胚発生におけるタイミングに影響を与える要因
発生における温度と代謝が分節時計にどう影響するかを調べる。
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胚胎の初期発生段階で、細胞はいろんな重要な変化を経るんだ。細胞が増殖したり、違うタイプの細胞に変わったり、互いにコミュニケーションを取ったりする。この過程でいろんな遺伝子がオン・オフされて、発生に必要なタンパク質や他の分子が作られるんだ。もしこのプロセスのタイミングがうまく調整されてなかったりすると、問題が起こる。だから、発生中に全てが同期するための共通の要因があるのかって疑問が湧くよね。さらに、動物によって発生のスピードが違うから、全ての種が同じ要因を使って発生を制御してるのかも気になるところ。
科学の中での一つの議論は、どうやって生物の発生スピードを影響するグローバルな要因があるのかどうかってこと。研究によれば、体温を外部の熱源に依存している動物、例えば昆虫や魚などの発生スピードに温度が影響を与えることがあるんだ。こういう動物たちにとっては、ちょっとした温度変化が生物学的プロセスを大きく早めたり遅らせたりするんだ。でも、哺乳類みたいな温血動物は安定した体温を持ってるから、温度を同じようにはあまり頼ってないかもしれない。
もう一つの可能性としては、代謝がある。代謝ってのは、生命を維持するために体内で起こる化学プロセス全般を指すんだ。エネルギーは全ての生物学的プロセスにとって必要不可欠で、代謝の変化が複数の発生プロセスに影響を与える可能性があるんだ。例えば、細胞のエネルギーを生産するミトコンドリアの活動は、遺伝子発現や細胞発生などの重要なプロセスに関連してるし、栄養素も生物が成長するのに重要な役割を果たしてる。研究者たちは、代謝の変化が生物の発生スピードにも影響を与える可能性があるって見てるんだ。
分節時計
発生のタイミングがどう機能するかを研究する上で大事な概念が分節時計なんだ。これは、胚発生の初期段階で体のセグメントが形成されるタイミングを制御するメカニズムだ。科学者たちは、この時計を人間を含むいくつかの種で研究していて、セグメントが形成されるのにかかる時間は種によってかなり異なることが分かってきたんだ。
分節時計のメカニズムはHes7という遺伝子を中心にしている。この遺伝子は、遅延の後に自分自身の生産を抑制するタンパク質を生成する。このプロセスが活動の繰り返しサイクルを作り出し、これは体のセグメントの発生にとって重要なんだ。このサイクルのタイミング、つまり1サイクルを完了するのにかかる時間は、Hes7タンパク質の分解速度やその生産プロセスの遅延に影響される。
研究によると、これらのサイクルの長さは種によって異なる。例えば、マウスやウサギのサイクルは約2-3時間で、人間のサイクルは約5時間だ。これは、これらのタイミングの違いがどう制御されているのかといった興味深い質問を生む。
代謝の役割を探る
代謝は、分節時計を制御する可能性がある領域の一つとして科学者たちが注目している。以前の研究では、代謝活動の変化が発生プロセスに影響することが示されている。例えば、解糖(エネルギーのために砂糖を分解する過程)を抑制すると、胚内でのセグメント形成に影響が出ることが分かっている。細胞がエネルギーを生成する方法が分節時計のタイミングに関連している可能性も示唆されている。
ただ、代謝ってのはエネルギーの生産だけでなく、エネルギー生産や他の必要な機能に関与するさまざまな化学物質を細胞がどう扱うかも含まれている幅広い用語なんだ。最近の発見は、特定の代謝要因が単にエネルギーレベルよりも分節時計において重要な役割を果たすかもしれないことを示唆している。
異なる代謝経路をブロックすることが分節時計にどう影響するかを研究するために、いくつかの実験が行われた。これらの実験では、異なる代謝抑制剤が分節時計プロセスのタイミングに特定の方法で影響することが示された。ある抑制剤は時計の周期を延ばすことができる一方、他の抑制剤はよりターゲットを絞った影響を与える。
代謝抑制剤の選択的な影響
代謝が分節時計に与える影響を理解するために、研究者たちは様々な抑制剤とそれがHes7遺伝子に関わる3つの主要なプロセス(タンパク質の分解、イントロン処理、生産遅延)にどのように影響するかを調べた。結果は、異なる抑制剤がこれらのプロセスに対して異なる方法で作用することを示した。
例えば、解糖をターゲットとするある抑制剤はHes7タンパク質の分解を遅延させ、その半減期を延ばした。別の抑制剤は電子伝達系をターゲットとして、イントロン処理のタイミングに影響を与えたが、タンパク質の分解には大きな影響を与えなかった。こうした選択的な影響は、異なる代謝経路が分節時計の調節において異なる役割を持つことを示唆している。
研究者たちが抑制剤を組み合わせたとき、特に解糖と電子伝達系に影響を与える抑制剤を使った場合、その影響はさらに顕著だった。これは、さまざまな経路が同時に影響を受けると、分節時計の周期がさらに延びる可能性があることを示している。
温度をグローバルなモジュレーターとして
代謝抑制剤による選択的な調整と対比するために、科学者たちは温度の変化が分節時計にどのように影響するかを調べた。暖血動物ではなく変温動物のゼブラフィッシュなどに関する以前の研究は、温度の変化が分節時計に大きな影響を与えることを示している。例えば、温度が下がると分節時計の周期が劇的に長くなることがある。
マウス細胞の実験では、温度を37°Cから30°Cに下げることで、人間に近い分節時計の周期に変わることが確認された。温度の変化はHes7遺伝子に関わる3つの主要なプロセスにも影響を与え、温度が発生に影響を与えるグローバルな要因として作用する可能性があることを示唆している。
種間の比較分析
