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# 生物学# 遺伝学

外温動物の上昇する気温に対する遺伝的戦い

外温性生物は、地球の気温上昇に適応するのが大変なんだ。

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外温性動物と気温上昇外温性動物と気温上昇してる。変温動物は地球温暖化への遺伝的適応に苦労
目次

温度は外部の熱源に頼る生物、つまり変温動物にとって大きな課題なんだ。これらの生物は環境に依存して体温を調整していて、それが生存や成長、繁殖に影響を与えるんだ。温室効果ガスの排出によって全球の温度が上昇する中で、多くの変温動物は厳しい選択を迫られてる:高温に適応するか、絶滅の危険にさらされるか。

熱性能曲線

変温動物は、熱性能曲線(TPC)と呼ばれるもので温度に対する反応を示すんだ。この曲線は、成長や適応度などの要素が異なる温度でどれだけうまく機能するかを示している。普通、これらの曲線は、生物が特定の温度範囲で最も良く機能し、その範囲を超えるとパフォーマンスが低下する、特に高温では顕著なんだ。

異なる種は形や最適温度が異なるTPCを持ってる。これらの違いは、生物の遺伝子が温度に対する反応に影響を与えることを示唆してる。研究によれば、種内でTPCに遺伝的変異が見つかってるけど、その程度は種や集団ごとに異なるんだ。たいていの場合、遺伝的差異は最適温度でのパフォーマンスの高さに見られ、最適温度そのものの変化にはあまり見られない。

遺伝的変異と温度適応

温度が上昇する中で、遺伝的変異を理解することは重要だ、特に熱性能の文脈では。ある種は性能特性を維持しながら高温に適応するのが難しいかもしれない。適応にはトレードオフが生じることがあって、ある温度でのパフォーマンスを改善すると別の温度でのパフォーマンスが損なわれることもあるんだ。

細胞内のすべての生化学反応は温度の影響を受ける。温度が変化すると、これらの反応に必要なエネルギーも変わるから、TPCの特性も変わることがある。寒冷適応生物は暖かい温度でうまく機能できないことがあるし、その逆も然り。このパターンは、TPCが低温から高温に移行する際に顕著だね。

ニューロスポラ・クラッサの調査

遺伝的要因がTPCにどのように影響するかをよりよく理解するために、研究者たちはニューロスポラ・クラッサという filamentous fungus を研究したんだ。このキノコは、無性生殖と有性生殖の両方を含むライフサイクルがあって、亜熱帯の条件で腐植を分解するから、遺伝的モデルとして役立つんだ。

このキノコの株は、アメリカ南東部やカリブ海の地域から集められた。異なる株を交配して、多様な集団を作成して、さまざまな温度での成長の遺伝的基盤を特定する手助けをしたんだ。

ゲノムワイド関連解析

ニューロスポラ・クラッサの成長に関連する遺伝子を特定するために、ゲノムワイド関連解析(GWAS)が行われた。目標は、異なる遺伝子が異なる温度での成長速度にどのように影響するかを調べることだった。この研究で使われた株は、20、25、30、35、37.5、40 °Cの6つの異なる温度での成長が事前にテストされていたんだ。

研究者たちは、高度なDNAシーケンシング技術を使って、これらの株の遺伝的構成について情報を集めた。さらに、遺伝データの質を確認する方法を用いて、異なる温度での成長に影響を与える可能性のある変異を正確に特定する手助けもしたんだ。

遺伝子マッピングと分析

異なる遺伝的マーカーが異なる温度での成長とどのように関連するかを理解するために、研究者たちは各系統の遺伝子マップを作成した。これらのマーカーをマッピングすることで、特性が一緒に引き継がれる可能性を見て、温度適応に対する遺伝的影響をより良く理解できるようにしたんだ。

統計分析ツールを使って、研究者たちはデータを調べて各系統のTPCを推定した。異なる遺伝的マーカーが異なる温度での成長速度にどのように対応するか、また特定の遺伝子と温度パフォーマンスの間に有意な関連があるかを見たんだ。

研究の結果

この研究では、特定の遺伝的変異とニューロスポラ・クラッサの異なる温度での成長速度の間にいくつかの重要な関連が見つかった。いくつかの変異は特定の温度での成長に特に関連している一方、他の変異は複数の温度での成長に影響を与えるようだった。

