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膵臓線維症治療の新しい知見

研究がCF感染に対するファージ療法の可能性を明らかにした。

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嚢胞性線維症におけるファー嚢胞性線維症におけるファージ療法肺感染の新しい治療戦略を探る。
目次

嚢胞性線維症(CF)は、呼吸器系に影響を与える遺伝性疾患で、両親から子どもに受け継がれるんだ。特定の遺伝子、つまり嚢胞性線維症膜伝導調節因子(CFTR)に変化が起こることで発症する。全世界で何百万人もの人々に影響を与えていて、主に体が厚くて粘り気のある mucus を作る原因になってる。この mucus が気道に溜まって、呼吸困難や重い肺感染、他の深刻な健康問題を引き起こすんだ。

CF 患者が直面する大きな問題の一つが、肺の感染リスク。厚い mucus がバイ菌が育つのにぴったりな環境を作っちゃうから、体の免疫システムがこれらの感染と戦うのが難しくなる。CF 患者に問題を引き起こす一般的なバイ菌が緑膿菌(Pseudomonas aeruginosa)で、これが病状を悪化させて、CF にかかっている人の死亡率を上げることがある。だから、CF の治療の大部分はこれらの感染を防ぐことに重点を置いてるんだ。

Pseudomonas aeruginosa がいるってわかったら、医者は通常、経口と吸入両方の強力な抗生物質の組み合わせを使って感染を治そうとする。ただ、この方法がうまくいくとは限らない。その理由の一つは、Pseudomonas aeruginosa がバイオフィルムを形成することがあるからで、これはバイ菌がくっついて、自分たちを抗生物質や免疫システムから守る層なんだ。さらに、これらのバイ菌はあまり活発でない形に変わることができるから、長い間生き延びて感染を引き起こし続けることができちゃう。

嚢胞性線維症財団によると、CF の大人の約 60% が Pseudomonas aeruginosa による慢性感染を経験してるんだ。だから、特にこのバイ菌とそのバイオフィルムを狙った代替治療法を見つける必要が急がれている。

ファージ療法:潜在的な解決策

バクテリオファージ、通称ファージは、特定のバイ菌を感染させて殺すことができるウイルスなんだ。抗生物質とは違って、ファージは特定のバイ菌の株に非常に特異的なんだ。ファージが Pseudomonas aeruginosa に感染すると、すぐに増殖してバイ菌を破裂させるから、難治性の感染を治療するための有望な選択肢になってる。

ファージ療法は、個々の CF 患者にいる特定のバイ菌の種類に合わせて治療を調整する新しい医療アプローチを代表している。現在、CF 患者のための臨床試験でファージ療法が試されていて、Pseudomonas aeruginosa の感染を治療するためのファージカクテルを使う試験がいくつか進行中で、この治療法への関心が高まっている。

ファージには2種類あって、病原性ファージと温和なファージ。病原性ファージはすぐにバイ菌を殺すけど、温和なファージはバイ菌のゲノムに組み込まれて、不活性なままでいることができる。このプロセスはバイ菌間で遺伝子が移ることにつながることもある。温和なファージは Pseudomonas aeruginosa に多く見られて、環境からの信号を受け取ると病原性の状態に切り替わって、CF の治療にさらなる合併症を引き起こす可能性がある。

CFにおけるプロファージの役割

プロファージは、バイ菌のゲノムに組み込まれた温和なファージで、バイ菌の振る舞いに大きな影響を与えることができる。研究者たちは、これらのプロファージが CF の場合のバイ菌、宿主、周囲の環境との相互作用において重要な役割を果たしていることを認識し始めている。

プロファージは、抗生物質耐性や病原性因子など、バイ菌宿主に利点をもたらす遺伝子を運ぶことがある。例えば、バイ菌が組織を傷つけたり肺感染を悪化させるのを助ける毒素を作ることがあるんだ。さらに、プロファージが活性化されると、バイオフィルムの形成を引き起こすことがあり、これが CF 患者における Pseudomonas aeruginosa 感染の持続的な性質にとって重要なんだ。

プロファージとバイ菌の相互作用は、CF管理において大きな課題を生む。特にファージ療法に関連して。今回の研究では、研究者たちはドイツの CF 患者から採取した Pseudomonas aeruginosa の株のプロファージの存在を分析し、抗生物質と病原性ファージによる治療中の振る舞いを調査することを目指した。

研究の概要

合計で 51 サンプルの Pseudomonas aeruginosa が調べられたのは、29 人の CF 患者から採取されたもの。何人かの患者は複数のサンプルが分析され、他の人は一つだけだった。サンプル数が少ないのと、同じ患者からのサンプルが繰り返しあったため、研究者はさらなる人口統計分析は有益ではないと判断した。

