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# 生物学# 合成生物学

細胞フリータンパク質生産システムの進展

新しい透析システムが細胞フリーの環境でのタンパク質収量を向上させる。

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目次

細胞フリーシステムは、科学者が生きた細胞を使わずにタンパク質を作るためのセットアップだよ。このシステムは、柔軟性やタンパク質が作られる環境をコントロールできる点でいろいろと便利なんだ。主に2種類あって、一つは抽出した細胞材料を使うライセートベースのシステム、もう一つはPUREみたいな完全再組換えシステム。

現在の細胞フリーシステムの課題

細胞フリーシステムには利点があるけど、生細胞を使ったタンパク質生産に比べていくつかの欠点もあるんだ。一つ大きな問題は、自分では再生しないから、限られた時間しかタンパク質を作れないってこと。このせいで、作れるタンパク質の総量も少なくなる。だから、研究者たちは、このシステムのタンパク質生産時間を延ばす方法に興味を持っているんだ。

一般的に、これらのシステムでタンパク質の収量を改善するには、まずシステム内の材料の組み合わせを調整すること。そして、反応を長く続けさせるために、エネルギー源やタンパク質生成に必要な小さいビルディングブロックみたいな追加成分を提供することだね。

ライセートシステムとPUREシステムの違い

ライセートシステムはPUREシステムよりも多くのタンパク質を生産する傾向があるけど、ライセートは細胞から取った材料を使うから、バッチによってばらつきが出やすい。一方で、PUREシステムは別々に作られた成分からできているから、合成生物学や医療療法などいろんな用途に対して信頼性が高いんだ。

これまでに細胞フリーシステムで達成された最高のタンパク質収量は、特別なライセートの形を使ってリポソームという小さな密封構造に入れた状態で8 mg/mLだった。この方法は、タンパク質の量を増やすだけじゃなく、20時間の間、製造を続けることができたよ。でも、PUREシステムの最高収量は10年前に報告された3.8 mg/mLで、ダイアリシスという大きな分子と小さな分子を分ける方法を使ったんだ。

タンパク質の生産を長く続けるための他の方法には、特別な材料にタンパク質を閉じ込めたりすることもあるけど、これらの方法は複雑で手間がかかることが多く、しばしば収量が低くなっちゃうんだ。

新しいシンプルなダイアリシスシステム

研究者たちは、少量(100 µL)のタンパク質を生産するために設計されたシンプルなダイアリシスシステムを開発したよ。この設定は簡単に手に入るパーツを使って作れるし、普通の実験室の機器で機能するんだ。この新しいシステムの主な利点は、プロセス中に反応エリアに簡単にアクセスできるから、栄養素を追加したり、リアルタイムで状況を追跡できることだね。

テストでは、この新しいダイアリシスシステムを使ったタンパク質の生産が4日間続き、栄養素を定期的に追加することで12.5日まで延びて、1.15 mg/mLのタンパク質を生産した。この結果は、カプセル化方法を使わないPUREシステムの中で最長の生産時間を示しているんだ。

ダイアリシスシステムの仕組み

新しいシステムは24ウェルプレートを基にしているよ。各ウェルには、給餌コンパートメントと反応室を含むダイアリシスチャンバーがあるんだ。選ばれたダイアリシスカップには、サイズの小さい分子が通過できる特別なフィルターがあって、大きなタンパク質が逃げないようにしてる。研究者たちは、これらのカップを慎重に切ってプレートに配置することで、同時に24の反応を設定できたんだ。

システムのモニタリングと維持の時には、プレートの封印を外して古い溶液を新しいものに替えることで、給餌溶液を簡単にリフレッシュできた。この設計は、タンパク質生産環境を安定させながら調整を可能にしているんだ。

新しいシステムのテスト

新しいダイアリシス設定を使ったライセートとPUREシステムのタンパク質生産を比較したテストでは、ライセートのタンパク質生産が1日も経たずに止まるのに対し、PUREは約4日間続いたことがわかった。総タンパク質収量はPUREの方が高くて、約25,300相対蛍光単位(RFU)を生産し、ライセートは19,200 RFUだったよ。

定期的な栄養補給でタンパク質生産が向上するかを確かめるために、研究者たちは3〜4日ごとに新鮮な給餌溶液を追加したんだ。この方法でPUREのタンパク質生産は12.5日続き、アクティブな生産時間が大幅に延びた。一方で、ライセートの反応は、この補充からあまり利益を得られなかったみたい。

タンパク質収量の結果

各テストで生産されたタンパク質の総量は、蛍光読み取りを既知の濃度と比較する標準的な方法を使って測定したよ。PUREの反応は補充なしで0.43と0.32 mg/mLを生産し、新鮮な給餌溶液を加えることで1.05と1.16 mg/mLに増えた。ライセートの反応は、補充しても0.24〜0.36 mg/mLの範囲で、より低かったんだ。

この新しいダイアリシスシステムを使って、研究者たちは以前のダイアリシスなしの方法に比べてPUREシステムのタンパク質生産の効率を大幅に改善したんだ。達成された収量は、以前の結果の約5倍だったよ。

結論と今後の応用

この研究では、細胞を使わずにタンパク質を生産するためのシンプルだけど効果的なシステムが紹介されたんだ。ダイアリシスを使って生産時間を延ばすことができるって実験が示したんだ。この新しいセットアップは、12.5日間タンパク質生産を続けることができたことが、従来の方法に対する大きな改善だね。これは、治療薬の作成や環境の監視や病状の診断システムの開発など、いろんな分野で価値があるかもしれない。

このシンプルなデザインなら、多くの研究室が簡単にこのシステムを導入できるから、様々な用途のためのタンパク質生産の進展を促すかもしれないね。さらなる研究では、タンパク質の収量をもっと改善するために、材料や条件の異なる組み合わせをテストして、特にライセートシステムでのタンパク質の塊や劣化の問題を軽減することに焦点を当てるかもしれない。全体として、この開発は細胞フリーシステムの可能性と、今後の科学研究や産業応用における役割を示しているんだ。

オリジナルソース

タイトル: Long-term protein synthesis with PURE in a mesoscale dialysis system

概要: Cell-free systems are powerful tools in synthetic biology with versatile and wide-ranging applications. However, a significant bottleneck for these systems, particularly the PURE cell-free system, is their limited reaction lifespan and yield. Dialysis offers a promising approach to prolong reaction lifetimes and increase yields, yet most custom dialysis systems require access to sophisticated equipment like 3D printers or microfabrication tools. In this study, we utilized an easy-to-assemble, medium-scale dialysis system for cell-free reactions using commercially available components. By employing dialysis with periodic exchange of the feeding solution, we achieved a protein yield of 1.16 mg/mL GFP in the PURE system and extended protein synthesis for at least 12.5 consecutive days, demonstrating the systems excellent stability.

著者: Sebastian Josef Maerkl, L. R. Julia, L. Grasemann, F. Stellacci

最終更新: 2024-09-09 00:00:00

言語: English

ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.09.09.611992

ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.09.09.611992.full.pdf

ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。

オープンアクセスの相互運用性を利用させていただいた biorxiv に感謝します。

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