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# 生物学# 生化学

細胞相互作用の研究の進展

新しい方法で、細胞がいろんな生物的な状況でどうやって相互作用するかがよくわかるようになったよ。

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目次

私たちの体の細胞は孤立して働いてるわけじゃないんだ。細胞同士がコミュニケーションを取り合って相互作用し、脳の働き方、組織の発達、免疫系の反応、腫瘍の成長など、さまざまな機能に欠かせないネットワークを形成してる。例えば、免疫反応に重要なT細胞は、抗原提示細胞に触れると活性化するんだ。腫瘍では、がん細胞と周りの非がん細胞(免疫細胞や血管細胞など)が相互作用してる。この細胞同士の相互作用を理解することは、実際の条件を考慮しながら重要なんだ。

細胞間相互作用の研究方法

最近、科学者たちは細胞同士の相互作用を研究するためのさまざまな方法を開発してきた。よく使われる方法の一つは、蛍光を使う手法で、細胞が触れたときに明るい色で示すんだ。例えば、あるチームは、細胞間の接触を検出するツールを作ったり、別のチームは特定のマーカーを使って細胞の相互作用を記録する方法を開発した。ただ、これらの技術は細胞を変化させる必要があって、既知の細胞タイプにしか使えないから、自然な細胞環境での相互作用を理解するには限界があるんだ。

近接ラベリングは、これらの相互作用を研究するための多様な方法として人気が出てきた。この技術では、科学者たちが近くにあるタンパク質をマークできるんだ。LIPSTICという方法では、特殊な酵素を使って樹状細胞やT細胞の表面にあるタンパク質をラベル付けし、これらの免疫細胞の相互作用を理解するのに役立ててる。EXCELLという新しい方法は、この酵素を改良して機能を向上させるんだけど、マーカーが組織にどれだけ浸透するかはまだ研究中なんだ。他にも近くの細胞のタンパク質や糖をタグ付けする戦略も出てきたけど、in vivoでの使用にはまだ改良が必要だね。

光触媒の役割

最近の進展で、バイオロジカルな設定で相互作用を可視化するのを助ける光触媒が開発された。MicroMapというツールは、光を使って非常に近い距離でタンパク質にラベルを付けられる反応性分子を作るんだ。また、他の研究では、光を使って選択的にタンパク質をターゲットにするシステムが設計されてる。ただ、光が必要なため、これらの方法は多くが実験室環境に限られ、生きた生物ではうまく機能しないんだ。

細胞相互作用研究におけるペルオキシダーゼの利用

既存の方法の限界を考慮して、研究者たちは細胞相互作用の研究を助けるためにペルオキシダーゼという酵素の使用を検討してる。このペルオキシダーゼは、体内に自然に存在する物質(過酸化水素など)を利用して、細胞表面のタンパク質間の相互作用を促進できるんだ。例えば、よく使われるペルオキシダーゼのHRPは、この状況でよく機能する。

研究によると、生きた細胞は自然に少量の過酸化水素を生成できるんだ。実際、この物質は体内のさまざまなメカニズムで作られてるから、細胞が自分で過酸化水素を生成できるのは、外部の有害な化学物質を使わずに細胞間の相互作用を研究する新しい道を開くんだ。

新しいツールの開発

細胞相互作用をよりよく研究するために、研究者たちはHRPと特定のペプチド信号を組み合わせた新しいツールを設計した。このペルオキシダーゼを細胞の外側に結合させて、隣接する細胞のタンパク質を、あくまでその細胞が生成した過酸化水素のみで効果的にラベリングできるんだ。初期のテストでは、HRPと別の酵素を比較して、細胞表面のタンパク質ラベル付けの効果を調べたところ、HRPの方が効果的に機能することがわかったんだ。追加の過酸化水素処理なしでも、相互作用の研究に利用する可能性を示してるんだ。

その後の実験では、2種類の細胞が混ぜられた時、HRPが密接に接触している細胞をラベリングすることが観察された。顕微鏡で見ると、明確に確認できたよ。興味深いことに、過酸化水素を追加しなかった場合でも、HRPは細胞を効果的にラベリングしたから、自然な条件下での機能がよくわかるね。