CF 患者の年齢は 7 歳から 57 歳までで、大半は 32 歳から 35 歳の間。性別の分布はほぼ均等で、男性が 45%、女性が 55% だった。サンプルには痰、喉の swab、鼻洗浄が含まれていて、ほぼ半分が粘液性の成長パターンを示していた。

Pseudomonas aeruginosa の他にも、サンプルにバイ菌が見つかり、最も一般的だったのはブドウ球菌(Staphylococcus aureus)だった。

Pseudomonas aeruginosa 株の抗生物質に対する耐性

肺の悪化に関連した感染を治療するために、医療提供者は通常、Pseudomonas aeruginosa の分離株の耐性プロファイルに基づいて静脈内抗生物質を推奨することが多い。治療には吸入抗生物質や経口薬も含まれることがある。

抗生物質の耐性を調べるためのルーチン診断テストが 51 の分離株に対して実施された。結果は、確立されたガイドラインに従って、感受性、中間耐性、または耐性に分類された。テストされた抗生物質には、セフタジジム、ピペラシリン/タゾバクタム、メロペネム、シプロフロキサシン、トブラマイシンが含まれていた。

結果として、テストされたベータラクタム抗生物質に感受性のある分離株は非常に少数だったが、ほとんどは中間耐性を示した。特に多くの分離株がシプロフロキサシンに耐性を示したのは、CF 治療において一般的に使われる抗生物質であるため、注目に値する。耐性はトブラマイシンにも広がっていた。

吸入治療に使われる他の抗生物質もテストされ、耐性の率はさまざまだった。例えば、コリスチンの耐性がいくつかの分離株で見つかったが、この抗生物質はローカルに吸入されるため、高いMIC値にもかかわらず、効果的に使用されることがある。

また、さまざまな抗生物質の耐性間に正の相関が見られたが、これは CF の分離株においてよく見られる多剤耐性を反映している。

CF株におけるプロファージの分布

研究者たちは、Pseudomonas aeruginosa の株におけるプロファージの分布を調べ、Pf ファージに関連する特定の遺伝要素に焦点を当てた。多くの分離株がこれらの遺伝要素を含んでいることがわかり、Pf4 プロファージが最も一般的だった。

この研究は、CF 患者が特定の Pseudomonas aeruginosa サブタイプに対して素因を持っている可能性があり、このコホートからの分離株に見られた特定のプロファージ要素の頻度が以前の研究よりも高いことを示唆している。これにより、これらのプロファージが治療結果にどのように影響するのか、さらなる研究が必要であることが示されている。

病原性ファージに対する感受性

分離株は、Pseudomonas aeruginosa を標的とする 3 つの病原性ファージに対する感受性がテストされた。その結果、異なる分離株の間で感受性と耐性のレベルが異なることがわかった。かなりの割合のサンプルがこれらのファージに耐性を示し、CF 株がファージ療法にあまり反応しない可能性があることを示している。

全体として、分離株の中で全ての 3 つのファージに完全に感受性があるのはごく一部だけだった。興味深いことに、一部の分離株は感受性が低下していて、これが治療の努力を複雑にする可能性がある。

プロファージとファージ感受性の相関

分析の結果、プロファージの存在と病原性ファージに対する耐性との間に有意な相関は見られなかった。しかし、いくつかの弱い傾向が観察され、プロファージがバイ菌の振る舞いや治療結果にどのように影響するのかを理解するために、さらなる調査が必要であることを示唆している。

特定のプロファージ要素の存在は、特定の抗生物質に対する耐性との相関を示していて、プロファージ、抗生物質耐性、ファージ感受性との間の複雑な関係を示している。

分離株のクローン性

同じ患者から得られた分離株は、たとえ似たようなプロファージパターンを共有していても、特性においてかなりの違いを示すことが多かった。これは、CF の肺における Pseudomonas aeruginosa 株の変異性を強調していて、異なる耐性パターンが治療の効果に影響を与えるため、感染管理を複雑にしている。

バイオフィルムにおけるプロファージの誘導

酸素不足、栄養不足、免疫反応などの条件が、プロファージの活性化を引き起こすことがあり、結果としてバイ菌の細胞溶解をもたらすことがある。このシナリオは、CF 患者の肺に存在するバイオフィルムでよく起こる。

この研究では、特に Pf4 プロファージがバイオフィルム内で再活性化される仕組みを理解しようとした。研究者たちは、バイオフィルムの上清における活性ファージの存在が時間とともに変化することを発見し、バイ菌とプロファージの間でのダイナミックな相互作用を示している。

