ビーファロのハイブリッド化に関する遺伝的洞察
研究によると、ビーファローの中のバイソンの祖先は限られてるらしい。
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遺伝子の流れ、つまり集団間での遺伝子の移動は、牛やバイソンのさまざまな種の間でよく見られる現象だよ。これには、家畜の牛、アメリカバイソン、ヤク、ガウルが含まれる。多くの混合は人間の活動、特に農業や繁殖の結果だね。例えば、青銅器時代には、近東でトーリン(ヨーロッパの牛)とインディシン(ゼブ牛)の牛が混ざり、それがアフリカや北アメリカに広がった。また、人間の介入によって異なる品種の牛やバイソンが交配し、これらの動物を管理したり、環境に適応したりするための遺伝的変異が生まれた。
これらの系統間の混合は一般的だけど、繁殖に問題が起こることも多いんだ。これは、何百万年もかけて進化してきた大きな違いがあるからだと思う。例えば、異なるバイソンと牛の種のほとんどのハイブリッドは、繁殖能力のある雄の子供を産まないんだ。ただ、トーリンとインディシンのハイブリッドはうまく繁殖できるけど、一部のアフリカの牛のハイブリッドは、遺伝的な不一致の影響を示すような先祖のレベルが異なることがある。
ビーファロは、バイソンと牛の成功したハイブリッドの例としてよく挙げられている。この品種は1970年代に、商業目的でバイソンと牛を混ぜる試みの後に作られた。20世紀初頭のブリーダーは、実行可能なハイブリッドを作るのに多くの課題に直面していたため、ビーファロの確立は注目に値する。ただ、ビーファロの起源は完全には明らかで、初期の記録にはその先祖に関する詳細がないんだ。
ビーファロの確立
アメリカビーファロ協会は、ビーファロを主に牛で構成され、少しのバイソンを含む安定したハイブリッドと定義している。この品種はカリフォルニアで慎重な繁殖方法を通じて開発された。創設者からの明確な系譜がないにもかかわらず、後の研究がこの品種の成り立ちについての理解を深めた。
研究によると、ほとんどのビーファロは牛に見られる特定のY染色体を持っていて、オリジナルの交配にはバイソンの雌牛とトーリンの雄牛が関与していた可能性がある。また、初期のビーファロには通常バイソンに関連付けられるマーカーが欠けていることもわかった。これは、バイソンが混合プロセスの一部であったものの、その寄与は以前考えられていたほど重要ではなかった可能性を示している。
この研究では、ビーファロの遺伝的構成について包括的な分析が行われた。47頭のビーファロの全ゲノムを調べ、バイソンや他の牛種と比較して、このユニークなハイブリッドの先祖を明らかにすることを目指した。この分析には、品種の初期における基盤となる動物が含まれ、ビーファロの先祖についてのより明確なイメージを提供した。
ビーファロのゲノム分析
ビーファロとバイソンのハイブリッドのゲノムが調べられ、先祖を比較した。ほとんどのビーファロはトーリンの牛に非常に近いクラスタを形成していて、ほとんどバイソンの先祖がいないことが示された。主成分分析では、ほとんどのビーファロに重要なバイソンの遺伝子が含まれていないことが示され、一部例外がわずかにバイソンの遺伝的特徴を示した。
バイソンのハイブリッドのほとんどは明確なバイソンの先祖を持っていて、予想された遺伝的背景を確認できた。興味深いことに、一部のビーファロはわずかなバイソンの先祖を示したが、それは37.5%の標準よりもかなり低かった。これは、交配が可能な一方で、ビーファロの実際のバイソンの先祖のレベルは最小限であることを示唆している。
分析の結果、ほとんどのビーファロは安定したハイブリッド集団ではないことが明らかになった。大部分はバイソンの先祖を持っている個体は少数で、これらの動物は繰り返し牛と交配され、遺伝的な構成がバイソンよりも牛に近いものになっているようだ。
遺伝分析の方法
この研究では、ビーファロとバイソンのサンプルから広範なゲノムデータが集められた。USDAからの精液サンプルが利用され、多くは品種の創設時代に収集された。DNAを抽出して配列決定を行い、遺伝的な祖先の包括的な分析が可能になった。
研究者たちは、主成分分析やADMIXTUREと呼ばれる技術を使って、祖先を視覚化しモデル化するさまざまな方法を用いた。遺伝マーカーを調べることで、各ビーファロのゲノムにおけるバイソンと牛の先祖の割合を推定することができた。
全体的に見て、この研究では検出可能なバイソンの先祖を含むビーファロはごく少数であり、これまで報告されていたものよりもかなり低いことがわかった。ほとんどの個体はインディシンの先祖の存在が強く示されていて、ゼブ牛との交配がビーファロの表現型を形成するのに重要な役割を果たした可能性がある。
バイソンの先祖の役割
ほとんどのビーファロはトーリンのY染色体を持っていて、バイソンの先祖は主にバイソンの雄牛との交配から来た可能性がある。対照的に、バイソンの先祖を持つ個体は、常染色体に比べてX染色体での表現が少ない傾向があった。このパターンは、バイソンの先祖が主に母方から導入されたという考えに反する。
この研究の結果は、バイソンと牛の間にハイブリダイゼーションの大きな障壁が存在し、安定したハイブリッド集団が形成されるのを妨げていることを示している。遺伝子の流れの証拠が存在するけれど、ビーファロの中のバイソンの先祖の実際の量はかなり限られている。
動物繁殖への影響
この研究の結果は、異なる種の牛とバイソン之间の遺伝子流動の程度に疑問を投げかけている。ブリーダーたちは歴史的に実行可能なハイブリッドを作ろうとしてきたが、繁殖の障壁の課題が明らかになっている。報告によれば、ハイブリッドは特に雄においてしばしば繁殖能力の問題を抱えることが多い。
結果はまた、ビーファロのようなハイブリッド動物の先祖を理解するための遺伝分析の重要性を強調している。過去のビーファロの先祖を評価しようとする試みは、正確性の低い方法によってバイソンの先祖の推定を誇張させてしまった。しかし、包括的なゲノム調査によって、これらの動物の真の遺伝的構成を明らかにできる。