特定の相互作用のテスト

この新しいアプローチで相互作用している細胞を特異的にラベリングできることを確認するために、科学者たちはユニークなマーカーに結合する2種類の細胞を準備した(パズルのピースが合うみたいに)。これらの細胞を組み合わせたとき、マッチしたペアだけがビオチンというマーカーでラベリングされた。これは、HRPが自然に存在する過酸化水素を利用して、細胞間の特定の相互作用を研究するのに使えることを示してるんだ。

メリットと制限

この方法は、大きくて複雑なマーカーが必要ないことや、細胞に有害な光や追加の化学物質の問題を避けられるなど、従来のラベリング技術に比べていくつかの利点を示してる。科学者たちは、HRPが生きた生物に対して毒性がないと提案していて、動物モデルなどの実際のバイオロジカルな設定で細胞間の相互作用を研究するのに有用だと思ってる。

ただし、いくつかの課題もある。生成される過酸化水素の量は、細胞の種類によって異なったり、同じ細胞の状態によって変わったりすることもある。これらの変動は、ラベリングの効果に影響を与えるかもしれないし、実際の相互作用の変化というより、過酸化水素のレベルの違いによって変わる可能性があるから、注意が必要なんだ。

今後の方向性

最近の進展では、近接ラベリングとさまざまな「オミクス」技術を組み合わせて、細胞生物学の多くの側面を分析できるようになってきた。これらの研究は、免疫細胞と他の細胞タイプ間の特定の相互作用を明らかにできるかもしれなくて、免疫系が疾患にどのように反応するのかについての理解が深まる可能性があるんだ。

生きた生物で細胞をマークするためのHRPの potencialがあることから、てこのようなツールのさらなる開発に高い関心が寄せられてる。研究者たちは、ウイルスと細胞の相互作用についても探っていて、これらの関係を理解することが治療法の開発に重要なんだ。

HRPを使用したラベリングの結果を空間オミクスデータと統合することで、科学者たちは、さまざまな疾患で重要な役割を果たす細胞間の複雑なネットワークを明らかにできることを期待してる。これにより、体内の異なる細胞がどのようにコミュニケーションを取り、相互作用しているかに着目した新たな疾患の理解と治療法の開発が進むかもしれないね。

まとめると、細胞間相互作用をより自然で効果的な方法で研究するためのより良いツールを開発し続けることで、生物学や医学における重要な進展への道を切り開けるかもしれない。今後の可能性は期待できるし、さまざまな健康状態をどう考え、治療するかに関わる突破口に繋がるかもしれないんだ。

オリジナルソース

タイトル: Painting cell-cell interactions by horseradish peroxidase and endogenously generated hydrogen peroxide

概要: Cell-Cell interactions are fundamental in biology for maintaining physiological conditions, with direct contact being the most straightforward mode of interaction. Recent advancements have led to the development of various chemical tools for detecting or identifying these interactions. However, the use of exogenous cues, such as toxic reagents, bulky probes, and light irradiations, can disrupt normal cell physiology. For example, the toxicity of hydrogen peroxide (H2O2) limits the applications of peroxidases in proximity labeling field. In this study, we aimed to address this limitation by demonstrating that membrane-localized Horseradish Peroxidase (HRP-TM) efficiently utilizes endogenously generated extracellular H2O2. By harnessing endogenous H2O2, we observed that HRP-TM-expressing cells can effectively label contacting cells without the need for exogenous H2O2 treatment. Furthermore, we confirmed that HRP-TM labels proximal cells in an interaction-dependent manner. These findings offer a novel approach for studying cell-cell interactions under more physiological conditions, without the confounding effects of exogenous stimuli. Our study contributes to elucidating cell-cell interaction networks in various model organisms, providing valuable insights into the dynamic interplay between cells in their native network.

著者: Hyun-Woo Rhee, I. Jeong, K.-e. Kim

最終更新: 2024-06-13 00:00:00

言語: English

ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.06.11.598589

ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.06.11.598589.full.pdf

ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/

変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。

オープンアクセスの相互運用性を利用させていただいた biorxiv に感謝します。

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