癌細胞の反応におけるTERRAの役割
TERRAの細胞質内での存在が、癌細胞のストレス応答に影響を与えるかもしれない。
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ロングノンコーディングRNA(lncRNA)は、細胞内でいろんな役割を果たす分子で、特にどこにいるかによって変わってくるんだ。特定の細胞の部分にいることが多くて、その場所によって機能が影響されるんだよ。これらのRNA分子は、他の分子と相互作用することが知られていて、条件によっての働きが変わるんだ。
lncRNAが核内で作られると、時々細胞質に移動することがある。そのとき、特別な機械が手伝ってくれて、核から出るのを助けるんだ。特定のlncRNAの場合、その移動は特有の特徴に依存するんだよ。例えば、長い形をしていて特定の修飾があるlncRNAは、NXF1というタンパク質によって運ばれることが多いんだ。
多くのlncRNAは、核内にも細胞質にも存在できるし、細胞がストレスを受けるときに細胞質に移動することもあるんだ。細胞質にいると、ストレスに対してどう反応するかや、タンパク質の合成に影響を与えることができる。研究によると、細胞内で見つかるlncRNAの約40%はポリソームに関連していて、これはタンパク質合成の場所なんだ。この結びつきは、lncRNAが直接タンパク質合成を助けるというよりも、分解されるためにマークされている可能性があるんだ。細胞質のlncRNAは、ストレスがかかっているときにできるストレス顆粒という構造にも見つかることがある。
ストレス顆粒は、細胞がストレスにさらされるときにRNAやタンパク質を集める特別な場所なんだ。これらの顆粒は、細胞がどんな状況に直面しているかによって内容が変わるんだ。lncRNAがこの顆粒内で正確に何をするかはまだはっきりしてないけど、いろんなRNA分子の相互作用がこの構造を形成して安定化させる手助けをしているかもしれないって言われてるよ。
注目すべきlncRNAの一つはTERRAで、これは染色体の保護端であるテロメアに関連しているんだ。TERRAは染色体のサブテロメア領域で作られていて、長さは200ヌクレオチドから1万ヌクレオチド以上まであるんだ。ほとんどのテロメアはTERRAを作っていて、作られた後にいろんな修飾を受けるんだ。このRNAは細胞内で特定の構造を形成することができるけど、これらの構造が生物にとってどれだけ重要かはまだ議論の余地があるんだ。
TERRAは細胞内でいろんな重要な機能を果たしていて、テロメアの構造を維持したり、テロメラーゼという酵素を調節したりしてるんだ。TERRAは、テロメラーゼを使わない特定のがん細胞において、テロメアを長くする代替的な方法にも関与しているよ。研究によると、これらの細胞ではTERRAのレベルが上がっていて、テロメラーDNAとの特定の相互作用を通じてテロメアを維持するのを手伝っているんだ。
TERRAが核の外でも役割を果たすという証拠が増えてきてるよ。例えば、特定の成長段階で酵母の細胞質に移動するのが観察されてるんだ。ヒトの細胞では、TERRAが炎症に関与することがあるエクソソームという構造に見つかっているんだ。新たな発見は、TERRAが老化細胞の炎症反応を引き起こすのに重要だと示唆しているよ。さらに、TERRAがタンパク質に翻訳されることもあるという証拠があって、追加の役割を果たす可能性があるんだ。
この研究では、がん細胞でのTERRAを調べて、特に細胞質での存在を探ったんだ。研究者たちはTERRAを可視化して分析するためにいろんな技術を使用したよ。結果は、TERRAが特定のがん細胞株の細胞質に存在することを確認できたんだ。さらに、テロメアが損傷すると、細胞質内のTERRAのレベルが上がることも示したんだ。
特別なイメージング技術を使って、ストレスのある条件下で細胞質の中のストレス顆粒成分と一緒にTERRAを検出したよ。この実験から、細胞質に存在するTERRA、サイトTERRAと呼ばれるものは、テロメアの損傷によって影響を受ける可能性があることが示唆されたんだ。これは、TERRAが細胞のストレス応答に関与しているかもしれないことを示してるよ。
細胞培養技術
この研究では、いろんなヒト細胞株を使って細胞を培養したんだ。例えば、ユニークな方法でテロメアを維持する特定のがん細胞株を使ったよ。細胞がストレス下でどう反応するかを研究するために特定の条件で成長させたんだ。研究者たちは、細胞に汚染がないかを定期的にテストすることを忘れなかったよ。
TERRAを研究するためのツール
TERRAを可視化するために、研究者たちは特定のプラスミドを使ったんだ。これは彼らの実験用にデザインされた小さなDNA分子だよ。観察に影響を与える可能性がある遺伝子をブロックする方法も含まれてた。さらに、これらのプラスミドを細胞に導入する特別な技術を使って、TERRAをより効果的に研究できるようにしたんだ。
RNAの分析
研究者たちは、細胞が生成したRNAを調べるためにいろんな方法を使ったよ。RNAを抽出して、そのサイズと量を分析したんだ。TERRAの特性を確認して、いろんな細胞成分に存在するかを調べることに重点を置いたよ。これには、細胞質にどれくらいTERRAが見つかるかを核と比較することも含まれてた。
細胞質のTERRAを検出する