この研究は、バイソンと牛の間のハイブリダイゼーションが可能である一方で、安定したハイブリッド集団の確立を妨げる重要な繁殖障壁が存在することを示している。ビーファロの中で見つかった限られたバイソンの先祖は、以前の繁殖努力がより多くの牛の先祖を取り入れていた可能性があることを示唆している。
結論
この研究はビーファロの遺伝的な詳細な調査を初めて行い、この品種が以前主張されていたよりもはるかに少ないバイソンの先祖を含んでいることを明らかにした。ほとんどのビーファロはトーリンの牛と密接に関連していて、バイソンとの成功した交配が安定したハイブリッド集団につながっていないことを示す証拠がある。
ビーファロの遺伝的歴史を理解することは、動物繁殖、保全活動、そして種のハイブリダイゼーションの理解に寄与する。研究者たちが牛とバイソン間の遺伝子流動の複雑さを探求し続ける中で、この研究は今後の調査のための貴重な参考点として機能する。この発見は、繁殖慣行における慎重なアプローチの必要性と、種の間に存在する遺伝的障壁に対する理解を高める重要性を強調している。
タイトル: Most Beefalo cattle have no detectable bison genetic ancestry
概要: Hybridization is common among lineages in the genus Bos, often mediated through human management for the selection of adaptive or desirable traits. A recent example is the American Beefalo cattle breed, which was developed in the 1970s and defined as a hybrid between American bison (Bison bison) and cattle (Bos taurus). The American Beefalo Association typically require [3/8] bison ancestry to qualify as Beefalo. Here, we sought to characterize admixed ancestry among Beefalo as a component of a larger project to understand the role of hybridization in shaping present-day diversity in bison and cattle. We generated genomic data from 50 historical and present-day Beefalo and bison hybrids, including several important founding animals, as well as from 10 bison originating from commercial herds that represent potential sources of bison ancestry in Beefalo. We found that most Beefalo did not contain detectable bison ancestry. No individual Beefalo within our data set satisfies the ancestry requirements specified by the American Beefalo Association (ABA), although several Beefalo had smaller proportions of bison ancestry (2-18%). Some beefalo had detectable indicine cattle ancestry (2-38%), suggesting that hybridization of taurine and zebu cattle may contribute to morphological similarity between some Beefalo and bison. Overall, ancestry profiles of Beefalo and bison hybrid genomes are consistent with repeated backcrossing to either parental species rather than the breeding between hybrids themselves, implying significant barriers to gene flow between bison and cattle. Our results call into question the [3/8] bison ancestry targeted by the breed association and demonstrate the value of genomic information in examining claims of interspecies gene flow among Bos species.
著者: Beth Shapiro, J. Oppenheimer, M. P. Heaton, K. L. Kuhn, E. Green, H. D. Blackburn, T. P. L. Smith
最終更新: 2024-09-19 00:00:00
言語: English
ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.09.16.613218
ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.09.16.613218.full.pdf
ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。
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