Simple Science

最先端の科学をわかりやすく解説

# 生物学# 遺伝学

DDX3XとDDX3Y遺伝子の関係

DDX3XとDDX3Y遺伝子は、遺伝子発現に影響を与えるユニークな相互作用を示してるよ。

― 1 分で読む


DDX3XとDDX3Yの相DDX3XとDDX3Yの相互作用が明らかにされたる新しい発見。DDX3XとDDX3Yの遺伝子調節に関す
目次

DDX3XとDDX3Yは人間のX染色体とY染色体にある遺伝子だよ。似てるけど、完全に同じってわけじゃない。これらの遺伝子は細胞がRNAを管理するのに重要な役割を果たしていて、これはタンパク質を作ったりストレスに対応するのに欠かせないんだ。DDX3Xの変異は脳の発達や一部の癌に影響を与えるいくつかの病気を引き起こすことがあるよ。

DDX3XとDDX3Yは体中のいろんな種類の細胞に存在してる。女性ではX染色体の両方のコピーからDDX3Xが発現するけど、男性では1つのX染色体からしか発現しないんだ。一方、DDX3Yは主に男性の生殖に関連して研究されていて、精巣で発現してる。

類似点と相違点

タンパク質のレベルでは、DDX3XとDDX3Yはアミノ酸として知られる約91%の構成要素を共有しているんだ。構造の一部は変わってるけど、RNAを結合したり処理を助ける領域はほとんど同じままで残ってる。いくつかの実験では、DDX3Yが実験室の設定でDDX3Xと似たようなタスクをこなせることが示されているよ。ただ、最近の研究では、この2つのタンパク質は重なり合う役割を持ちながらも、特にストレス処理やタンパク質合成の調整に関しては異なる役割があることが示唆されているんだ。

DDX3XとDDX3Yの活性を保つ方法

普通の染色体が性染色体になった進化の過程で生き残った遺伝子はほんの数個なんだ。X染色体にはまだたくさんの遺伝子があるけど、Y染色体は時間が経つにつれて多くを失っているよ。それでも、DDX3XやDDX3Yのような特定の遺伝子は無事で機能的なまま残っているんだ。

面白いことに、DDX3Xのレベルは男性と女性の細胞で似たようなもので、ただその発現の仕方はDDX3Yの存在に影響されるかもしれない。これが研究者たちに、DDX3XとDDX3Yの生産量を調整する特別な制御があると考えさせたんだ。

DDX3XとDDX3Yの用量感受性

研究者たちはDDX3XとDDX3Yが自分たちのレベルの変化に特に敏感であることを発見したんだ。片方の遺伝子が多くなると、もう片方の遺伝子にも影響が出ることが多いみたい。たとえば、Y染色体が余分にある細胞ではDDX3Yのレベルが上がる一方でDDX3Xのレベルは下がる。逆に、X染色体が増えるとDDX3Xのレベルが上がってDDX3Yのレベルは下がる。このユニークな関係は他のX-Y遺伝子ペアには見られないから、彼らは特別な方法で進化した可能性が高いんだ。

用量感受性をテストする

DDX3XとDDX3Yがどれくらい用量感受性があるかを確認するために、研究者たちは17の他の人間のX-Y遺伝子ペアを調べたんだ。すると、DDX3XとDDX3Yだけがその数の変化に対してこの独特な反応を示したんだよ。彼らは女性の両方のX染色体からの発現を測定して、他の哺乳類におけるこれらの遺伝子の保存期間も調べた。

分析の結果、DDX3Xは他の遺伝子に比べてそのレベルの変化に敏感であることが分かり、発現が厳密に制御されていることを示唆しているよ。

異なる組織での発現

DDX3XとDDX3Yは、ただ敏感なだけじゃなくて、体のさまざまな組織で広く発現しているんだ。この広い発現パターンは、彼らが多くの生物学的プロセスで重要な役割を果たしているかもしれないことを示唆しているよ。研究者たちは鶏の遺伝子を調べて、これらの遺伝子の過去の発現がどのようであったかを研究したんだ。

人間と鶏の発現レベルを比較した結果、DDX3XとDDX3Yは時間が経っても適切な用量の要求が似たまま保たれているみたい。

遺伝子レベルの変化

研究者たちは、DDX3XとDDX3Yの染色体の数が変化するとどうなるのかを調べたんだ。Y染色体が1つ以上ある場合、DDX3Yのレベルが上がって、DDX3Xのレベルが下がることがわかった。逆に、X染色体の数が増えると、DDX3Xのレベルは上がってDDX3Yのレベルが下がった。

この振る舞いはDDX3XとDDX3Yに特有で、他の遺伝子ペアと比較して特定の調整メカニズムが存在することを示唆しているよ。

DDX3XとDDX3Yの相互作用

研究者たちは、DDX3Yが削除されているように一方の遺伝子が明らかに減少した場合に何が起こるかを探ってみたんだ。そうすると、その人たちのDDX3Xのレベルがかなり上昇したことがわかって、DDX3Yが欠けてる時にDDX3Xの生産が補償的に行われることが確認されたよ。

