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# 健康科学# 心臓血管医学

心疾患リスク予測のための新しいタンパク質の洞察

研究が、リスクのある人々の心臓の問題をよりよく予測するためのタンパク質マーカーを探っています。

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目次

心血管疾患(CVD)は、世界中での死因のトップなんだ。リスクが高い人に焦点を当てれば、多くのケースを防げるんだって。今は、医者が今後10年間に深刻な心臓の問題が起きる確率を見て、リスクのある人を特定してるんだ。これには一般的なリスク要因が使われていて、いくつかのスコアリングシステムに組み込まれてる。でも、これらのスコアは必ずしも個人に対して正確じゃなくて、問題がいつ起こるかの良いアイデアを与えないんだ。だから、新しい指標やバイオマーカーを見つけるための強い努力が進んでいて、これがリスクスコアを改善できるかもしれない。タンパク質検査の新しい方法が、血液中のこれらのバイオマーカーを見つけるためのワクワクする可能性を開いているんだ。

タンパク質セットの重要性

最近の研究で、特定のタンパク質のグループを追加すると、従来のリスクスコアよりも心臓の問題を避ける予測が良くなることが分かったんだ。これは特に、すでに心臓の問題を抱えている人に当てはまる。でも、まだ問題がない人に関しては結果があまりはっきりしてないんだ。一部の特別な血液検査を使った研究では、将来の心臓イベントの予測は標準的なリスク評価と同じか、少し良いくらいだった。それに対して、別の方法を使った研究では、新しいタンパク質検査が従来のリスク要因と比べて大きな改善を示したんだ。

現在の研究の概要

この研究では、血液中の特定のタンパク質セットが、心臓の問題を経験したことがない大規模な集団で重大な心臓イベントを予測できるかを調べたんだ。研究には、主要な健康研究プロジェクトであるUKバイオバンクから38,000人の参加者が含まれていて、研究者たちは約3,000の大きなグループからデータの傾向と既存の知識に基づいてこれらのタンパク質を選んだんだ。

研究の対象集団

参加者は、初めての訪問時に血液タンパク質分析のためにUKバイオバンクからランダムに選ばれたんだ。深刻な心臓イベントの履歴がある人や、20%以上のタンパク質測定が欠損している人は除外された。参加者が研究に参加する前に抱えていた健康問題は、異なるコーディングシステムを使って追跡されたんだ。すべてのプロセスは、必要な研究倫理委員会に承認されているんだ。

結果の理解

この研究では、深刻な心血管イベントは、研究開始から10年以内に起きた心臓発作や脳卒中などの死亡または非死亡の心臓事故を含んでいるんだ。同じコーディング方法が使われて、これらの結果が追跡されたんだ。

従来のリスク要因

参加者の初回訪問時に健康特性が記載された。考慮された主要な10の従来のリスク要因は、年齢、性別、血圧、喫煙習慣、糖尿病の状態、コレステロールレベルだったんだ。

プロテオミクス解析

タンパク質の測定と分析方法については、以前の研究で詳しいことがシェアされているんだ。簡単に言うと、Olink Exploreシステムという技術を使って、血液サンプルの中の2,900以上のタンパク質を測定したんだ。20%以上の欠損データがあるタンパク質は除外されて、他の変数の欠損情報は特定のアルゴリズムを使って埋められたんだ。

データ分析のアプローチ

高度な機械学習方法が使われて、重大な心臓イベントのリスクを10年にわたって予測できるモデルが訓練されたんだ。データは訓練セットとテストセットに分けられた。比較のために、2つの既存のリスクモデルが選ばれたんだ。さまざまなタンパク質モデルが作成されて、その中にはすべてのタンパク質を含むもの、以前の発見に基づいたもの、データ分析から導き出されたもの、ランダムに選ばれたタンパク質を含むモデルがあったんだ。

モデルのパフォーマンス評価

各モデルのパフォーマンスは、特定の統計指標を通じて評価された。従来のリスクスコアとさまざまなタンパク質モデルの間で、どちらが結果をよりよく予測できるかを比較したんだ。

研究対象集団の結果

ランダムに選ばれた中で、約46,799人がタンパク質のデータを分析され、約45,666人は深刻な心臓イベントの履歴がなかった。欠損データが多すぎる人を除外した後、最終的なグループには約38,380人が含まれた。フォローアップ中に心臓イベントを経験した人たちは、他の人に比べてリスク要因のプロファイルがより深刻だったんだ。

