遺伝学と長寿:長生きする家族からの洞察
希少な遺伝子変異が人間の健康や長寿にどう影響するかを調べる。
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目次
人間の老化って、遺伝子やライフスタイル、環境、医療へのアクセスみたいな色んな要素に影響される複雑なプロセスなんだ。過去200年で、栄養、衛生、医療の改善によって平均寿命は延びたけど、必ずしも健康的に長生きできるわけじゃない。慢性疾患が出る前に悪化した健康状態で過ごす年数は大して増えてないから、特に女性の間で健康が下がっていく期間が長くなってるんだ。
長生きする人たち、特に長寿家系の人たちは、後の人生での健康を高めるためのキーな洞察を持ってるかもしれない。そういう家族は年齢に関連する健康問題が少ないことが多いんだ。長寿って、特に長い人生を生きる能力を指すんだけど、家族で受け継がれることがよくあって、多くの親族が90歳を超えて生きる可能性が高いんだよね。過去200年の間に病気や飢饉、戦争などの挑戦に直面してもね。
ライデン長寿研究(LLS)っていう研究は、長寿家系の人たちが中年を迎える時に健康な免疫システムや代謝のプロファイルを持っていることを示したんだ。この家族達の遺伝子データを調べることで、老後の健康に良い影響を与える特定の遺伝子変異を見つけようとしてる。
長寿に関連する遺伝的変異の探索
長生きに関連した遺伝的特性を見つけるためのアプローチの多くは、一般的な遺伝的変異に集中してきたんだ。全ゲノム関連解析(GWAS)っていう方法では、長寿に関連するゲノム内のいくつかの重要な領域が見つかっているけど、APOEとFOXO3の2つの遺伝子だけが、様々な研究で一貫して関連性を示しているんだ。
GWASでの発見が限られていたことから、研究者たちはより大きな影響を与えるかもしれない珍しい遺伝子変異に焦点を当てることにしたんだ。GWASが一般的な変異を広く探すのに対して、候補遺伝子アプローチは特定の遺伝子経路が長寿にどう関係するかを調査するんだ。一部の研究では、他の種での寿命に関連する遺伝子を調べていて、人間にも同じ原則が適用されることを期待してるんだ。
重要なタンパク質のファミリーの一つが、ミトジェン活性化プロテインキナーゼ(MAPK)なんだ。これらのタンパク質は、細胞外から内側に信号を送る重要な役割を果たしてて、細胞の成長、生存、代謝などのプロセスに影響を与えている。細胞内にはいくつかのMAPK経路があって、異なる信号を管理しているけど、時には逆らうこともあるんだ。これらの経路がどうやって特定の効果を達成するかは、まだ研究者たちの探求の途中なんだ。
これらの経路の中で、細胞外信号調節キナーゼ1/2(ERK1/2)経路が注目を集めているんだ。なぜなら、その活動を制限することが酵母や虫、ハエ、マウスなどの様々な生物で長寿に関連づけられているから。これは、細胞が外部の信号に反応できるように、いくつかのタンパク質が順に相互作用する経路なんだ。
MAPK/ERK経路は、ホスファチジルイノシトール3キナーゼ(PI3K)-プロテインキナーゼB(AKT)経路という別の重要な経路とも相互作用するんだ。この経路は細胞の成長と代謝を調整する上で重要な役割を果たしている。それぞれの経路が互いに影響を与え合っていて、片方を阻害するともう片方に変化をもたらすことが研究で示されているんだ。
MAPK/ERK経路における遺伝的変異の役割の調査
MAPK/ERK経路の遺伝的変異が人間の長寿にどう影響するかを理解するために、研究者たちは長寿者のゲノムに見られる珍しい変異の機能的影響を特定する手法を作ったんだ。研究したサブグループは、少なくとも二人の兄弟姉妹が特に長く生きたオランダの家族に焦点を当てたLLSからのもので、男性は89歳以上、女性は91歳以上だったんだ。
研究者たちは、特定の基準を満たす10の珍しい遺伝子変異を特定したんだ。珍しい遺伝的変異を研究するには限界があって、十分な統計的パワーがないとその重要性を示すのが難しいから、長寿の家族だけに見られる変異を選ぶことで、長く健康的な生活に寄与する変異を発見する可能性を高めようとしたんだ。
特定の変異が細胞活動に与える影響
これらの変異を特定した後、研究者たちはそれらの機能的影響に焦点を当てて、マウス胚性幹細胞(mESC)という特定のタイプの幹細胞を使ったんだ。目的は、これらの遺伝的変化が長寿に関連する重要なシグナル経路にどう影響するかを探ることだったんだ。
NF1とRAF1の遺伝子の変異を調べたところ、MAPK/ERK経路の活動に大きな変化が見つかったんだ。具体的には、これらの遺伝子の変異がこの経路内の信号伝達活動を減少させ、細胞が通常の細胞分裂を促す成長因子にどう反応するかに影響を与えたんだ。
面白いことに、RAF1で見つかった変異の一つは細胞の成長を減少させたけど、細胞複製中のストレスに対する抵抗力が向上したんだ。これは、これらの遺伝的変化と細胞機能の間に複雑な関係があることを示している。もう一方のNF1の変異は細胞成長を促進したけど、そのやり方はもっと複雑で、状況によってこれらの変異が細胞の挙動に異なる影響を及ぼす可能性があることを示唆しているんだ。
タンパク質と遺伝子活動への広範な影響
これらの遺伝的変化が細胞機能にどのように影響するかをより包括的に見るために、研究者たちは修正されたmESCラインの全体的なタンパク質レベルも分析したんだ。結果は、重要な経路に関与するタンパク質の発現に明確な変化が見られた。
MAPK/ERK経路のようなタンパク質は、異なる豊富さを示して、これらの遺伝的変異が細胞の結果をどう変える可能性があるかを強調しているんだ。例えば、研究者たちは1つの変異で成長シグナルやリボソーム機能に関与するタンパク質の量が増加しているのを確認して、別の変異では逆の効果が見られたよ。
長寿に関連する特定の遺伝子の転写レベルも測定されたんだ。1つの変異は細胞成長に重要なc-Mycという遺伝子の増加をもたらし、両方の変異が健康的な老化に関連するもう一つの遺伝子Foxo3のレベルも高くなってたんだ。
増殖とストレス抵抗
MAPK/ERKとPI3K-AKT経路が細胞分裂を制御する中心的な役割を持っていることを考慮して、研究者たちは遺伝的変異が細胞増殖にどう影響するかを評価したんだ。NF1変異を持つmESCラインは成長率が高かったけど、RAF1変異を持つものは成長が遅かった。
さらに、RAF1変異を持つ細胞はストレス下でより強靭性を示していて、これらの遺伝的変化が細胞の全体的なストレス応答を改善するかもしれないことを示唆しているんだ。研究者たちは、この抵抗力の向上がDNA複製中の損傷を検出・修復する経路の活動が高まることに関連しているのを確認したよ。
結論
この研究は、遺伝的変異、細胞経路、長寿の間の複雑な関係を示しているんだ。長寿家系の珍しい遺伝子変異を特定し分析することで、MAPK/ERKシグナル経路の特定の変化が細胞の成長やストレス応答に影響を与える可能性があることがわかったんだ。