培養細胞で意図的にDDX3XまたはDDX3Yのレベルを減少させた実験では、もう一方の遺伝子が逆に増加するのが観察された。これはDDX3XとDDX3Yがレベルのバランスを保つために一緒に働いていることを示しているんだ。

全体的な遺伝子調整

この研究ではDDX3XとDDX3Y間の相互調整が一つの文脈だけに当てはまるわけじゃないと強調されている。これは、このメカニズムがさまざまな組織や細胞タイプで働いている可能性が高いことを示しているんだ。だから、一方の遺伝子のレベルの変化がもう一方の遺伝子の発現に影響を与えて、活動を調整しているのを助けているんだ。

研究者たちはトリソミー21の人々の遺伝子発現の変化も詳しく調べた。すると、DDX3XとDDX3Yのレベルは21番染色体の追加に関して変動しなかったことがわかり、彼らの調整相互作用が単なる染色体数の変化への反応ではなく、特にDDX遺伝子間のものであることが確認されたんだ。

調整のメカニズム

DDX3XとDDX3Yの調整は、これらの共通の祖先にあった性に紐づかない古い調整システムに由来するかもしれないと考えられているよ。証拠として、酵母では似たような遺伝子が自己調整していることを示唆する振る舞いをすることが示されているんだ。

これから見ても、DDX3XとDDX3Yが互いに調整し合って発現を管理する方法は、さらに古いメカニズムから進化した可能性があるってことだね。これは長い間、進化を通じて持続してきた調整機能の歴史を示唆しているんだ。

DDX3Xと発現の安定性

DDX3Xは自分自身のRNAに結合することが知られていて、これがそのメッセージが細胞内でどれくらい安定しているかに影響を与えるかもしれない。実験では、DDX3Yのレベルが高い時、DDX3XのRNAがあまり安定しなくなり、結果的に全体のレベルが低くなることが示されたよ。DDX3Yのレベルが上昇したときはDDX3Xのレベルがかなり下がることが示されて、DDX3Xの安定性に直接的な影響があるってことを示唆している。

これはDDX3YがDDX3XのRNAの量を調整する役割を果たしている可能性があることを示していて、彼らの関係がどれだけ微調整されているかを示すものだよ。

結論と広範な意味

DDX3XとDDX3Yの複雑な関係は性染色体上の遺伝子調整の複雑さを浮き彫りにしている。これらの遺伝子の相互調整と自己調整は、遺伝子発現のバランスを保つために進化した非常に高度なメカニズムを示唆しているよ。

この研究は、これらの遺伝子が健康や病気にどのように関与しているかを理解する新しい道を開くものだね。特に性染色体に関連する状態において。在来の文脈でこれらの調整メカニズムがどのように機能するかに焦点を当てた今後の研究は、DDX3XとDDX3Yが人間の生物学においてどんな役割を果たしているのかをさらに明らかにするだろう。この発見は特定の遺伝子の重要性だけでなく、遺伝子同士が遺伝学全体の中でどのように相互作用しているかを考慮する必要性を強調しているんだ。

オリジナルソース

タイトル: Post-transcriptional cross- and auto-regulation buffer expression of the human RNA helicases DDX3X and DDX3Y

概要: The Y-linked gene DDX3Y and its X-linked homolog DDX3X survived the evolution of the human sex chromosomes from ordinary autosomes. DDX3X encodes a multi-functional RNA helicase, with mutations causing developmental disorders and cancers. We find that, among X-linked genes with surviving Y homologs, DDX3X is extraordinarily dosage-sensitive. Studying cells of individuals with sex chromosome aneuploidy, we observe that when the number of Y chromosomes increases, DDX3X transcript levels fall; conversely, when the number of X chromosomes increases, DDX3Y transcript levels fall. In 46,XY cells, CRISPRi knockdown of either DDX3X or DDX3Y causes transcript levels of the homologous gene to rise. In 46,XX cells, chemical inhibition of DDX3X protein activity elicits an increase in DDX3X transcript levels. Thus, perturbation of either DDX3X or DDX3Y expression is buffered - by negative cross-regulation of DDX3X and DDX3Y in 46,XY cells, and by negative auto-regulation of DDX3X in 46,XX cells. DDX3X-DDX3Y cross-regulation is mediated through mRNA destabilization - as shown by metabolic labeling of newly transcribed RNA - and buffers total levels of DDX3X and DDX3Y protein in human cells. We infer that post-transcriptional auto-regulation of the ancestral (autosomal) DDX3 gene transmuted into auto- and cross-regulation of DDX3X and DDX3Y as these sex-linked genes evolved from ordinary alleles of their autosomal precursor.

著者: David C Page, S. Rengarajan, J. Derks, D. W. Bellott, N. Slavov

最終更新: 2024-07-10 00:00:00

言語: English

ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.07.08.602613

ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.07.08.602613.full.pdf

ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。

オープンアクセスの相互運用性を利用させていただいた biorxiv に感謝します。

類似の記事