葉物野菜のバイ菌と食品安全について理解する
この研究は、バイ菌が葉物野菜の安全性にどう影響するかを調べてるよ。
Achim Schmalenberger, P. Culliney
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葉物野菜、例えばルッコラやほうれん草は、多くの人に人気の選択肢だよね。栄養素やビタミン、他の有益な化合物で知られてるし、年々これらの野菜の需要がすごく増えてきたんだ。例えば、ほうれん草の世界的な生産量は2001年から2021年の間にかなり増加したんだ。これが増えた理由の一つは、ポリトンネルの利用で、農家が冬や天候が厳しい地域でも年中これらの野菜を育てられるようになったから。
でも、需要が高まる中で、一部の農家はもっと安くて早い生産方法を使い始めたよね。これで、L. monocytogenesみたいな有害なバイ菌に汚染される危険が懸念されてる。ほうれん草やルッコラにおけるL. monocytogenesの挙動に関する研究は様々な結果が出ていて、農業のやり方や環境条件の違いが影響してるみたい。
植物の表面はフィロスフィアって呼ばれてて、ここにはバイ菌やカビ、ウイルスを含むいろんな微生物がいるんだ。この微生物のコミュニティの構成は、植物の種類や環境、葉の年齢によって変わることがあるんだけど、フィロスフィアは多様性があっても、多くの植物種は特定のバイ菌グループが優勢な似たような微生物コミュニティを持ってる。
フィロスフィアの微生物は、L. monocytogenesみたいな食中毒の病原菌から植物を守る手助けをしてくれることもあるよ。例えば、あるバイ菌は有害なバイ菌と一緒に育つときにその成長を抑えられるんだ。でも、L. monocytogenesに対するフィロスフィアの影響を専念して研究したものはまだ少ないんだよね。
乳酸菌(LAB)はフィロスフィアによく見られて、資源を巡って競争する能力があるため、L. monocytogenesに悪影響を与えることもある。中には酸を作るものもあって、それがpHを下げてL. monocytogenesが育ちにくくするんだ。一部のLAB、例えばLactiplantibacillus plantarumはルッコラに見つかって、L. monocytogenesを抑える可能性があるとわかったよ。でも、全てのバイ菌が助けになるわけじゃなくて、いくつかはタンパク質をアミノ酸に分解することでL. monocytogenesの成長を助長することもある。
今回の研究の主な目的は、ほうれん草、ルッコラ、ケールのフィロスフィアにいるバイ菌を調べて、異なる栽培条件がL. monocytogenesの成長に影響を与える特定のバイ菌の存在にどう関係しているかを見つけることだったんだ。研究者たちはバイ菌のタイプとL. monocytogenesのレベルとのつながりを探ってたんだ。
材料と方法
野菜サンプル
この研究では、特定の条件下で育てられたほうれん草、ルッコラ、ケールのサンプルを使ったよ。合計160のサンプルを収集して、露地栽培とポリトンネルの両方からのものが含まれてた。研究者たちはサンプルを一定の温度で数日間保存して、その後微生物の含有量を分析したんだ、特にL. monocytogenesに焦点を当てて。
リステリア・モノサイトゲネスのレベル測定
L. monocytogenesを検出するために、各野菜サンプルにこのバイ菌を接種したんだ。研究者たちはサンプルをバッファーと一緒にブレンドして、その混合物を分析してL. monocytogenesのレベルを調べたよ。異なるサンプルの中でバイ菌の成長可能性を計算したんだ。
DNA抽出とシーケンシング
サンプルを分析した後、残りの材料を使ってDNAを抽出したんだ。このDNAは次にシーケンシングのために送られて、サンプルに存在するバイ菌コミュニティについての詳細な情報が得られたよ。研究者たちは特別なソフトウェアを使って結果を分析し、異なるバイ菌グループを特定したんだ。
データの分析
研究者たちは異なるグループ間でのバイ菌コミュニティを、栽培条件、植物種、収穫時期に基づいて比較したよ。彼らはさまざまな多様性メトリックを推定して、異なる要因がバイ菌の個体群やL. monocytogenesとの関係にどのように影響を与えたかを理解しようとしたんだ。
結果
バイ菌コミュニティの構成
分析の結果、サンプルで最も豊富に見られたバイ菌は、いくつかの主要なグループに属していたよ。ポリトンネルで育てられた野菜と露地で育てられた野菜で、バイ菌コミュニティに顕著な違いがあったんだ。栽培条件が植物種自体よりもバイ菌コミュニティの構造に強く影響を与えるように見えた。
研究者たちは、最も一般的なバイ菌の中にL. monocytogenesと正の相関があるものもあれば、負の影響を与えるものもあることを見つけたよ。これは、特定のバイ菌が栽培条件に応じてL. monocytogenesの成長を促進するか、抑制するかのどちらかであることを示唆してるね。
季節的な影響
この研究では、年間のどの時期がフィロスフィアのバイ菌に影響を与えるかも見たんだ。異なる季節によってバイ菌の多様性と豊富さに変化があったよ。例えば、夏と冬のほうれん草は異なるバイ菌パターンを示して、冬の収穫は夏の収穫とは明確に異なった特徴があったんだ。
植物品種の比較
研究者たちは、ほうれん草やルッコラの異なる品種が多様なバイ菌コミュニティを持っていることに気づいたよ。一部の品種はL. monocytogenesの成長潜在能力が高い一方で、他の品種は低いレベルを示した。特定の植物品種とそのフィロスフィアバイ菌との関係は、野菜の安全性を改善するための洞察を提供しているね。
考察
微生物の役割
フィロスフィアにおける特定のバイ菌の存在は、有害な病原菌であるL. monocytogenesの成長にかなり影響を与える可能性があるんだ。バイ菌の多様性は重要で、高い多様性はL. monocytogenesのレベルが低くなることと相関することが多いから、葉物野菜における微生物の健康的なバランスを維持することが、食中毒の病原菌をコントロールするのに役立つかもしれない。
農業の実践
この研究の結果は、野菜の安全性に対する農業の実践の重要性を強調しているよ。ポリトンネルや露地栽培などの異なる栽培方法を使うことで、葉物野菜に存在する微生物コミュニティに影響が出て、その結果、有害なバイ菌の成長可能性が変わるんだ。
季節性の重要性
この研究は、バイ菌コミュニティを形成する上で季節の変化が果たす役割を強調してるね。天候条件や季節の成長サイクルは、野菜の安全性を評価し、汚染のリスクを減らす戦略を開発するのに考慮すべきだね。
