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# 生物学# 細胞生物学

細胞機能における核膜孔複合体の役割

核膜孔複合体を探求し、それがRNA輸送と細胞の健康に与える影響を見てみる。

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核膜孔複合体の洞察核膜孔複合体の洞察NPCとその重要な細胞内の役割を調べる。
目次

核膜孔複合体(NPC)は、細胞の核を囲むバリアである核膜にある大きな構造だよ。NPCは、核と細胞質の間で材料を輸送するのに欠かせない存在で、細胞内の大部分の活動が行われる液体のことを指すんだ。NPCは、ヌクレオポリンと呼ばれる多くのタンパク質からできていて、これらのタンパク質は分子が通過できるチャネルを形成するのを手助けしているんだ。

核膜孔複合体の構造

NPCの構造はかなり複雑で、約30種類のタンパク質の複数のコピーから成り立っているんだ。NPCのコアは3つのリングに配置されていて、対称的な構造を形成しているよ。つまり、リングが簡単に回転したり配置されたりできるように整理されてるんだ。NPCの外側のリングには、付属物と呼ばれる追加の特徴があるんだ。そのうちの1つは核バスケットと呼ばれ、核膜に伸びていて、もう1つは細胞質輸出プラットフォームで、こちらは細胞質に向いているよ。

NPCの可視化

NPCを研究するために、科学者たちはdoRITEという方法を使って、生きた酵母細胞の中の単一のNPCを観察することができるんだ。蛍光タグを使用することで、研究者たちはさまざまなヌクレオポリンがNPCの中でどのように振る舞っているかを追跡できるよ。

核バスケット

核バスケットは、NPCの組み立てと機能に重要な3つのダイナミックなヌクレオポリンからできているんだ。構造的ヌクレオポリンと一緒に、フィラメントのような構造を形成するんだ。このフィラメントは、RNAを核から細胞質に輸送するなど、さまざまな細胞機能を支えるのを手伝っているよ。

形成とタイミング

核バスケットのタンパク質は、NPCの組み立てプロセスの後半、つまりNPCの初期形成から約40分後にNPCに結合するんだ。この遅れた結合は重要で、RNA処理に依存しているかもしれないよ。細胞がRNAを積極的に作っていないとき、バスケットタンパク質はNPCの近くには見当たらないんだ。だから、バスケットの存在は細胞の転写活動と密接に関係しているんだ。

RNAの品質管理の役割

核バスケットの主要な役割の1つは、RNAの品質を管理することなんだ。バスケットは、完全に処理されたmRNAだけが核を出るようにするのを助けているんだ。もし特定のバスケットタンパク質が欠けていると、不適切に処理されたRNAが細胞質に漏れ出して、遺伝子発現に問題を引き起こす可能性があるよ。

核バスケットの機能

RNAの品質管理に加えて、核バスケットは細胞内のDNAを保護する役割も果たしているんだ。DNAの修復を助けたり、遺伝子発現を妨げる可能性のあるRループのような有害な構造を防ぐ役割もあるよ。

専門的な核膜孔

最近の研究では、異なるタイプのNPCが専門的な役割を持つことが示されているんだ。たとえば、いくつかのNPCはmRNAを輸出するのに必要な特定の成分が欠けているかもしれなくて、これが細胞の分裂サイクルに影響を与えることがあるよ。さらに、老化した細胞は、適切な輸送に必要な重要な構造が欠けているため、効率の悪いNPCを持つ傾向があるんだ。

ヌクレオポリンの理解

ヌクレオポリンの研究では、一部のタンパク質は安定していて長時間NPCに結合している一方で、他のタンパク質はダイナミックで自由に動けることが発見されたんだ。これらのタンパク質の振る舞いを見れば、彼らの機能についてもっと学べるよ。

doRITEでのヌクレオポリン追跡

doRITEを使って、科学者たちは細胞の中で安定したヌクレオポリンとダイナミックなヌクレオポリンの挙動を可視化することができるんだ。これにより、異なるヌクレオポリンがどのように分布しているのか、そして時間とともにどのように変化するのかを知ることができるよ。たとえば、あるヌクレオポリンは特定の場所に留まる一方で、他のヌクレオポリンは細胞分裂中にすぐにNPCの中を再分配されることがあるんだ。

核バスケットタンパク質の調査

核バスケットタンパク質Mlp1とMlp2は特に注目されているんだ。いくつかの研究によれば、彼らは素早く交換されるように見えるけど、新しい方法では実際には数時間もNPCにとどまっていることがわかったんだ。これは、これらのタンパク質が一度取り込まれると、NPCに安定して保持されることを示しているんだ。

Pml39の役割

Pml39は核バスケットの安定性において重要な役割を果たす他のタンパク質なんだ。これがMlp1とMlp2をNPCに固定するのを助けているよ。たとえPml39が取り除かれても、Mlp1はNPCに結合し続けることができるから、これらのタンパク質はこの複合体と強い結びつきがあることを示しているんだ。