プロファージ誘導後の病原性ファージに対する耐性

この研究では、プロファージの活性化が無関係な病原性ファージに対するバイ菌の感受性に影響を与えるかどうかも調べた。バイオフィルムが成熟するにつれて、特定の Pseudomonas aeruginosa のクローンは病原性ファージに対する耐性が高まったことが示されていて、バイ菌の防御がバイオフィルム成長中に進化していることを示唆している。

抗生物質耐性プロファイルの変化

バイオフィルムの成長に伴い、研究者たちは選択されたクローンにおける抗生物質耐性の変化を監視した。耐性レベルが大きく変動することがわかり、バイオフィルム内のバイ菌の振る舞いが複雑で、時間とともに変わる可能性があることが示されている。

プロファージの存在とバイオフィルムの成熟が、特に一部の株が時間とともに耐性が高まる中で、様々な抗生物質に対する感受性に影響を与えているようだ。

結論

要するに、嚢胞性線維症は、バイ菌、プロファージ、免疫システムとの複雑な相互作用のために挑戦的な状態なんだ。CF 患者における Pseudomonas aeruginosa の研究は、抗生物質耐性とファージ感受性の関係について重要な洞察を明らかにした。

研究者たちがファージ療法のような新しい治療法を探求し続け、プロファージのダイナミクスを深く理解することで、嚢胞性線維症を抱える人々の結果が改善されることを願っている。今後の研究は、これらの関係をさらに明確にし、この複雑な疾患のためのより効果的な治療戦略につながる可能性があるんだ。

オリジナルソース

タイトル: Temperate bacteriophage induced in Pseudomonas aeruginosa biofilms can modulate bacteriophage and antibiotic resistance

概要: Given the high levels of resistance in Gram-negative bacteria, phage therapy is garnering increasing attention. In Germany, a clinical study is already underway investigating a phage cocktail for the treatment of Pseudomonas aeruginosa in cystic fibrosis (CF) patients. In our study, we examined susceptibility to virulent phages and the PF1-like prophage and antimicrobial profiles and of P. aeruginosa isolates from a local cystic fibrosis cohort to identify correlations and lysogenic conversion of the prophegs. Consistent with other studies, prophage Pf4 is the most prevalent in this cohort and is activated in the absence of other influences during biofilm formation. These phages can be transferred to other strains that do not contain Pf1-like prophages, thereby influencing the dynamics of bacterial populations in the CF lung. This also rapidly leads to the emergence of a subpopulation resistant to the virulent phages, potentially complicating phage therapy. However, this subset also becomes more susceptible to most antibiotics commonly used in CF, which could be a useful treatment strategy. Interestingly, this bacterial subset lost its susceptibility to colistin, an important inhaled antibiotic in CF, which could lead to treatment failure. Our research highlights both the difficulties and potential strategies to improve treatment options for CF patients. Author summaryWe investigated 51 P. aeruginosa isolates obtained from CF patients for the presence of PF1-like prophages and characterized their susceptibility prior and after lysogenig conversion of the prophages to three virulent phages. Our study revealed that the temperate phage Pf4 is the most prominent PF1-like prophage in this cohort, undergoing lysogenic conversion during biofilm formation. The virions identified in the biofilm supernatants are superinfective and transferable to other prophage-free P. aeruginosa isolates, shaping population dynamics in the CF lung. Prophage reactivation results in the survival of a sub-population with reduced susceptibility to virulent phages, posing a potential challenge for phage therapy. However, this sub-population exhibited restored susceptibility to most CF-relevant antibiotics, presenting an intriguing therapeutic opportunity. Targeted prophage reactivation could sensitize multidrug-resistant P. aeruginosa in CF patients, enhancing or even restoring antimicrobial efficacy. Notably, this sub-population also showed a loss of colistin susceptibility, which may lead to treatment failure when colistin is used as an inhaled antipseudomonal antibiotic. Our findings highlight both significant challenges and potential therapeutic opportunities for optimizing the treatment of CF patients. However, these findings are preliminary and require further investigation, particularly regarding the possibility of lysogenic conversion in other prophages (such as Siphoviridae) and how these interplays with resistance to virulent phages. Further studies are ongoing and will enhance our understanding of the role of prophages in the pathophysiology of CF.

著者: Oliwia Makarewicz, M. G. Martinet, B. J. Samuel, D. Weiss, M. W. Pletz

最終更新: 2024-07-10 00:00:00

言語: English

ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.07.10.602839

ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.07.10.602839.full.pdf

ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。

オープンアクセスの相互運用性を利用させていただいた biorxiv に感謝します。

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