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# 生物学# 細胞生物学

細胞研究におけるリボソームカウントの進展

新しい方法でリボソームのカウントが改善され、細胞内での役割が明らかになってきた。

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細胞内のリボソームの数を数細胞内のリボソームの数を数える明らかにした。研究がリボソームの数に関する重要な洞察を
目次

リボソームは細胞の中で重要な構造だよ。ここでタンパク質が作られるんだけど、これって生物の機能や構造に欠かせないものなんだ。リボソームはメッセンジャーRNA(mRNA)っていう特別なタイプの分子を読み取って、それを長いアミノ酸の鎖に変えて、タンパク質に折りたたむんだ。リボソームの仕組みについてはたくさん知られているけど、いろんな細胞にどれくらいのリボソームがあるか詳しく調べられてはいないんだよね。

リボソームは何からできてるの?

すべてのリボソームは大きなサブユニットと小さなサブユニットの2つの部分からできているよ。ヒトの細胞では大きな部分は60Sサブユニットって呼ばれていて、3種類のリボソームRNA(RRNA)とたくさんのタンパク質が含まれてる。小さな部分は40Sサブユニットって言われてて、1種類のrRNAといくつかのタンパク質があるんだ。驚くことに、ヒトのリボソームのいくつかのタンパク質は、バクテリアや他の単純な生物のリボソームにはないもので、ヒトのリボソームがちょっとユニークだって示してるんだ。

リボソームはどうやって数えるの?

科学者たちは細胞のリボソームを数える方法をいろいろ模索してきたよ。1つの方法は細胞内のrRNAの量を測ること、もう1つはリボソームの一部であるタンパク質を数えることだ。どちらの方法も正確な数字を出すわけじゃなくて、比較すると混乱する結果になることもあるんだ。

この問題を解決するために、電子トモグラフィーって技術を使った新しい方法が開発されたんだ。この方法は細胞の詳細な画像を撮って、リボソームをもっと正確に数えるのに役立つんだ。研究者たちはこの方法を使ってヒトの細胞でリボソームを信頼できる数字で数えることができるか見てみたし、普通のミミズと処理されたミミズのリボソームの数を比較したんだ。

細胞はどんな風に準備されるの?

電子顕微鏡でリボソームを調べる前に、細胞のサンプルはいくつかの準備ステップを経る必要があるよ。ヒトの細胞の場合、特別な皿で育てられて、表面から優しく剥がされるんだ。その後、すぐに凍らせて、特別な溶液に置き換えてさらに処理されるんだ。ミミズにも同じように丁寧な準備がされて、構造を損なうことなくイメージングの準備が整うんだ。

ヒトの細胞のリボソームを分析する

研究では、科学者たちはヒト細胞株のhTERT-RPE-1を使ったよ。電子顕微鏡と特別な画像処理パイプラインを使ってこの細胞の画像を作り出し、リボソームを数えたんだ。その結果、これらの細胞の細胞質1立方マイクロメートルあたり平均18,605個のリボソームがあることがわかったよ。このリボソームの数に関する理解が深まったおかげで、ヒト細胞内でのリボソームの機能についての洞察が得られたんだ。

細胞のサイズと体積を決める

ヒトの細胞内のリボソームの総数を見積もるには、まず細胞のサイズを知る必要があるんだ。科学者たちは共焦点顕微鏡を使って細胞の詳細な画像を撮ったよ。細胞の体積を測って、核(細胞の制御センター)の体積を引くことで、リボソームが見つかる細胞質の体積を計算したんだ。この計算した体積に小さな体積で見つかったリボソームの数を掛けて、細胞全体にあるリボソームの総数を推定したんだ。

ミミズのリボソームを数える

科学者たちはミミズの一種、Caenorhabditis elegansのリボソームも数えたいと思ったんだ。このミミズは構造がシンプルで、実験で扱いやすいから研究に便利なんだ。ミミズのいろんな部分を分析することで、胚細胞(卵や精子に発展する細胞)や体細胞(皮膚や筋肉の細胞など)のリボソームを数えたんだ。リボソームの数は細胞の種類によって異なることがわかって、異なる組織がリボソーム製造機の数を持っていることを示しているんだ。

RNAの知識を使ってリボソームの数を推定する

リボソームを数えるもう1つの方法は、細胞からRNAを分析することだったんだ。リボソームはrRNAからできているから、科学者たちはこのRNAの量を見て、リボソームがどれだけ存在するか推測できるんだ。彼らはヒトの細胞からRNAを抽出して、毛細管電気泳動っていう技術を使って18Sと28Sサブユニットの2種類のrRNAの量を測ったんだ。これらのリボソームRNAの量を見れば、細胞の中のリボソームの数を推定できるんだ。

リボソームが減るとどうなる?

最後に、研究者たちはミミズでRNA干渉(RNAi)を使ってリボソームの数が減るとどうなるかを調べたんだ。リボソームの生産に関わる遺伝子をターゲットにすることで、ミミズのリボソームの数を減らすことができたんだ。リボソームが少ないミミズは健康が悪くてオフスプリングが少ない兆候を示したことから、リボソームが生物全体の健康にとってどれだけ重要かがわかったんだ。

結論

この研究はリボソームとその細胞内での役割についてのより明確なイメージを提供してくれるよ。高度なイメージング技術と伝統的な技術を組み合わせることで、科学者たちはリボソームをより正確に数えることができるようになったんだ。これは細胞の機能を理解するために重要だし、さまざまな要因がリボソームの生産にどのように影響を与えるかを探る助けにもなるんだ。これらの小さな構造について学び続けることで、健康や病気への影響をよりよく理解できるようになるんだ。

オリジナルソース

タイトル: In situ quantification of ribosome number by electron tomography

概要: Ribosomes, discovered in 1955 by George Palade, were originally described as small cytoplasmic particles preferentially associated with the endoplasmic reticulum (ER). Over the years, numerous studies were conducted on both ribosome structure and function. The basic question, however, how many ribosomes are contained within whole cells has not been addressed so far. Here we developed a microscopic method to determine the total number of ribosomes in human hTRET-RPE-1 and in nematode cells from different tissues in Caenorhabditis elegans hermaphrodites. Electron tomography of high-pressure frozen, freeze substituted and resin-embedded samples revealed that the number of ribosomes as determined by this electron tomographic approach closely matches the biochemical estimates for the hTRET-RPE-1 cells. In addition, RPOA-1-depleted worms compared to control worms showed an expected decrease in the number of ribosomes in two out of three different tissue types investigated. The application of our imaging-based approach to directly count the number of ribosomes in given samples will significantly enhance our basic understanding of ribosome localization and distribution within cells and tissues.

著者: Gunar Fabig, M. El Hankouri, M. Nousch, T. Mueller-Reichert

最終更新: 2024-09-28 00:00:00

言語: English

ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.09.27.614074

ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.09.27.614074.full.pdf

ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。

オープンアクセスの相互運用性を利用させていただいた biorxiv に感謝します。

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