この発見は、遺伝子が健康的な老化にどう影響するかを理解する上で大きな一歩を示しているけど、これらの変異が実際の状況や異なる種でどう機能するかを探るためには、さらに研究が必要なんだよね。引き続きの調査が、将来的には人間の健康的な老化を促進するための新しい戦略につながるかもしれないよ。
タイトル: Functional characterisation of rare variants in genes encoding the MAPK/ERK signalling pathway identified in long-lived Leiden Longevity Study participants
概要: Human longevity, which is coupled to a compression of age-related disease, has been shown to be heritable. However, the number of identified common genetic variants linked to this trait remains small. This may indicate that longevity is, at least to some extent, determined by rare genetic variants that are potentially family-specific. We therefore investigated whole-genome sequencing data of long-lived families from the Leiden Longevity Study for family-specific variants. We identified variants residing in genes involved in the mitogen-activated protein kinase (MAPK) cascade, a lifespan-associated and evolutionarily conserved pathway emerging from studies in model organisms. We subsequently generated mouse embryonic stem cells (mESCs) harbouring these variants and conducted in vitro functional characterisation. Two variants, located in NF1 (Phe1112Leu) and RAF1 (Asp633Tyr), reduce MAPK/extracellular signal-regulated kinase (ERK) signalling pathway activity in mESCs. At the proteomic and transcriptomic level, we observed prominent changes that were shared (e.g. up-regulation of the ribosome) and opposing between the variants (e.g. down-regulation of mTORC1 signalling in the RAF1Asp633Tyr variant cell line versus up-regulation in the NF1Phe1112Leu variant cell lines). These metabolic changes were accompanied by an opposing effect of the variants on proliferation. Moreover, the RAF1Asp633Tyr variant improved resistance to replication stress, while this was not the case for the NF1Phe1112Leu variant. In conclusion, we identified two rare genetic variants in long-lived families that influence MAPK/ERK signalling in a manner that has previously been linked to increased lifespan in model organisms. Interestingly, we also observe some opposing and diverging effects between the variants, which indicates that they may either have some pleiotropic effects that are not relevant to longevity or that they target slightly different mechanisms to elicit their effects in mESCs. Our findings suggest that mESCs offer a good starting point for in vitro characterisation of rare genetic variants linked to human longevity and can be used to assess which of these variants to take forward to in vivo studies in model organisms.
著者: Joris Deelen, H. Hinterding, M. Baghdadi, T. Gehrmann, P. Putter, M. Neuerburg, N. Lakenberg, E. B. van den Akker, P. E. Slagboom, L. Partridge
最終更新: 2024-05-23 00:00:00
言語: English
ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.06.01.541708
ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.06.01.541708.full.pdf
ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。
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