研究はまた、種によって分節時計がどう機能するかに違いがあることを浮き彫りにした。Hes7遺伝子とそのプロセスはマウスから人間まで高い保存性がある(つまり似ている)とはいえ、さまざまな代謝抑制剤がこれらのプロセスに与える影響は種ごとに若干の違いがあった。これは、基本的なメカニズムは同じでも、各種がこれらのプロセスをどう微調整しているかは異なる可能性があることを意味するかもしれない。
人間では、解糖抑制が分節時計の周期を延ばすことがマウス細胞での発見と似ていた。しかし、効果はより穏やかに見えたので、密接に関連する種であっても、発生の調節が異なる場合があるかもしれない。
今後の研究への影響
この研究の発見は、今後の探求のさまざまな道を開いている。異なる種が分節時計をどう調整しているかを理解することで、発生生物学や進化についての洞察が得られるかもしれない。また、再生医療や遺伝学研究を含むさまざまな文脈で発生を操作する方法を開発する助けにもなりそうだ。
代謝経路とその抑制剤が分節時計に選択的な効果を持つことを考えると、今後の研究はこれらのプロセスで役割を果たす特定の代謝物の特定に焦点を当てる可能性がある。そんな研究が進めば、細胞代謝が発生にどのように関与しているかについてもっと明らかになるかもしれない。
結論
要するに、分節時計は発生にとって重要な要素で、そのタイミングは温度や代謝などのさまざまな要因に影響される。代謝経路は選択的な効果を示す一方で、温度は発生タイミングの広範なグローバルな調節者として機能するようだ。これらの要因の相互作用を理解することで、生物学的発生や進化についての知識が深まる。今後の調査が、発生の背後にある複雑なメカニズムを解明し、生物学や医療に実用的な応用につながるかもしれない。
タイトル: Metabolic activities are selective modulators for individual segmentation clock processes
概要: A sequence of cellular and molecular processes unfolding during embryonic development prompts fundamental questions of how the tempo of multiple processes is coordinated and whether a common global modulator exists. The oscillation of the segmentation clock is a well-studied model of developmental tempo. While the clock period is known to scale with the kinetics of gene expression and degradation processes of the core clock gene Hes7 across mammalian species, how these key molecular processes are coordinated remains unclear. In this study, we investigated if metabolic activities act as a global modulator for the segmentation clock, finding that they are rather selective modulators. While several metabolic inhibitions extended the clock period, their effects on the key processes varied. Inhibition of glycolysis decelerated the protein degradation of Hes7 and extended the production delay but did not influence the intron delay. Electron transport chain inhibition extended Hes7 intron delay without influencing the other two processes. Combinations of distinct metabolic inhibitions exhibited synergistic effects. By contrast, temperature changes affected the clock period and all three key processes simultaneously. These results highlight the selective effects of metabolic activities on segmentation clock processes, hinting that their scaled kinetics across species may be achieved through combinations of multiple modulators.
著者: Miki Ebisuya, M. Matsuda, J. Lazaro
最終更新: 2024-06-06 00:00:00
言語: English
ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.06.04.597451
ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.06.04.597451.full.pdf
ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。
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