結論
まとめると、この研究は葉物野菜、それらの微生物コミュニティ、L. monocytogenesみたいな有害なバイ菌との複雑な相互作用を示してるんだ。栽培方法や環境要因がこれらの関係を大きく形成してる。これらのダイナミクスを理解することで、葉物野菜の食品安全の実践を改善して、食中毒のリスクを減らすことができるんだ。今後の研究も、これらの関係を探って、野菜の微生物の管理に効果的な戦略を開発していくべきだね。
タイトル: Cultivation conditions of leafy vegetables determine phyllosphere bacterial community structures and ultimately affect growth of L. monocytogenes post-harvest
概要: Cultivation conditions including plant species, variety, cultivation method and seasonality are all at least co-factors of epiphytic growth of L. monocytogenes. Meanwhile, phyllosphere associated bacteria were found to influence colonisation of invading pathogens. Thus, the main objective of this study was to determine whether cultivation conditions are factors in the development of the bacterial phyllosphere community on leafy vegetables which consequently influences L. monocytogenes growth. Indeed, this study revealed that vegetable cultivation condition was a more influential determinant of phyllosphere development than plant species. Of the identified phyllosphere associated bacteria presence of Pseudomonadaceae had a positive correlation with L. monocytogenes populations on all tested produce. Yet, Pseudomonadaceae content appeared to be more important for L. monocytogenes growth on spinach F1 Trumpet. From day 7 to 9 of storage, Pseudomonadaceae increases on open field spinach F1 Trumpet were associated with L. monocytogenes largest increase (0.94 log10 cfu g-1), whereas Pseudomonadaceae content decreased for polytunnel spinach F1 Trumpet and the corresponding L. monocytogenes populations remained unchanged. Carnobacteriaceae were present on spinach F1 Trumpet from polytunnel but not on other spinach produce with higher associated L. monocytogenes growth. Pectobacteriaceae (genus Dickeya) increased for spinach F1 Trumpet polytunnel but decreased for other spinach produce with lower associated L. monocytogenes growth. Similarly, polytunnel rocket Esmee had an increasing relative abundance of Pectobacteriaceae whereas it remained constant for polytunnel rocket Buzz. Compared to summer spinach F1 Trumpet produce, winter produce had significantly greater Streptococcaceae content and was correlated with a decrease in L. monocytogenes growth. Finally, higher phyllosphere alpha diversity putatively limited L. monocytogenes growth. Ultimately, this study revealed that cultivation conditions determine bacterial phyllosphere community structure which consequently influences L. monocytogenes growth.
著者: Achim Schmalenberger, P. Culliney
最終更新: 2024-10-19 00:00:00
言語: English
ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.10.19.619193
ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.10.19.619193.full.pdf
ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。
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