれだけ異なるかを見る。

これらの評価は、ストレス下でのマイクロバイオームがどれだけ強靭かを特定するのに役立つ。

結果の理解

データを集めた結果、研究者たちはマイクロバイオームが曝露されたストレス因子に対して異なる反応を示したことを発見した。

化学ストレス因子への感受性

動物のマイクロバイオームはコミュニティ構造と多様性で最も大きな変化を示し、化学ストレスに最も敏感であることがわかった。土壌のマイクロバイオームは多様性が減少したけど、水や植物のような他の要素はそれほど劇的な変化は見られなかった。

さらに、増減した特定の微生物も記録して、どの微生物がさまざまなストレス因子に対してより強靭か、または敏感かの洞察を得たよ。

健康への影響

マイクロバイオームの変化は健康に深刻な影響を及ぼす可能性がある。例えば、特定の有益なバクテリアが減少すると、動物の病気に対する感受性が増すかもしれないし、土壌のマイクロバイオームの変化は植物の健康に影響を与えることがある。これが連鎖反応を引き起こして、エコシステム全体の健康を脅かすことになるんだ。

共生ネットワーク

研究者たちはまた、微生物がコミュニティ内でどう相互作用しているかも調べた。彼らは共生ネットワークを作成して、これらの関係を可視化した。より多くの接続(またはノード)を持つネットワークは通常、より健康で安定している。ストレス因子に曝露した後、いくつかのネットワークはスパースになり、有益な微生物間の相互作用が失われる可能性を示唆した。特に、動物のネットワークは大きく変化し、曝露後にあまり安定していないかもしれないことを示している。

結論と今後の方向性

この研究は、相互に関連したシステムの健康がいかに複雑で、さまざまな要素が同じストレス因子に対して独自に反応するかを強調している。結果は、すべてのエコシステム要素にわたって健康なマイクロバイオームを維持するためのさらなる研究の必要性を強調している。

科学が進むにつれて、これらのつながりを理解することは、エコシステムやその中の生物の健康を促進するための効果的な戦略を開発するために重要になるだろう。この知識のギャップに取り組むことで、農業、環境管理、公共の健康のためのより良い実践につながるかもしれない。

結論として、この発見は、異なる要素間のマイクロバイオームの相互依存性を考慮した、健康を包括的に見ることの重要性を強調し、最終的にはすべての人にとって健康的な地球に寄与することになるんだ。

オリジナルソース

タイトル: Component specific responses of the microbiomes to common chemical stressors in the human food chain

概要: Along a food chain, microbiomes occur in each component and often contribute to the functioning or the health of their host or environment. One Health emphasizes the connectivity of each components health. Chemical stress typically causes dysbiotic microbiomes, but it remains unclear whether chemical stressors consistently affect the microbiomes along food chain components. Here, we systematically challenged a model food chain, including water, sediments, soil, plants, and animals, with three chemical stresses consisting of arsenic (a toxic trace element), benzoxazinoids (an abundant bioactive plant metabolites), and terbuthylazine (an herbicide typically found along a human food chain). The analysis of 1,064 microbiome profiles for commonalities and differences in their stress responses indicated that chemical stressors decreased microbiome diversity in soil and animal, but not in the other microbiomes. In response to stress, all food chain communities strongly shifted in their composition, generally becoming compositionally more similar to each other. In addition, we observed stochastic effects in host-associated communities (plant, animal). Dysbiotic microbiomes were characterized by different sets of bacteria, which responded specifically to the three chemical stressors. Microbial co-occurrence patterns significantly shifted with either decreased (water, sediment, plant, animal) or increased (soil) network sparsity and numbers of keystone taxa following stress treatments. This suggested major re-distribution of the roles that specific taxa may have, with the community stability of plant and animal microbiomes being the most affected by chemical stresses. Overall, we observed stress- and component-specific responses to chemical stressors in microbiomes along the model food chain, which could have implications on food chain health.

著者: Alban Ramette, W. Wasimuddin, A. Chiaia-Hernandez, C. Terrettaz, L. Thoenen, V. Caggia, P. Matteo, M. Coll-Crespi, M. Notter, M. Mukherjee, T. Chavez-Capilla, F. Ronchi, S. C. Ganal-Vonarburg, M. Grosjean, M. Bigalke, S. Spielvogel, A. Macpherson, A. Mestrot, S. Hapfelmeier, M. Erb, K. Schlaeppi

最終更新: 2024-04-21 00:00:00

言語: English

ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.04.20.590402

ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.04.20.590402.full.pdf

ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。

オープンアクセスの相互運用性を利用させていただいた biorxiv に感謝します。

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