非コーディング遺伝的変異、つまり実際の遺伝子の一部ではないものの存在は、遺伝子の活動を調整する役割があることを示唆しているかもしれない。ミスセンス変異、つまりタンパク質の一つのアミノ酸が変わる変異も見つかり、異なる温度条件下での成長プロセスとの直接的な関連が示唆されている。

面白いことに、研究者たちは小さな遺伝的変異が成長速度を低下させることが多いと指摘した。これらの変異の多くは自然集団で低頻度で見られ、有害であるように思えるため、負の選択がこれらのアリルを抑制している可能性があるんだ。

研究結果の意味

この研究結果は、変温動物の遺伝子と温度応答の間の複雑な関係を示している。様々な温度での成長に関連する多くの遺伝子は、単独の温度応答だけでなく、代謝過程にも関与している。

たとえば、エネルギー生産や細胞壁の完全性に関連する遺伝子は、異なる温度での成長に関連づけられていた。これにより、温度適応が一般的な成長や代謝機能と絡み合っている可能性があることが強調されている。

温度パフォーマンスのトレードオフ

この研究では、異なる温度でのパフォーマンスの間のトレードオフの概念が探求された。これは種がどのように適応するかを理解する上で重要な要素なんだ。いくつかの遺伝的変異においてトレードオフの証拠が見られ、特定のアリルの効果が温度によって変わることがあった。しかし、これらのトレードオフについての強い証拠は主に弱かった。

多くの場合、特定のアリルの影響は温度特異的であるようだった。つまり、一つの温度ではパフォーマンスを向上させるが、別の温度では有害である可能性があるってこと。これは、温度に対する適応が様々な遺伝的要素の複雑な相互作用であることを示唆している。

結論

全体的に、研究は変温動物の温度パフォーマンスの遺伝的基盤についての理解を深めたんだ。ニューロスポラ・クラッサの研究は、特定の遺伝的変異が温度適応に対応している一方で、これらの変異が他の成長関連プロセスにも影響を与えることを示している。

温度適応によるパフォーマンスのトレードオフは遺伝的レベルで存在するけど、温度の変動を引き起こす主な力ではないんだ。これらの発見は、気候が変化する中で生物がどのように対処するかに関する将来の研究に役立つかもしれなくて、高温に対するレジリエンスに寄与する遺伝的要因についての洞察を提供するんだ。

気候が変わり続ける中で、これらの遺伝的メカニズムを理解することは、さまざまな種がどのように反応し、生き残り、進化するかを予測するのに重要になるよ。

オリジナルソース

タイトル: Genome-wide association for loci influencing thermal performance curves in Neurospora crassa

概要: Temperature poses a unique challenge to ectothermic species, as it affects all biochemical reactions in the cell and causes physiological stress. The effect of temperature on an organism can be described by a thermal performance curve (TPC), which displays organismal performance, such as growth rate, as a function of temperature. Previous studies on thermal performance have revealed different amounts of genetic variation and trade-offs in TPC shape and position within species and populations. However, very little is known about the genetic architecture of TPCs on the level of individual loci and alleles. We asked what is the identity of loci contributing to genetic variation in TPCs, and do the alleles exhibit trade-offs or thermodynamic scaling across the temperature range? We used genome-wide association mapping to find loci influencing growth rate at different temperatures and TPC traits in the filamentous fungus Neurospora crassa. We also evaluated the directions and magnitudes of allelic effects to investigate possible trade-offs. We observed both unique associations at specific temperatures, as some loci affected growth rate only at low, intermediate, or high temperatures, and associations that were shared across multiple temperatures. However, only weak evidence of trade-offs was detected, indicating that the evolution of TPCs in N. crassa is not constrained by allelic effects in opposite directions at hot and cold temperatures. Our findings indicate that trade-offs contribute little to variation in TPCs.

著者: Ilkka Kronholm, E. Rasanen, N. N. Moghadam, K. Sidhu, P. A. M. Summanen, H.-R. Littunen, T. Ketola

最終更新: 2024-05-15 00:00:00

言語: English

ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.04.29.591604

ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.04.29.591604.full.pdf

ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。

オープンアクセスの相互運用性を利用させていただいた biorxiv に感謝します。

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