可視化方法を通じて、研究者たちはがん細胞の細胞質でTERRAを成功裏に特定したんだ。細胞によって細胞質のTERRA分子の数がかなり異なることを観察したよ。特に、テロメラーゼを使う特定のがん細胞ではTERRAが見つからないこともわかって、その存在は特に代替的なテロメア維持メカニズムに関連しているかもしれないことを示してるんだ。
ストレス処理したとき、TERRAレベルが変わるのも観察されたよ。これは、細胞が損傷や厳しい条件に反応するためにもっとTERRAを生成したり輸出したりしている可能性があるんだ。
タンパク質の相互作用
分析の中で、研究者たちはTERRAと相互作用するタンパク質も探ったんだ。TERRAがRNAを核から外に輸出するのを助けるNXF1というタンパク質と相互作用することがわかったよ。このつながりは、TERRAが核から細胞質に移動する可能性を説明する手助けになるんだ。
TERRAとストレス顆粒
研究では、細胞質のTERRAがストレス顆粒のタンパク質と一緒に層を成すことがよく見られることがわかったよ。これらの発見はさまざまなストレス条件でも一貫していて、TERRAが細胞がストレスを管理する方法に関与している可能性があることをさらに示しているんだ。
今後の方向性
この研究の結果は、TERRAが細胞質でどのように機能するかについて多くの疑問を提起しているよ。TERRAがストレス顆粒の形成に関与している可能性があるし、細胞の翻訳機構と相互作用して細胞がストレスに対処する方法に影響を与えることも考えられる。これらのつながりを解明し、TERRAが細胞のストレス信号や応答にどのように関与しているかを理解するために、さらなる研究が必要だよ。
要は、この研究はTERRAが細胞質に存在することを強調していて、特に代替メカニズムでテロメアを維持するがん細胞においてそうなんだ。TERRA、ストレス顆粒、テロメア損傷のつながりは、細胞がさまざまなストレスに応答する際のlncRNAの役割を探る基盤を提供しているよ。細胞質でのTERRAの役割を理解することで、細胞が遺伝的損傷やストレスにどう対処するかについての新たな洞察が得られるかもしれないんだ。
タイトル: Telomeric lncRNA TERRA localizes to stress granules in human ALT cells
概要: TERRA, the lncRNA derived from the ends of chromosomes, has a number of well-described nuclear roles including telomere maintenance and homeostasis. A growing body of evidence now points at its role in human cells outside of nucleus--it has been found to be a component of extracellular vesicles, a player in inflammation signalling and its capacity for translation has been shown. In this work, using a combination of sensitive microscopy methods, cellular fractionation, proteomics and transcriptome analysis, we demonstrate directly for the first time that TERRA is present in the cytoplasm of human telomerase-negative cells, especially upon various stress stimuli, and that it associates with stress granules. Confirming the presence of TERRA in the cytoplasm, our work fills an important gap in the field, and contributes to the discussion about the role of TERRA as a transcript involved in nucleo-cytoplasmic stress communication.
著者: Katarina Jurikova, L. Larini, E. Goretti, E. Zulian, E. Busarello, S. M. Marino, M. Hajikazemi, K. Paeschke, T. Tebaldi, E. Cusanelli
最終更新: 2024-06-18 00:00:00
言語: English
ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.06.18.599513
ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.06.18.599513.full.pdf
ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。
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