予測のためのタンパク質選択

研究では、少数のタンパク質測定が欠損していることが分かった。適切な方法を使って、研究者たちは心臓イベントを予測するのに役立つ114の関連するタンパク質を大きなグループから選んだんだ。さらに、以前の研究に基づいて113のタンパク質の別のセットも特定した。比較のためにランダムなタンパク質も含まれたけど、特定の方法で選ばれたものだけが心臓リスクを予測する実際の関連性を示したんだ。

モデルパフォーマンスの評価

すべてのモデルの予測能力は、別のテストグループで試された。既存のリスクシステムは基本的な予測レベルを提供し、完全なタンパク質モデルと選ばれたモデルは少し高い精度を提供したんだ。選択されたタンパク質を従来のリスク要因と組み合わせることで、予測が大きく改善されたんだ。

モデルパフォーマンスの分析

異なるリスク閾値で、モデルはさまざまな効果を示した。完全なモデルや選ばれたタンパク質セットは、既存のリスク要因と組み合わせることで予測が向上し、データ駆動の選択の重要性を強調したんだ。一方で、ランダムタンパク質モデルは予測を改善しなかったことで、選ばれたタンパク質の具体的な価値を強調しているんだ。

追加タンパク質の利益

予測精度の変化は小さかったけど、心臓イベントのリスクがある人を従来のリスク要因とタンパク質データを組み合わせることでよりよく特定できる可能性があったみたい。特にリスクが高い人でこの改善がより顕著であるようだ。だから、タンパク質検査は一般の人よりも心臓問題の可能性が高い人にとってもっと有益かもしれないんだ。

研究の限界

この研究には限界があるんだ。まず、結果を一般化するには適用できる追加のグループがなかったこと。次に、タンパク質測定に使った方法は、異なるテストプラットフォームで再現可能でないかもしれないこと。三つ目は、この研究が信頼できるタンパク質パネルの作成に焦点を当てていたけど、心臓問題の発生におけるタンパク質の個々の役割については調べていないこと。最後に、これらの新しいタンパク質測定を使う経済的な利益を理解するにはさらに研究が必要で、それはこの研究では含まれていなかったこと。

結論

高度な機械学習と大規模なタンパク質データを使って、この研究は114の選ばれたタンパク質のパネルを通じて重大な心臓イベントを予測する進展を示したんだ。同様で、でもあまり納得のいかない結果が、以前の研究に基づいて選ばれた113のタンパク質のグループでも見つかった。改善があったとされるものは控えめだったけど、心臓問題を防ぐためのこれらのバイオマーカーの臨床的な有用性については、さらに探求が必要だと思われるんだ。

オリジナルソース

タイトル: Large-scale plasma proteomics in the UK Biobank modestly improves prediction of major cardiovascular events in a population without previous cardiovascular disease

概要: Background and AimsImproved identification of individuals at high risk of developing cardiovascular disease would enable targeted interventions and potentially lead to reductions in mortality and morbidity. Our aim was to determine whether use of large-scale proteomics improves prediction of cardiovascular events beyond traditional risk factors (TRFs). MethodsUsing proximity extension assays, 2919 plasma proteins were measured in 38 380 participants of the UK Biobank. Both data- and hypothesis-driven feature selection and trained models using extreme gradient boosting machine learning were used to predict risk of major cardiovascular events (MACE: fatal and non-fatal myocardial infarction, stroke and coronary artery revascularisation) during a 10-year follow-up. Area under the curve (AUC) and net reclassification index (NRI) were used to evaluate the additive value of selected protein panels to MACE prediction by Systematic COronary Risk Evaluation 2 (SCORE2) or the 10 TRFs used in SCORE2. ResultsSCORE2 and SCORE2 refitted to UK Biobank data predicted MACE with AUCs of 0.740 and 0.749, respectively. Data-driven selection identified 114 proteins of greatest relevance for prediction. Prediction of MACE was not improved by using these proteins alone (AUC of 0.758) but was significantly improved by combining these proteins with SCORE2 or the 10 TRFs (AUC=0.771, p View larger version (27K): [email protected]@153b885org.highwire.dtl.DTLVardef@177464borg.highwire.dtl.DTLVardef@1a7fd3e_HPS_FORMAT_FIGEXP M_FIG C_FIG

著者: Goran Bergstrom, P. Royer, E. Bjornson, M. Adiels, R. Josefsson, E. Hagberg, A. Gummesson

最終更新: 2024-03-15 00:00:00

言語: English

ソースURL: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2024.03.13.24304196

ソースPDF: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2024.03.13.24304196.full.pdf

ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。

オープンアクセスの相互運用性を利用させていただいた medrxiv に感謝します。

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