核小体領域からの排除

面白いことに、Mlp1とMlp2を含むNPCは、しばしば核の核小体領域の外に見つかることが多いんだ。核小体は、リボソームRNAが生成される特定のエリアなんだ。核バスケットタンパク質を含むNPCは、この領域には一般的に見られず、周辺エリアに留まることを好むことが分かるよ。

突然変異細胞の調査

研究者たちは、特定の核バスケットタンパク質がない場合にNPCがどう振る舞うかを理解するために、さまざまな突然変異細胞をテストしているんだ。たとえば、Mlp1とMlp2が欠けている細胞では、NPCが正常な細胞より核小体エリアに多く存在していたんだ。しかし、この濃縮はNPCが特定の役割を持つことを示唆しているわけではなく、むしろ通常の排除メカニズムが損なわれたことを示しているんだ。

Nup2の役割

Nup2は、バスケットタンパク質と一緒に働く別のヌクレオポリンなんだ。Nup2の存在はNPCが核小体領域から出ないのを助けていて、Nup2が欠けるとNPCが核膜全体に均等に広がることが分かる。これは、NPCの局在に直接的な役割があることを示しているんだ。

核膜内のNPCの動き

NPCは固定されているわけじゃなくて、核膜の中を動き回ることができるよ。バスケットタンパク質はこの動きに影響を与えるんだ。正常な核バスケットタンパク質を持つ細胞ではNPCはあまり動かず、これらのタンパク質が欠けている細胞ではNPCがより動きやすくなることがあって、核表面の分布に変化をもたらすことがあるんだ。

NPCの動きを観察

特別な追跡方法を使って、科学者たちはNPCが核膜の中でどれくらい速く動くかを観察することができるんだ。NPCの動きを静止、遅い、速いなどの異なる状態に分類することができるよ。バスケットタンパク質の存在は、NPCがこれらの状態にどれくらい長く留まるかにも影響を与えるんだ。

結論

核膜孔複合体とそれに関連するタンパク質の研究は、細胞が輸送をどのように調整し、機能を維持しているのかについて貴重な洞察を提供するんだ。安定性と可動性の微妙なバランスは、RNAの輸出やDNAの修復といった細胞のプロセスが成功裏に行われるために重要なんだ。doRITEのような技術を使うことで、研究者たちはこれらの複雑なシステムと、それらが細胞の健康を維持する役割についての理解を深めていくことができるよ。

ヌクレオポリン、核バスケット、そしてそれらの局在動態の特定の相互作用は、多くの細胞機能にとって重要なんだ。研究が進むことで、これらのタンパク質の機能や相互作用についてのさらなる情報が得られ、細胞の生命を支配する基本的なプロセスについての深い洞察が得られることになるんだ。

オリジナルソース

タイトル: Nuclear basket proteins regulate the distribution and mobility of nuclear pore complexes in budding yeast

概要: Nuclear pore complexes (NPCs) mediate all traffic between the nucleus and the cytoplasm and are among the most stable protein assemblies in cells. Budding yeast cells carry two variants of NPCs which differ in the presence or absence of the nuclear basket proteins Mlp1, Mlp2 and Pml39. The binding of these basket proteins occurs very late in NPC assembly and Mlp-positive NPCs are excluded from the region of the nuclear envelope that borders the nucleolus. Here, we use recombination-induced tag exchange (RITE) to investigate the stability of all the NPC subcomplexes within individual NPCs. We show that the nuclear basket proteins Mlp1, Mlp2 and Pml39 remain stably associated with NPCs through multiple cell-division cycles, and that Mlp1/2 are responsible for the exclusion of NPCs from the nucleolar territory. In addition, we demonstrate that binding of the FG-nucleoporins Nup1 and Nup2 depletes also Mlp-negative NPCs from this region by an independent pathway. We develop a method for single NPC tracking in budding yeast and observe that NPCs exhibit increased mobility in the absence of nuclear basket components. Our data suggest that the distribution of NPCs on the nucleus is governed by multiple interaction of nuclear basket proteins with the nuclear interior. Significance StatementO_LIA subset of yeast nuclear pore complexes have a basket structure at their nuclear face. The stoichiometry, architecture and molecular functions of the basket are not clear. C_LIO_LIThe authors use a tag exchange method to show stable binding of nuclear basket proteins through multiple generations. They also find that multiple nuclear basket proteins disfavour localization of NPCs proximal to the nucleolus. C_LIO_LIThese findings demonstrate that having a nuclear basket is a final and stable state for yeast NPCs. The methods developed can be applied to gain more insight into the properties of NPCs and other stable complexes as they age. C_LI

著者: Elisa Dultz, J. Zsok, F. Simon, G. Bayrak, L. Isaki, N. Kerff, Y. Kicheva, A. Wolstenholme, L. E. Weiss

最終更新: 2024-09-13 00:00:00

言語: English

ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.09.28.558499

ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.09.28.558499.full.pdf

ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/

変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。

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